Les unités BAP

Les unités du département BAP

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Type d'unité

Départements BAP

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UMR - Unité Mixte de Recherche

Biologie et Amélioration des Plantes

Estrées-Mons

UR - Unité de Recherche

BioEcoAgro

GCIE

UE - Unité expérimentale

Les recherches du département BAP s’inscrivent dans le domaine des sciences du végétal. Elles visent à produire des connaissances fondamentales et opérationnelles sur le fonctionnement des plantes en interaction avec leur environnement en intégrant les différents niveaux d’organisation du vivant, pour comprendre et optimiser le fonctionnement des agrosystèmes.

US - Unité de Service

Ile-de-France

UAR -Unité d'Appui à la Recherche

IJPB

RGCO

IPS2

Colmar

Rennes

IGEPP

IGEPP

GQE

Brest

SVQV

UE VS

UEAV

Unités en co-tutelleavec les départements INRAE

La Motte

Dijon

URGI

Angers

Agroécologie

EPGV

IRHS

U2E

BAP

SPE

Horti

AgroEcoSystem

Poitiers

P3F

Transform

Clermont-Ferrand

Ecosocio

Lyon

GDEC

Missions & Enjeux

• Contribuer au développement d'agricultures durablesen faibles intrants et face au changement climatique
• Caractériser, étudier et valoriser la diversité génétiquepour la multi-performance de l'agriculture
• Sélection et amélioration des plantes

RDP

PHACC

Grenoble

Bordeaux

LPCV

BFP

EGFV

Vigne

Avignon

Arbo

GAFL

A2M

Toulouse

Montpellier

LIPME

Diascope

AGAP Institut

Maïs

APC

Vassal

IPSIM

CNRGV

Pech Rouge

LEPSE

Associée BAP

Corse

AGAP Corse

Guadeloupe

ASTRO

PEYI

Octobre 2025

Les unités du département BAP

Les unités du département BAP

Département Biologie et Amélioration des Plantes

Type d'unité

UMR - Unité Mixte de Recherche

Estrées-Mons

UR - Unité de Recherche

BioEcoAgro

GCIE

UE - Unité expérimentale

US - Unité de Service

Ile-de-France

UAR -Unité d'Appui à la Recherche

IJPB

RGCO

IPS2

Colmar

Rennes

Brest

GQE-Le Moulon

SVQV

IGEPP

UE VS

UEAV

La Motte

Dijon

URGI

Angers

Agroécologie

EPGV

IRHS

U2E

BAP

Horti

Unités en co-tutelleavec les départements INRAE

Poitiers

P3F

SPE

Clermont-Ferrand

Lyon

GDEC

AgroEcoSystem

RDP

PHACC

Grenoble

Transform

Bordeaux

LPCV

BFP

Ecosocio

EGFV

Vigne

Avignon

Arbo

GAFL

A2M

Toulouse

Montpellier

LIPME

Diascope

AGAP Institut

Maïs

APC

Vassal

IPSIM

CNRGV

Pech Rouge

LEPSE

Associée BAP

Corse

AGAP Corse

Guadeloupe

ASTRO

PEYI

UMR Agroécologie - Faits marquants 2024 (département BAP)

• afila : l'origine et la nature d'une innovation majeure dans l'histoire de la sélection de poisL'étude a permis de mettre en évidence que la délétion de deux gènes en tandem codant des facteurs de transcription est responsable du caractère afila chez cette espèce tout en identifiant des délétions plus ou moins importantes des gènes voisins. L’introgression du caractère afila dans les variétés, contribuant essentiellement à une meilleure tenue de tige, reste jusqu’à ce jour une des plus grandes innovations de la sélection de pois.doi.org/10.1111/nph.19800

• OrthoLegKB - une base pour l’intégration de connaissances en graphe pour soutenir la recherche et l’amélioration variétale chez les légumineuses L’étude démontre que les cellules végétales positionnent un module de détection de l’état mécanique de la paroi dans les arêtes des cellules pour réguler la synthèse de la paroi cellulaire lors de la croissance. Elle illustre comment les informations géométriques et mécaniques sont intégrées pour promouvoir une morphogenèse robuste. doi.org/10.3389/frai.2023.1191122
• Bases génétiques des interactions plante-microbiotes Une approche multidisciplinaire combinant génétique, écophysiologie et écologie microbienne a été conduite sur une collection d’écotypes de M. truncatula. Des gènes de plantes associés à l’occurrence de bactéries centrales dans les réseaux de cooccurences microbiennes ou qui prédisent certains traits phénotypiques de plante, ont pu être identifiés. Ces résultats ouvrent des perspectives vers le pilotage du microbiote des plantes pour améliorer la croissance, la nutrition et la santé des plantes.doi.org/10.1111/nph.20272
• Médailles de l'Académie d'Agriculture de France Nadim Tayeh, de l'UMR Agroécologie, a reçu le prix Limagrain pour ses travaux sur la génétique et la génomique des légumineuses.

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Recueil des faits marquants 2024

Départements BAP

Biologie et Amélioration des Plantes

UMR IRHS - Faits marquants 2024 (département BAP)

• Un modèle de "cessez-le-feu" pour expliquer l’efficacité de transmission de Xanthomonas citri pv. fuscans aux graines de haricotCette étude met en lumière un modèle d’interaction de type "cessez-le-feu" entre une bactérie pathogène et une graine pendant la maturation, permettant à celle-ci de se développer et germer, malgré des modifications épigénétiques affaiblissant ses défenses lors de la germination.doi.org/10.1111/pce.15037

• Retour vers le futur : la canicule extrême de 2019 n’a pas eu raison de tous les cépagesLes épisodes caniculaires s’intensifient en France, ce qui nécessite d’adapter nos cultures. Une nouvelle étude dévoile des régions du génome impliquées dans la tolérance aux températures extrêmes chez la vigne – grâce à une expérimentation valorisant l’épisode caniculaire exceptionnel de juin 2019.doi.org/10.1111/nph.19540

• Laboratoire International Associé ‘LIA iWUE’ France-AustralieLe LIA iWUE (Isotopic biomarkers of water use efficiency and carbon allocation), a été créé pour 5 ans entre INRAE, l’Australian National University et l’Université d’Angers. Son objectif est de suivre les cycles du carbone et de l’eau et de mettre à jour des marqueurs isotopiques de performance des plantes cultivées.www.inrae.fr
• Médailles de l'Académie d'Agriculture de France Matthieu Barret, de l'UMR IRHS, a obtenu le prix Jean Dufrenoy pour ses travaux pionniers en écologie des semences et le développement de nouvelles méthodes de protection.

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Recueil des faits marquants 2024

Départements BAP

Biologie et Amélioration des Plantes

UMR IJPB - Faits marquants 2024 (département BAP)

• Les protéines SMXL répriment la croissance des mousses via une voie de signalisation ancestrale, conservée chez les plantes terrestresLes protéines SMXL sont des répresseurs de la croissance dont la dégradation, chez les plantes à fleurs, est induite par les strigolactones ou par le signal KL. L’étude des protéines PpSMXL de mousse a permis de montrer que le rôle de ces protéines est conservé dans la voie KL, confirmant son antériorité dans l’évolution. Cependant, chez les mousses, certaines PpSMXL régulent également la voie des strigolactones, ce qui suggèrerait une évolution convergente de ces protéines.doi.org/10.1093/plcell/koae009

• Admirer le ballet des chromosomes en méiose en temps réelAu cours de la méiose chez Arabidopsis thaliana les chromosomes sont attachés par leurs télomères à l’enveloppe nucléaire et soumis à des mouvements drastiques. Cette dynamique des chromosomes est nécessaire à la formation de gamètes viables et donc à la fertilité de l’espèce.doi.org/10.1038/s41467-024-50169-4
• Compréhension du rôle des mitochondries dans l’initiation du développement racinaireCette étude révèle que le gène ROOT PRIMORDIUM DEFECTIVE 1 (RPD1), localisé dans les mitochondries, est essentiel à l’épissage mitochondrial. Ses mutations thermosensibles perturbent ce processus, entraînant un dysfonctionnement mitochondrial et une inhibition du développement racinaire. Ce travail met ainsi en évidence le rôle clé des mitochondries dans la régulation du développement végétal, au-delà de leur fonction énergétique.doi.org/10.1093/nar/gkae072

• Arabidopsis montre une grande variabilité naturelle pour sa réponse aux stress abiotiques complexes, comme la combinaison des déficits en eau et en azoteComprendre les mécanismes de réponse des plantes aux stress passe souvent par l'étude de stress individuels, sans nécessairement aborder les interactions majeures qui apparaissent dans la nature ou au champ, où les stress se combinent dans une dynamique complexe. Dans cette étude, nous révélons l'étendue de la diversité naturelle existant chez l'espèce Arabidopsis thaliana en réponse au stress hydrique et à la déficience en azote, seuls ou combinés.doi.org/10.1093/plcell/koae173

• Augmenter la densité de recombinaison dynamise la cartographie génétiqueIl est depuis longtemps théorisé que la limitation principale à la résolution de la cartographie génétique des caractères complexes dans une population en ségrégation réside dans la densité des recombinaisons le long des chromosomes. Cette hypothèse a désormais été démontrée grâce à la comparaison de 2 populations en ségrégation, dont l'une offre une densité de re-combinaison 6 fois supérieure à l'autre. La cartographie des loci contrôlant différents caractères s'en trouve fortement améliorée.doi.org/10.1038/s42003-024-06530-w

• Un nouvel inhibiteur de la synthèse de la cellulose affectant la sécrétion des complexes cellulose synthase et la dynamique des microtubulesUn nouvel inhibiteur de la synthèse de la cellulose a été identifié, agissant sur la sécrétion des complexes cellulose synthase, ainsi que sur la dynamique des microtubules. A des temps courts de traitement, son mode d’action est différent de celui des autres inhibiteurs de synthèse de cellulose décrits jusqu’à présent.doi.org/10.1093/plphys/kiae232

• Le champignon Botrytis cinerea dégrade spécifiquement les sphingolipides des plantes infectées grâce à une phospholipase CUne analyse oligoglycomique a montré que Botrytis cinerea, un agent phytopathogène nécrotrophe est capable de dégrader des lipides hautement complexes et vitaux de la plante hôte. Leur dégradation au cours du processus infectieux libère des oligosaccharides phosphorylés, identiques à ceux que la plante génère au cours de son développement..doi.org/10.1038/s42003-024-07064-x

• Un parachute génétique de secours permet de maintenir la forme de la feuille en réponse à des stressUn nouveau mécanisme contribuant à la robustesse du développement des plantes suite à une perturbation épigénétique a été découvert. Ce mécanisme fait intervenir l’activation d’un microARN qui vient compenser les effets de la perturbation épigénétique et maintient un développement foliaire inchangédoi.org/10.1093/plcell/koae260

• La fonction isochorismate synthase ICS1 impliquée dans la synthèse d’acide salicylique est nécessaire pour faire face aux carences en soufre chez Arabidopsis thalianaLes mutants sid2 incapables de synthétiser l’acide salicylique présentent un défaut d'absorption du SO42-, ainsi qu’une suraccumulation de composés de défense soufrés (glutathion), expliquant leur hypersensibilité à la carence en SO42-doi.org/10.1111/tpj.16702

• Rôle structurel et de signalisation dans l'assemblage de la paroi cellulaire des poils racinaires du facteur d'alcalinisation rapide 22Dans les poils racinaires, la formation d'une paroi cellulaire résistante mais extensible est guidée par l'interaction entre des polysaccharides chargés de la paroi cellulaire et un complexe protéine-peptide. Le même peptide recrute également un complexe de récepteurs de la membrane plasmique exerçant un retrocontrôle sur le processus d'assemblage de la paroi cellulaire.doi.org/10.1038/s41477-024-01637-8
• Imagerie confocale des grainesDans les plantes à fleurs, le développement des graines dépend de l'interaction continue entre les produits de la fécondation (embryon et endosperme) et les tissus maternels. Comprendre ce processus complexe nécessite des techniques de microscopie pour révéler la structure interne. Nous présentons ici deux méthodes pour imager la structure tridimensionnelle des graines d'Arabidopsis par microscopie confocale à balayage laser.doi.org/10.1007/978-1-0716-3965-8_9

Recueil des faits marquants 2024

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Départements BAP

Biologie et Amélioration des Plantes

Unité IGEPP - Faits marquants 2024 (département BAP)

• Un livre de cuisine pour faire connaitre des variétés fermières de choux et de navetsDans le cadre du projet UE Prima BrasExplor, de nombreuses variétés fermières ou populations sauvages de navets ou de choux ont été collectées sur un large gradient climatique. Leur maintien en culture dépend de leur usage et c’est pourquoi il nous a paru important de les faire connaître à travers un e-book de recettes de cuisine. A partir de variétés ou de populations locales de quatre pays, des recettes adaptées à chacune sont proposées en 5 langues.doi.org/10.57745/YD4VHS

• Une diversité génétique jamais explorée pour comprendre l’adaptation aux changements climatiques chez les BrassicaL’objectif du projet UE Prima BrasExplor a été de rassembler et d’explorer ce matériel végétal pour tenter d’identifier les déterminants génétiques de l’adaptation au climat. Ce matériel servira de support à la création de populations de prébreeding adaptées à chaque pays ainsi qu’à l’amélioration du colza qui est un hybride naturel entre ces deux espèces.UE Prima BrasExplor (2020-2024)
• Une méthode innovante permettant d’augmenter la diversité et de faciliter l’amélioration génétique des espèces cultivées polyploïdes via la dérégulation de la recombinaison méiotique : ex du colzaEn jouant sur le niveau de ploïdie, nous avons démontré qu’il était possible de modifier naturellement le contrôle strict de la recombinaison méiotique et ainsi faciliter la diversification génétique ou la combinaison d’allèles favorables chez les espèces cultivées polyploïdes.doi.org/10.1093/plcell/koae208

• Identification des déterminants génétiques de la stabilité du rendement du colza oléagineux d'hiverLa caractérisation fine d’un réseau d’essais multi-locaux et multi-annuels a permis d'identifier des régions génomiques contrôlant le rendement en graines chez le colza stables à l’échelle du réseau ou inversement spécifiques de conditions environnementales. En particulier, un locus n’est détecté que dans les environnements les plus limitants. Cette région montre une diversité génétique réduite dans les variétés modernes par comparaison aux colzas anciensdoi.org/10.1007/s00122-024-04664-3

• Étude multidisciplinaire des réponses adaptatives du colza face à la sécheresseCe travail interdisciplinaire combine relaxométrie RMN, microscopie, analyses multi-omiques et mesures hydriques pour étudier les mécanismes d’adaptation des feuilles de colza d’hiver à la sécheresse. Les résultats montrent une stratégie adaptative alliant ajustements structuraux et métaboliques, dépendant fortement du stade de développement. Ces travaux ouvrent des perspectives novatrices pour explorer la variabilité génétique des réponses adaptatives dans le genre Brassicadoi.org/10.1111/ppl.14454

• Utilisation de méthodes de prédiction génomique ou phénomique pour identifier des allèles à effet faible et favorables pour la germination chez le colzaLa prédiction phénomique appliquée à une large game de diversité génétique peut prédire efficacement la germination des graines de colza, capturer les allèles favorables à faible effet qui ne sont pas révélés par les études d'association à l’échelle du génome et identifier des ressources génétiques prometteuses pour une utilisation en pre-breedingdoi.org/10.1007/s00122-024-04659-0

• Exploitation d’un panel de géniteurs améliorés de pomme de terre pour identifier par génétique d’association des QTL de résistance au mildiou et aux nématodes à kysteDes analyses de génétique d’association génome complet ont été menées sur un panel de géniteurs améliorés de pomme de terre. Elles ont conduit à l’identification de quatre régions associées à la résistance au nématode à kyste Globodera pallida, et quatre régions associées à la résistance au mildiou. Cette étude a montré l’intérêt de combiner les gènes/QTL pour obtenir des variétés multi-résistantes potentiellement durables.doi.org/10.3389/fpls.2024.1384401

• Des épimutations naturelles et induites, dont les effets peuvent être modulés par les conditions environnementales, contrôlent la résistance quantitative à la hernie des crucifères chez Arabidopsis thalianaUne épimutation naturelle et des épimutations induites contrôlant la résistance quantitative à la hernie des crucifères ont été identifiées chez Arabidopsis. L'étude a révélé que deux gènes NLR voisins AT5G47260 et AT5G47280 coopèrent dans le contrôle de la résistance partielle quantitative à large spectre à la hernie et qu'ils sont épigénétiquement régulés. 31 régions contrôlées par des épimutations (QTLépi) impliquées dans la réponse à la hernie ont été également identifiées.doi.org/10.1016/j.xplc.2024.100824 et doi.org/10.3389/fpls.2024.1245545

• Bases génétiques des interactions plante-microbiotesUne approche multidisciplinaire combinant génétique, écophysiologie et écologie microbienne a été conduite sur une collection d’écotypes de M. truncatula. Des gènes de plantes associés à l’occurrence de bactéries centrales dans les réseaux de cooccurences microbiennes ou qui prédisent certains traits phénotypiques de plante, ont pu être identifiés. Ces résultats ouvrent des perspectives vers le pilotage du microbiote des plantes pour améliorer la croissance, la nutrition et la santé des plantesdoi.org/10.1111/nph.20272
• La gestion des adventices sans herbicide : quelles fonctions et quels traits des cultures améliorer grâce à la sélection ?Différentes stratégies de gestion des adventices sans herbicide sont présentées dans cette synthèse bibliographique. Les principales stratégies portent sur l’amélioration de la compétitivité, l’évitement de la compétition, la réduction du stock semencier, le désherbage mécanique et l’allélopathie. Pour chaque levier agronomique, cette synthèse identifie les traits fonctionnels à cibler et à intégrer dans de futurs schémas de sélection.doi.org/10.1016/j.cropro.2024.106631

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Recueil des faits marquants 2024

Départements BAP

Biologie et Amélioration des Plantes

Unité XXX - Faits marquants 2024 (département BAP)

Page en construction (à partir du recueil des FM BAP 2024)

• TitreChapô.doi

• TitreChapô.doi
• TitreChapô.doi
• TitreChapô.doi

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Recueil des faits marquants 2024

Départements BAP

Biologie et Amélioration des Plantes

Unité URGI - Faits marquants 2024 (département BAP)

• Le pangénome de Brachypodium distachyon met en évidence la dynamique des éléments transposables dans l’espècepanREPET est un nouvel outil bioinformatique qui détecte les insertions d’éléments transposables (ET) partagés entre les génomes.Au niveau de l’espèce, notre approche pangénomique cherche à détecter la diversité des insertions d’ET intra-spécifiques, à retracer leur dynamique et à comprendre comment les ET peuvent permettre à une espèce de s’adapter à son environnement local.doi.org/10.1101/2024.06.17.598857

• OrthoLegKB - une base pour l’intégration de connaissances en graphe pour soutenir la recherche et l’amélioration variétale chez les légumineusesL’étude démontre que les cellules végétales positionnent un module de détection de l’état mécanique de la paroi dans les arêtes des cellules pour réguler la synthèse de la paroi cellulaire lors de la croissance. Elle illustre comment les informations géométriques et mécaniques sont intégrées pour promouvoir une morphogenèse robuste.doi.org/10.3389/frai.2023.1191122

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Recueil des faits marquants 2024

Départements BAP

Biologie et Amélioration des Plantes

Unité AGAP-Corse - Faits marquants 2024 (département BAP)

• Partenariat entre le château de Compiègne et le centre INRAE de Corse Un partenariat qui permettra l’échange de connaissances scientifiques sur les agrumes et la mise en place d'expérimentations dans le cadre de l'adaptation au changement climatique.Le centre INRAE de Corse héberge l’une des plus belles collections d’agrumes au monde. Elle est certifiée Centre de Ressources Biologiques (CRB) ISO9001 et comprend plus de 1 100 variétés. Outre ses échanges scientifiques, le partenariat prévoit aussi des actions de médiation scientifique et culturelle au château, comme la mise en place d’exposition ou des conférences données par des scientifiques d’INRAE-Cirad.

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Recueil des faits marquants 2024

Départements BAP

Biologie et Amélioration des Plantes

Unité IPSIM - Faits marquants 2024 (département BAP)

• Cultiver des sols calcaires et faire face au changement climatiqueLa revue publiée dans Trends In Plant Science par Bontpart et al fait le point sur les adaptations des plantes aux sols calcaires, avec un focus sur les bases génétiques des réponses cellulaires et moléculaires. Nous proposons des stratégies d’amélioration, en prenant en compte l’impact de facteurs environnementaux liés au changement climatique sur les propriétés physico-chimiques des sols calcaires, particulièrement riches en CaCO3.doi.org/10.1016/j.tplants.2024.03.013

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Recueil des faits marquants 2024

Départements BAP

Biologie et Amélioration des Plantes

Unité LEPSE - Faits marquants 2024 (département BAP)

• Retour vers le futur : la canicule extrême de 2019 n’a pas eu raison de tous les cépagesLes épisodes caniculaires s’intensifient en France, ce qui nécessite d’adapter nos cultures. Une nouvelle étude dévoile des régions du génome impliquées dans la tolérance aux températures extrêmes chez la vigne – grâce à une expérimentation valorisant l’épisode caniculaire exceptionnel de juin 2019.doi.org/10.1111/nph.19540

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Recueil des faits marquants 2024

Départements BAP

Biologie et Amélioration des Plantes

Unité AGAP Institut - Faits marquants 2024 (département BAP)

• Une diversité génétique jamais explorée pour comprendre l’adaptation aux changements climatiques chez les BrassicaL’objectif du projet UE Prima BrasExplor a été de rassembler et d’explorer ce matériel végétal pour tenter d’identifier les déterminants génétiques de l’adaptation au climat. Ce matériel servira de support à la création de populations de prébreeding adaptées à chaque pays ainsi qu’à l’amélioration du colza qui est un hybride naturel entre ces deux espèces.UE Prima BrasExplor (2020-2024).

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Recueil des faits marquants 2024

Départements BAP

Biologie et Amélioration des Plantes

Unité GAFL - Faits marquants 2024 (département BAP)

• Robustesse et résilience face au dérèglement climatique et aux défis sanitaires, les nouveaux traits à cibler en sélection variétaleFace aux défis sanitaires et climatiques actuels et futurs, les chercheurs proposent de cibler des estimateurs de robustesse et de résilience pour améliorer la capacité d'adaptation et de récupération des plantes soumises à des stress biotiques et abiotiques. En considérant ces estimateurs héritables, discriminants et complémentaires, il devient possible de développer des variétés, répondant mieux au dérèglement climatique et aux enjeux de durabilité de l’immunité.doi.org/10.1093/jxb/erae150 doi.org/10.1093/hr/uhae239 doi.org/10.1101/2024.10.15.618428

• 1er Symposium ISHS Prunier et Abricotier, amélioration et culture22 au 25 avril 2024 en Avignon.Le 1er Symposium ISHS sur la génétique, l’amélioration et la culture de l’abricotier et du prunier a permis de faire le point des avancées scientifiques et techniques dans les différents domaines (génétique et amélioration, protection sanitaire, techniques culturales, qualité et post récolte…). Il a réuni environ 130 chercheurs, techniciens, hybrideurs issus de 23 pays.

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Recueil des faits marquants 2024

Départements BAP

Biologie et Amélioration des Plantes

Unité RDP - Faits marquants 2024 (département BAP)

• Un module autorégulateur de détection de la paroi cellulaire à la périphérie des cellules contrôle la croissance des plantesL’étude démontre que les cellules végétales positionnent un module de détection de l’état mécanique de la paroi dans les arêtes des cellules pour réguler la synthèse de la paroi cellulaire lors de la croissance. Elle illustre comment les informations géométriques et mécaniques sont intégrées pour promouvoir une morphogenèse robuste.doi.org/10.1038/s41477-024-01629-8

• Découverte d’une nouvelle étape du cycle cellulaire Nous avons découvert une nouvelle étape du cycle cellulaire où les microtubules ne s’alignent plus avec les contraintes mécaniques. Nous proposons que cette étape permette à la cellule de percevoir sa propre géométrie, indépendamment du contexte mécanique, pour contrôler la précision de la symétrie de la division cellulaire.doi.org/10.1073/pnas.2320470121
• Laboratoire International Associé ‘LIA HortiLab’ France-ChineDans le cadre du partenariat entre le RDP et Huazhong Agricultural University-Wuhan-Chine, le Laboratoire International Associé ‘HortiLab’ a été créé dans le domaine de l’horticulture et des plantes ornementales. Ce laboratoire implique également l’UMR IPS2 de Paris-Saclay..
• Prix EMBO Young InvestigatorEMBO, l’organisation européenne de biologie moléculaire, a récompensé Charlotte Kirchhelle en tant que jeune chercheuse dans le domaine de la biologie cellulaire et du développement des plantes. Tout en développant ses activités scientifiques avec 4 jeunes chercheurs dédiés au projet ERC EDGE-CAM (qui étudie les mécanismes en jeu sur les bords des cellules lors du développement des plantes), elle a pris la direction de l'équipe MechanoDevo en 2024.

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Recueil des faits marquants 2024

Départements BAP

Biologie et Amélioration des Plantes

Unité LPCV - Faits marquants 2024 (département BAP)

• Première classification structurale des facteurs de transcription végétauxChez les plantes comme chez tous les organismes vivants, les facteurs de transcription sont des protéines essentielles pour les réponses à l’environnement ou la genèse des organes. Les plantes possèdent un jeu original de facteurs de transcription. Pourtant aucune classification de ces protéines n’existait. Nous avons bâti la première classification structurale des facteurs végétaux, base de référence internationale pour les études futures.doi.org/10.1016/j.tplants.2023.06.023

• Caractérisation d’une micro-algue verte ayant un fort potentiel de remédiation d’eaux polluées par les métauxLa micro-algue verte Coelastrella sp. PCV possède des propriétés uniques de tolérance et d’accumulation de l’uranium, un radioélément naturel et chimiotoxique. La micro-algue présente un fort potentiel pour la bioremédiation puisqu’elle est capable de dépolluer des eaux naturelles contaminées par l’uranium et le plomb. Coelastrella sp. PCV est un organisme de choix pour identifier de nouveaux mécanismes moléculaires de réponse et d’adaptation au stress métallique.doi.org/10.1016/j.scitotenv.2023.168195
• Ouvrage sur la domestication des plantes : son passé et ses possibles futursCet ouvrage fournit à un public large un bagage de connaissances génétiques sur la domestication des plantes depuis ses origines empiriques jusqu’aux techniques les plus récentes incluant l’édition des génomes (NGT ou Nouvelles technologies génomiques). Il vise à permettre à chacun de se positionner de façon informée dans le débat actuel sur le futur de l’agriculture.ISBN-10 : 237931635X - ISBN-13 : 978-2379316357

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Recueil des faits marquants 2024

Départements BAP

Biologie et Amélioration des Plantes

Unité EGFV - Faits marquants 2024 (département BAP)

• Explorer le microbiote rhizosphérique et racinaire des porte-greffes de vigne comme levier de l’agroécologieL’analyse du microbiome des compartiments sol-rhizosphère-racine de dix combinaisons greffon/porte-greffe de vigne cultivées sur un même sol montre que le génotype du porte-greffe joue un rôle majeur sur la composition et la structure de la communauté microbienne associée aux racines. Les fonctions prédites associées à ses communautés sont variables en fonction des porte-greffes et les indices de diversité observés sont corrélés à des caractères phénotypiques d’intérêt.doi.org/10.1111/1758-2229.13318

• Vigne, vin et changement climatiqueL’ouvrage fait la synthèse des impacts du changement climatique dans la filière, explore les leviers d’adaptation depuis le changement de cépage jusqu’à la relocalisation des vignobles et montre comment ces leviers peuvent se combiner dans des stratégies à plusieurs échelles, du viticulteur jusqu’à la politique climat du secteur.Editions QUAE
• Phénotypage des connexions du xylème dans les plantes greffées à l'aide de la tomographie à rayons XLes greffes de plantes peuvent se faire naturellement ou par l'intervention humaine. La greffe nécessite la formation de connexions vasculaires entre deux plantes différentes. Dans cette publication, nous présentons une nouvelle méthode pour visualiser les connexions des structures xylémiennes sur un grand nombre de plantes.doi.org/10.1111/pce.14883
• Cartographie mondiale de l’évolution des régions viticoles face au changement climatiqueCette étude confirme la plus grande vulnérabilité en matière de qualité des vins produits dans les vignobles historiques face au changement climatique. Elle confirme aussi le seuil clef de 2 °C de réchauffement global du climat, au-delà duquel des modifications majeures sont envisagées pour ce secteur à l’échelle mondiale.

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Recueil des faits marquants 2024

Départements BAP

Biologie et Amélioration des Plantes

Unité SVQV - Faits marquants 2024 (département BAP)

• Inscription au catalogue officiel de 3 variétés à résistance polygénique au mildiou et à l’oïdium issues du programme ResDur : Calys N, Exelys B et Artys BTrois nouvelles variétés de vigne possédant des gènes de résistances aux maladies fongiques mildiou et oïdium ont été inscrites au catalogue français des variétés. Il s'agit de Calys, Exelys et Artys, qui viennent en complément de 9 autres variétés inscrites précédemment par INRAE. Ces variétés permettent une réduction considérable de l'utilisation de fongicides.

• Lancement du projet européen GrapeBreed4IPM : des solutions durables pour la viticultureLe développement de variétés de vignes résistantes aux maladies, et leur perception par les consommateurs, est au cœur du projet Horizon Europe "GrapeBreed4IPM". Coordonné par INRAE, il rassemble pour 4 ans 19 partenaires de 7 pays, et 2 partenaires associés. Il doit fournir aux professionnels des outils d’aide à la décision pour gérer durablement leurs vignobles, dans le respect des normes européennes.

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Recueil des faits marquants 2024

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité BFP - Faits marquants 2024 (département BAP)

• Le secret de la croissance du fruit de tomate enfin révélé ?La protéine FW2.2 associée au QTL majeur qui gouverne la taille du fruit chez la tomate a pour fonction de réguler l’activité des callose synthases, ce qui module le dépôt de callose au niveau des plasmodesmes, modifiant ainsi leur ouverture et leur perméabilité pour favoriser le trafic moléculaire de cellule à cellule, et contrôler potentiellement la croissance du fruit.doi.org/10.1093/plphys/kiae198

• Le noyer au service des caprinsDes teneurs très importantes en progestérone ont été détectées dans les feuilles de 3 variétés de noyers les plus cultivées. L’ingestion de granulés à base de feuilles de noyer pourrait être une alternative à l’utilisation d’éponges intra vaginales utilisées pour synchroniser les ovulations chez les caprins. Ces nouvelles pratiques seraient utilisables en élevage biologique et éviteraient la libération de composés chimiques dans l’environnement.doi.org/10.1016/j.animal.2024.101392Brevet : FR 3116720 “Progestérone végétale et utilisations"

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Recueil des faits marquants 2024

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité GQE-Le Moulon - Faits marquants 2024 (département BAP)

• Les normes de réaction du blé entre monoculture et mélange variétal sont causées par la plasticité du tallage et l’évitement de l’ombrageLa variabilité du rendement des mélanges de blé relativement à la moyenne des variétés les composant est principalement expliquée par la plasticité du nombre d’épis. Celle-ci est elle-même due à la perception précoce de signaux de qualité de lumière influant sur la dynamique de tallage. Comprendre les stratégies des variétés de blé selon le type d’interaction plante-plante contribue ainsi à une meilleure sélection pour leur aptitude au mélange.doi.org/10.1016/j.fcr.2024.109368

• Amélioration de la prédiction et de la compréhension des interactions génotypes x environnements par intégration de données multi-omiquesDes données de transcriptomique peuvent être considérablement plus efficaces que les marqueurs de polymorphisme de l’ADN pour prédire les interactions génotypes x environnements. Ces données nous ont également permis de gagner en résolution et en puissance de détection dans les analyses d’association, démontrant ainsi leur complémentarité par rapport aux puces SNP.doi.org/10.1007/s00122-024-04679-w

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Recueil des faits marquants 2024

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité P3F - Faits marquants 2024 (département BAP)

• Analyse de la compétition et de la complémentarité entre espèces dans les associations luzerne-graminées fourragères pour des prairies multi-services Les associations luzerne - graminée fourragère permettent de d’obtenir une prairie productive et de bonne valeur alimentaire, tout en limitant l’envahissement par des adventices et en fournissant des reliquats azotés pour la culture suivante. L’estimation des effets directs et associés de la graminée dans le mélange permet de bien illustrer les compétitions. Une complémentarité se met en place après 3 ans de culture concernant l’azote et la croissance.doi.org/10.1007/s11104-024-06479-z et doi.org/10.1016/j.fcr.2024.109308

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Recueil des faits marquants 2024

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Biologie et Amélioration des Plantes

UMR IPS2 - Faits marquants 2024 (département BAP)

• Sexe des plantes, attractivité des pollinisateurs et développement des fruitsPublication de trois études portant sur les mécanismes moléculaires contrôlant le sexe des plantes fleurs, les avancées en phénotypage des interactions plantes-pollinisateurs et la nouaison des fleurs. Ces travaux lient recherche fondamentale et applications agricoles, en répondant aux défis liés à la reproduction végétale, à l’adaptation climatique et à l’amélioration des rendements.doi.org/10.1038/s41467-024-49250-9doi.org/10.1016/j.molp.2024.06.011doi.org/10.1016/j.tplants.2024.06.007

• Laboratoire International Associé ‘LIA HortiLab’ France-ChineDans le cadre du partenariat associant l'UMR IPS2, l'UMR RDP et Huazhong Agricultural University-Wuhan-Chine, le Laboratoire International Associé ‘HortiLab’ a été créé dans le domaine de l’horticulture et des plantes ornementales.

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Recueil des faits marquants 2024

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Biologie et Amélioration des Plantes

UMR Agroécologie - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

Le pôle LEGAE - Génétique et écophysiologie des légumineuses pour l’Agroécologie et l’alimentation (Legumes Ecophysiology and Genetics for agroecology)Ce pôle étudie la génétique et l’écophysiologie des légumineuses à graines pour l’agroécologie et l’alimentation via une approche multidisciplinaire (génétique, écophysiologie, physiologie moléculaire). L’enjeu des recherches est de concevoir des idéotypes de légumineuses servant de leviers pour développer des régulations biologiques et des systèmes de culture plus économes en intrants et sources de protéines végétales et de nutriments de qualité. Les enjeux scientifiques sont d’acquérir des connaissances sur les déterminants génétiques et physiologiques à la base de l’adaptation des légumineuses à graines aux systèmes de culture agroécologiques et impliqués dans le contrôle de la qualité nutritionnelle, organoleptique et technologique des graines. Pour répondre à ces enjeux, 2 équipes développent des recherches plus spécifiquement en lien avec les objectifs de BAP : Equipe ECP (Génétique et génomique des Espèces Cibles Protéagineuses). Les principales recherches visent à :

• Caractériser les ressources génétiques et développer des outils biochimiques, génétiques, génomiques et bioinformatiques nécessaires pour comprendre le fonctionnement des légumineuses à graines ;
• Décrire la diversité du système racinaire nodulé des légumineuses, et de ses interactions avec les micro-organismes rhizosphériques ;
• Comprendre les mécanismes qui contrôlent la résistance aux insectes ravageurs (bruches, sitones) et donc la qualité des graines de légumineuses ;
• Comprendre et améliorer les interactions plante-plante dans les systèmes de culture agroécologiques (cultures associées, adventices) ;
• Contribuer au pré-breeding par l’identification de géniteurs, le développement de marqueurs moléculaires liés à des traits d’intérêt et l’application de la génomique translationnelle.

Equipe FILEAS (Remplissage de la graine, remobilisation NS, et stress abiotiques de fin de cycle). Les recherches visent à :

• Améliorer la qualité des graines de légumineuses pour l’alimentation humaine
• Stabiliser le rendement et la qualité des graines dans un contexte de changement climatique associé à des carences minérales.
• Identifier des gènes candidats et développer des ressources/outils pour la validation fonctionnelle de ces gènes et l’amélioration variétale.

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Biologie et Amélioration des Plantes

UMR IRHS - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

Le projet d’unité vise à déchiffrer les mécanismes qui sous-tendent la durabilité de la santé des plantes et des qualités des semences et cultures spécialisées dans le contexte de la transition agroécologique. Dans les champs de BAP, les recherches portent notamment sur :

• L’immunité végétale pour l’adaptation aux changements environnementaux et la durabilité de l’immunité
• Le pilotage du microbiote pour améliorer la vigueur des plantes dès les étapes précoces de germination-levée
• L’impact du changement climatique sur des caractères d’intérêt
• Le développement de marqueurs isotopiques de la qualité des semences et la régulation des flux métaboliques et du transport phloémien par la photosynthèse
• La compréhension de l'histoire de la sélection du rosier et de son principal bioagresseur fongique
• L'innovation variétale pour des systèmes de culture innovants, sur pomoïdés et apiacées

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité IGEPP - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité P3F - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

Le projet d'unité vise à améliorer les services rendus par les couverts prairiaux via la génétique et les pratiques culturales dont en particulier la valorisation des ressources génétiques et l'élaboration de schémas de sélection inovants (sélection génomique, sélection pour une utilisation en mélange).

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité XXX - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

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Les Grands Objectifs Scientifiques (GOS) du département BAP :

• GOS 1 : Gérer, décrire et analyser la diversité génétique et épigénétique pour comprendre le fonctionnement et l’adaptation des plantes et des peuplements végétaux ;
• GOS 2 : Comprendre la réponse des plantes et des peuplements végétaux aux stress climatiques, nutritifs et biotiques pour les adapter au changement climatique en systèmes agroécologiques ;
• GOS 3 : Identifier, comprendre et mobiliser les fonctions et les traits des plantes à la base des services pour la santé humaine/animale et environnementale ;
• GOS 4 : Améliorer les plantes et les peuplements en mobilisant les outils d’aide à la sélection pour les systèmes de cultures innovants.

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité IJPB - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

Les recherches menées à l’IJPB s’articulent autour de 3 grands axes de recherche et de trois projets phares, en synergies avec les quatre Grands Objectif Scientifiques du département BAP - Plus d'infos >>> Les priorités scientifiques de l'IJPB à court terme visent à renforcer :

• Les activités de l'unité sur les nouvelles techniques de sélection végétale ;

• L’intégration des données issues d’outils de visualisation avancés dans des modèles multi-échelles afin de comprendre comment les modifications à l’échelle nanométrique déterminent l’organisation cellulaire et les fonctions biologiques à l’échelle macroscopique ;

• Les recherches sur les bases génétiques des interactions plantes x environnement abiotique ;

• Le continuum de recherche entre diversité génétique, diversité environnementale et variabilité des produits biosourcés, en nous appuyant sur notre double tutelle avec le département TRANSFORM.

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Les Grands Objectifs Scientifiques (GOS) du département BAP :

• GOS 1 : Gérer, décrire et analyser la diversité génétique et épigénétique pour comprendre le fonctionnement et l’adaptation des plantes et des peuplements végétaux ;
• GOS 2 : Comprendre la réponse des plantes et des peuplements végétaux aux stress climatiques, nutritifs et biotiques pour les adapter au changement climatique en systèmes agroécologiques ;
• GOS 3 : Identifier, comprendre et mobiliser les fonctions et les traits des plantes à la base des services pour la santé humaine/animale et environnementale ;
• GOS 4 : Améliorer les plantes et les peuplements en mobilisant les outils d’aide à la sélection pour les systèmes de cultures innovants.

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité GDEC - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

L’Unité Mixte de Recherche GDEC « Génétique, Diversité et Ecophysiologie des Céréales » développe, avec le blé comme objet d’étude, un projet de recherche pluridisciplinaire porteur d’une double ambition : acquérir des connaissances fondamentales sur les processus biologiques à l’origine de la capacité d’adaptation des blés aux contraintes environnementales, puis sur la base de ces découvertes caractériser et exploiter les ressources génétiques pour la conception de variétés répondant aux enjeux sociétaux liés au changement climatique et à la transition agro-écologique. L’Unité GDEC s’appuie sur six équipes de recherche organisées en deux pôles scientifiques. - Dans le premier pôle, trois équipes de recherche ont pour objectif commun de comprendre l’impact de l'organisation, de la régulation et de l’évolution des (épi)-génomes des blés sur la genèse de la diversité génétique moderne utilisée en sélection. PaleoEVO Disséquer et exploiter les bases moléculaires de plasticité génomique post-polyploïdie source d’adaptation aux contraintes. GOS* BAP #1, GeCO Comprendre et débloquer le contrôle fonctionnel et structural de la recombinaison. GOS* BAP #1-2, DIGEN Comprendre et exploiter la diversité (épi)génomique des Triticeae. GOS* BAP #1-4. - Pour le second pôle, trois équipes de recherche cherchent quant à elles à caractériser les bases génétiques, (épi)-génétiques, moléculaires et physiologiques de caractères agronomiques majeurs, tels que la stabilité du rendement, la qualité et la tolérance aux stress biotiques (maladies) et abiotiques (nutritionnel, hydrique, thermique), seuls ou en association. QualiGrain Maintien de la qualité d’utilisation, la valeur nutritionnelle et la valeur santé sous contraintes environnementales. GOS* BAP #2-3. VISTA Variabilité des composantes de rendement comme source de stabilité sous contraintes abiotiques. GOS* BAP #1-2. PHI Identifier et caractériser de nouvelles sources plus durables de résistance aux maladies. GOS* BAP #1-2. Pour le développement de leurs projets, les équipes de recherche de l’UMR GDEC bénéficient de l’appui des activités R&D de plateformes dotées des équipements les plus récents et de leurs expertises uniques : - GENTYANE pour le séquençage et génotypage haut débit ; - Validation Fonctionnelle pour l'analyse fonctionnelle par transgénèse et l'édition des génomes ;- VEGEPOLE pour les expérimentations en conditions contrôlées grâce à 5500m² de dispositifs de types serres et chambres de cultures ; - Centre de Ressources Biologiques Céréales à paille pour la caractérisation et l'exploitation d'une collection de ~27000 accessions dont environ 12 000 représentant la diversité des blés mondiaux ; - BIOINFO pour l'analyse des données génomiques grâce aux ressources et outils bioinformatiques disponibles au sein de l’unité et sur le site au Mésocentre et la plateforme AuBi.

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*GOS : Grands Objectifs Scientifiques

Les Grands Objectifs Scientifiques (GOS) du département BAP :

• GOS 1 : Gérer, décrire et analyser la diversité génétique et épigénétique pour comprendre le fonctionnement et l’adaptation des plantes et des peuplements végétaux ;
• GOS 2 : Comprendre la réponse des plantes et des peuplements végétaux aux stress climatiques, nutritifs et biotiques pour les adapter au changement climatique en systèmes agroécologiques ;
• GOS 3 : Identifier, comprendre et mobiliser les fonctions et les traits des plantes à la base des services pour la santé humaine/animale et environnementale ;
• GOS 4 : Améliorer les plantes et les peuplements en mobilisant les outils d’aide à la sélection pour les systèmes de cultures innovants.

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité CNRGV - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

Le CNRGV se positionne dans les GOS*1 et 2 du département BAP. Il apporte un support pour les équipes de recherche du département pour produire et intégrer des données génomiques de très haute qualité, qui seront la base pour mieux comprendre le fonctionnement des organismes. Pour cela, le CNRGV propose des méthodes pour accélérer la production de données fiables et étendues et identifier des gènes cibles et allèles à fort potentiel pour l’amélioration variétale.

*GOS : Grands Objectifs Scientifiques

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Les Grands Objectifs Scientifiques (GOS) du département BAP :

• GOS 1 : Gérer, décrire et analyser la diversité génétique et épigénétique pour comprendre le fonctionnement et l’adaptation des plantes et des peuplements végétaux ;
• GOS 2 : Comprendre la réponse des plantes et des peuplements végétaux aux stress climatiques, nutritifs et biotiques pour les adapter au changement climatique en systèmes agroécologiques ;
• GOS 3 : Identifier, comprendre et mobiliser les fonctions et les traits des plantes à la base des services pour la santé humaine/animale et environnementale ;
• GOS 4 : Améliorer les plantes et les peuplements en mobilisant les outils d’aide à la sélection pour les systèmes de cultures innovants.

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité EPGV - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité URGI - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

L’URGI a des activités de R&D dans les domaines suivants : - Intégration de connaissance dans des bases de données graphes - Amélioration des services de la plateforme assistés par l’IA

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité AGAP-Corse - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

L'unité contribue par ses travaux aux axes 1.1, 1.2 et 1.3 du GOS*1 avec la caractérisation et valorisation de la collection de San Giuliano de près de 1000 génotypes d'agrumes, une analyse de la dynamique et du rôle adaptatif de la diversité infraspécifique, et l'analyse de l'impact des séquences répétées génomiques sur la régulation des gènes. L'unité contribue aussi à l'axe 2.1 du GOS*2 par ses travaux sur l'impact de la polyploidie sur l'adaptation aux contraintes environnementales et la caractérisation des compostions en huile essentielles en lien avec les stress. Enfin l'unté contribue aussi au GOS*4 en intégrant les connaissances pour créer et sélectionner du matériel végétal innovant.

*GOS : Grands Objectifs Scientifiques

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Les Grands Objectifs Scientifiques (GOS) du département BAP :

• GOS 1 : Gérer, décrire et analyser la diversité génétique et épigénétique pour comprendre le fonctionnement et l’adaptation des plantes et des peuplements végétaux ;
• GOS 2 : Comprendre la réponse des plantes et des peuplements végétaux aux stress climatiques, nutritifs et biotiques pour les adapter au changement climatique en systèmes agroécologiques ;
• GOS 3 : Identifier, comprendre et mobiliser les fonctions et les traits des plantes à la base des services pour la santé humaine/animale et environnementale ;
• GOS 4 : Améliorer les plantes et les peuplements en mobilisant les outils d’aide à la sélection pour les systèmes de cultures innovants.

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité IPSIM - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité LEPSE - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

Le projet du LEPSE vise à relever le défi majeur de l'adaptation au changement climatique en traitant plus particulièrement des combinaisons de restrictions d'eau, de températures élevées, de vagues de chaleur, de demandes évaporatives extrêmes, d'interactions avec le CO2 élevé. L’objectif global est de fournir des outils, des modèles et des connaissances capables de contribuer à l'évaluation, dans un large contexte géographique et temporel, des pratiques de gestion innovantes (y compris celles inspirées par l'agroécologie), des variétés existantes et à créer et, dans certains cas, à l'évaluation croisée des performances des espèces. Les travaux du LEPSE contribuent à l’intégration de l’échelle plante aux échelles supra, notamment de la parcelle cultivée.

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité ASTRO - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

Au sein de l’unité, les recherches concernant le département BAP portent sur la création, la caractérisation et la diffusion de génotypes d’ignames (notamment via le CRB-PT) avec un focus sur la sélection de génotypes d’ignames résistants aux maladies (marqueurs génétiques et phénotypage), présentant des aptitudes à la transformation et avec une qualité nutritionnelle élevée. Un dispositif de phénotypage au champ des génotypes d'ignames du CRB a été mis en place et devrait être la base du déploiement d'un programme de sélection participative.

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité RDP - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

Le laboratoire RDP mène des recherches fondamentales visant à acquérir une compréhension quantitative et multi-échelle (du génome à l'organisme) du développement et de l'évolution des organes des plantes, avec un focus particulier sur les structures reproductrices (de la formation des fleurs au développement des graines). Les projets liés aux objectifs du département BAP se concentrent en particulier sur les déterminants génétiques, génomiques et moléculaires du développement, de la morphogenèse et de la reproduction chez les plantes modèles et les plantes d'intérêt agronomique et ornemental. Les projets du laboratoire s’inscrivent dans le cadre de la biologie quantitative et utilisent des approches multidisciplinaires, notamment la biophysique, la bio-informatique et la modélisation informatique et mathématique, afin d'étudier les bases moléculaires et physiques de la morphogenèse végétale.

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité LPCV - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

Le projet d’unité vise à déchiffrer les mécanismes qui sous-tendent le développement des plantes, la qualité des semences dans le contexte de la transition agroécologique ainsi que la production de biomolécules par les espèces de microalgues pour les biotechnologies et les bioénergies. Dans les champs du département BAP, les recherches sont développées chez des modèles de plantes et de microalgues et portent sur les mécanismes fondametaux de la photosynthèse, les flux de carbone au sein du métabolisme et la production de molécules denses en carbone, en particulier les lipides. L'unité étudie aussi les interactions avec les paramètres de l'environnement, en particulier la température, les nutriments phosphatés et azotés et les métaux lourds. L'unité déchiffre enfin le controle génétique et épigéntique du développement des plantes au niveau des organes floraux.

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité LIPME - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

• Sélection génomique
• Services écosystémiques
• Interactions plante-plante
• Santé des plantes

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité EGFV - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

Les activités de l’unité 1287 Ecophysiologie et Génomique Fonctionnelle de la Vigne sont actuellement centrées sur l’étude des interactions vigne/environnement abiotique. En combinant diverses approches, EGFV vise à comprendre les bases moléculaires, génétiques, épigénétiques et physiologiques de la réponse de la vigne aux contraintes environnementales et à établir les liens entre génotypes et phénotypes en mobilisant les concepts de la biologie intégrative. L’enjeu est principalement d’adapter les génotypes (sélection des porte-greffes), mais aussi les pratiques culturales pour adapter la viticulture aux enjeux qui sont ceux du changement climatique et de la transition agroécologique. Son objet de recherche est la Vigne, à des échelles qui vont principalement du gène à la plante entière avec un focus sur le système racinaire d’une part et sur le fruit d’autre part. Par rapport au Schéma stratégique du département BAP 2020-2025, ces recherches s’inscrivent principalement - dans le GOS*-1 « Gérer, décrire et analyser la diversité génétique et épigénétique pour comprendre le fonctionnement et l’adaptation des plantes aux végétaux »- dans le GOS - 2 « comprendre la réponse des plantes et des peuplements végétaux aux stress climatiques, nutritifs et biotiques pour les adapter au changement climatique en systèmes agroécologiques»- et le GOS - 4 : « améliorer les plantes et les peuplements en mobilisant les outils d’aide à la sélection pour les systèmes de culture innovants ». L’ensemble des champs thématiques sont couverts par les projets de l’UMR, soit - le CT**- 1 « Fonctionnement, dynamique et évolution des génomes (thème GENEPI, animé par P. Gallusci), - le CT - 2 « fonctionnement des plantes et des peuplements en interaction avec l’environnement » (thèmes ROOTI, QualyGRAPe et ADAPT), - et le CT - 3 « diversité génétique, adaptation et sélection » (thèmes ROOTI, GENEPI et ADAPT) pour ce qui est de la sélection des porte-greffes ou de la caractérisation de dispositifs lourds et de long terme (VitAdapt, GreffAdapt).

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*GOS : Grands Objectifs Scientifiques** CT : Champ Thématique

Les Grands Objectifs Scientifiques (GOS) du département BAP :

• GOS 1 : Gérer, décrire et analyser la diversité génétique et épigénétique pour comprendre le fonctionnement et l’adaptation des plantes et des peuplements végétaux ;
• GOS 2 : Comprendre la réponse des plantes et des peuplements végétaux aux stress climatiques, nutritifs et biotiques pour les adapter au changement climatique en systèmes agroécologiques ;
• GOS 3 : Identifier, comprendre et mobiliser les fonctions et les traits des plantes à la base des services pour la santé humaine/animale et environnementale ;
• GOS 4 : Améliorer les plantes et les peuplements en mobilisant les outils d’aide à la sélection pour les systèmes de cultures innovants.

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité SVQV - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

Les recherches de l'unité sont en liens étroits avec les objectifs du département BAP : - GOS*1 : Gérer, décrire et analyser la diversité génétique et épigénétique pour comprendre le fonctionnement et l’adaptation des plantes et des peuplements végétaux : 1.3 Comprendre et prédire l’expression des gènes et leur impact au niveau plante et peuplement - GOS*2 : Comprendre la réponse des plantes et des peuplements végétaux aux stress climatiques, nutritifs et biotiques pour les adapter au changement climatique en systèmes agroécologiques : 2.2 Comprendre et valoriser les mécanismes de l’immunité végétale pour faire face à la réduction des pesticides - GOS*3 : Identifier, comprendre et mobiliser les fonctions et les traits des plantes à la base desservices pour la santé humaine/animale et environnementale : 3.1 Comprendre et améliorer le métabolisme pour la qualité des produits - GOS*4 : Améliorer les plantes et les peuplements en mobilisant les outils d’aide à la sélection pour les systèmes de cultures innovants: 4.2 Développement d’outils d’aide à la sélection et évaluation de l’innovation

*GOS : Grands Objectifs Scientifiques

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité BioEcoAgro - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

• Adaptation multifonctions miscanthus pour production, transformation, services écosystémiques
• Adaptation froid pois/légumineuses

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité BFP - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

BFP contribue aux champs thématiques (CT) de BAP, avec par ordre d’importance : - le CT2 (« Fonctionnement des plantes et des peuplements en interaction avec l’environnement »), - le CT1 (« Fonctionnement, dynamique et évolution des génomes ») - et le CT3 (« Diversité génétique, adaptation et sélection »). Les travaux de BFP, menés sur des espèces modèles et/ou d’intérêt agronomique (tomate, fraisier, cerisier, abricotier…), mais aussi avec de la diversité intra et interspécifique, vont du très en amont (chimie, biochimie, génomique, épigénomique, biologie de synthèse) au très en aval (épidémiologie, étiologie, stratégies de lutte contre des pathogènes, sélection variétale). Ils répondent aux grands objectifs scientifiques (GOS) du département BAP : - utilisation de la diversité génétique pour produire des connaissances sur le fonctionnement et l’adaptation des plantes (GOS1), - étude des réponses aux stress abiotiques (notamment chaleur et sécheresse) et biotiques (virus et phytoplasmes) (GOS2), - services pour la santé humaine (antioxydants) et environnementale (alternatives aux pesticides) (GOS3) - amélioration des plantes à l’aide d’outils innovants (prédiction de la performance, identification de leviers génétiques pour la sélection de variétés résistantes aux virus et adaptées aux futures conditions climatiques, développement d’outils moléculaires et de matériel végétal innovant et étude de pangénomes) (GOS4)

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité BFP - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

BFP contribue aux champs thématiques (CT) de BAP, avec par ordre d’importance : - le CT2 (« Fonctionnement des plantes et des peuplements en interaction avec l’environnement »), - le CT1 (« Fonctionnement, dynamique et évolution des génomes ») - et le CT3 (« Diversité génétique, adaptation et sélection »). Les travaux de BFP, menés sur des espèces modèles et/ou d’intérêt agronomique (tomate, fraisier, cerisier, abricotier…), mais aussi avec de la diversité intra et interspécifique, vont du très en amont (chimie, biochimie, génomique, épigénomique, biologie de synthèse) au très en aval (épidémiologie, étiologie, stratégies de lutte contre des pathogènes, sélection variétale). Ils répondent aux grands objectifs scientifiques (GOS) du département BAP : - utilisation de la diversité génétique pour produire des connaissances sur le fonctionnement et l’adaptation des plantes (GOS1), - étude des réponses aux stress abiotiques (notamment chaleur et sécheresse) et biotiques (virus et phytoplasmes) (GOS2), - services pour la santé humaine (antioxydants) et environnementale (alternatives aux pesticides) (GOS3) - amélioration des plantes à l’aide d’outils innovants (prédiction de la performance, identification de leviers génétiques pour la sélection de variétés résistantes aux virus et adaptées aux futures conditions climatiques, développement d’outils moléculaires et de matériel végétal innovant et étude de pangénomes) (GOS4)

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Les Grands Objectifs Scientifiques (GOS) du département BAP :

• GOS 1 : Gérer, décrire et analyser la diversité génétique et épigénétique pour comprendre le fonctionnement et l’adaptation des plantes et des peuplements végétaux ;
• GOS 2 : Comprendre la réponse des plantes et des peuplements végétaux aux stress climatiques, nutritifs et biotiques pour les adapter au changement climatique en systèmes agroécologiques ;
• GOS 3 : Identifier, comprendre et mobiliser les fonctions et les traits des plantes à la base des services pour la santé humaine/animale et environnementale ;
• GOS 4 : Améliorer les plantes et les peuplements en mobilisant les outils d’aide à la sélection pour les systèmes de cultures innovants.

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Biologie et Amélioration des Plantes

Unité GAFL - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

Les recherches de l'unité s'inscrivent dans les 4 grands objectifs scientifiques de BAP. En lien avec les 2 CRB hébergés, une priorité de l'unité vise à maintenir, caractériser et valoriser les ressources génétiques des espèces légumières et fruitières méditerranéennes. Les enjeux sont de caractériser:

• des nouveaux mécanismes de résistance par perte de sensibilité, la diversité allélique et d’homologues des R-gènes par séquençage ciblé et les résistances quantitatives pour de nombreux agresseurs, construire la durabilité des résistances, évaluer la robustesse en conditions de multistress
• la résilience chez les Prunus, en prenant en compte de multiples bioagresseurs, sur la base d’essais multisites et des méthodes de phénotypage instrumenté
• les bases génétiques et génomiques des capacités d’adaptation des plantes aux stress climatiques et nutritifs chez la tomate
• le compromis entre les fonctions de défense et réponse aux stress et celles de production

De nouveaux traits sont également explorés telles que les interactions biotiques favorables, comme l’attractivité des pollinisateurs chez les Cucurbitacées. Enfin, l'unité développe des recherches pour accélerer la sélection variétale :

• sélection multicaractère, phénomique et génomique
• édition des génomes, y compris chez les espèces récalcitrantes pour valider de nouveaux gènes et créer de nouveaux allèles
• combinaisons de gènes pour des traits d’intérêt chez les Prunus et la tomate

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Départements BAP

Biologie et Amélioration des Plantes

Unité AGAP Institut - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

Les recherches et activités d’AGAP Institut (1334) s’inscrivent de façon majoritaire dans les Grands Objectifs Scientifiques (GOS) 1, 2 et 4 du département BAP (Schéma stratégique de département 2021-2025). Un des axes de recherche majeurs au sein de l'unité AGAP est dédié à l’analyse de la diversité génétique des plantes cultivées, la compréhension de sa structure et de sa dynamique évolutive, passée et en prospective. Dans ce contexte l'unité contribue aux axes 1.1 et 1.2 du GOS1. L’unité a une forte implication dans l’étude des mécanismes de réponse des plantes et des peuplements à des contraintes environnementales, contribuant ainsi aux objectifs de l’Axe 2.1 du GOS2. A l’interface entre les GOS1, GOS2 et GOS4, l'unité développe des recherches et des analyses de type GWAS pour identifier les traits impliqués dans les différents caractères recherchés en amélioration et décrypter leur déterminisme génétique : qualité des produits, résistances aux principaux pathogènes, adaptation de la phénologie et régularité des productions, interactions plante x plante et plante x microorganismes. Ses recherches dans les GOS 1, 2 et 3 contribuent très largement au sein de l’unité au GOS4 - Améliorer les plantes et les peuplements en mobilisant les outils d’aide à la sélection pour les systèmes de cultures innovants.

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Les Grands Objectifs Scientifiques (GOS) du département BAP :

• GOS 1 : Gérer, décrire et analyser la diversité génétique et épigénétique pour comprendre le fonctionnement et l’adaptation des plantes et des peuplements végétaux ;
• GOS 2 : Comprendre la réponse des plantes et des peuplements végétaux aux stress climatiques, nutritifs et biotiques pour les adapter au changement climatique en systèmes agroécologiques ;
• GOS 3 : Identifier, comprendre et mobiliser les fonctions et les traits des plantes à la base des services pour la santé humaine/animale et environnementale ;
• GOS 4 : Améliorer les plantes et les peuplements en mobilisant les outils d’aide à la sélection pour les systèmes de cultures innovants.

Départements BAP

Biologie et Amélioration des Plantes

Unité GQE-Le Moulon - Les recherches en lien avec les objectifs du département BAP

L’un des objectifs de l'unité GQE est de comprendre et éclairer les mécanismes de l’évolution. Ses recherches contribuent à une meilleure compréhension des sources de variation génétique et épigénétiques qui façonnent la diversité phénotypique. Au fil des années, GQE a développé des ressources génétiques chez différentes espèces (colza, nigelle, maïs, pommier…) qui permettent d’explorer le rôle de différents (epi)variants dans la diversité phénotypique à différentes échelles, du phénotype moléculaire (transcriptome, protéome) jusqu’au phénotype mesuré sur des plantes au champ. GQE s’intéresse à l’échelle génomique, au rôle des éléments cis-régulateurs, aux petits éléments non-codants comme les sRNAs, aux patrons de méthylation de l’ADN, etc. La spécificité de GQE est de travailler à l’échelle du génome, dans des populations de plantes, et de développer des modèles mathématiques permettant d’utiliser les données expérimentales pour reconstruire des réseaux biologiques. Un autre objectif est de comprendre et prédire les bases génétiques des interactions, en mobilisant les compétences en génétique quantitative des différentes équipes pour aborder la question des interactions biologiques à différentes échelles, des interactions génétiques (dominance, épistasie) aux interactions biotiques (entre individus d’espèces différentes), en passant par les interaction génotype x environnement (GxE) et les interactions plantes-plantes (GxGxE) mesurées à l’échelle individuelle ou à l’échelle d’un peuplement. Pour cela GQE bénéficie de matériel génétique original (populations, panels de diversité, ...) bien caractérisé sur différentes espèces comme blé, maïs, haricot, pommier, et de collaborations bien établies (par exemple, au sein de l’IDEEV sur les interactions maïs-foreurs de tiges). L’expertise de GQE est reconnue concernant l’intégration de données omiques et la caractérisation des interactions GxE. L’objectif de GQE est de développer des outils méthodologiques pour la modélisation et la prédiction des interactions, et des outils d’aide à la sélection de mélanges variétaux ou mélanges d’espèces dans un objectif de diversification des parcelles agricoles. Le dernier objectif de GQE est de comprendre et mobiliser la diversité cultivée pour répondre aux attentes des acteurs. En phase avec le GOS3 de BAP, il s’agit de mobiliser les connaissances opérationnelles sur les ressources génétiques des plantes cultivées et les compétences en méthodologie de la sélection de plantes allogames ou autogames pour répondre aux enjeux de la transition agroécologique liés à la diversification.

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Départements BAP

Biologie et Amélioration des Plantes

Unité Mixte de Recherche SVQV

Santé de la Vigne et Qualité du Vin

Mots clés : • Vigne • Vin • Résistance • Qualité • Virus• Vecteurs

Thématique de recherche :

Les thématiques s’inscrivent dans le contexte général de réduction de l'utilisation de fongicides et de durabilité de la culture de la vigne, incluant l'adaptation au changement climatique. Des thématiques en virologie sur vigne et hôtes herbacés, dont la betterave, visent à comprendre les interactions plantes-virus-vecteurs afin de proposer des pistes pour maitriser la dispersion des virus.

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Axes de recherche

• Méthodologie de sélection variétale & matériel végétal afférent
• Déterminants de le recombinaison génétique chez la vigne et conséquences
• Mise en œuvre de résistances aux champignons et aux virus chez la vigne
• Déterminants génétiques de la typicité des vins
• Métabolisme secondaire de la vigne et résistance aux maladies
• Biologie des multi-infections virales
• Biologie de la transmission des virus
• Contrôle les symptômes par prémunition
• Recherches participatives permettant la conception de pratiques agricoles, éco-nomiquement durable et minimisant leur impact sur l’environnement

Compétences et expertises :

• Métabolomique
• Pathologie végétale
• Virologie

• Génétique

• Génomique
• Transcriptomique

Infos administratives :

• Effectif : 80 agents (dont 50 permanents)
• Adresse : 28 rue de Herrlisheim - 68000 Colmar
• Centre INRAE : Grand Est-Colmar
• Départements scientifiques : BAP, SPE

Principal modèle d'études :

Créations variétales

• Vigne

Dispositifs particuliers :

Plateformes

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale DiaScope

Domaine Expérimental de Melgueil

Labellisations et certifications :

• ISC et ISO14001 (SME)

Systèmes de culture :

• Agriculture biologique
• Bas intrants
• Agroforesterie
• Scénarios hydriques différenciés

Localisations : Mauguio (34)Centre INRAE Occitanie-Montpellier Unités partenaires : AGAP, LEPSE, IJPB, GQE, LIPME, ABSys Département scientifique : BAP Effectif : 14 agents SAU : 70 ha

Types de culture :

• Grandes cultures
• Cultures fuitières

Conditions climatiques : Type de sol :

Réseau CLIMATIK

Méditerranéen

Sols alluviaux calcaires et sols fersialitiques

Cultures :

• Protéagineux (pois chiche, pois d'hiver)
• Pommiers
• Oliviers

• Blé
• Maïs
• Sorgho

CRB

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Thématiques

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale U2E

Unité Expérimentale du domaine d'Epoisses

Labellisations et certifications :

• ISC et ISO 14001 (SME)

Système de culture :

Localisations : Bretenière (21)Centre INRAE Bourgogne-Franche-Comté Unité partenaire : Agroécologie Départements scientifiques : BAP, AgroEcoSystem, SPE 17 agents SAU : 130 ha

• Agroécologie

Type de culture :

• Grandes cultures

Conditions climatiques : Type de sol :

Réseau CLIMATIK

Semi-continental

Réseau CAREX

Argilo-calcaire (30 à 50 % argile)

Cultures :

• Blé
• Orge
• Triticale
• Maïs
• Colza

• Moutarde
• Tournesol
• Soja
• Lin
• Chanvre

• Pois
• Féverole
• Lupin
• Pois chiche
• Cultures intermédiaires multi-services

CRB

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Thématiques

Site web unité

Contact

Unité Mixte de Recherche LPCV

Laboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale

Mots clés : • Plantes & algue • Photosynthèse • Métabolisme • Floraison • Stress • Cytosquelette

Thématique de recherche :

Le laboratoire étudie l’organisation fonctionnelle des cellules eucaryotes (plantes, micro-algues, cellules humaines, levures) avec un focus spécifique sur les cellules végétales et les micro-algues

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Axes de recherche

• Photosynthèse et métabolisme
• Morphogenèse et développement
• Réponse et adaptation à un environnement abiotique changeant

Compétences et expertises :

• Biochimie
• Biologie cellulaire
• Biologie moléculaire
• Bioinformatique
• Statistique

Principaux modèles d'études :

• Arabidopsis
• Cameline
• Chimie verte
• Micro-algues

Infos administratives :

• Effectif : 100 agents (dont 60 permanents)
• Adresse : 17 avenue des Martyrs - 38 054 Grenoble
• Centre INRAE : Lyon-Grenoble Auvergne-Rhône-Alpes
• Département scientifique : BAP

Dispositifs particuliers :

Plateformes

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche RDP

Laboratoire de Reproduction et de Développement des Plantes

Mots clés : • Développement et reproduction • Plantes • Biologie cellulaire • Biophysique

Thématique de recherche :

Les recherches portent sur la compréhension quantitative multi-échelle du développement et de l’évolution des structures reproductives des plantes.

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Axes de recherche

• Biologie et évolution du développement des plantes et de leurs systèmes de reproduction
• Biologie prédictive : rôle des signaux biochimiques et mécaniques dans la morphogénèse
• Problématiques sociétales : anthropocène, agriculture, architecture et urbanisme

Compétences et expertises :

• Biophysique
• Bioinformatique
• Modélisation

• Génétique
• Génomique
• Biologie cellulaire

Principaux modèles d'études :

• Maïs
• Pétunia
• Rose
• Arabidopsis

Infos administratives :

• Effectif : 122 agents (dont 67 permanents)
• Adresse : 46 rue d'Italie - 69364 Lyon
• Centre INRAE : Lyon-Grenoble Anuvergne-Rhône-Alpes
• Département scientifique : BAP

Dispositifs particuliers :

Plateformes

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale Maïs

Labellisations et certifications :

Unité Maïs

• ISC

Localisations : Saint-Martin-de-Hinx (40)Centre INRAE Nouvelle-Aquitaine Bordeaux Unité partenaire : GQE, LEPSE, AGAP Département scientifique : BAP 5 agents SAU : 45 ha

Systèmes de culture :

• Une parcelle en transition agroécologique
• Essai azote limitant

Type de culture :

Conditions climatiques : Type de sol :

Réseau CLIMATIK

Océanique

Sablo-limoneux Sols battants à faibles taux de matière organique et légèrement acide

• Grandes cultures

Cultures principales :

• Maïs
• Sorgho

web et contact à mettre à jour

CRB

Thématiques

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche BioEcoAgro

Unité Transfrontalière BioEcoAgro

Mots clés : •Miscanthus •Légumineuses •Systèmes bas-intrants •Carbone •Azote •Gaz à effet de serre

Thématique de recherche :

Les recherches, à l'échelle de l'unité, portent sur l’ingénierie biologique appliquée à l’agriculture, la biotechnologie, l’agro-alimentaire et l’environnement ("du champ à l'assiette, en incluant santé animale et humaine")

Mission et enjeux

Axes de recherche

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

• Systèmes de culture innovants pour la transition agro-écologique et bioéconomique dans le contexte du changement climatique
• Biomolécules d’origine végétale et microbienne : de l’identification à la bioproduction
• Formulation - qualité et sécurité des aliments nutrition - santé

Compétences et expertises :

A l'échelle du département BAP

Créations variétales

• Génétique
• Ecophysiologie

Principaux modèles d'études :

Lien prochainement actif

A l'échelle du département BAP

Infos administratives :

• Miscanthus

• Pois / Légumineuses

• Effectif : 33 agents INRAE sur les 370 agents de l'unité (dont 170 permanents - dont 25 agents INRAE)
• Adresse : 180 rue Pierre Gilles de Gennes 02 000 Barenton Bugny
• Centre INRAE : Hauts-de-France

• Départements scientifiques : AgroEcoSystem, BAP

Plus largement

• Systèmes de grande culture conventionnels et bas intrants

Dispositifs particuliers :

Plateformes

Station ICOS

Contact

Site web d'unité

Unité de Service URGI

Unité Ressources Génomique-Info

s'inscrit dans le Labex SPS Univ Paris-Saclay

Mots clés : •Bioinformatique •Gestion de données •FAIR •Annotation de génomes •Eléments transposables

Thématique :

L'URGI est une plateforme bioinformatique qui soutient différentes activités de recherche sur les plantes d’intérêt agronomique et forestières pour INRAE.

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Offre de services :

• Gestion des données suivant les principes FAIR

• Support à des fédérations internationales de systèmes d’information de données en agronomie

• Annotation des génomes avec le pipeline d’annotation haut débit d’éléments transposables : REPET
• Méthodes et outils pour l’intégration de données hétérogènes

Compétences et expertises :

• Génomique
• Génétique
• Bioinformatique

Portail de données

Principaux modèles d'études :

Infos administratives :

• Effectif : 16 agents (dont 12 permanents)
• Adresse : Route de Saint-Cyr - 78026 Versailles
• Centre INRAE : Ile-de-France Versailles-Saclay
• Département scientifique : BAP

• Plantes cultivées
• Arbres forestiers

Dispositifs particuliers :

Plateformes

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale La Motte

Système de culture :

Localisation : Le Rheu (35)Centre INRAE Bretagne-Normandie Unités partenaires : IGEPP, SAS, PEGASE Département scientifique : BAP Effectif : 12 agents SAU : 280 ha

• Agroécologique

Type de culture :

• Grandes cultures

Réseau CLIMATIK

Conditions climatiques : Type de sol :

Océanique

Sols limoneux à battance marquée

Cultures :

• Blé
• Céréales à paille,
• Maïs
• Colza

• Crucifères fourragères
• Protéagineux
• Betterave fourragère
• Prairies et graminées fourragères

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Thématiques

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale A2M

Arboriculture et Maraîchage Méditerranéens

Labellisations et certifications :

Systèmes de culture :

• ISC et ISO14001 (SME)

• Conventionnel
• Bas intrants
• Système diversifié
• Verger PPAM

Localisations : Avignon (84) et Amarine (30)Centre INRAE Provence-Alpes-Côte d’Azur Unités partenaires : GAFL, PSH Départements scientifiques : AgroEcoSytem, BAP, SPE Effectif : 19 agents SAU : 52 ha

Types de culture :

• Cultures fruitières
• Cultures légumières

Réseau CLIMATIK

Conditions climatiques : Type de sol :

Méditerranéen

Argilo calcaire moyen (Avignon) Limon sableux argileux (Amarine)

Cultures :

• Prunier
• Pêcher
• Abricotier
• Amandier

• Forêt
• Céréales
• Culture d'homogénéisation
• Grandes cultures

• Maraichage
• Herbabacée et fleurie

CRB

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Thématiques

Contact

Site web d'unité

Unité de Service CNRGV

Centre National de Ressources Génomiques Végétales

Thématique :

Le CNRGV est à la fois un Centre de Ressources Biologiques (CRB) dédié aux ressources génomiques végétales provenant d'espèces modèles et cultivées, et un laboratoire qui propose des outils efficaces pour la génomique végétale.

Missionset enjeux

Offre de service

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

• Conservation de Banques d'ADN de plantes
• Clonage et caractérisation de grands fragments d’ADN
• Extraction d’ADN de haut poids moléculaire
• Scaffolding de Génomes Hi-C / Bionano
• Séquençage et Assemblage de Génomes
• Annotation structurale et fonctionnelle des génomes
• Capture de grands fragments d'ADN

Compétences et expertises :

• Génomique
• Génétique
• Bioinformatique

Principaux modèles d'études :

Infos administratives :

• Effectif : 14 agents permanents
• Adresse : 24 Chemin de Borde Rouge - 31326 Castanet Tolosan
• Centre INRAE : Occitanie Toulouse
• Département scientifique : BAP

• Ressources génomiques de plantes modèles et cultivées

Dispositifs particuliers :

CRB

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche BFP

Biologie du Fruit et Pathologie

Mots clés : •Développement •Métabolisme •Adaptation •Pathogènes •Changement climatique

Thématique de recherche :

L'unité mène des recherches en biologie fonctionnelle et prédictive des plantes et de leurs pathogènes

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Axes de recherche

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

• Explorer les frontières du vivant
• Aboutir à une vision intégrée du développement des plantes et des fruits
• Comprendre comment les plantes s’adaptent au changement climatique et aux pathogènes

Compétences et expertises :

• Métabolomique
• Physiologie
• Microbiologie
• Bioinformatique
• Modélisation

• Chimie
• Biochimie
• Biologie moléculaire
• Génétique, génomique
• Biologie synthétique

Créations variétales

Principaux modèles d'études :

• Tomate

• Fraisier
• Prunus (Cerisier, Abricotier, Amandier, Prunier)

• Arabidopsis

• Vigne
• Céréales (Blé, Orge)
• Betterave

Infos administratives :

• Effectif : 160 agents (dont 102 permanents)
• Adresse : 71 av. Edouard Bourlaux - 33882 Villenave d'Ornon
• Centre INRAE : Nouvelle-Aquitaine Bordeaux
• Départements scientifiques : BAP, SPE

Dispositifs particuliers :

Plateformes

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche LEPSE

Laboratoire d’Écophysiologie des Plantes Sous Stress Environnementaux

Mots clés : •Maïs •Blé •Vigne •Ecophysiologie •Génétique quantitative •Sécheresse •Floraison

Thématique de recherche :

Les recherches visent à accompagner l’émergence d’une agriculture plus économe en eau et résiliente face aux changements climatiques

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Axes de recherche

• Efficience de transpiration et adaptation des plantes aux climats secs
• Modélisation et Analyse de l'interaction Génotype Environnement

Compétences et expertises :

• Génétique
• Modélisation

Principaux modèles d'études :

• Blé

• Maïs
• Vigne
• Arabidopsis

Infos administratives :

• Effectif : 70 agents (dont 30 permanents)
• Adresse : 2 Place Viala - 34060 Montpellier
• Centre INRAE : Occitanie-Montpellier
• Département scientifique : AgroEcoSystem, BAP

Dispositifs particuliers :

Plateformes

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale UE VS

Unité Expérimentale Versailles-Saclay

Localisations : Versailles (78) et Saclay (91)Centre INRAE Ile-de-France - Versailles-Saclay Unités partenaires : GQE, IJPB, ECOSYS, BIOGER, Agronomie Départements scientifiques : BAP, AgroEcoSystem, SPE SAU : 80 ha

Système de culture :

• Un îlot en conduite sans intrants de synthèse

Type de culture :

• Grandes cultures

Réseau CLIMATIK

Conditions climatiques : Type de sol :

Océanique altéré

Limons profonds argileux

Cultures :

• Blé
• Orge
• Maïs fourrage
• Colza

• Luzerne
• Miscanthus
• Cameline

• Légumineuses (pois, féverole)
• Associations blé/pois

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Thématiques

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche AGAP Institut

Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes méditerranéennes et Tropicales

AGAP Institut s'inscrit dans le l'I-Site MUSE (pôles AEB et MIPS)

Thématique de recherche :

Les recherches portent sur les facteurs de développement des plantes et leur adaptation aux contraintes environnementales, l’organisation et la diversité des génomes, ainsi que sur l'agrobiodiversité.

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Axes de recherche

• Diversités et dynamique évolutive des plantes cultivées
• Structure et dynamique des génomes
• Développement et fonctionnement des plantes et des peuplements
• Déterminisme génétique et méthodologies de sélection

Compétences et expertises :

• Bioinformatique
• Sélection
• Modélisation
• Ecophysiologie

• Génétique
• Génomique
• Physiologie moléculaire

Créations variétales

Principaux modèles d'études :

• Vigne

• Blé dur
• Pommier
• Maïs
• Medicago

• Agrumes

• Riz
• Sorgho
• Palmier
• Bananier

Infos administratives :

• Effectif : 400 agents (dont environ 300 permanents)
• Adresse : Avenue d'Agropolis - 34398 Montpellier
• Centre INRAE : Occitanie-Montpellier
• Département scientifique : BAP

Dispositifs particuliers :

Plateformes

CRB

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale ARBO

Unité Arboriculture

Labellisations et certifications :

• ISO14001 (SME)

Système de culture :

Localisations : Toulenne (33) et Bourran (47)Centre INRAE Nouvelle-Aquitaine Bordeaux Unités partenaires : BFP, GAFL, Biogéco, A2M Département scientifique : BAP Effectif : 16 agents SAU : 110 ha

• Conventionnel
• Bas intrants et sans CMR
• Agriculture biologique
• Ecopaturage
• Système diversifié

Réseau CLIMATIK

Types de culture :

Conditions climatiques : Type de sol :

Océanique (Toulenne)Océanique dégradé (Bourran)

• Cultures fruitières

Limons profonds (Toulenne) Limono argileux (Bourran)

• Culture secondaire : culture forestière

Cultures :

• Cerisier
• Noyer
• Pêcher
• Prunier

• Abricotier

• Pommier
• Forêt

CRB

Thématiques

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Contact

Site web d'unité

Unité d'Appui à la Recherche associée-BAP

Biologie et Amélioration des Plantes

Rôle du département :

Le département est un réseau national coordonné d'unité, d'infrastructures et de compétences. Il se caractérise par ses disciplines, ses thématiques et ses objets d'étude. Dans son périmètre scientifique et thématique, le département contribue à l'élaboration de la stratégie scientifique de l'Institut et de sa stratégie de partenariat pour l'innovation, et les traduit en termes opérationnels. Il joue un rôle d'interface scientifique privilégiée entre les unités et la direction générale :

Missions de l'unité d'appui

L'unité d'appui réunit la cellule Ressources Humaines du département BAP.Elle assiste le Chef de département dans l'exercice de ses responsabilités en matière de Ressources Humaines. La cellule RH intervient, dans son périmètre d'activités, auprès de l'ensemble de l'équipe de direction du département, des agents et des unités BAP (de recherche et expérimentales) et des directions de l'Institut.

• Il a en charge la programmation scientifique et alloue les moyens (délégués par la direction générale), pour la mise en œuvre du projet scientifique des unités • Il instruit les questions relatives à la gestion des compétences • Il anime la vie scientifique et partenariale, assure la veille et l'animation scientifique, et coordonne l'évaluation des unités

Publications

Infos administratives de l'UAR associée :

• Effectif : 3 agents permanents
• Adresse : 2 place Pierre Viala - 34060 Montpellier
• Centre INRAE : Occitanie-Montpellier

Dispositifs :

26 plateformes

16 CRB

43 unités

Site web d'unité et contact

Unité Mixte de Recherche GQE-Le Moulon

Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon

GQE s'inscrit dans le Labex SPS Univ Paris-Saclay

Mots clés : • Blé • Maïs • Génétique quantitative • Evolution • Protéomique • Ecophysiologie

Thématique de recherche :

Les recherches portent sur la génétique et l’évolution des caractères quantitatifs dans les populations, avec un intérêt particulier pour les plantes cultivées et des finalités en lien avec l’agriculture

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Pôles de recherche

• Comprendre et éclairer les mécanismes de l'évolution
• Comprendre et prédire les bases génétiques des interactions
• Comprendre et mobiliser la diversitée cultivée pour répondre aux attentes des acteurs

Compétences et expertises :

• Génétique
• Génomique
• Biostatistiques
• Modélisation

• Bioinformatique
• Biologie théorique
• Biologie évolutive

Principaux modèles d'études :

• Maïs
• Blé
• Colza

• Haricot

• Lupin
• Pois chiche

Infos administratives :

• Effectif : 110 agents (dont 50 permanents)
• Adresse : Bat 680, 12 route 128 - 91190 Gif-sur-Yvette
• Centre INRAE : Île-de-France - Versailles-Saclay
• Département scientifique : BAP

Dispositifs particuliers :

Plateformes

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche IPS2

Institut of Plant Sciences Paris-Saclay

IPS2 s'inscrit dans le Labex SPS Univ Paris-Saclay

Mots clés : •Changement climatique •Chromatine •Signalisation hormonale •Développement •Biologie translationnelle

Thématique de recherche :

Les recherches portent sur l'analyse de la croissance et du développement des plantes modèles et sur la transposition de ces recherches aux plantes cultivées

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Pôles de recherche

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

• Génomique et génétique du développement
• Physiologie et signalisation
• Interactions plantes-microorganismes et réseaux

Compétences et expertises :

• Génétique, génomique et épigénomique
• Bioinformatique
• Biochimie
• Physiologie

Principaux modèles d'études :

• Modélisation

• Biologie cellulaire
• Biologie prédictive

• Arabidopsis
• Tomate
• Melon
• Medicago
• Pois

• Blé
• Haricot
• Cucurbitaceae
• Solanaceae
• Sauge

Infos administratives :

• Effectif : 200 agents (dont 105 permanents)
• Adresse : Bat 630, avenue des Sciences - 91190 Gif-sur-Yvette
• Centre INRAE : Île-de-France - Versailles-Saclay
• Département scientifique : BAP

Dispositifs particuliers :

Plateformes

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche IRHS

Institut de Recherche en Horticulture et Semences

Mots clés : •Holobionte végétal •Phenomics •Fluxomique •Sélection génomique •Agroécologie

Thématique de recherche :

Les recherches portent sur les mécanismes impliqués dans la durabilité de la santé et des qualités des semences et des espèces horticoles, dans le contexte actuel de changements globaux.

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Axes de recherche

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

• Mécanismes de réponse et d’adaptation des plantes à l’environnement biotique et abiotique
• Mécanismes et stratégies de bio contrôle et autres méthodes alternatives aux intrants chimiques
• Histoires évolutives des plantes et microorganismes associés
• Recherche méthodologique et développement d’outils innovants

Compétences et expertises :

• Modélisation

• Bioinformatique
• Biostatistique
• Biophysique

• (Epi)Génomique
• (Epi)Génétique
• Phytopathologie
• (Eco)Physiologie
• Biochimie

Créations variétales

Principaux modèles d'études :

• Pommiers, poiriers
• Rosiers
• Carottes
• Semences
• Microbiote associé aux semences
• Bactéries et champignons phytopathogènes

Infos administratives :

• Effectif : 253 agents (dont 183 permanents)
• Adresse : 42 rue Georges Morel - 49071 Beaucouzé
• Centre INRAE : Pays de la Loire
• Départements scientifiques : BAP, SPE, AgroEcoSystem

Dispositifs particuliers :

Plateformes

CRB

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale GCIE

Grandes Cultures Innovation Environnement

Labellisations et certifications :

• ISC et ISO 14001 (SME)

Systèmes de culture :

• Conventionnel
• Bas intrants

Localisations : Estrées-Mons (80)Centre INRAE Hauts-de-France Unités partenaires : BioEcoAgro, GQE, Agroécologie, IGEPP, GDEC, Agronomie, Ecosys, IJPB Départements scientifiques : BAP, AgroEcoSystem 14 agents SAU : 173 ha

Types de culture :

• Grandes cultures

Réseau CLIMATIK

Conditions climatiques : Type de sol :

Océanique altéré

Limons moyens à argileux profonds

Cultures :

• Pois
• Maïs
• Blé

• Betterave Sucrière
• Pomme de Terre
• Miscanthus
• Switchgrass

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Thématiques

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale Vigne

Unité Vigne Bordeaux

Labellisations et certifications :

• ISC et ISO14001 (SME)

Système de culture :

Localisations : Villeneuve d'Omon (33)Centre INRAE Nouvelle-Aquitaine Bordeaux Unités partenaires : EGFV, SAVE Départements scientifiques : BAP, AgroEcoSystem, SPE Effectif : 7 agents SAU : 16 ha

• Très bas-intrants

Types de culture :

• Vignes
• Chataigniers

Réseau CLIMATIK

Conditions climatiques : Type de sol :

Atlantique

Sablo-graveleux

Cultures :

• Vigne
• Chataigniers

Dispositifs contrôlés

Thématiques

Observations & Phénotypage

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche IPS2

Institut of Plant Sciences Paris-Saclay

IPS2 s'inscrit dans le Labex SPS Univ Paris-Saclay

Mots clés : • Croissance • Développement • Stress • Signalisation • Génétique

Thématique de recherche :

Les recherches portent sur l'analyse de la croissance et du développement des plantes modèles et sur la transposition de ces recherches aux plantes cultivées

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Pôles de recherche

• Génomique et génétique du développement
• Physiologie et signalisation
• Interactions plantes-microorganismes et réseaux

Compétences et expertises :

• Génétique, génomique et épigénomique
• Bioinformatique
• Biochimie
• Physiologie

Principaux modèles d'études :

• Modélisation

• Biologie cellulaire
• Biologie prédictive

• Arabidopsis
• Tomate
• Melon
• Medicago
• Pois

• Blé
• Haricot
• Cucurbitaceae
• Solanaceae
• Sauge

Infos administratives :

• Effectif : 150 agents (dont 105 permanents)
• Adresse : Bat 630, avenue des Sciences - 91190 Gif-sur-Yvette
• Centre INRAE : Île-de-France - Versailles-Saclay
• Département scientifique : BAP

Dispositifs particuliers :

Plateformes

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale PEYI

Plateforme Expérimentale du végétal et des agrosYstèmes Innovants

Localisations : Petit-Bourg et Petit-Canal (971)Centre INRAE Antilles-Guyane Unité partenaire : ASTRO Départements scientifiques : AgroEcoSystem, BAP SAU : 130 ha

Système de culture :

• Agroécologiques co-conçus
• Polyculture

Type de culture :

• Cultures tropicales

Conditions climatiques : Type de sol :

Réseau CLIMATIK

Tropical humide à saison sèche marquée

Ferralsols (Petit-Bourg) Vertisols (Petit-Canal)

Cultures :

• Ignames
• Canne à sucre
• Solanacées maraichères
• Patate douce

• Manioc
• Bananier plantain
• Pois tropicaux
• Maïs tropicaux

• Tournesol
• Giraumon
• Arboriculture fruitière

CRB

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Thématiques

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale Maïs

Labellisations et certifications :

Unité Maïs

• ISC

Localisations : Saint-Martin-de-Hinx (40)Centre INRAE Nouvelle-Aquitaine Bordeaux Unité partenaire : GQE, LEPSE, AGAP Département scientifique : BAP 5 agents SAU : 45 ha

Systèmes de culture :

• Une parcelle en transition agroécologique
• Essai azote limitant

Type de culture :

Conditions climatiques : Type de sol :

Réseau CLIMATIK

Océanique

Sablo-limoneux Sols battants à faibles taux de matière organique et légèrement acide

• Grandes cultures

Cultures principales :

• Maïs
• Sorgho

CRB

Thématiques

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Contact

Site web d'unité

Liens à venir

Unité de Recherche AGAP Corse

Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes méditerranéennes et Tropicales

L'unité est rattachée à l'UMR AGAP-Institut

Mots clés : • Agrumes • Ressources génétiques • Innovatoin variétale

Thématique de recherche :

La durabilité de l’agrumiculture en Corse et plus largement dans le monde

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Axes de recherche

• Structuration de la diversité génétique, génomique et phénotypique des ressources génétiques
• Déterminants de la variabilité des caractères cibles de l’amélioration et sa mise en relation avec des marqueurs moléculaires
• Biologie de la reproduction

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Compétences et expertises :

• Génomique
• Génétique
• Physiologie

Créations variétales

Principaux modèles d'études :

• Oranges
• Citrons
• Clémentines
• Pamplemousses
• Bergamote

• Calamondin
• Kumquats
• Cédrats
• Limes
• Citron caviar

Infos administratives :

• Effectif : 23 agents (dont environ 20 permanents)
• Adresse : San Giuliano - 20230 San Giuliano
• Centre INRAE : Corse
• Département scientifique : BAP

Dispositifs particuliers :

CRB

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche GDEC

Génétique Diversité Ecophysiologie des Céréales

Mots clés : •Blé •Génétique quantitative •Protéine végétale •Rendement •Immunité •Paléogénétique

Thématique de recherche :

Les recherches portent les processus biologiques à l'origine de la capacité d'adaptation des blés aux contraintes environnementales

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Axes de recherche

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

• Développer les connaissance sur la structure, l'organisation, le fonctionnement et l'évolution du génome du blé tendre
• Décrypter et modéliser les mécanismes moléculaires et physiologiques impliqués dans le contrôle de caractères agronomiques importants
• Analyser et valoriser les ressources génétiques
• Contribuer au développement de nouveaux outils et méthodes de sélection

Compétences et expertises :

• Bioinformatique
• Biologie prédictive
• Modélisation

• Génomique
• Génétique
• Epigénétique

Créations variétales

Principal modèle d'études :

Infos administratives :

• Blé

• Effectif : 110 agents (dont 80 permanents)
• Adresse : 5 chemin de Beaulieu - 63000 Clermont-Ferrand
• Centre INRAE : Clermont-Auvergne-Rhône-Alpes
• Départements scientifiques : BAP, AgroEcoSystem

Dispositifs particuliers :

Plateformes

CRB

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale Vigne

Unité Vigne Bordeaux

Labellisations et certifications :

• ISC et ISO14001 (SME)

Système de culture :

Localisations : Villeneuve d'Omon (33)Centre INRAE Nouvelle-Aquitaine Bordeaux Unités partenaires : EGFV, SAVE Départements scientifiques : BAP, AgroEcoSystem, SPE Effectif : 7 agents SAU : 16 ha

• Très bas-intrants

Types de culture :

• Vignes
• Chataigniers

Réseau CLIMATIK

Conditions climatiques : Type de sol :

Atlantique

Sablo-graveleux

Cultures :

• Vigne
• Chataigniers

Dispositifs contrôlés

Thématiques

Observations & Phénotypage

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale UEAV

Unité Expérimentale Agronomique et Viticole de Colmar

Labellisations et certifications :

• ISC et ISO 14001 (SME)

Système de culture :

Localisations : Colmar, Bergheim, Wintzenheim, Ribeauvillé (68)Centre INRAE Grand Est - Colmar Unités partenaires : SVQV, SAVE, LAE, ECOSYS, ABSys, LEPSE, EMMAH, MISTEA, UR Sols Département scientifique : BAP SAU : 63 ha

• Très bas intrants

Types de culture :

• Vignes
• Grandes cultures

Réseau CLIMATIK

Conditions climatiques : Type de sol :

Semi-continental tempéré

Calcosol limono-argileux (Colmar) Argile limono-sableuse sur marne calcaire (Bergheim) Sablo-limoneux sur arène granitique (Wintzenheim)

Cultures :

• Vignes
• Céréales à pailles
• Maïs grain

• Soja
• Herbacées (serres)

Dispositifs contrôlés

Thématiques

Observations & Phénotypage

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale PHACC

PHénotypage Au Champ des Céréales

Labellisations et certifications :

• ISC et ISO 14001 (SME)

Système de culture :

Localisations : Clermont-Ferrand et Theix (63)Centre INRAE Clermont-Auvergne-Rhône-Alpes Unités partenaires : GDEC, LEPSE, AGAP, P3F, AgroEcologie, EMMAH, UREP, UMRH, LIPME, Herbipole Département scientifique : BAP SAU : 97 ha

• Un îlot en conduite sans intrants de synthèse

Types de culture :

• Grandes cultures
• Fourrages

Conditions climatiques : Type de sol :

Continental (Clermont)Océanique (Theix)

Réseau CLIMATIK

Réseau CAREX

Argilo-limoneux calcaire (Clermont) Limono-sableux granitique (Theix)

Cultures :

• Céréales à paille
• Graminées fourragères
• Protéagineux

• Maïs
• Tournesol
• Sorgho
• Luzerne

CRB

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Thématiques

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale U2E

Unité Expérimentale du domaine d'Epoisses

Labellisations et certifications :

• ISC et ISO 14001 (SME)

Système de culture :

Localisations : Bretenière (21)Centre INRAE Bourgogne-Franche-Comté Unité partenaire : Agroécologie Départements scientifiques : BAP, AgroEcoSystem, SPE 17 agents SAU : 130 ha

• Agroécologie

Type de culture :

• Grandes cultures

Conditions climatiques : Type de sol :

Réseau CLIMATIK

Semi-continental

Réseau CAREX

Argilo-calcaire (30 à 50 % argile)

Cultures :

• Blé
• Orge
• Triticale
• Maïs
• Colza

• Moutarde
• Tournesol
• Soja
• Lin
• Chanvre

• Pois
• Féverole
• Lupin
• Pois chiche
• Cultures intermédiaires multi-services

CRB

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Thématiques

Site web unité

Contact

Unité expérimentale de Vassal

Localisations : Marseillan (34)Centre INRAE Occitanie-Montpellier Unité partenaire : AGAP Département scientifique : BAP Effectif : 9 agents SAU : 20 ha

Système de culture :

• Viticulture raisonnée

Type de culture :

Conditions climatiques : Type de sol :

Réseau CLIMATIK

Méditerranéen

Sables marins du cordon littoral

• Vignes

Cultures :

• Vignes cultivée et espèces apparentées

CRB

Dispositifs contrôlés

Thématiques

Observations & Phénotypage

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche IJPB

Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du végétal

s'inscrit dans le Labex SPS Univ Paris-Saclay

Mots clés : •Génome •Développement •Signalisation •Modélisation •Physiologie & Interactions

Thématique de recherche :

Les recherches visent à développer des concepts et des outils pour produire des connaissances fondamentales en sciences du végétal et les inscrire dans un processus d’innovation afin de répondre aux défis scientifiques et sociétaux actuels et à venir.

Missions et enjeux

Faits marquants BAP 2024

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Axe de recherche

• Mieux comprendre les processus fondamentaux du fonctionnement des plantes et de leurs interactions avec l’environnement
• Concevoir les plantes de demain pour une agriculture durable face au défi climatique

• Développer de nouveaux produits dérivés des plantes pour les usages alimentaires et non-alimentaires

Compétences et expertises :

• Biologie
• Chimie
• Mathématiques appliquées

Principaux modèles d'études :

• Sorgho

• Pois
• Blé
• Tomate
• Cameline
• Orge
• Modèles microbiens

• Arabidopsis thaliana
• Brachypodium distachyon
• Physcomitrella patens
• Brassica napus
• Amaranthe
• Maïs

Infos administratives :

• Effectif : 300 agents (dont 187 permanents)
• Adresse : Route de Saint-Cyr - 78000 Versailles
• Centre INRAE : Île-de-France - Versailles-Saclay
• Départements scientifiques : BAP, Transform

Dispositif particulier :

CRB

Contact

Observatoire du végétal

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche LIPME

Laboratoire des Interactions Plantes-Microbes-Environnement

s'inscrit dans le Labex TULIP

Mots clés : • Immunité • Symbioses • Pathogènes • Mécanismes

Thématique de recherche :

Comprendre les interactions des plantes avec leur environnement pour répondre aux enjeux de l’agriculture de demain.

Missionset enjeux

Axes de recherche

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

• Compréhension des processus d’évolution et d’adaptation des organismes

Compétences et expertises :

• Génomique
• Génétique
• Bioinformatique

• Microbiologie
• Biologie cellulaire

Principaux modèles d'études :

• Arabidopsis thaliana
• Medicago truncatula
• Tournesol
• Tomate
• Soja

Infos administratives :

• Effectif : 150 agents (dont 96 permanents)
• Adresse : 24 chemin de Borde Rouge - Auzeville - 31326 Castanet Tolosan
• Centre INRAE : Occitanie Toulouse
• Départements scientifiques : SPE, BAP

Dispositifs particuliers :

Plateformes

CRB

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale RGCO

Ressources Génétiques Végétales en Conditions Océaniques

Labellisations et certifications :

• ISC et ISO 14001 (SME)

Systèmes de culture :

Localisation : Ploudaniel (29)Centre INRAE Bretagne-Normandie Unités partenaires : IGEPP, GQE, IJPB, AGAP Département scientifique : BAP Effectif : 6 agents SAU : 67 ha

• Agriculture biologique
• Conventionnel

Types de culture :

• Grandes cultures
• Cultures légumières

Conditions climatiques : Type de sol :

Réseau CLIMATIK

Océanique frais et humide

Sols profonds limoneux issus de dépôts éoliens et de la décomposition de la roche mère granitique

Réseau CAREX

Cultures :

• Chou
• Échalote
• ail

• Pomme de terre
• Maïs
• Blé
• Colza

CRB

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Thématiques

Contact

Site web d'unité

Unité Propre de Recherche ASTRO

AgroSystèmes TROpicaux

Mots clés : •Agro-écologie •Transition •Systèmes de culture multi-spécifiques •Interdisciplinarité

Thématique de recherche :

Les recherches portent sur la transition agroécologique des agrosystèmes tropicaux dans une perspective de résilience et de souveraineté alimentaire.

Missionset enjeux

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Axes de recherche

• Agrodiversité et biodiversité pour une santé durable des agrosystèmes
• Impacts des agricultures sur l’environnement et restauration des milieux
• Système alimentaire, bioéconomie territoriale et changement climatique

Compétences et expertises :

• Economie
• Epidémiologie
• Génétique
• Pathologie

• Agronomie
• Chimie
• Ecologie
• Ecophysiologie

Principaux modèles d'études :

Infos administratives :

• Igname
• Jardin créole

• Effectif : 60 agents (dont 39 permanents)
• Adresse : Domaine Duclos - 97170 Petit Bourg - Guadeloupe
• Centre INRAE : Antilles-Guyane
• Départements scientifiques : AgroEcoSystem, BAP, SPE, Ecosocio

Dispositifs particuliers :

Plateformes

CRB

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale A2M

Arboriculture et Maraîchage Méditerranéens

Labellisations et certifications :

Systèmes de culture :

• ISC et ISO14001 (SME)

• Conventionnel
• Bas intrants
• Système diversifié
• Verger PPAM

Localisations : Avignon (84) et Amarine (30)Centre INRAE Provence-Alpes-Côte d’Azur Unités partenaires : GAFL, PSH Départements scientifiques : AgroEcoSytem, BAP, SPE Effectif : 19 agents SAU : 52 ha

Types de culture :

• Cultures fruitières
• Cultures légumières

Réseau CLIMATIK

Conditions climatiques : Type de sol :

Méditerranéen

Argilo calcaire moyen (Avignon) Limon sableux argileux (Amarine)

Cultures :

• Prunier
• Pêcher
• Abricotier
• Amandier

• Forêt
• Céréales
• Culture d'homogénéisation
• Grandes cultures

• Maraichage
• Herbabacée et fleurie

CRB

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Thématiques

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale de Vassal

Localisations : Marseillan (34)Centre INRAE Occitanie-Montpellier Unité partenaire : AGAP Département scientifique : BAP Effectif : 9 agents SAU : 20 ha

Système de culture :

• Viticulture raisonnée

Type de culture :

Conditions climatiques : Type de sol :

Réseau CLIMATIK

Méditerranéen

Sables marins du cordon littoral

• Vignes

Cultures :

• Vignes cultivée et espèces apparentées

CRB

Dispositifs contrôlés

Thématiques

Observations & Phénotypage

Contact

Site web d'unité

Unité de Recherche AGAP Corse

Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes méditerranéennes et Tropicales

L'unité est rattachée à l'UMR AGAP-Institut

Mots clés : • Agrumes • Ressources génétiques • Innovatoin variétale

Thématique de recherche :

La durabilité de l’agrumiculture en Corse et plus largement dans le monde

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Axes de recherche

• Structuration de la diversité génétique, génomique et phénotypique des ressources génétiques
• Déterminants de la variabilité des caractères cibles de l’amélioration et sa mise en relation avec des marqueurs moléculaires
• Biologie de la reproduction

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Compétences et expertises :

• Génomique
• Génétique
• Physiologie

Créations variétales

Principaux modèles d'études :

• Oranges
• Citrons
• Clémentines
• Pamplemousses
• Bergamote

• Calamondin
• Kumquats
• Cédrats
• Limes
• Citron caviar

Infos administratives :

• Effectif : 23 agents (dont environ 20 permanents)
• Adresse : San Giuliano - 20230 San Giuliano
• Centre INRAE : Corse
• Département scientifique : BAP

Dispositifs particuliers :

CRB

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche SVQV

Santé de la Vigne et Qualité du Vin

Mots clés : • Vigne • Vin • Résistance • Qualité • Virus• Vecteurs

Thématique de recherche :

Les thématiques s’inscrivent dans le contexte général de réduction de l'utilisation de fongicides et de durabilité de la culture de la vigne, incluant l'adaptation au changement climatique. Des thématiques en virologie sur vigne et hôtes herbacés, dont la betterave, visent à comprendre les interactions plantes-virus-vecteurs afin de proposer des pistes pour maitriser la dispersion des virus.

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Axes de recherche

• Méthodologie de sélection variétale & matériel végétal afférent
• Déterminants de le recombinaison génétique chez la vigne et conséquences
• Mise en œuvre de résistances aux champignons et aux virus chez la vigne
• Déterminants génétiques de la typicité des vins
• Métabolisme secondaire de la vigne et résistance aux maladies
• Biologie des multi-infections virales
• Biologie de la transmission des virus
• Contrôle les symptômes par prémunition
• Recherches participatives permettant la conception de pratiques agricoles, éco-nomiquement durable et minimisant leur impact sur l’environnement

Compétences et expertises :

• Métabolomique
• Pathologie végétale
• Virologie

• Génétique

• Génomique
• Transcriptomique

Infos administratives :

• Effectif : 80 agents (dont 50 permanents)
• Adresse : 28 rue de Herrlisheim - 68000 Colmar
• Centre INRAE : Grand Est-Colmar
• Départements scientifiques : BAP, SPE

Principal modèle d'études :

Créations variétales

• Vigne

Dispositifs particuliers :

Plateformes

Contact

Site web d'unité

Unité Propre de Recherche ASTRO

AgroSystèmes TROpicaux

Mots clés : •Agro-écologie •Transition •Systèmes de culture multi-spécifiques •Interdisciplinarité

Thématique de recherche :

Les recherches portent sur la transition agroécologique des agrosystèmes tropicaux dans une perspective de résilience et de souveraineté alimentaire.

Missionset enjeux

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Axes de recherche

• Agrodiversité et biodiversité pour une santé durable des agrosystèmes
• Impacts des agricultures sur l’environnement et restauration des milieux
• Système alimentaire, bioéconomie territoriale et changement climatique

Compétences et expertises :

• Economie
• Epidémiologie
• Génétique
• Pathologie

• Agronomie
• Chimie
• Ecologie
• Ecophysiologie

Principaux modèles d'études :

Infos administratives :

• Igname
• Jardin créole

• Effectif : 60 agents (dont 39 permanents)
• Adresse : Domaine Duclos - 97170 Petit Bourg - Guadeloupe
• Centre INRAE : Antilles-Guyane
• Départements scientifiques : AgroEcoSystem, BAP, SPE, Ecosocio

Dispositifs particuliers :

Plateformes

CRB

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale ARBO

Unité Arboriculture

Labellisations et certifications :

• ISO14001 (SME)

Système de culture :

Localisations : Toulenne (33) et Bourran (47)Centre INRAE Nouvelle-Aquitaine Bordeaux Unités partenaires : BFP, GAFL, Biogéco, A2M Département scientifique : BAP Effectif : 16 agents SAU : 110 ha

• Conventionnel
• Bas intrants et sans CMR
• Agriculture biologique
• Ecopaturage
• Système diversifié

Réseau CLIMATIK

Types de culture :

Conditions climatiques : Type de sol :

Océanique (Toulenne)Océanique dégradé (Bourran)

• Cultures fruitières

Limons profonds (Toulenne) Limono argileux (Bourran)

• Culture secondaire : culture forestière

Cultures :

• Cerisier
• Noyer
• Pêcher
• Prunier

• Abricotier

• Pommier
• Forêt

CRB

Thématiques

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Contact

Site web d'unité

Unité de Service EPGV

Etude du Polymorphisme des Génomes Végétaux

s'inscrit dans le Labex SPS Univ Paris-Saclay

Mots clés : • Polymorphisme • Génotypage • Séquençage • Diversité • Caractérisation

Thématique :

Analyse de génomes et de leur diversité

Missionset enjeux

Offre de service :

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

• Analyse de génomes et de leur diversité
• Production, traçabilité et stockage pérenne de données génomiques
• Développement de protocoles adaptés aux spécificités des espèces végétales
• Mise à disposition d'outils de séquençage et de génotypage à haut débit afin de répondre aux besoins de programmes scientifiques
• Etablissement de processus et d'outils pour l'analyse et la gestion des données de polymorphisme

Compétences et expertises :

• Génomique
• Génétique
• Bioinformatique

Principaux modèles d'études :

Infos administratives :

• Plantes et animaux

• Effectif : 6 agents permanents
• Adresse : 2 rue Gaston Crémieux - 91057 Evry
• Centre INRAE : Ile-de-France Versailles-Saclay
• Département scientifique : BAP

Dispositifs particuliers :

Plateforme

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche EGFV

Ecophysiologie et Génomique Fonctionnelle de la Vigne

Mots clés : • Vigne • Greffe • Porte-greffe • Epigenetique • Changement Climatique

Thématique de recherche :

Les recherches portent sur l'impact de l’environnement sur les processus biologiques et physiologiques du fonctionnement de la vigne qui conduisent à la formation de raisins de qualité en réponse à l'environnement climatique.

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Axes de recherche

• Caractériser la variabilité phénotypique de la vigne dans différents environnements et simuler les performances de la plante dans le cadre du changement climatique,
• Analyser les déterminants physiologiques et génétiques des effets de l’environnement sur la composition des raisins,
• Comprendre la contribution du génome et de l’épigénome au phénotype,
• Analyser les déterminants physiologiques et génétiques des interactions greffon x porte-greffe x rhizosphère.

Compétences et expertises :

• Ecophysiologie
• Physiologie moléculaire
• Epigénétique

• Biochimie
• Bioclimatologie
• Génétique
• Modélisation

Créations variétales

Principaux modèles d'études :

Infos administratives :

• Vigne
• Arabidopsis

Lien prochainement actif

• Effectif : 72 agents (dont 47 permanents)
• Adresse : 210 Chemin de Leysotte, 33140 Villenave-d'Ornon
• Centre INRAE : Nouvelle Aquitaine-Bordeaux
• Départements scientifiques : AgroEcoSystem, BAP

Dispositifs particuliers :

Conservatoire des ressources génétiques

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche LEPSE

Laboratoire d’Écophysiologie des Plantes Sous Stress Environnementaux

Mots clés : •Maïs •Blé •Vigne •Ecophysiologie •Génétique quantitative •Sécheresse •Floraison

Thématique de recherche :

Les recherches visent à accompagner l’émergence d’une agriculture plus économe en eau et résiliente face aux changements climatiques

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Axes de recherche

• Efficience de transpiration et adaptation des plantes aux climats secs
• Modélisation et Analyse de l'interaction Génotype Environnement

Compétences et expertises :

• Génétique
• Modélisation

Principaux modèles d'études :

• Blé

• Maïs
• Vigne
• Arabidopsis

Infos administratives :

• Effectif : 70 agents (dont 30 permanents)
• Adresse : 2 Place Viala - 34060 Montpellier
• Centre INRAE : Occitanie-Montpellier
• Département scientifique : AgroEcoSystem, BAP

Dispositifs particuliers :

Plateformes

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale GCIE

Grandes Cultures Innovation Environnement

Labellisations et certifications :

• ISC et ISO 14001 (SME)

Systèmes de culture :

• Conventionnel
• Bas intrants

Localisations : Estrées-Mons (80)Centre INRAE Hauts-de-France Unités partenaires : BioEcoAgro, GQE, Agroécologie, IGEPP, GDEC, Agronomie, Ecosys, IJPB Départements scientifiques : BAP, AgroEcoSystem 14 agents SAU : 173 ha

Types de culture :

• Grandes cultures

Réseau CLIMATIK

Conditions climatiques : Type de sol :

Océanique altéré

Limons moyens à argileux profonds

Cultures :

• Pois
• Maïs
• Blé

• Betterave Sucrière
• Pomme de Terre
• Miscanthus
• Switchgrass

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Thématiques

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale HORTI

Unité Horticole

Labellisations et certifications :

• ISC et ISO 14001 (SME)

Systèmes de culture :

Localisations : Beaucouzé (Bois l'Abbé) et Les Hauts d'Anjou (la Rétuzière) - (49)Centre INRAE Pays de la Loire Unité partenaire : IRHS Département scientifique : BAP Effectif : 17 agents SAU : 82 ha

• Production Fruitière Intégrée
• Agriculture Biologique
• Faibles intrants

Types de culture :

• Cultures fruitières
• Cultures ornementales

Conditions climatiques : Type de sol :

Réseau CLIMATIK

Tempéré (entre climat océanique et continental)

Sable argilo limoneux (Bois l'Abbé) Limono sablo argileux (La Rétuzière)

Cultures :

• Malus (pommiers)
• Pyrus (poiriers)
• Cydonia (cognassiers)

• Rosa (rosiers)
• Prunus (pêchers, abricotiers, cerisiers)

CRB

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Thématiques

Contact

Site web d'unité

Unité de Recherche P3F

Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères

Mots clés : •Couverts prairiaux semés •Modélisation •Mélanges •Plantes de services •Ressources génétiques

Thématique de recherche :

L’unité a basé son projet sur une analyse conceptuelle du fonctionnement des prairies en fonction des contraintes du milieu et des objectifs de production.

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Axes de recherche

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

• Adapter les prairies aux changements climatiques (température, eau, CO2)
• Mettre au point de nouveaux schémas de sélection
• Comprendre et améliorer la dynamique de la valeur alimentaire de la production fourragère par les prairies

Compétences et expertises :

• Ecophysiologie
• Génétique

Principaux modèles d'études :

• Luzerne
• Ray-grass
• Dactyle
• Fétuque

Infos administratives :

• Effectif : 57 agents (dont 37 permanents)
• Adresse : RD 150, CS 80006 - 86 600 Lusignan
• Centre INRAE : Nouvelle-Aquitaine-Poitiers
• Départements scientifiques : AgroEcoSystem, BAP

Dispositifs particuliers :

Services

CRB

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche LIPME

Laboratoire des Interactions Plantes-Microbes-Environnement

s'inscrit dans le Labex TULIP

Mots clés : • Immunité • Symbioses • Pathogènes • Mécanismes

Thématique de recherche :

Comprendre les interactions des plantes avec leur environnement pour répondre aux enjeux de l’agriculture de demain.

Missionset enjeux

Axes de recherche

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

• Compréhension des processus d’évolution et d’adaptation des organismes

Compétences et expertises :

• Génomique
• Génétique
• Bioinformatique

• Microbiologie
• Biologie cellulaire

Principaux modèles d'études :

• Arabidopsis thaliana
• Medicago truncatula
• Tournesol
• Tomate
• Soja

Infos administratives :

• Effectif : 150 agents (dont 96 permanents)
• Adresse : 24 chemin de Borde Rouge - Auzeville - 31326 Castanet Tolosan
• Centre INRAE : Occitanie Toulouse
• Départements scientifiques : SPE, BAP

Dispositifs particuliers :

Plateformes

CRB

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche GQE-Le Moulon

Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon

GQE s'inscrit dans le Labex SPS Univ Paris-Saclay

Mots clés : • Blé • Maïs • Génétique quantitative • Evolution • Protéomique • Ecophysiologie

Thématique de recherche :

Les recherches portent sur la génétique et l’évolution des caractères quantitatifs dans les populations, avec un intérêt particulier pour les plantes cultivées et des finalités en lien avec l’agriculture

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Pôles de recherche

• Comprendre et éclairer les mécanismes de l'évolution
• Comprendre et prédire les bases génétiques des interactions
• Comprendre et mobiliser la diversitée cultivée pour répondre aux attentes des acteurs

Compétences et expertises :

• Génétique
• Génomique
• Biostatistiques
• Modélisation

• Bioinformatique
• Biologie théorique
• Biologie évolutive

Principaux modèles d'études :

• Maïs
• Blé
• Colza

• Haricot

• Lupin
• Pois chiche

Infos administratives :

• Effectif : 110 agents (dont 50 permanents)
• Adresse : Bat 680, 12 route 128 - 91190 Gif-sur-Yvette
• Centre INRAE : Île-de-France - Versailles-Saclay
• Département scientifique : BAP

Dispositifs particuliers :

Plateformes

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale HORTI

Unité Horticole

Labellisations et certifications :

• ISC et ISO 14001 (SME)

Systèmes de culture :

Localisations : Beaucouzé (Bois l'Abbé) et Les Hauts d'Anjou (la Rétuzière) - (49)Centre INRAE Pays de la Loire Unité partenaire : IRHS Département scientifique : BAP Effectif : 17 agents SAU : 82 ha

• Production Fruitière Intégrée
• Agriculture Biologique
• Faibles intrants

Types de culture :

• Cultures fruitières
• Cultures ornementales

Conditions climatiques : Type de sol :

Réseau CLIMATIK

Tempéré (entre climat océanique et continental)

Sable argilo limoneux (Bois l'Abbé) Limono sablo argileux (La Rétuzière)

Cultures :

• Malus (pommiers)
• Pyrus (poiriers)
• Cydonia (cognassiers)

• Rosa (rosiers)
• Prunus (pêchers, abricotiers, cerisiers)

CRB

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Thématiques

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale PEYI

Plateforme Expérimentale du végétal et des agrosYstèmes Innovants

Localisations : Petit-Bourg et Petit-Canal (971)Centre INRAE Antilles-Guyane Unité partenaire : ASTRO Départements scientifiques : AgroEcoSystem, BAP SAU : 130 ha

Système de culture :

• Agroécologiques co-conçus
• Polyculture

Type de culture :

• Cultures tropicales

Conditions climatiques : Type de sol :

Réseau CLIMATIK

Tropical humide à saison sèche marquée

Ferralsols (Petit-Bourg) Vertisols (Petit-Canal)

Cultures :

• Ignames
• Canne à sucre
• Solanacées maraichères
• Patate douce

• Manioc
• Bananier plantain
• Pois tropicaux
• Maïs tropicaux

• Tournesol
• Giraumon
• Arboriculture fruitière

CRB

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Thématiques

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche EGFV

Ecophysiologie et Génomique Fonctionnelle de la Vigne

Mots clés : • Vigne • Greffe • Porte-greffe • Epigenetique • Changement Climatique

Thématique de recherche :

Les recherches portent sur l'impact de l’environnement sur les processus biologiques et physiologiques du fonctionnement de la vigne qui conduisent à la formation de raisins de qualité en réponse à l'environnement climatique.

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Axes de recherche

• Caractériser la variabilité phénotypique de la vigne dans différents environnements et simuler les performances de la plante dans le cadre du changement climatique,
• Analyser les déterminants physiologiques et génétiques des effets de l’environnement sur la composition des raisins,
• Comprendre la contribution du génome et de l’épigénome au phénotype,
• Analyser les déterminants physiologiques et génétiques des interactions greffon x porte-greffe x rhizosphère.

Compétences et expertises :

• Ecophysiologie
• Physiologie moléculaire
• Epigénétique

• Biochimie
• Bioclimatologie
• Génétique
• Modélisation

Créations variétales

Principaux modèles d'études :

Infos administratives :

• Vigne
• Arabidopsis

Lien prochainement actif

• Effectif : 72 agents (dont 47 permanents)
• Adresse : 210 Chemin de Leysotte, 33140 Villenave-d'Ornon
• Centre INRAE : Nouvelle Aquitaine-Bordeaux
• Départements scientifiques : AgroEcoSystem, BAP

Dispositifs particuliers :

Conservatoire des ressources génétiques

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche Agroécologie

Unité Agroécologie

Mots clés : •Agroécosystème •Environnement •Ecologie •Paysage •Diversification •Adaptation

Thématique de recherche :

Les recherches visent à mieux comprendre les interactions biotiques au sein des agrosystèmes afin de concevoir des systèmes de culture innovants respectueux de l’environnement.

Missions

Enjeux scientifiques

Faits marquants BAP 2024

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Pôles de recherche

• Adventices et agroécosystèmes
• Mécanismes et gestion des interactions plantes-microorganismes
• Déterminismes génétiques et environnementaux de l’adaptation des plantes à des systèmes de culture Innovants
• Microbiomes et fonctions écosystémiques des sols

Compétences et expertises :

• Agronomie
• Ecologie
• Biologie
• Physiologie

• Ecophysiologie
• Génétique
• Microbiologie
• Modélisation

Principaux modèles d'études :

Infos administratives :

• Pois
• Féveroles
• Lentille

• Lupin

• Soja

• Effectif : 457 agents
• Adresse : 17 rue de Sully - 21065 Dijon
• Centre INRAE : Bourgogne-Franche-Comté
• Départements scientifiques : AgroEcoSystem, BAP, SPE

Dispositifs particuliers :

Plateformes

CRB

Contact

Site web d'unité

Unité d'Appui à la Recherche BAP

Biologie et Amélioration des Plantes

Rôle du département :

Le département est un réseau national coordonné d'unité, d'infrastructures et de compétences. Il se caractérise par ses disciplines, ses thématiques et ses objets d'étude. Dans son périmètre scientifique et thématique, le département contribue à l'élaboration de la stratégie scientifique de l'Institut et de sa stratégie de partenariat pour l'innovation, et les traduit en termes opérationnels. Il joue un rôle d'interface scientifique privilégiée entre les unités et la direction générale :

Missions de l'unité d'appui

L’ unité d’appui à la recherche du département BAP réunit la cellule administrative du département qui assure le pilotage et la coordination des volets administratifs et financiers ainsi que la communication. L’unité est également en charge des activités partenariales et d'innovation (y compris PLANTINNOV). Elle assure par ailleurs le suivi des unités expérimentales et des ressources génétiques.L’unité assiste le Chef de Département dans l'exercice de ses responsabilités et assure un rôle d’animation auprès de ses collectifs, en intervenant en relais des directions centrales.

• Il a en charge la programmation scientifique et alloue les moyens (délégués par la direction générale), pour la mise en œuvre du projet scientifique des unités • Il instruit les questions relatives à la gestion des compétences • Il anime la vie scientifique et partenariale, assure la veille et l'animation scientifique, et coordonne l'évaluation des unités

Publications

Infos administratives de l'UAR de Versailles :

• Effectif : 9 agents permanents
• Adresse : Route de Saint-Cyr - 78026 Versailles
• Centre INRAE : Ile-de-France Versailles-Saclay

Dispositifs :

26 plateformes

16 CRB

43 unités

Site web d'unité et contact

Unité de Recherche GAFL

Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes

Mots clés : •Diversité génétique •Immunité •Perte de sensibilité •Robustesse •Résilience •Durabilité

Thématique de recherche :

Mobiliser la diversité génétique naturelle et éditée pour adapter les variétés de fruits et légumes au changement climatique, réduire l'usage des pesticides, de l'eau, des engrais dans les cultures

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Axes de recherche

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

• Cibler les caractères primordiaux d'adaptation aux stress biotiques et abiotiques
• Identifier des sources de résistance
• Comprendre la fonction des déterminants de résistance dans les interactions plantes × bioagresseurs × environnements

Compétences et expertises :

• Génétique quantitative
• Génomique
• Edition

• Bioinformatique
• Phénotypage instrumenté

Créations variétales

Principaux modèles d'études :

• Abricotier
• Arabidopsis
• Aubergine

• Melon

• Pêcher
• Piment
• Porte-greffe Prunus
• Tomate

Infos administratives :

• Effectif : 75 agents (dont 50 permanents)
• Adresse : 67, allée des Chênes - 84143 Montfavet
• Centre INRAE : Provence-Alpes-Côte d'Azur
• Département scientifique : BAP

Dispositifs particuliers :

Réseau de vergers

CRB

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche Agroécologie

Unité Agroécologie

Mots clés : •Agroécosystème •Environnement •Ecologie •Paysage •Diversification •Adaptation

Thématique de recherche :

Les recherches visent à mieux comprendre les interactions biotiques au sein des agrosystèmes afin de concevoir des systèmes de culture innovants respectueux de l’environnement.

Missions

Enjeux scientifiques

Faits marquants BAP 2024

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Pôles de recherche

• Adventices et agroécosystèmes
• Mécanismes et gestion des interactions plantes-microorganismes
• Déterminismes génétiques et environnementaux de l’adaptation des plantes à des systèmes de culture Innovants
• Microbiomes et fonctions écosystémiques des sols

Compétences et expertises :

• Agronomie
• Ecologie
• Biologie
• Physiologie

• Ecophysiologie
• Génétique
• Microbiologie
• Modélisation

Principaux modèles d'études :

Infos administratives :

• Pois
• Féveroles
• Lentille

• Lupin

• Soja

• Effectif : 457 agents
• Adresse : 17 rue de Sully - 21065 Dijon
• Centre INRAE : Bourgogne-Franche-Comté
• Départements scientifiques : AgroEcoSystem, BAP, SPE

Dispositifs particuliers :

Plateformes

CRB

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche BioEcoAgro

Unité Transfrontalière BioEcoAgro

Mots clés : •Miscanthus •Légumineuses •Systèmes bas-intrants •Carbone •Azote •Gaz à effet de serre

Thématique de recherche :

Les recherches, à l'échelle de l'unité, portent sur l’ingénierie biologique appliquée à l’agriculture, la biotechnologie, l’agro-alimentaire et l’environnement ("du champ à l'assiette, en incluant santé animale et humaine")

Mission et enjeux

Axes de recherche

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

• Systèmes de culture innovants pour la transition agro-écologique et bioéconomique dans le contexte du changement climatique
• Biomolécules d’origine végétale et microbienne : de l’identification à la bioproduction
• Formulation - qualité et sécurité des aliments nutrition - santé

Compétences et expertises :

A l'échelle du département BAP

Créations variétales

• Génétique
• Ecophysiologie

Principaux modèles d'études :

Lien prochainement actif

A l'échelle du département BAP

Infos administratives :

• Miscanthus

• Pois / Légumineuses

• Effectif : 33 agents INRAE sur les 370 agents de l'unité (dont 170 permanents - dont 25 agents INRAE)
• Adresse : 180 rue Pierre Gilles de Gennes 02 000 Barenton Bugny
• Centre INRAE : Hauts-de-France

• Départements scientifiques : AgroEcoSystem, BAP

Plus largement

• Systèmes de grande culture conventionnels et bas intrants

Dispositifs particuliers :

Plateformes

Station ICOS

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale de Pech Rouge

Labellisations et certifications :

• ISC et ISO14001 (SME)

Systèmes de culture :

• Conventionnel
• Agriculture biologique
• AB à bas niveau d'intrants

Localisations : Gruissan (11)Centre INRAE Occitanie-Montpellier Unités partenaires : SPO, LEPSE, AGAP Départements scientifiques : Transform, BAP Effectif : 25 agents SAU : 60 ha

Type de culture :

Conditions climatiques : Type de sol :

Réseau CLIMATIK

Méditerranéen

• Vigne

Sols calcaires à horizon marneux Sols calcaires durs concassésSols sableux et sablo-limoneux

Culture :

• Vigne

Dispositifs contrôlés

Thématiques

Observations & Phénotypage

Contact

Site web d'unité

Unité de Service CNRGV

Centre National de Ressources Génomiques Végétales

Mots clés : • Genomique • Séquençage • Clonage • Assemblage • Annotation

Thématique :

Le CNRGV est à la fois un Centre de Ressources Biologiques (CRB) dédié aux ressources génomiques végétales provenant d'espèces modèles et cultivées, et une plateforme de génomique qui propose des outils et des services pour caractériser les génomes végétaux.

Missionset enjeux

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Offre de service

• Conservation de Banques d'ADN de plantes
• Clonage et caractérisation de grands fragments d’ADN
• Extraction d’ADN de haut poids moléculaire
• Scaffolding de Génomes Hi-C / Bionano
• Séquençage et Assemblage de Génomes
• Annotation structurale et fonctionnelle des génomes
• Séquençage de régions ciblées

Compétences et expertises :

• Génomique
• Génétique
• Bioinformatique

Principaux modèles d'études :

Infos administratives :

• Effectif : 14 agents permanents
• Adresse : 24 Chemin de Borde Rouge - 31326 Castanet Tolosan
• Centre INRAE : Occitanie Toulouse
• Département scientifique : BAP

• Ressources génomiques de plantes modèles et cultivées

Dispositifs particuliers :

CRB

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale UEAV

Unité Expérimentale Agronomique et Viticole de Colmar

Labellisations et certifications :

• ISC et ISO 14001 (SME)

Système de culture :

Localisations : Colmar, Bergheim, Wintzenheim, Ribeauvillé (68)Centre INRAE Grand Est - Colmar Unités partenaires : SVQV, SAVE, LAE, ECOSYS, ABSys, LEPSE, EMMAH, MISTEA, UR Sols Département scientifique : BAP SAU : 63 ha

• Très bas intrants

Types de culture :

• Vignes
• Grandes cultures

Réseau CLIMATIK

Conditions climatiques : Type de sol :

Semi-continental tempéré

Calcosol limono-argileux (Colmar) Argile limono-sableuse sur marne calcaire (Bergheim) Sablo-limoneux sur arène granitique (Wintzenheim)

Cultures :

• Vignes
• Céréales à pailles
• Maïs grain

• Soja
• Herbacées (serres)

Dispositifs contrôlés

Thématiques

Observations & Phénotypage

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche LPCV

Laboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale

Mots clés : • Plantes & algue • Photosynthèse • Métabolisme • Floraison • Stress • Cytosquelette

Thématique de recherche :

Le laboratoire étudie l’organisation fonctionnelle des cellules eucaryotes (plantes, micro-algues, cellules humaines, levures) avec un focus spécifique sur les cellules végétales et les micro-algues

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Axes de recherche

• Photosynthèse et métabolisme
• Morphogenèse et développement
• Réponse et adaptation à un environnement abiotique changeant

Compétences et expertises :

• Biochimie
• Biologie cellulaire
• Biologie moléculaire
• Bioinformatique
• Statistique

Principaux modèles d'études :

• Arabidopsis
• Cameline
• Chimie verte
• Micro-algues

Infos administratives :

• Effectif : 100 agents (dont 60 permanents)
• Adresse : 17 avenue des Martyrs - 38 054 Grenoble
• Centre INRAE : Lyon-Grenoble Auvergne-Rhône-Alpes
• Département scientifique : BAP

Dispositifs particuliers :

Plateformes

Contact

Site web d'unité

Unité d'Appui à la Recherche BAP

Biologie et Amélioration des Plantes

Rôle du département :

Le département est un réseau national coordonné d'unité, d'infrastructures et de compétences. Il se caractérise par ses disciplines, ses thématiques et ses objets d'étude. Dans son périmètre scientifique et thématique, le département contribue à l'élaboration de la stratégie scientifique de l'Institut et de sa stratégie de partenariat pour l'innovation, et les traduit en termes opérationnels. Il joue un rôle d'interface scientifique privilégiée entre les unités et la direction générale :

Missions de l'unité d'appui

L’ unité d’appui à la recherche du département BAP réunit la cellule administrative du département qui assure le pilotage et la coordination des volets administratifs et financiers ainsi que la communication. L’unité est également en charge des activités partenariales et d'innovation (y compris PLANTINNOV). Elle assure par ailleurs le suivi des unités expérimentales et des ressources génétiques.L’unité assiste le Chef de Département dans l'exercice de ses responsabilités et assure un rôle d’animation auprès de ses collectifs, en intervenant en relais des directions centrales.

• Il a en charge la programmation scientifique et alloue les moyens (délégués par la direction générale), pour la mise en œuvre du projet scientifique des unités • Il instruit les questions relatives à la gestion des compétences • Il anime la vie scientifique et partenariale, assure la veille et l'animation scientifique, et coordonne l'évaluation des unités

Publications

Infos administratives de l'UAR de Versailles :

• Effectif : 9 agents permanents
• Adresse : Route de Saint-Cyr - 78026 Versailles
• Centre INRAE : Ile-de-France Versailles-Saclay

Dispositifs :

26 plateformes

16 CRB

43 unités

Site web d'unité et contact

Unité expérimentale PHACC

PHénotypage Au Champ des Céréales

Labellisations et certifications :

• ISC et ISO 14001 (SME)

Système de culture :

Localisations : Clermont-Ferrand et Theix (63)Centre INRAE Clermont-Auvergne-Rhône-Alpes Unités partenaires : GDEC, LEPSE, AGAP, P3F, AgroEcologie, EMMAH, UREP, UMRH, LIPME, Herbipole Département scientifique : BAP SAU : 97 ha

• Un îlot en conduite sans intrants de synthèse

Types de culture :

• Grandes cultures
• Fourrages

Conditions climatiques : Type de sol :

Continental (Clermont)Océanique (Theix)

Réseau CLIMATIK

Réseau CAREX

Argilo-limoneux calcaire (Clermont) Limono-sableux granitique (Theix)

Cultures :

• Céréales à paille
• Graminées fourragères
• Protéagineux

• Maïs
• Tournesol
• Sorgho
• Luzerne

CRB

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Thématiques

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche BFP

Biologie du Fruit et Pathologie

Mots clés : •Développement •Métabolisme •Adaptation •Pathogènes •Changement climatique

Thématique de recherche :

L'unité mène des recherches en biologie fonctionnelle et prédictive des plantes et de leurs pathogènes

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Axes de recherche

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

• Explorer les frontières du vivant
• Aboutir à une vision intégrée du développement des plantes et des fruits
• Comprendre comment les plantes s’adaptent au changement climatique et aux pathogènes

Compétences et expertises :

• Métabolomique
• Physiologie
• Microbiologie
• Bioinformatique
• Modélisation

• Chimie
• Biochimie
• Biologie moléculaire
• Génétique, génomique
• Biologie synthétique

Créations variétales

Principaux modèles d'études :

• Tomate

• Fraisier
• Prunus (Cerisier, Abricotier, Amandier, Prunier)

• Arabidopsis

• Vigne
• Céréales (Blé, Orge)
• Betterave

Infos administratives :

• Effectif : 160 agents (dont 102 permanents)
• Adresse : 71 av. Edouard Bourlaux - 33882 Villenave d'Ornon
• Centre INRAE : Nouvelle-Aquitaine Bordeaux
• Départements scientifiques : BAP, SPE

Dispositifs particuliers :

Plateformes

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche IPSIM

Institut des Sciences des Plantes de Montpellier

Mots clés : • Nutrition • Croissance • Environnement • Développement racinaire

Thématique de recherche :

Les travaux visent à élucider les mécanismes fondamentaux régissant la nutrition hydro-minérale des plantes et leurs réponses aux contraintes abiotiques de l’environnement, notamment celles liées au changement climatique.

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Axes de recherche

• Étude des mécanismes d'action des transporteurs membranaires d'eau et d'ions chez les plantes
• Étude de la réponse moléculaire des plantes aux contraintes de l'environnement
• Étude du développement racinaire

Compétences et expertises :

• Biologie moléculaire
• Modélisation

• Génomique
• Génétique
• Biophysique

Principaux modèles d'études :

• Arabidopsis
• Blé
• lupin
• Maïs

• Medicago
• Pois
• Riz
• Vigne

Infos administratives :

• Effectif : 160 agents (dont 100 permanents)
• Adresse : 2 Place Viala - 34060 Montpellier
• Centre INRAE : Occitanie-Montpellier
• Département scientifique : BAP

Dispositifs particuliers :

Plateformes

Contact

Site web d'unité

Unité d'Appui à la Recherche associée-BAP

Biologie et Amélioration des Plantes

Rôle du département :

Le département est un réseau national coordonné d'unité, d'infrastructures et de compétences. Il se caractérise par ses disciplines, ses thématiques et ses objets d'étude. Dans son périmètre scientifique et thématique, le département contribue à l'élaboration de la stratégie scientifique de l'Institut et de sa stratégie de partenariat pour l'innovation, et les traduit en termes opérationnels. Il joue un rôle d'interface scientifique privilégiée entre les unités et la direction générale :

Missions de l'unité d'appui

L'unité d'appui réunit la cellule Ressources Humaines du département BAP.Elle assiste le Chef de département dans l'exercice de ses responsabilités en matière de Ressources Humaines. La cellule RH intervient, dans son périmètre d'activités, auprès de l'ensemble de l'équipe de direction du département, des agents et des unités BAP (de recherche et expérimentales) et des directions de l'Institut.

• Il a en charge la programmation scientifique et alloue les moyens (délégués par la direction générale), pour la mise en œuvre du projet scientifique des unités • Il instruit les questions relatives à la gestion des compétences • Il anime la vie scientifique et partenariale, assure la veille et l'animation scientifique, et coordonne l'évaluation des unités

Publications

Infos administratives de l'UAR associée :

• Effectif : 3 agents permanents
• Adresse : 2 place Pierre Viala - 34060 Montpellier
• Centre INRAE : Occitanie-Montpellier

Dispositifs :

26 plateformes

16 CRB

43 unités

Site web d'unité et contact

Unité Mixte de Recherche IPSIM

Institut des Sciences des Plantes de Montpellier

Mots clés : • Nutrition • Croissance • Environnement • Développement racinaire

Thématique de recherche :

Les travaux visent à élucider les mécanismes fondamentaux régissant la nutrition hydro-minérale des plantes et leurs réponses aux contraintes abiotiques de l’environnement, notamment celles liées au changement climatique.

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Axes de recherche

• Étude des mécanismes d'action des transporteurs membranaires d'eau et d'ions chez les plantes
• Étude de la réponse moléculaire des plantes aux contraintes de l'environnement
• Étude du développement racinaire

Compétences et expertises :

• Biologie moléculaire
• Modélisation

• Génomique
• Génétique
• Biophysique

Principaux modèles d'études :

• Arabidopsis
• Blé
• lupin
• Maïs

• Medicago
• Pois
• Riz
• Vigne

Infos administratives :

• Effectif : 160 agents (dont 100 permanents)
• Adresse : 2 Place Viala - 34060 Montpellier
• Centre INRAE : Occitanie-Montpellier
• Département scientifique : BAP

Dispositifs particuliers :

Plateformes

Contact

Site web d'unité

Unité de Recherche GAFL

Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes

Mots clés : •Diversité génétique •Immunité •Perte de sensibilité •Robustesse •Résilience •Durabilité

Thématique de recherche :

Mobiliser la diversité génétique naturelle et éditée pour adapter les variétés de fruits et légumes au changement climatique, réduire l'usage des pesticides, de l'eau, des engrais dans les cultures

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Axes de recherche

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

• Cibler les caractères primordiaux d'adaptation aux stress biotiques et abiotiques
• Identifier des sources de résistance
• Comprendre la fonction des déterminants de résistance dans les interactions plantes × bioagresseurs × environnements

Compétences et expertises :

• Génétique quantitative
• Génomique
• Edition

• Bioinformatique
• Phénotypage instrumenté

Créations variétales

Principaux modèles d'études :

• Abricotier
• Arabidopsis
• Aubergine

• Melon

• Pêcher
• Piment
• Porte-greffe Prunus
• Tomate

Infos administratives :

• Effectif : 75 agents (dont 50 permanents)
• Adresse : 67, allée des Chênes - 84143 Montfavet
• Centre INRAE : Provence-Alpes-Côte d'Azur
• Département scientifique : BAP

Dispositifs particuliers :

Réseau de vergers

CRB

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche AGAP Institut

Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes méditerranéennes et Tropicales

AGAP Institut s'inscrit dans le l'I-Site MUSE (pôles AEB et MIPS)

Thématique de recherche :

Les recherches portent sur les facteurs de développement des plantes et leur adaptation aux contraintes environnementales, l’organisation et la diversité des génomes, ainsi que sur l'agrobiodiversité.

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Axes de recherche

• Diversités et dynamique évolutive des plantes cultivées
• Structure et dynamique des génomes
• Développement et fonctionnement des plantes et des peuplements
• Déterminisme génétique et méthodologies de sélection

Compétences et expertises :

• Bioinformatique
• Sélection
• Modélisation
• Ecophysiologie

• Génétique
• Génomique
• Physiologie moléculaire

Créations variétales

Principaux modèles d'études :

• Vigne

• Blé dur
• Pommier
• Maïs
• Medicago

• Agrumes

• Riz
• Sorgho
• Palmier
• Bananier

Infos administratives :

• Effectif : 400 agents (dont environ 300 permanents)
• Adresse : Avenue d'Agropolis - 34398 Montpellier
• Centre INRAE : Occitanie-Montpellier
• Département scientifique : BAP

Dispositifs particuliers :

Plateformes

CRB

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche IRHS

Institut de Recherche en Horticulture et Semences

Mots clés : •Holobionte végétal •Phenomics •Fluxomique •Sélection génomique •Agroécologie

Thématique de recherche :

Les recherches portent sur les mécanismes impliqués dans la durabilité de la santé et des qualités des semences et des espèces horticoles, dans le contexte actuel de changements globaux.

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Axes de recherche

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

• Mécanismes de réponse et d’adaptation des plantes à l’environnement biotique et abiotique
• Mécanismes et stratégies de bio contrôle et autres méthodes alternatives aux intrants chimiques
• Histoires évolutives des plantes et microorganismes associés
• Recherche méthodologique et développement d’outils innovants

Compétences et expertises :

• Modélisation

• Bioinformatique
• Biostatistique
• Biophysique

• (Epi)Génomique
• (Epi)Génétique
• Phytopathologie
• (Eco)Physiologie
• Biochimie

Créations variétales

Principaux modèles d'études :

• Pommiers, poiriers
• Rosiers
• Carottes
• Semences
• Microbiote associé aux semences
• Bactéries et champignons phytopathogènes

Infos administratives :

• Effectif : 253 agents (dont 183 permanents)
• Adresse : 42 rue Georges Morel - 49071 Beaucouzé
• Centre INRAE : Pays de la Loire
• Départements scientifiques : BAP, SPE, AgroEcoSystem

Dispositifs particuliers :

Plateformes

CRB

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche IGEPP

Institut de Génétique pour l’Environnement et la Protection des Plantes

Mots clés : • Interaction • Protection • Environnement • Durabilité • Biodiversité • Adaptation

Thématique de recherche :

Compréhension des interactions entre plantes cultivées et environnement pour développer des méthodes agroécologiques innovantes et durables de protection des cultures et de production végétale dans un contexte de réduction des intrants externes.

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Axes de recherche

• Diversité et évolution des plantes et de leurs organismes associés
• Les réponses des plantes et l’adaptation de leurs organismes associés aux stress biotiques et abiotiques
• Fonctionnement des communautés en interaction au sein des agro-écosystèmes afin de proposer de nouvelles méthodes de protection des plantes et des systèmes de culture

Compétences et expertises :

• Ecologie
• Pathologie
• Epidémiologie
• Physiologie
• Biochimie

• Génétique
• Génomique
• Cytogénétique
• Bioinformatique
• Modélisation

Créations variétales

Principaux modèles d'études :

• Blé tendre
• Associations céréales à pailles - légumineuses à graines (pois, féverole, lentille)
• Brassica
• Pomme de terre

Infos administratives :

• Effectif : 250 agents (dont 156 permanents)
• Adresse : Domaine de la Motte - 35650 Le Rheu
• Centre INRAE : Bretagne-Normandie
• Départements scientifiques : SPE, BAP

Dispositifs particuliers :

Plateformes

CRB

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale de Pech Rouge

Labellisations et certifications :

• ISC et ISO14001 (SME)

Systèmes de culture :

• Conventionnel
• Agriculture biologique
• AB à bas niveau d'intrants

Localisations : Gruissan (11)Centre INRAE Occitanie-Montpellier Unités partenaires : SPO, LEPSE, AGAP Départements scientifiques : Transform, BAP Effectif : 25 agents SAU : 60 ha

Type de culture :

Conditions climatiques : Type de sol :

Réseau CLIMATIK

Méditerranéen

• Vigne

Sols calcaires à horizon marneux Sols calcaires durs concassésSols sableux et sablo-limoneux

Culture :

• Vigne

Dispositifs contrôlés

Thématiques

Observations & Phénotypage

Contact

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Unité Mixte de Recherche RDP

Laboratoire de Reproduction et de Développement des Plantes

Mots clés : • Développement et reproduction • Plantes • Biologie cellulaire • Biophysique

Thématique de recherche :

Les recherches portent sur la compréhension quantitative multi-échelle du développement et de l’évolution des structures reproductives des plantes.

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Axes de recherche

• Biologie et évolution du développement des plantes et de leurs systèmes de reproduction
• Biologie prédictive : rôle des signaux biochimiques et mécaniques dans la morphogénèse
• Problématiques sociétales : anthropocène, agriculture, architecture et urbanisme

Compétences et expertises :

• Biophysique
• Bioinformatique
• Modélisation

• Génétique
• Génomique
• Biologie cellulaire

Principaux modèles d'études :

• Maïs
• Pétunia
• Rose
• Arabidopsis

Infos administratives :

• Effectif : 122 agents (dont 67 permanents)
• Adresse : 46 rue d'Italie - 69364 Lyon
• Centre INRAE : Lyon-Grenoble Anuvergne-Rhône-Alpes
• Département scientifique : BAP

Dispositifs particuliers :

Plateformes

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche IGEPP

Institut de Génétique pour l’Environnement et la Protection des Plantes

Mots clés : • Interaction • Protection • Environnement • Durabilité • Biodiversité • Adaptation

Thématique de recherche :

Compréhension des interactions entre plantes cultivées et environnement pour développer des méthodes agroécologiques innovantes et durables de protection des cultures et de production végétale dans un contexte de réduction des intrants externes.

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Axes de recherche

• Diversité et évolution des plantes et de leurs organismes associés
• Les réponses des plantes et l’adaptation de leurs organismes associés aux stress biotiques et abiotiques
• Fonctionnement des communautés en interaction au sein des agro-écosystèmes afin de proposer de nouvelles méthodes de protection des plantes et des systèmes de culture

Compétences et expertises :

• Ecologie
• Pathologie
• Epidémiologie
• Physiologie
• Biochimie

• Génétique
• Génomique
• Cytogénétique
• Bioinformatique
• Modélisation

Créations variétales

Principaux modèles d'études :

• Blé tendre
• Associations céréales à pailles - légumineuses à graines (pois, féverole, lentille)
• Brassica
• Pomme de terre

Infos administratives :

• Effectif : 250 agents
• Adresse : Domaine de la Motte - BP 35327 - 35653 Le Rheu
• Centre INRAE : Bretagne-Normandie
• Départements scientifiques : SPE, BAP

Dispositifs particuliers :

Plateformes

CRB

Contact

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Unité de Service URGI

Unité Ressources Génomique-Info

s'inscrit dans le Labex SPS Univ Paris-Saclay

Mots clés : •Bioinformatique •Gestion de données •FAIR •Annotation de génomes •Eléments transposables

Thématique :

L'URGI est une plateforme bioinformatique qui soutient différentes activités de recherche sur les plantes d’intérêt agronomique et forestières pour INRAE.

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

Offre de services :

• Gestion des données suivant les principes FAIR

• Support à des fédérations internationales de systèmes d’information de données en agronomie

• Annotation des génomes avec le pipeline d’annotation haut débit d’éléments transposables : REPET
• Méthodes et outils pour l’intégration de données hétérogènes

Compétences et expertises :

• Génomique
• Génétique
• Bioinformatique

Portail de données

Principaux modèles d'études :

Infos administratives :

• Effectif : 16 agents (dont 12 permanents)
• Adresse : Route de Saint-Cyr - 78026 Versailles
• Centre INRAE : Ile-de-France Versailles-Saclay
• Département scientifique : BAP

• Plantes cultivées
• Arbres forestiers

Dispositifs particuliers :

Plateformes

Contact

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Unité Mixte de Recherche GDEC

Génétique Diversité Ecophysiologie des Céréales

Mots clés : •Blé •Génétique quantitative •Protéine végétale •Rendement •Immunité •Paléogénétique

Thématique de recherche :

Les recherches portent les processus biologiques à l'origine de la capacité d'adaptation des blés aux contraintes environnementales

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Axes de recherche

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

• Développer les connaissance sur la structure, l'organisation, le fonctionnement et l'évolution du génome du blé tendre
• Décrypter et modéliser les mécanismes moléculaires et physiologiques impliqués dans le contrôle de caractères agronomiques importants
• Analyser et valoriser les ressources génétiques
• Contribuer au développement de nouveaux outils et méthodes de sélection

Compétences et expertises :

• Bioinformatique
• Biologie prédictive
• Modélisation

• Génomique
• Génétique
• Epigénétique

Créations variétales

Principal modèle d'études :

Infos administratives :

• Blé

• Effectif : 110 agents (dont 80 permanents)
• Adresse : 5 chemin de Beaulieu - 63000 Clermont-Ferrand
• Centre INRAE : Clermont-Auvergne-Rhône-Alpes
• Départements scientifiques : BAP, AgroEcoSystem

Dispositifs particuliers :

Plateformes

CRB

Contact

Site web d'unité

Unité Mixte de Recherche IJPB

Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du Végétal

s'inscrit dans l'EUR SPS Univ Paris-Saclay

Mots clés : •Génomes •Développement •Modélisation •Signalisation •Physiologie végétale •Bioproduits

Thématique de recherche :

Les recherches visent à développer des concepts et des outils pour produire des connaissances fondamentales en sciences du végétal et les inscrire dans un processus d’innovation afin de répondre aux défis scientifiques et sociétaux actuels et à venir.

Missions et enjeux

Faits marquants BAP 2024

Axe de recherche

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

• Mieux comprendre les processus fondamentaux du fonctionnement des plantes et de leurs interactions avec l’environnement
• Concevoir les plantes de demain pour une agriculture durable face au défi climatique

• Développer de nouveaux produits dérivés des plantes pour les usages alimentaires et non-alimentaires

Compétences et expertises :

• Biologie
• Chimie
• Mathématiques appliquées

Principaux modèles d'études :

• Sorgho

• Pois
• Blé
• Tomate
• Cameline
• Orge
• Modèles microbiens

• Arabidopsis thaliana
• Brachypodium distachyon
• Physcomitrella patens
• Brassica napus
• Amaranthe
• Maïs

Infos administratives :

• Effectif : 300 agents (dont 187 permanents)
• Adresse : Route de Saint-Cyr - 78000 Versailles
• Centre INRAE : Île-de-France - Versailles-Saclay
• Départements scientifiques : BAP, Transform

Dispositif particulier :

CRB

Contact

Observatoire du Végétal

Site web d'unité

Unité de Service EPGV

Etude du Polymorphisme des Génomes Végétaux

s'inscrit dans le Labex SPS Univ Paris-Saclay

Mots clés : • Polymorphisme • Génotypage • Séquençage • Diversité • Caractérisation

Thématique :

Analyse de génomes et de leur diversité

Missionset enjeux

Offre de service :

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

• Analyse de génomes et de leur diversité
• Production, traçabilité et stockage pérenne de données génomiques
• Développement de protocoles adaptés aux spécificités des espèces végétales
• Mise à disposition d'outils de séquençage et de génotypage à haut débit afin de répondre aux besoins de programmes scientifiques
• Etablissement de processus et d'outils pour l'analyse et la gestion des données de polymorphisme

Compétences et expertises :

• Génomique
• Génétique
• Bioinformatique

Principaux modèles d'études :

Infos administratives :

• Plantes et animaux

• Effectif : 6 agents permanents
• Adresse : 2 rue Gaston Crémieux - 91057 Evry
• Centre INRAE : Ile-de-France Versailles-Saclay
• Département scientifique : BAP

Dispositifs particuliers :

Plateforme

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale APC

Agroécologie et Phénotypage des Cultures

Labellisations et certifications :

• ISC et ISO14001 (SME)

Systèmes de culture :

• Conventionnel
• Bas intrants
• Agriculture biologique
• ACS

Localisations : Auzeville-Tolosane (31)Centre INRAE Occitanie-Toulouse Unités partenaires : LIPME, AGIR, GDEC, IGEPP, LEPSE, EMMAH Départements scientifiques : AgroEcoSystem, BAP Effectif : 12 agents SAU : 80 ha

Type de culture :

Conditions climatiques : Type de sol :

Réseau CLIMATIK

• Grandes cultures

Tempéré océanique à influence méditerranéenne et continentale

Alluvions récentes argilo-limoneuses

Réseau CAREX

Cultures :

• Grandes cultures et cultures intermédiaires multi-service
• Céréales à paille

• Tournesol
• Sorgho

• Maïs

• Soja
• Pois
• Feverole
• Pois chiche

CRB

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Thématiques

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale UE VS

Unité Expérimentale Versailles-Saclay

Localisations : Versailles (78) et Saclay (91)Centre INRAE Ile-de-France - Versailles-Saclay Unités partenaires : GQE, IJPB, ECOSYS, BIOGER, Agronomie Départements scientifiques : BAP, AgroEcoSystem, SPE SAU : 80 ha

Système de culture :

• Un îlot en conduite sans intrants de synthèse

Type de culture :

• Grandes cultures

Réseau CLIMATIK

Conditions climatiques : Type de sol :

Océanique altéré

Limons profonds argileux

Cultures :

• Blé
• Orge
• Maïs fourrage
• Colza

• Luzerne
• Miscanthus
• Cameline

• Légumineuses (pois, féverole)
• Associations blé/pois

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Thématiques

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale APC

Agroécologie et Phénotypage des Cultures

Labellisations et certifications :

• ISC et ISO14001 (SME)

Systèmes de culture :

• Conventionnel
• Bas intrants
• Agriculture biologique
• ACS

Localisations : Auzeville-Tolosane (31)Centre INRAE Occitanie-Toulouse Unités partenaires : LIPME, AGIR, GDEC, IGEPP, LEPSE, EMMAH Départements scientifiques : AgroEcoSystem, BAP Effectif : 12 agents SAU : 80 ha

Type de culture :

Conditions climatiques : Type de sol :

Réseau CLIMATIK

• Grandes cultures

Tempéré océanique à influence méditerranéenne et continentale

Alluvions récentes argilo-limoneuses

Réseau CAREX

Cultures :

• Grandes cultures et cultures intermédiaires multi-service
• Céréales à paille

• Tournesol
• Sorgho

• Maïs

• Soja
• Pois
• Feverole
• Pois chiche

CRB

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Thématiques

Contact

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Unité de Recherche P3F

Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères

Mots clés : •Couverts prairiaux semés •Modélisation •Mélanges •Plantes de services •Ressources génétiques

Thématique de recherche :

L’unité a basé son projet sur une analyse conceptuelle du fonctionnement des prairies en fonction des contraintes du milieu et des objectifs de production.

Missionset enjeux

Faits marquants BAP 2024

Axes de recherche

Publications

Les recherches en lien avec les objectifs de BAP

• Adapter les prairies aux changements climatiques (température, eau, CO2)
• Mettre au point de nouveaux schémas de sélection
• Comprendre et améliorer la dynamique de la valeur alimentaire de la production fourragère par les prairies

Compétences et expertises :

• Ecophysiologie
• Génétique

Principaux modèles d'études :

• Luzerne
• Ray-grass
• Dactyle
• Fétuque

Infos administratives :

• Effectif : 57 agents (dont 37 permanents)
• Adresse : RD 150, CS 80006 - 86 600 Lusignan
• Centre INRAE : Nouvelle-Aquitaine-Poitiers
• Départements scientifiques : AgroEcoSystem, BAP

Dispositifs particuliers :

Services

CRB

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale DiaScope

Domaine Expérimental de Melgueil

Labellisations et certifications :

• ISC et ISO14001 (SME)

Systèmes de culture :

• Agriculture biologique
• Bas intrants
• Agroforesterie
• Scénarios hydriques différenciés

Localisations : Mauguio (34)Centre INRAE Occitanie-Montpellier Unités partenaires : AGAP, LEPSE, IJPB, GQE, LIPME, ABSys Département scientifique : BAP Effectif : 14 agents SAU : 70 ha

Types de culture :

• Grandes cultures
• Cultures fuitières

Conditions climatiques : Type de sol :

Réseau CLIMATIK

Méditerranéen

Sols alluviaux calcaires et sols fersialitiques

Cultures :

• Protéagineux (pois chiche, pois d'hiver)
• Pommiers
• Oliviers

• Blé
• Maïs
• Sorgho

CRB

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Thématiques

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale La Motte

Système de culture :

Localisation : Le Rheu (35)Centre INRAE Bretagne-Normandie Unités partenaires : IGEPP, SAS, PEGASE Département scientifique : BAP Effectif : 12 agents SAU : 280 ha

• Agroécologique

Type de culture :

• Grandes cultures

Réseau CLIMATIK

Conditions climatiques : Type de sol :

Océanique

Sols limoneux à battance marquée

Cultures :

• Blé
• Céréales à paille,
• Maïs
• Colza

• Crucifères fourragères
• Protéagineux
• Betterave fourragère
• Prairies et graminées fourragères

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Thématiques

Contact

Site web d'unité

Unité expérimentale RGCO

Ressources Génétiques Végétales en Conditions Océaniques

Labellisations et certifications :

• ISC et ISO 14001 (SME)

Systèmes de culture :

Localisation : Ploudaniel (29)Centre INRAE Bretagne-Normandie Unités partenaires : IGEPP, GQE, IJPB, AGAP Département scientifique : BAP Effectif : 6 agents SAU : 67 ha

• Agriculture biologique
• Conventionnel

Types de culture :

• Grandes cultures
• Cultures légumières

Conditions climatiques : Type de sol :

Réseau CLIMATIK

Océanique frais et humide

Sols profonds limoneux issus de dépôts éoliens et de la décomposition de la roche mère granitique

Réseau CAREX

Cultures :

• Chou
• Échalote
• ail

• Pomme de terre
• Maïs
• Blé
• Colza

CRB

Dispositifs contrôlés

Observations & Phénotypage

Thématiques

Contact

Site web d'unité