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Coccinelles arlequin
Richy
Created on March 13, 2025
Permet d'aborder la biodiversité intraspécifique et la définition d'espèce
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Transcript
Les coccinelles arlequins
Une seule espèce ou plusieurs ?
Introduction
Réalisé à partir du travail de Stéphane Varaire.
Direction le labo
Les objectifs ce travail sont de :- Savoir s'il s'agit de variations intraspécifiques (au sein d'une même espèce) ou spécifiques (plusieurs espèces différentes). - Savoir si les coccinelles arlequins sont de la même espèce que Coccinella septempunctata. - Connaitre l'origine précise de cette variabilité.
Mais connaissez-vous les coccinelles arlequins ?Il s'agit de coccinelles présentant des motifs variés sur leur élytres (la carapace protégeant leurs ailes). Il s'agit d'un bon exemple de diversité des êtres vivants...
Tout le monde connait la coccinelle à 7 points Coccinella septempunctata, une grande habituée de nos jardins...
Bibliothèque
Il y a tâche et tâche....
Des infos sur la coccinelle? ... c'est par ici !
Séquencer l'ADN
Localiser et inactiver des gènes
Faire des croisements
Lancer l'analyse génétique pour connaitre la région responsable du motif des élytres
Afin d'identifier la région du génome associée aux variations de coloration des élytres, nous avons séquencé plusieurs génomes de coccinelles et les avons comparé entre eux.
Afin d'identifier la région du génome associée aux variations de coloration des élytres, nous avons séquencé plusieurs génomes de coccinelles et les avons comparé entre eux.
Inactiver le gène itr
Inactiver le gène pnr
Inactiver le gène aor
Nous avons identifié une région bien précise du chromosome 4 de la coccinelle arlequin, dont les variations de séquences sont corrélées avec les variations de coloration. Cette région s’étend sur trois gènes : le gène aor, le gène pnr et le gène itr Pour pouvoir savoir lequel de ces trois gènes est impliqué, on peut inactiver chaque gène l'un après l'autre et d’observer les effets de cette inactivation sur les caractéristiques de la coccinelle.
Refaire une expérience d'inactivation
Expérience d'inactivation du gène pnr
Gène pnr inactif
Gène pnr actif(expérience témoin)
Black-2spots
Black-nspots
Red-nspots
Black-4spots
Black-2spots
Black-nspots
Red-nspots
Black-4spots
Refaire une expérience d'inactivation
Expérience d'inactivation du gène aor
Gène aor inactif
Gène aor actif(expérience témoin)
Black-2spots
Black-nspots
Red-nspots
Black-4spots
Black-2spots
Black-nspots
Red-nspots
Black-4spots
Refaire une expérience d'inactivation
Expérience d'inactivation du gène itr
Gène itr inactif
Gène itr actif(expérience témoin)
Black-2spots
Black-nspots
Red-nspots
Black-4spots
Black-2spots
Black-nspots
Red-nspots
Black-4spots
Pour accéder au contenu de l'enveloppe, saisissez le mot de passe.
Introduire le mot de passe
refermer le placard
l'oeil est ici
Les 2 tâches blanches derrière la tête ne sont pas des yeux (mais juste des taches)
Attention aux yeux des coccinelles
refermer le placard
Entrez le chiffre correspondant au chromosome concerné par le séquencage.
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Recommencer le sequençage
Recommencer le sequençage
___
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Recommencer le sequençage
Recommencer le sequençage
x__
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Recommencer le sequençage
Recommencer le sequençage
xx_
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Recommencer le sequençage
Recommencer le sequençage
___
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Recommencer le sequençage
Recommencer le sequençage
x__
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Recommencer le sequençage
Recommencer le sequençage
xx_
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Si vous avez testé les 3 gènes, il est temps de retourner au labo et de découvrir le contenu de l'enveloppe en saisissant le code "4pnr4"
Recommencer le sequençage
La séquence d'ADN demandée a bien été séquencée.Il existe 4 allèles de ce gène pnr ("pannier") : hsp : allèle trouvé chez Black-4spots hA : allèle trouvé chez Black-nspots hC : allèle trouvé chez Black-2spots h : allèle trouvé chez Red-nspots
Recommencer le sequençage
Recommencer le sequençage
ERREUR : ce n'est pas le bon gène !
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Recommencer le sequençage
Recommencer le sequençage
Ce chromosome contient plein de gènes, mais celui choisi ne participe à la mise ne place du motif des élytres.
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Sélectionnez les coccinelles que vous voulez croiser...
Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Refaire un croisement
Sélectionnez une deuxième coccinelle...
Descendant viable et fertile
Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Refaire un croisement
Descendant viable et fertile
Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Refaire un croisement
Descendant viable et fertile
Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Refaire un croisement
Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Pas de croisement possible
Refaire un croisement
Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Refaire un croisement
Sélectionnez une deuxième coccinelle...
Descendant viable et fertile
Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Refaire un croisement
Descendant viable et fertile
Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Refaire un croisement
Descendant viable et fertile
Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Refaire un croisement
Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Pas de croisement possible
Refaire un croisement
Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Refaire un croisement
Sélectionnez une deuxième coccinelle...
Descendant viable et fertile
Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Refaire un croisement
Descendant viable et fertile
Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Refaire un croisement
Descendant viable et fertile
Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
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Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Pas de croisement possible
Refaire un croisement
Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
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Sélectionnez une deuxième coccinelle...
Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
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Pas de croisement possible
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Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
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Pas de croisement possible
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Coccinella septempunctata
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Coccinella septempunctata
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Coccinella septempunctata
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Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Refaire un croisement
Explorer le genial.ly pour répondre aux questions suivantes :
Travail à faire :
- Définir le concept d’espèce.
- A partir des croisements, déduire si les coccinelle arlequin constituent une seule ou plusieurs espèces ET si cette/ces espèce(s) est/sont distincte(s) de Coccinella septenpunctata.
- Si il s'agit de la même espèce, expliquer l’origine de la variabilité des phénotypes des coccinelles arlequins. Soyez le plus précis possible !
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- Définir le concept d’espèce.
- A partir des croisements, déduire si les coccinelle arlequin constituent une seule ou plusieurs espèces ET si cette/ces espèce(s) est/sont distincte(s) de Coccinella septenpunctata.
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Article Les critères de reconnaissance de l'espèce, Agnès Dettaï, mai 2008
Définition d'espèce
L'espèce est un concept flou dont il existe une multitude de définitions (définition écologique, morphologique, phylogénétique, ...). Dans son plus simple sens, le concept d'espèce permet de distinguer les différents types d'organismes vivants en identifiants des caractères distinctifs de l'espèce (présence ou ressemblance génétiques, morphologiques, comportementales, ...) La définition la plus communément citée est celle du concept biologique énoncé par Ernst Mayr en 1942 : "Les espèces sont des groupes de populations naturelles, effectivement ou potentiellement interfécondes, qui sont génétiquement isolées d'autres groupes similaires". A cette définition a été rajouté que l'espèce doit avoir une descendance viable et fertile.
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Phénotypes : Ensemble des traits observables d'un organisme. Génotype : Composition allélique de tous les gènes de cet individu. Génome : Ensemble des chromosomes et des gènes (d'une espèce ou d'un individus). Mutation : modification accidentelle ou provoquée de l'infomation génétique (ADN ou ARN) dans le génome
Rappels de génétique
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Travail à faire :
- Définir le concept d’espèce.
- A partir des croisements, déduire si les coccinelle arlequin constituent une seule ou plusieurs espèces ET si cette/ces espèce(s) est/sont distincte(s) de Coccinella septenpunctata.
- Si il s'agit de la même espèce, expliquer l’origine de la variabilité des phénotypes des coccinelles arlequins. Soyez le plus précis possible !
Explorer le genial.ly pour répondre aux questions suivantes :
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