Sopa Azul 2

Biosíntesis de Macromoléculas

#BlueSoup

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Sara Torres Sobrados, Celia Muñoz Luna, Paula Morillo Moreno y Pablo Bertó García

¿Existe un gen homólogo para la síntesis de indigoidina en S. quinivorans?

Segunda Reunión Proyecto

Biosíntesis de Macromoléculas

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¿Cuál era el problema del cromatograma mezclado y cómo lo hemos solucionado?

¿Qué nos ha llevado a la conclusión de que el microorganismo responsable de la producción de indigoidina es Serratia quinivorans?

¿Qué se conoce sobre la síntesis de indigoidina en S. quinivorans? ¿Y en otros microorganismos?

Problemas:

Posible mezcla de varios microorganismos (simbiosis)

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1. ¿Cuál era el problema del cromatograma mezclado y cómo lo hemos solucionado?

Cultivo en placa con antibiótico (para seleccionar bacterias con plásmido insertado).

Soluciones:

Análisis del cromatograma y realización del BLAST

Secuenciación Sanger (probabilidad)

Dejamos crecer y aislamos el ADN plasmídico

Clonación del producto PCR e inserción de vectores (plásmidos) en bacterias E.Coli

Purificación del ADN tras PCR y electroforesis

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1. ¿Cuál era el problema del cromatograma mezclado y cómo lo hemos solucionado?

Alineamiento de secuencias por BLAST Serratia quinivorans

NCBI Resource Coordinators. (2023). BLAST: Basic Local Alignment Search Tool. National Center for Biotechnology Information (NCBI). https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/

Anális químico indigoidina

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2. ¿Qué nos ha llevado a la conclusión de que el microorganismo responsable de la producción de indigoidina es Serratia quinivorans?

EC 4.3.3.9: indigoidine synthase

https://iubmb.qmul.ac.uk/enzyme/reaction/misc/indigo.html Zhao M, Zhang XS, Xiong LB, Liu K, Li XF, Liu Y, Wang FQ. Establishment of an Efficient Expression and Regulation System in Streptomyces for Economical and High-Level Production of the Natural Blue Pigment Indigoidine. J Agric Food Chem. 2024 Jan 10;72(1):483-492. doi: 10.1021/acs.jafc.3c05696. Epub 2023 Dec 26. PMID: 38146267.

Ejemplo: Streptomyces

No existen estudios que prueben que la especie S. quinivorans pueda producir indigoidina

Ruta Metabólica

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3. ¿Qué se conoce sobre la síntesis de indigoidina en S. quinivorans? ¿Y en otros microorganismos?

Ejemplo: Erwinia chrysanthemi

Starr MP, Cosens G, Knackmuss HJ. Formation of the blue pigment indigoidine by phytopathogenic erwinia. Appl Microbiol. 1966 Nov;14(6):870-2. doi: 10.1128/am.14.6.870-872.1966. PMID: 16349687; PMCID: PMC1058434.

Reverchon S, Rouanet C, Expert D, Nasser W. Characterization of indigoidine biosynthetic genes in Erwinia chrysanthemi and role of this blue pigment in pathogenicity. J Bacteriol. 2002 Feb;184(3):654-65. doi: 10.1128/JB.184.3.654-665.2002. PMID: 11790734; PMCID: PMC139515.

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3. ¿Qué se conoce sobre la síntesis de indigoidina en S. quinivorans? ¿Y en otros microorganismos?

Base de datos usada: NCBI GenBank (formato FASTA)

Artículo: Reverchon S, Rouanet C, Expert D, Nasser W. Characterization of indigoidine biosynthetic genes in Erwinia chrysanthemi and role of this blue pigment in pathogenicity. J Bacteriol. 2002 Feb;184(3):654-65. doi: 10.1128/JB.184.3.654-665.2002. PMID: 11790734; PMCID: PMC139515.

Accesion number: AJ277403

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4. ¿Existe un gen homólogo para la síntesis de indigoidina en S. quinivorans?

KEGG Blastx: Erwinia chrysanthemi indA gene, indB gene and indC gene

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4. ¿Existe un gen homólogo para la síntesis de indigoidina en S. quinivorans?

MUCHAS GRACIAS!