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Análisis y estudio de biosistemas
Carolina Álvarez Marín
Created on March 14, 2025
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HidrogEnasa Fe-Fe
Análisis y estudio de biosistemas Grupo 101 Elaboró: Estefanía Alexia Anaid Villegas Esquivel A01369242 Ana Cristina Lagarda Perz A01772689 Carolina Álvarez Marín A01769638 Profesor: Juan Jesús Cruz Maldonado 14 de marzo del 2025
Análisis y estudio de biosistemas
Hidrógeno Verde con Enzimas: Innovación Biotecnológica
Resumen
Los métodos tradicionales de producción de hidrógeno requieren de mucha electricidad y necesitan de catalizadores costosos. Para hacer del hidrógeno una mejor alternativa, se propone el uso de hidrogenasa [FeFe] proveniente de Clostridium pasteurianum, cuya constante catalítica de 100-500 s⁻¹ la hace destacar. En su organismo de origen, tiene un papel importante en el equilibrio redox al tomar electrones y formar hidrógeno molecular.Se planea tener un cultivo de este organismo a 30-37 °C y pH 6-7, condiciones que favorecen la expresión de la enzima. Posteriormente, para extraerla, se realizará una lisis por sonicación y la purificación se llevará a cabo mediante precipitación con sulfato de amonio y cromatografía de intercambio aniónico.
Introducción/Justificación
Panorama general de la problemática
Propuesta de solución
Relevancia de resolver el problema
Características de la enzima
La caracterización de la ferredoxina hidrogenasa es crucial para comprender su eficiencia catalítica, estabilidad y condiciones óptimas de actividad. Esto permite optimizar su uso en la producción biotecnológica de hidrógeno, asegurando su rendimiento en condiciones industriales.
Propiedades
Papel en el Metabolismo
Reacción
Parámetros
Producción, purificación y caracterización de la enzima
Producción y Purificación
Ensayo cinético
Normatividad y principios de sustentabilidad asociados
Listado de normativas aplicables
Propuesta de métricas o indicadores
Impacto en las dimensiones del desarrollo sustentable
conclusiones
referencias
Este trabajo propone el uso de la ferredoxina hidrogenasa de Clostridium pasteurianum como una alternativa biotecnológica para la producción de hidrógeno. Esta enzima cataliza la conversión de protones en hidrógeno molecular bajo condiciones más sostenibles, con menor impacto ambiental y costos más bajos. Su implementación podría mejorar la eficiencia del proceso y acercarnos a un modelo energético más limpio y accesible.
Para alcanzar una transición energética más limpia, es crucial desarrollar alternativas de producción de hidrógeno más eficientes y sostenibles. La producción biotecnológica mediante enzimas permite generar hidrógeno sin necesidad de procesos altamente demandantes en energía ni metales preciosos, alineándose con objetivos de sustentabilidad.
I. Reacción Catalizada: La ferredoxina hidrogenasa cataliza la reacción reversible de conversión de protones en hidrógeno molecular. Esta reacción es clave en el metabolismo anaerobio, facilitando la producción y consumo de hidrógeno molecular.
El uso de ferredoxina hidrogenasa para la producción de hidrógeno se alinea con múltiples Objetivos de Desarrollo Sostenible (ODS), contribuyendo a un modelo energético más limpio y accesible.Ambiental: Reducir las emisiones de carbono al reemplazar procesos convencionales con biotecnología limpia (ODS 13: Acción por el clima). También contribuye al ODS 7 al promover energía limpia y asequible.Económico: Disminución de costos asociados al uso de catalizadores metálicos, promoviendo tecnologías accesibles y viables para su uso en la industria energética (ODS 7: Energía asequible y no contaminante).Social: La implementación de esta tecnología puede mejorar la calidad del aire y disminuir los riesgos para la salud pública relacionados con las emisiones contaminantes (ODS 3: Salud y bienestar).
La demanda de hidrógeno como fuente de energía renovable ha crecido debido a su potencial para reducir la dependencia de combustibles fósiles. Sin embargo, los métodos convencionales de producción, como la electrólisis y el reformado de gas natural, requieren altos costos energéticos y el uso de catalizadores metálicos costosos, lo que limita su sostenibilidad y viabilidad a gran escala.
Ensayo cinético
Para medir la actividad enzimática se decidió imitar el proceso que sucede in vivo desde la glucolisis hacia el camino de las pentosas fosfato donde el nadph es reducido y sus electrones son aprovechados por hidrogenasa fefe para producir hidrógeno molecular. Lo cual es medido mediante una cromatografía de intercambio de gases al cuantificar la catidad de hidrógeno producida en un ambiente de 98% nitrógeno.Las concentraciones de los reactantes son 25 mM Tris pH 7, 100 μM FNR, 80 μM oxidized Fd, 2 μM hydrogenasa fefe, 15 mM glucosa-6-fosfato (G6P), y 7 mM NADPH.
Figura 1. Diagrama de flujo para el ensayo de actividad enzimática propuesto por Lu et al, 2015. La FNR toma como sustrato al NADPH para reducirla y producir un hidrogenión. Mientras que la deshidrogenasa toma como sustrato al producto de la reacción anterior y lo transforma en hidrógeno molecular.
Producción y purificación
Para su obtención se planea tener un cultivo del organismo de origen en medio GS2 en un ambiente anaeróbico para evitar su oxidación e inhibición, desde 30-37 °C y con pH 6.0-7.0, usando glucosa o almidón como fuente de carbono.
Una vez que la célula alcance la máxima expresión de la hidrogenasa fefe se procederá a realizar una lisis por sonicación que es el primer paso para aislar, extraer y purificar proteínas. Este método fue elegido gracias a que minimiza la contaminación y es rápido
Por último se emplearan dos metodos para purificar la enzima. El primero es la precipitación con sulfato de amonio y posteriormente se realizará una cromatografía de intercambio aniónico.
Para medir el impacto de la propuesta en términos de sustentabilidad se utilizarán los siguientes indicadores:
- Producción anual de hidrógeno renovable (kg/año).
- Reducción de emisiones de CO₂ comparado con métodos convencionales (toneladas/año).
- Costo de producción por kilogramo de hidrógeno (USD/kg).
- Número de instalaciones o sistemas industriales que adoptan la tecnología.
- Mejora en la eficiencia catalítica (kcat/Km) lograda mediante la optimización enzimática.
Este trabajo demuestra que la ferredoxina hidrogenasa de Clostridium pasteurianum es una alternativa prometedora para producir hidrógeno renovable, al ser eficiente y más económica que métodos convencionales. Su implementación contribuye a la sostenibilidad ambiental (ODS 7, 13 y 3) al reducir emisiones y costos. Sin embargo, su alta sensibilidad al oxígeno y la necesidad de mejorar su estabilidad y eficiencia industrial son desafíos pendientes. Se recomienda continuar con estudios para optimizar su aplicación a gran escala.
Regulaciones
La producción biotecnológica de hidrógeno mediante ferredoxina hidrogenasa debe cumplir con diversas normativas enfocadas en la seguridad, eficiencia y sostenibilidad del proceso. Aunque en México aún no hay normas en el extranjero las principales regulaciones aplicables son:NFPA 2 (EE.UU.) – Normativa que regula la seguridad en instalaciones de hidrógeno, incluyendo su producción, almacenamiento y distribución. Este estándar es relevante debido a la reactividad del hidrógeno y los pelígros que conlleva. Acto Delegado UE 2023 (Unión Europea) – Reglamento que define las normas para la producción de hidrógeno renovable a partir de fuentes no biológicas, asegurando que el proceso biotecnológico sea considerado una opción sostenible y regulada. IEC 62282 (Normativa Internacional) – Proporciona directrices sobre pruebas de seguridad y eficiencia en sistemas de producción de hidrógeno, garantizando la confiabilidad del proceso a nivel industrial.
Papel en Metabolismo:
En Clostridium pasteurianum, la enzima regula el equilibrio redox y participa en la fermentación anaeróbica al transferir electrones desde la ferredoxina reducida hacia los protones, generando hidrógeno molecular.
Propiedades Fisicoquímicas:
- Peso molecular: Aproximadamente 50 kDa.
- Punto isoeléctrico (pI): Entre 5 y 7.
- Condiciones óptimas de actividad:
- pH óptimo: 6-8, con máxima actividad en condiciones neutras o ligeramente ácidas.
- Temperatura óptima: 25-40 °C.
- Sensibilidad al oxígeno: Altamente susceptible a la inactivación oxidativa.
- Estabilidad y almacenamiento: Se conserva en condiciones anaeróbicas y en soluciones tampón con agentes reductores.
Parámetros Cinéticos:
- Km para H₂: 10-50 µM (según la fuente biológica).
- Vmax: Variable según el organismo productor y la disponibilidad de electrones.
- kcat: Entre 100-500 s⁻¹, reflejando alta eficiencia catalítica
Para evaluar la actividad catalítica de la enzima se utilizará un ensayo que sigue la glucolosis y camino de las pentosas fosfato para producir hidrogeno moluclar a partir de NADPH. Lo cual se va a medir con la cantidad de hidrógeno producida Al ser una innovación no hay normas que la regulen en México, pero en el extrangero está la NFPA 2, el Acto Delegado UE 2023 y la IEC 62282. Al ser una alternativa amigable con el ambiente y de bajo costo esta directamente relacionada con los ODS 3, 7 y 13. Y para asegurarlo se medira con redución de CO2, producción anual y precio por kg.
- Bose, K. (2022). Textbook on Cloning, Expression and Purification of Recombinant Proteins. SpringerLink. https://doi.org/10.1007/978-981-16-4987-5
- Climate Change 2022: Mitigation of climate change. (n.d.). IPCC. https://www.ipcc.ch/report/ar6/wg3/
- Coker, J. A. (2016). Extremophiles and biotechnology: current uses and prospects. F1000Research, 5, 396. https://doi.org/10.12688/f1000research.7432.1
- DeCS - Descriptores en Ciencias de la Salud. (s.f.). Hidrogenasa. https://decs.bvsalud.org/es/ths/resource/?id=7017
- Hong, P., Koza, S., & Bouvier, E. S. P. (2012). A REVIEW SIZE-EXCLUSION CHROMATOGRAPHY FOR THE ANALYSIS OF PROTEIN BIOTHERAPEUTICS AND THEIR AGGREGATES. Journal of Liquid Chromatography &Amp Related Technologies, 35(20), 2923–2950. https://doi.org/10.1080/10826076.2012.743724
- INTERNATIONAL ELECTROTECHNICAL COMMISSION. (2020). IEC 62282-2-100. https://standards.iteh.ai/catalog/standards/sist/94c5806d-f502-4766-9cbc-05de23da986c/iec-62282-2-100-2020
- IPCC (2022). Climate Change 2022: Mitigation of climate change. https://www.ipcc.ch/report/ar6/wg3/
- Islam, M. S., Aryasomayajula, A., & Selvaganapathy, P. (2017). A review on macroscale and microscale cell lysis methods. Micromachines, 8(3), 83. https://doi.org/10.3390/mi8030083
- Kielkopf, C. L., Bauer, W., & Urbatsch, I. L. (2020). Bradford assay for determining protein concentration. Cold Spring Harbor Protocols, 2020(4), pdb.prot102269. https://doi.org/10.1101/pdb.prot102269
- Koo, J., Shiigi, S., Rohovie, M., Mehta, K., & Swartz, J. R. (2016). Characterization of [FeFe] Hydrogenase O2 Sensitivity Using a New, Physiological Approach. Journal of Biological Chemistry, 291(41), 21563–21570. doi:10.1074/jbc.m116.737122
- Kushkevych, I. (2022). Bacterial metabolism. In Elsevier eBooks (pp. 159–310). https://doi.org/10.1016/b978-0-443-18738-4.50005-x
- La Comisión Europea. (2023). REGLAMENTO DELEGADO (UE) 2023/1184 DE LA COMISIÓN de 10 de febrero de 2023 por el que se completa la Directiva (UE) 2018/2001 del Parlamento Europeo y del Consejo estableciendo una metodología común de la Unión en la que se definan normas detalladas para la producción de carburantes líquidos y gaseosos renovables de origen no biológico. Diario Oficial de la Unión Europea. https://eur-lex.europa.eu/legal-content/ES/TXT/HTML/?uri=CELEX:32023R1184#tit_1Lubitz, W., Ogata, H., Rüdiger, O., & Reijerse, E. (2014). Hydrogenases. Chemical Reviews, 114(8), 4081–4148. https://doi.org/10.1021/cr4005814
- Libretexts. (2021, March 6). 4.1: protein purification. Biology LibreTexts. https://bio.libretexts.org/Bookshelves/Biochemistry/Supplemental_Modules_%28Biochemistry%29/4._Biotechnology_2/4.1%3A_Protein_Purification?utm_source=chatgpt.com
- Lu, F., Smith, P. R., Mehta, K., & Swartz, J. R. (2015). Development of a synthetic pathway to convert glucose to hydrogen using cell free extracts. International Journal of Hydrogen Energy, 40(30), 9113–9124. doi:10.1016/j.ijhydene.2015.05.121
- Lubitz, W., Ogata, H., Rüdiger, O., & Reijerse, E. (2014). Hydrogenases. Chemical Reviews, 114(8), 4081–4148. https://doi.org/10.1021/cr4005814
- Mayfosh, A. J., Day, Z. I., Unsworth, N. B., Liu, C., Gupta, R., Haynes, S., Abraham, R., Abraham, S., Shaw, Z. L., Walia, S., Elbourne, A., Hulett, M. D., & Rau, T. F. (2022). GS-2: a novel Broad-Spectrum Agent for Environmental Microbial Control. Biomolecules, 12(9), 1293. https://doi.org/10.3390/biom12091293
- MIT Climate Portal. (2024). How clean is green hydrogen?. https://climate.mit.edu/ask-mit/how-clean-green-hydrogen
- Moldoveanu, S. C., & David, V. (2017). Short overviews of the main analytical techniques containing a separation step. In Elsevier eBooks (pp. 55–85). https://doi.org/10.1016/b978-0-12-803684-6.00003-2
- Rabinowitz, J. C. (1993). The Clostridium pasteurianum Ferredoxin Gene. In Brock/Springer series in contemporary bioscience (pp. 363–372). https://doi.org/10.1007/978-1-4615-7087-5_25
- Rabinowitz, J. C. (1993). The Clostridium pasteurianum Ferredoxin Gene. In Brock/Springer series in contemporary bioscience (pp. 363–372). https://doi.org/10.1007/978-1-4615-7087-5_25
- Schuchmann, K., & Müller, V. (2014). Autotrophy at the thermodynamic limit of life: a model for energy conservation in acetogenic bacteria. Nature Reviews Microbiology, 12(12), 809–821. https://doi.org/10.1038/nrmicro3365
- Schuchmann, K., & Müller, V. (2014). Autotrophy at the thermodynamic limit of life: a model for energy conservation in acetogenic bacteria. Nature Reviews Microbiology, 12(12), 809–821. https://doi.org/10.1038/nrmicro3365
- Smutná, T., Dohnálková, A., Sutak, R., Narayanasamy, R. K., Tachezy, J., & Hrdý, I. (2021). A cytosolic ferredoxin-independent hydrogenase possibly mediates hydrogen uptake in Trichomonas vaginalis. Current Biology, 32(1), 124-135.e5. https://doi.org/10.1016/j.cub.2021.10.050
- Syed, K. (2024). Ferredoxins: Functions, evolution, potential applications, and challenges of subtype classification. Current Issues in Molecular Biology, 46(9), 9659–9673. https://doi.org/10.3390/cimb46090574
- Wang, S., Huang, H., Kahnt, J., & Thauer, R. K. (2013). A Reversible Electron-Bifurcating Ferredoxin- and NAD-Dependent [FeFe]-Hydrogenase (HydABC) in Moorella thermoacetica. Journal of Bacteriology, 195(6), 1267–1275. https://doi.org/10.1128/jb.02158-12
- Wingfield, P. (1998). Protein precipitation using ammonium sulfate. Current Protocols in Protein Science, 13(1). https://doi.org/10.1002/0471140864.psa03fs13
- Yacoby, I., Pochekailov, S., Toporik, H., Ghirardi, M. L., King, P. W., & Zhang, S. (2011). Photosynthetic electron partitioning between [FeFe]-hydrogenase and ferredoxin:NADP + -oxidoreductase (FNR) enzymes in vitro. Proceedings of the National Academy of Sciences, 108(23), 9396–9401. https://doi.org/10.1073/pnas.1103659108