Sopa Azul 2

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Biosíntesis de Macromoléculas

Blue Soup

Sara Torres Sobrados, Celia Muñoz Luna, Paula Morillo Moreno y Pablo Bertó García

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Biosíntesis de Macromoléculas

Segunda Reunión Proyecto

¿Qué se conoce sobre la síntesis de indigoidina en S. quinivorans? ¿Y en otros microorganismos?

¿Cuál era el problema del cromatograma mezclado y cómo lo hemos solucionado?

¿Qué nos ha llevado a la conclusión de que el microorganismo responsable de la producción de indigoidina es Serratia quinivorans?

¿Existe un gen homólogo para la síntesis de indigoidina en S. quinivorans?

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1. ¿Cuál era el problema del cromatograma mezclado y cómo lo hemos solucionado?

Problemas:

Posible mezcla de varios microorganismos (simbiosis)

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1. ¿Cuál era el problema del cromatograma mezclado y cómo lo hemos solucionado?

Soluciones:

Purificación del ADN tras PCR y electroforesis

Clonación del producto PCR e inserción de vectores (plásmidos) en bacterias E.Coli

Cultivo en placa con antibiótico (para seleccionar bacterias con plásmido insertado).

Dejamos crecer y aislamos el ADN plasmídico

Secuenciación Sanger (probabilidad)

Análisis del cromatograma y realización del BLAST

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2. ¿Qué nos ha llevado a la conclusión de que el microorganismo responsable de la producción de indigoidina es Serratia quinivorans?

Anális químico indigoidina

Alineamiento de secuencias por BLAST Serratia quinivorans

NCBI Resource Coordinators. (2023). BLAST: Basic Local Alignment Search Tool. National Center for Biotechnology Information (NCBI). https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/

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3. ¿Qué se conoce sobre la síntesis de indigoidina en S. quinivorans? ¿Y en otros microorganismos?

No existen estudios que prueben que la especie S. quinivorans pueda producir indigoidina

Ruta Metabólica

Ejemplo: Streptomyces

EC 4.3.3.9: indigoidine synthase

https://iubmb.qmul.ac.uk/enzyme/reaction/misc/indigo.html Zhao M, Zhang XS, Xiong LB, Liu K, Li XF, Liu Y, Wang FQ. Establishment of an Efficient Expression and Regulation System in Streptomyces for Economical and High-Level Production of the Natural Blue Pigment Indigoidine. J Agric Food Chem. 2024 Jan 10;72(1):483-492. doi: 10.1021/acs.jafc.3c05696. Epub 2023 Dec 26. PMID: 38146267.

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3. ¿Qué se conoce sobre la síntesis de indigoidina en S. quinivorans? ¿Y en otros microorganismos?

Ejemplo: Erwinia chrysanthemi

Reverchon S, Rouanet C, Expert D, Nasser W. Characterization of indigoidine biosynthetic genes in Erwinia chrysanthemi and role of this blue pigment in pathogenicity. J Bacteriol. 2002 Feb;184(3):654-65. doi: 10.1128/JB.184.3.654-665.2002. PMID: 11790734; PMCID: PMC139515.

Starr MP, Cosens G, Knackmuss HJ. Formation of the blue pigment indigoidine by phytopathogenic erwinia. Appl Microbiol. 1966 Nov;14(6):870-2. doi: 10.1128/am.14.6.870-872.1966. PMID: 16349687; PMCID: PMC1058434.

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4. ¿Existe un gen homólogo para la síntesis de indigoidina en S. quinivorans?

Base de datos usada: NCBI GenBank (formato FASTA)

Accesion number: AJ277403

Artículo: Reverchon S, Rouanet C, Expert D, Nasser W. Characterization of indigoidine biosynthetic genes in Erwinia chrysanthemi and role of this blue pigment in pathogenicity. J Bacteriol. 2002 Feb;184(3):654-65. doi: 10.1128/JB.184.3.654-665.2002. PMID: 11790734; PMCID: PMC139515.

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4. ¿Existe un gen homólogo para la síntesis de indigoidina en S. quinivorans?

KEGG Blastx: Erwinia chrysanthemi indA gene, indB gene and indC gene

MUCHAS GRACIAS!