TP12 : Appréhender la biodiversité L'exemple des coccinelles arlequins

TP12 : Appréhender la biodiversité L'exemple des coccinelles arlequins

Réalisé à partir du travail de Stéphane Varaire. Merci

INTRO

Tout le monde connait la coccinelle à 7 points Coccinella septempunctata, une grande habituée de nos jardins...

Mais il existe des coccinelles présentant des motifs variés sur leurs élytres. On les appelle les coccinelles arlequins.

Objectif : On cherche à savoir si la variabilité des motifs présents sur les élytres des coccinnelles constitue une biodiversité spécifique (plusieurs espèces) ou intraspécifique (une seule espèce) et déterminer l'origine de cette variabilité.

Travail à faire : Naviguez dans le genially et réalisez les tâches proposées. Notez pour chacune vos observations et vos conclusions. Répondez au problème.

Direction le labo

Des infos sur la coccinelle? ... c'est par ici !

La notion d'espèce

Rappels de génétique

Tâche 3 :Séquencer l'ADN

Tâche 2 :Localiser et inactiver des gènes

Tâche 1 : Faire des croisements

Retour à l'intro

Afin d'identifier la région du génome associée aux variations de coloration des élytres, nous avons séquencé plusieurs génomes de coccinelles et les avons comparé entre eux.

Nous avons identifié une région bien précise du chromosome 4 de la coccinelle arlequin, dont les variations de séquences sont corrélées avec les variations de coloration. Cette région s’étend sur trois gènes : le gène aor, le gène pnr et le gène itr Pour pouvoir savoir lequel de ces trois gènes est impliqué, on peut inactiver chaque gène l'un après l'autre et d’observer les effets de cette inactivation sur les caractéristiques de la coccinelle.

Inactiver le gène aor

Inactiver le gène pnr

Inactiver le gène itr

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Expérience d'inactivation du gène pnr

Red-nspots

Black-nspots

Black-4spots

Black-2spots

Gène pnr actif(expérience témoin)

Gène pnr inactif

Refaire une expérience d'inactivation

Red-nspots

Black-nspots

Black-4spots

Black-2spots

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Expérience d'inactivation du gène aor

Red-nspots

Black-nspots

Black-4spots

Black-2spots

Gène aor actif(expérience témoin)

Gène aor inactif

Refaire une expérience d'inactivation

Red-nspots

Black-nspots

Black-4spots

Black-2spots

Retour au labo

Expérience d'inactivation du gène itr

Red-nspots

Black-nspots

Black-4spots

Black-2spots

Gène itr actif(expérience témoin)

Gène itr inactif

Refaire une expérience d'inactivation

Red-nspots

Black-nspots

Black-4spots

Black-2spots

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refermer le placard

Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Entrez le chiffre correspondant au chromosome concerné par le séquencage.

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

___

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

x__

Recommencer le sequençage

Recommencer le sequençage

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

xx_

Recommencer le sequençage

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

___

Recommencer le sequençage

Recommencer le sequençage

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

x__

Recommencer le sequençage

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

xx_

Recommencer le sequençage

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La séquence d'ADN demandée a bien été séquencée.Il existe 4 versions (allèles) de ce gène pnr ("pannier") : hsp : allèle trouvé chez Black-4spots hA : allèle trouvé chez Black-nspots hC : allèle trouvé chez Black-2spots h : allèle trouvé chez Red-nspots

Que faire ?

Lien vers GenieGen2

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ERREUR : ce n'est pas le bon gène !

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Ce chromosome contient plein de gènes, mais aucun ne participe à la mise en place du motif des élytres.

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Sélectionnez les coccinelles que vous voulez croiser...

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Sélectionnez une deuxième coccinelle...

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

Pas de croisement possible

Sélectionnez une deuxième coccinelle...

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

Pas de croisement possible

Sélectionnez une deuxième coccinelle...

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Pas de croisement possible

Sélectionnez une deuxième coccinelle...

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Pas de croisement possible

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Pas de croisement possible

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Pas de croisement possible

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-nspots

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ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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