Réseau PHENOME

l'Infrastructure de recherche PHENOME-EMPHASIS

pour le PhÉnotypage vÉgÉtal haut débit en france

Les sites de l'IR PHENOME-EMPHASIS (& projet AgroEcoPhen)

Le réseau des développeurs de solutions de phenotypage

Les utilisateurs d'outils de phenotypage

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Sites des installations

de l'iR PHENOME-EMPHASIS pour le PhÉnotypage haut-dÉbit des plantes

Vers les sites d'expérimentations spécialisés (Projet AgroEcoPhen)

sites d'experimentations complémentaires

projet AGROEcoPhen porté par l'IR Phenome-EMPhasis pour le PhÉnotypage haut-dÉbit des plantes

Grandes Cultures

Arboriculture

Vigne

Vers le réseau des développeurs de solutions pour le phénotypage

le Réseau d'expertises

PERSONNEL RESSOURCE - developpeurs de solutions IR Phenome-EMphasis pour le PhÉnotypage haut-dÉbit des plantes

Développement de solutions de traitement de données

Systèmes d'information PHIS-SIXTINE

Capteurs pour le phenotypage Haut-débit

4P - Plateforme de traitement de données pour le Phenotypage des plantes

Vers le réseau des utilisateurs d'outils de phénotypage

LE REseau d'expertises

PERSONNEL RESSOURCE - UtiliSATeurs d'outils l'IR Phenome-emphasis pour le PhÉnotypage haut-dÉbit des plantes

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RÉSEAU INTERNATIONAL DU PHÉNOTYPAGE VÉGÉTAL

European plateforme for Plant phenotyping

PORTAIL des infrastructures de recherche INRAE

Reseau des Infrastrcutrures Nationales de Biologie Santé (INBS)

Montpellier - Grandes Cultures

• INRAE - Unité Expérimentale Diascope (observation de la biodisversité) - Contact: Romain Chapuis
• INRAE - Laboratoire d’Écophysiologie des Plantes Sous Stress Environnementaux (UR LEPSE) - Contact : Bertrand Muller
• GEVES - (Groupe d’Etude et de contrôle des Variétés Et des Semences) - Contact : Nathalie Luchaire

Réseau des dronistes du phenotypage végétal

Mail générique - utilisateurs drones INRAE Tele-pilote@inrae.fr

Animation: Franck Tison, UMR EMMAH, Avignon Rémy Marandel, UE APC, INRAE Toulouse

Sites de partage des bonnes pratiques drones : Wiki drones INRAE

Occitanie - Montpellier

MCP-DATA Système d'information distribué

Plateformes Conditions controlées

M3P (INRAE) PHENOARCH - Réponse génétique des plantes à la secheresse, température et lumière PHENODYN - enregistrement dynamique de la croissance des organes sous contrainte hydrique PHENOPSIS - automate d'irrigation et de prises d'images situé en chambre de culture de 1,5 x 5 m Responsable: Llorenç Carrera

MISTEA - Mathématiques, Informatique et STatistique pour l'Environnement et l'Agronomie (INRAE) Développement du système d'information (PHIS) qui permet d'organiser et de stocker des jeux de données Responsable: Isabelle Alic

Occitanie - Toulouse PHENOTOUL

Platforme Champ AgroPhen (INRAE) stress biotiques et sécheresse, pour grandes cultures Responsable : Gilles Tison

Platformes Conditions contrôlées Heliaphen - Polliphen (INRAE) stress hydrique, relation plante-pollinisateurs Responsable : Nicolas Langlade TPMP (INRAE) interactions biotiques et abiotiques, interaction plantes-pathogènes Responsable: Nemo Peeters

INRAE - Auvergne-Rhone-Alpes - Clermont-Fd

INRAE - UE PHACC

INRAE - UMR PIAF (Physique et Physiologie de l'Arbre en Environnement Fluctuant)

Boris Adam David Cormier Christophe Serre

INRAE - UE BFP

Piquets - Drone - Perche Phenomobile

Benedicte Wenden

Piquets connectés

Bruno Moulia

Perche

Drone

GEVES - Pays-de-Loire

GEVES

Nicolas Mascher

Drone - Perche

Angers - Horticulture et Analyse d'images

• IRHS - Institut de recherche en horticulture et semences - Equipe ImHorPhen
• Contact : David Rousseau
• Unité Expérimentale Horticole - Contact : David Lanoue

Angers - Expérimentation au champ

• GEVES (Groupe d’Etude et de contrôle des Variétés Et des Semences) - Contact Nicolas Mascher

Plateforme Conditions Controlées PHENOTIC (INRAE - GEVES - Univ. Angers - Institut Agro) Interaction plante-pathogènes (S2-S3) et analyse d'images asistée par ordinateur Responsable: Tristan Boureau Didier Demilly

Plateforme d'expérimentation au champ PHENOVAR (GEVES) Phénotypage au champ avec vecteurs mobiles légers et envirotypage dans le cadre d’essais de variétés Responsable: Nicolas Mascher

MCP DEV - Capteurs et Methodes Equipe ImHorPhen ( IRHS - INRAE - Univ. Angers - Institut Agro) Analyse d'image par DeepLearning Responsable: David Rousseau

GEVES - Le Magneraud

GEVES

Nicolas Mascher

Drone

Ouzouer-le-marché / Orleans

Plateforme Champ PHENOFIELD - ARVALIS Déficit hydrique grandes cultures REsponsable : Katia Beauchene

INRAE - Auvergne-Rhone-Alpes - Clermont-Fd

INRAE - UE PHACC

INRAE - UMR PIAF (Physique et Physiologie de l'Arbre en Environnement Fluctuant)

Boris Adam David Cormier Christophe Serre

INRAE - UE BFP

Piquets - Drone - Perche Phenomobile

Benedicte Wenden

Piquets connectés

Bruno Moulia

Perche

Drone

Le Magneraud - Expérimentation au champ

• GEVES (Groupe d’Etude et de contrôle des Variétés Et des Semences) - Contact Christophe Grizeau

INRAE - Auvergne-Rhone-Alpes - Clermont-Fd

INRAE - UE PHACC

INRAE - UMR PIAF (Physique et Physiologie de l'Arbre en Environnement Fluctuant)

Boris Adam David Cormier Christophe Serre

INRAE - UE BFP

Piquets - Drone - Perche Phenomobile

Benedicte Wenden

Piquets connectés

Bruno Moulia

Perche

Drone

Réseau des utilisateurs de perches INRAE

Information via liste de diffusion

literal-phenoman@inrae.fr

Animation et demande d'inscription: Mathieu Roy et Remy Marandel, UE APC, Toulouse

INRAE - Hauts-de-France - Lille

INRAE - UE GCIE

Drone - Piquets

Stephanie Arnoult

INRAE - PACA- Avignon

INRAE - UR GAFL

INRAE - UR PSH

Morgane Roth

INRAE - UE A2M

Gilles Vercambre

Chloé Guérin

Quentin Barra

Mathias Lefebvre

Perche - Drone Phenomobile

Phenomobile

Perche - Drone Phenomobile

Pheno- mobile

Drone

Benoit De Solan

Perche - Drone

PHENOVAR Le Magneraud - GEVES

Phénotypage au champ avec vecteurs mobiles légers et envirotypage dans le cadre d’essais de variétés

3 sites constituent le Nœud Phénovar : Anjouère, Le Magneraud, Montpellier Le Magneraud - Expertise variétale sur 25 espèces différentes, dans des essais DHS et VATE conduits en microparcelles, lignes ou plantes isolées, notamment pour l’évaluation des variétés par rapport aux stress hydriques et thermiques Contact: Nicolas Mascher

Nouvelle Aquitaine - Bordeaux

Plateforme Analytique HitMe (INRAE - Univ. Bordeaux) Quantifications ciblées de métabolites et d’activités enzymatiques haut-débit Responsable: Yves Gibon

GEVES - Pays-de-Loire

GEVES

Nicolas Mascher

Drone - Perche

Clermont-Ferrand - Grandes Cultures

• Unité Expérimentale PHACC (PHenotypage Au Champs des Céréales) - Contact : Boris Adam

• Unité Mixte de Recherche Génétique Diversité Ecophysiologie des Céréales (GDEC) - Contact: Jacques Le Gouis, responsable de WP

INRAE - Auvergne-Rhone-Alpes - Clermont-Fd

INRAE - UE PHACC

INRAE - UMR PIAF (Physique et Physiologie de l'Arbre en Environnement Fluctuant)

Boris Adam David Cormier Christophe Serre

INRAE - UE BFP

Piquets - Drone - Perche Phenomobile

Benedicte Wenden

Piquets connectés

Bruno Moulia

Perche

Drone

• INRAE - Unité Expérimentale Pech-Rouge (vigne oenologie) - Contact: Nicolas Saurin

Gruisan - Vigne

INRAE - Auvergne-Rhone-Alpes - Clermont-Fd

INRAE - UE PHACC

INRAE - UMR PIAF (Physique et Physiologie de l'Arbre en Environnement Fluctuant)

Boris Adam David Cormier Christophe Serre

INRAE - UE BFP

Piquets - Drone - Perche Phenomobile

Benedicte Wenden

Piquets connectés

Bruno Moulia

Perche

Drone

INRAE - Grand Est - Colmar

INRAE - UE AV Phenomobile

Lionel LEY

Dijon - Grandes Cultures

• INRAE - Unité Expérimentale Domaine d'Epoisses (U2E) - Contact: Pascal Marget

Dijon

Plateforme Conditions Controlées 4PMI - Plant Phenotyping Platform for Plant and Micro-organism Interactions (INRAE) Interaction plante-microorganismes, phenotypage des organes aériens et racinaires Responsable : Marion Prudent

Bordeaux - Vigne

• Unité Expérimentale Vigne & vin Bordeaux - Contact:Jean-Pascal Goutouly

Bordeaux - Arboriculture

• Unité Expérimentale Arboricole - Contact: : David Alletru

Lien vers le site de l'unité

Colmar - Vigne

• Unité Expérimentations Agronomiques et Viticoles (UE AV Contact: Lionel Ley
• Unité Mixte de Recherche Santé de Vigne et Qualité du Vin (UMR SVQV) - contact: Eric Duchene, responsable de WP

Lille - Grandes Cultures

• Unité Expérimentale Grandes Cultures Innovation Environnement (GCIE) - Estrée de Mons

Contact: Stephanie Arnoult

Plateforme Champ

Diaphen (INRAE) Grandes cultures et arboriculture sous climat méditerranéens : contraintes hydriques et thermiques Responsable: Romain Chapuis

Pays de Loire - Nantes

Plateforme Analytique BIBS (INRAE)

Chemotypage des biopolymères (fibres végétales) Responsable: Sophie Le Gall

PHENOVIA - Bretenière (21)

Plateforme plein champ La plateforme expérimentale PHENOVIA est répartie sur 3 sites expérimentaux: Bretenière (21) Le Subdray (18) et Montesquieu lauragais (31)

Bretenière • Un site équipé de matériel d’irrigation permettant d’étudier les besoins en eau des cultures • Diversité de cultures d’hiver

INRAE - Occitanie -Toulouse

INRAE - UE APC / UMR AGIR

Lionel Alletto Jean-François Lievin Rémy Marandel Romain Nicol Mathieu Roy

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Versaille - Saclay

MCP-DATA - Système d'information distribué

URGI - Unité de Recherches en Génomique Info (INRAE)Développement du système d'information (PHIS) qui permet d'organiser et de stocker des jeux de données Responsable : Cyril Pommier

Clermont-Ferrand

Plateforme Champ Pheno3C (INRAE) grande culture en stress hydrique et augmentation de la concentration en gaz carbonique (CO2) atmosphérique Responsable: Boris Adam

Versaille-Saclay - Grandes Cultures

• Unité Expérimentales Versailles-Saclay - contact: Camille Bedard

Occitanie - Montpellier

INRAE - AGAP

INRAE - UE Diascope

Romain Chapuis Antonin Grau

Evelyne Coste

GEVES

Nicolas Mascher

Drone

Perche - Drone Phenomobile

Perche - Drone Phenomobile

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Toulouse - Grandes Cultures

• Unité Expérimentale d'AgroEcologie et de Phénotypage des Cultures (APC) - Contact: Gilles Tison

INRAE - Auvergne-Rhone-Alpes - Clermont-Fd

INRAE - UE PHACC

INRAE - UMR PIAF (Physique et Physiologie de l'Arbre en Environnement Fluctuant)

Boris Adam David Cormier Christophe Serre

INRAE - UE BFP

Piquets - Drone - Perche Phenomobile

Benedicte Wenden

Piquets connectés

Bruno Moulia

Perche

Drone

Plateforme Conditions Controlées PHENOTIC (INRAE - GEVES - Univ. Angers - Institut Agro) Interaction plante-pathogènes (S2-S3), phenotypage des semences et analyse d'images asistée par ordinateur Responsable: Tristan Boureau Didier Demilly

MCP DEV - Capteurs et Methodes Equipe ImHorPhen ( IRHS - INRAE - Univ. Angers - Institut Agro) Analyse d'image par DeepLearning Responsable: David Rousseau

INRAE - Nouvelle Aquitaine - Bordeaux

INRAE - UE Arboricole

David Alletru

INRAE - UE Maïs

Carine Palaffre

Drone Phenomobile

Perche

Drone Phenomobile

INRAE - UE BFP

Benedicte Wenden

INRAE - Auvergne-Rhone-Alpes - Clermont-Fd

INRAE - UE PHACC

INRAE - UMR PIAF (Physique et Physiologie de l'Arbre en Environnement Fluctuant)

Boris Adam David Cormier Christophe Serre

INRAE - UE BFP

Piquets - Drone - Perche Phenomobile

Benedicte Wenden

Piquets connectés

Bruno Moulia

Perche

Drone

PHENOVAR Montpellier - GEVES

Phénotypage au champ avec vecteurs mobiles légers et envirotypage dans le cadre d’essais de variétés

3 sites constituent le Nœud Phénovar : Anjouère, Le Magneraud, Montpellier Montpellier - Expertise variétale sur 25 espèces différentes, dans des essais DHS et VATE conduits en microparcelles, lignes ou plantes isolées, notamment pour l’évaluation des variétés par rapport aux stress hydriques et thermiques Contact: Nicolas Mascher

PHENOVIA - Montesquieu-Lauragais (31)

Plateforme plein champ PHENOVIA est répartie sur 3 sites expérimentaux: Bretenière (21) Le Subdray (18) et Montesquieu lauragais (31)

Montesquieu-Lauragais • Diversité des cultures de printemps • Un site équipé de matériel d’irrigation • Localisation idéale pour l’étude du stress hydrique et des besoins en eau

INRAE - Auvergne-Rhone-Alpes - Clermont-Fd

INRAE - UE PHACC

INRAE - UMR PIAF (Physique et Physiologie de l'Arbre en Environnement Fluctuant)

Boris Adam David Cormier Christophe Serre

INRAE - UE BFP

Piquets - Drone - Perche Phenomobile

Benedicte Wenden

Piquets connectés

Bruno Moulia

Perche

Drone

GEVES - Pays-de-Loire

GEVES

Nicolas Mascher

Drone - Perche

PHENOVIA - Le Subdray (18)

Plateforme plein champ La plateforme expérimentale PHENOVIA est répartie sur 3 sites expérimentaux: Bretenière (21) Le Subdray (18) et Montesquieu lauragais (31)

Le Subdray • Types de sol variés et représentatifs, caractéristiques des zones dites intermédiaires • Diversité des cultures • Site accueillant le projet Pea4ever (plateforme multi-espèces de phénotypage de génotypes de pois) et une plateforme SYPPRE (essai longue durée évaluant des systèmes de cultures innovants)

Avignon - Arboriculture

• Unité Expérimentale Arboriculture et Maraîchage Méditerranéens (UE A2M) - Contact : Quentin Barra
• Unité de Recherche Génétique et Amélioration des Fruits et Legumes (UR GAFL) - Contact : Morgane Roth, responsable de WP

Avignon - Grandes Cultures mélanges

• Arvalis - Service Adaptation Génétique Environnement Phenotypage, pôle CIGALE - Contact : benoit De Solan, responsable de WP

Saint-Martin-de-Hinx - Grandes Cultures

• Unité Expérimentale sur le Maïs - Contact : Carine Palaffre

PHENOVAR Anjouère - GEVES

Phénotypage au champ avec vecteurs mobiles légers et envirotypage dans le cadre d’essais de variétés

3 sites constituent le Nœud Phénovar : Anjouère, Le Magneraud, Montpellier Anjouère - Expertise variétale sur 65 espèces différentes, dans des essais DHS et VATE conduits en microparcelles, lignes ou plantes isolées, notamment pour l’interaction plante-bioagresseurs Contact: Nicolas Mascher

PACA - Avignon

MCP-DEV- Capteurs et Methodes

EMMAH - Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes (INRAE - Univ Avignon) LPA CAPTE - Capteurs et télédétection (INRAE - Arvalis) Transformer des sorties de capteurs ou des images en variables utilisables (traits) pour l'analyse génétique et la modélisation Responsable : Marie Weiss