Coccinelles
stephanevaraire
Created on October 26, 2019
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Transcript
Tout le monde connait la coccinelle Coccinella septempunctata, une grande habituée de nos jardins...
Mais connaissez-vous les coccinelles arlequins ? Il s'agit de coccinelles présentant des motifs variés sur leurs élytres (la carapace protégeant leurs ailes).Il s'agit d'un bon exemple de diversité des êtres vivants...
Le but de cette séance est de :-Savoir s'il s'agit de variations intraspécifiques (au sein d'une même espèce) ou spécifiques (plusieurs espèces différentes).-Savoir si les coccinelles arlequins sont de la même espèce que Coccinella septempunctata.-Connaitre l'origine précise de cette variabilité.
NEXT
La notion d'espèce
Notions de génétique
Faire des croisements
Localiser et inactiver des gènes
Séquencer l'ADN
Retour à l'intro
Avec des méthodes statistiques, il est possible de connaitre la région approximative d'un chromosome responsable d'un certain caractère (ici les motifs des élytres de la coccinelle).
Connaitre la région responsable du motif des élytres
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Nous avons identifié une région bien précise du chromosome 4 de la coccinelle arlequin, dont les variations de séquences sont corrélées avec les variations de coloration. Cette région s’étend sur trois gènes : le gène aor, le gène pnr et le gène itr Pour pouvoir trancher entre ces trois gènes, il y a possibilité d’inactiver chaque gène et d’observer les effets sur les caractéristiques de la coccinelle.
Avec des méthodes statistiques, il est possible de connaitre la région approximative d'un chromosome responsable d'un certain caractère (ici les motifs des élytres de la coccinelle).
Connaitre la région responsable du motif des élytres
Inactiver le gène aor
Inactiver le gène pnr
Inactiver le gène itr
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Black-4spots
Red-nspots
Black-nspots
Black-2spots
Black-4spots
Red-nspots
Black-nspots
Black-2spots
Gène aor actif(expérience témoin)
Gène aor inactif
Expérience d'inactivation du gène aor
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Refaire une expérience d'inactivation
Black-4spots
Red-nspots
Black-nspots
Black-2spots
Black-4spots
Red-nspots
Black-nspots
Black-2spots
Gène pnr actif(expérience témoin)
Gène pnr inactif
Expérience d'inactivation du gène pnr
Retour au labo
Refaire une expérience d'inactivation
Black-4spots
Red-nspots
Black-nspots
Black-2spots
Black-4spots
Red-nspots
Black-nspots
Black-2spots
Gène itr actif(expérience témoin)
Gène itr inactif
Expérience d'inactivation du gène itr
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Refaire une expérience d'inactivation
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Entrez le chiffre correspondant au chromosome concerné par le séquencage.
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Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
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Recommencer le séquencage
___
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
Recommencer le séquencage
x__
Retour au labo
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
Recommencer le séquencage
xx_
Retour au labo
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
Recommencer le séquencage
___
Retour au labo
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
Recommencer le séquencage
x__
Retour au labo
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
Recommencer le séquencage
xx_
Retour au labo
La séquence d'ADN demandée a bien été séquencée.Il existe 4 versions (allèles) de ce gène pnr ("pannier"): hsp : allèle trouvé chez Black-4spots hA : allèle trouvé chez Black-nspots hC : allèle trouvé chez Black-2spots h : allèle trouvé chez Red-nspots
Recommencer le séquencage
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Obtenir séquence
Une fois dans le logiciel, vous devrez :-Aligner les séquences, pour mieux pouvoir les comparer (Action => aligner les séquences).-Afficher le tableau de comparaison des distances génétiques (Affichage => tableau de comparaison).
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
ERREUR : ce n'est pas le bon gène
Recommencer le séquencage
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Sélectionnez les coccinelles que vous voulez croiser...
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ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
Sélectionnez une deuxième coccinelle...
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Autre croisement
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
+
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Autre croisement
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
+
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Autre croisement
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
+
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Autre croisement
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
+
Pas de croisement possible
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Autre croisement
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
Sélectionnez une deuxième coccinelle...
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Autre croisement
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
+
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Autre croisement
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
+
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Autre croisement
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
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Autre croisement
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
+
Pas de croisement possible
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Autre croisement
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
Sélectionnez une deuxième coccinelle...
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Autre croisement
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
+
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Autre croisement
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
+
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Autre croisement
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
+
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Autre croisement
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
+
Pas de croisement possible
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Autre croisement
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
Sélectionnez une deuxième coccinelle...
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Autre croisement
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
+
Pas de croisement possible
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Autre croisement
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
+
Pas de croisement possible
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ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
+
Pas de croisement possible
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Autre croisement
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
+
Pas de croisement possible
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ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
Sélectionnez une deuxième coccinelle...
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Autre croisement
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
+
Pas de croisement possible
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Autre croisement
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
+
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Autre croisement
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
+
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Autre croisement
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata
+
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Autre croisement
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
Coccinella septempunctata