Coccinelles arlequin

La diversité des individus au sein d'une espece L'exemple des coccinelles arlequins

INTRO

Réalisé à partir du travail de Stéphane Varaire. Merci

Tout le monde connait la coccinelle à 7 points Coccinella septempunctata, une grande habituée de nos jardins...

Mais connaissez-vous les coccinelles arlequins ?Il s'agit de coccinelles présentant des motifs variés sur leur élytres (la carapace protégeant leurs ailes).Il s'agit d'un bon exemple de diversité des êtres vivants...

Les objectifs ce travail sont de :- Savoir s'il s'agit de variations intraspécifiques (au sein d'une même espèce) ou spécifiques (plusieurs espèces différentes).- Savoir si les coccinelles arlequins sont de la même espèce que Coccinella septempunctata.- Connaitre l'origine précise de cette variabilité.

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La notion d'espèce

Faire des croisements

Localiser et inactiver des gènes

Séquencer l'ADN

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Rappels de génétique

L’ADN est le support de l’information génétique. Il constitue le génome de tous les êtres vivants (bactéries, champignons, animaux, végétaux…). Le génotype des êtres vivants est l’ensemble de leurs gènes (30.000 gènes chez l’Homme). Gène : fragment de la molécule d’ADN (une séquence de nucléotides) qui porte une information codée pouvant contrôler un aspect de l’activité de la cellule, un caractère donné d’un individu ... (exemple : gène des groupes sanguins). En moyenne un gène fait 100.000 paires de nucléotides. Un gène peut avoir différentes versions appelées allèles. Les allèles d’un même gène sont des séquences de nucléotides avec quelques différences (ex : allèles grp sanguins A, B, O) Tous les êtres vivants possèdent de l’ADN. Les expériences de transgénèse montrent que le support et le codage de l’information génétique est universel. La comparaison des molécules d’ADN entre les êtres vivants est une preuve supplémentaire de l’origine commune des espèce.

Des infos sur la coccinelle? ... c'est par ici !

Il y a tâche et tâche....

Afin d'identifier la région du génome associée aux variations de coloration des élytres, nous avons séquencé plusieurs génomes de coccinelles et les avons comparé entre eux.

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Lancer l'analyse génétique pour connaitre la région responsable du motif des élytres

Nous avons identifié une région bien précise du chromosome 4 de la coccinelle arlequin, dont les variations de séquences sont corrélées avec les variations de coloration. Cette région s’étend sur trois gènes : le gène aor, le gène pnr et le gène itr Pour pouvoir savoir lequel de ces trois gènes est impliqué, on peut inactiver chaque gène l'un après l'autre et d’observer les effets de cette inactivation sur les caractéristiques de la coccinelle.

Inactiver le gène aor

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Inactiver le gène pnr

Inactiver le gène itr

Afin d'identifier la région du génome associée aux variations de coloration des élytres, nous avons séquencé plusieurs génomes de coccinelles et les avons comparé entre eux.

Black-4spots

Red-nspots

Black-nspots

Black-2spots

Black-4spots

Red-nspots

Black-nspots

Black-2spots

Gène pnr actif(expérience témoin)

Gène pnr inactif

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Expérience d'inactivation du gène pnr

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Black-4spots

Red-nspots

Black-nspots

Black-2spots

Black-4spots

Red-nspots

Black-nspots

Black-2spots

Gène aor actif(expérience témoin)

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Gène aor inactif

Expérience d'inactivation du gène aor

Refaire une expérience d'inactivation

Black-4spots

Red-nspots

Black-nspots

Black-2spots

Black-4spots

Red-nspots

Black-nspots

Black-2spots

Gène itr actif(expérience témoin)

Gène itr inactif

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Expérience d'inactivation du gène itr

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Attention aux yeux des coccinelles

Les 2 tâches blanches derrière la tête ne sont pas des yeux (mais juste des taches)

l'oeil est ici

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Pour tout connaître sur les secrets sur notre diversité phénotypique.........RDV sur GenieGen2!

Besoin d'un peu d'aide?

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Ouvrer la banque de séquences Saisir le mot clé « Pannier » puis cliquer sur la séquence suivante : Quand elle apparait alors dans la liste à droite, cliquer sur "charger les séquences" Avec les fonctionnalités du logiciel, montrer qu’il existe une diversité allélique du gène Pannier : Dans "Actions" - "Aligner les séquences". Comparer les différentes séquences : dans « Affichage » - « Tableau de comparaison ». Que déduire de ces informations? Proposer un mécanisme à l'origine de l’existence de ces différents allèles.

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je crois qu'on dérange...

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Entrez le chiffre correspondant au chromosome concerné par le séquencage.

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Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

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x__

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La séquence d'ADN demandée a bien été séquencée.Il existe 4 versions (allèles) de ce gène pnr ("pannier") : hsp : allèle trouvé chez Black-4spots hA : allèle trouvé chez Black-nspots hC : allèle trouvé chez Black-2spots h : allèle trouvé chez Red-nspots

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Si vous avez testé les 3 gènes, il est temps de retourner au labo et de découvrir ce que contient l'enveloppe laissée à votre disposition...

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ERREUR : ce n'est pas le bon gène !

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Ce chromosome contient plein de gènes, mais aucun ne participe à la mise ne place du motif des élytres.

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Sélectionnez les coccinelles que vous voulez croiser...

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ArlequinRed-nspots

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

Coccinella septempunctata

Sélectionnez une deuxième coccinelle...

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ArlequinBlack-2spots

Coccinella septempunctata

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