7 fev.
5 fev.
6 fev.
Traitement de données - 2
Outils d'acquisition - 2
Introduction
8h00 - Second atelier (3h30)PHIS / 4P / développer des modules
9h30 - Accueil et Introduction 10h15 - Le déploiement du PHD à l'INRAE 10h45 - Le contexte du PHD
Ecole Technique de Phenotypage HD2025
8h00 - Second atelier (4h)Perche / Drone / Piquet connecté
Stockage de données
+ info
+ info
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6 fev.
5 fev.
7 fev.
Programme
du 5 au 7 février 2025 Domaine du Lazaret 223 rue du Pasteur Benoit 34200 Sète
Traitement de données -1
Outils d'acquisition - 1
Conclusion
13h30 - Introduction sur le traitement et la gestion de données14h30 - Premier atelier (3h30) PHIS / 4P / développer des modules
14h00 - Comment collecter les besoins et prioriser les développements 14h45 - Perspective : PHD en 2030 15h15 - Conclusion - 15h30 - Fin
13h30 - Introduction sur les outils14h30 - Premier atelier (4h) Perche / Drone / Piquet connecté
+ info
+ info
+ info
Vendredi 7 février - après midi
14h - Le processus de collecte des besoins et priorisation : Echange avec la salle - Marie Weiss, David Rousseau et Bertrand Muller 14h45 - Pespectives : Quel phenotypage végétal haut-débit en 2030? - Bertrand Muller 15h15 - Conclusion - Anne Delaunay, Olivier Pailly 15h30 - Fin
Isabelle Alic, Renaud Colin et Anne Tireau, INRAE- Unité Mathématiques, Informatique et STatistique pour l'Environnement et l'Agronomie (MISTEA), Montpellier - Ingénieurs en Systèmes d'Information et de gestion de connaissances Jordan Bernigaud-Samatan, INRAE - Unité Expérimentale d'AgroEcologie et Phenotypage des Cultures (APC), Auzeville - Ingénieur en Analyse de données de phenotypage David Rousseau, Université d'Angers- Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), Angers - Chef d'équipe Imagerie pour l'Horticulture et le Phénotypage (ImHorPhen) Marie Weiss, INRAE - Unité Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystemes, LPA CAPTE, Avignon - Ingénieure, animatrice du Groupe de développement méthodologique 4P Florentin L'homme, INRAE - Unité Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystemes, LPA CAPTE, Avignon - Ingénieur développement 4P Raul Lopez-Lazaro, Sylvain Jay, INRAE - Unité Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystemes, LPA CAPTE, Avignon- Ingénieur développement 4P - Chargé de recherche / Ingénieur développement de méthodes
Anne Delaunay, INRAE- Adjointe au Chef de département Biologie et Amélioration des Plantes (BAP) en charge des Unités Expérimentales, Versailles-Saclay Bertrand Muller, INRAE- Unité Laboratoire d’Écophysiologie des Plantes Sous Stress Environnementaux (LEPSE), Montpellier - Coordinateur de l'infrastructure de Recherche PHENOME-EMPAHSIS France Olivier Pailly, INRAE - Unité Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes Méditerranéennes et Tropicales (AGAP), San Juliano - En charge des Unité Exépérimentales pour le département AgroEcoSystèmes (AES) Tania Rougier, INRAE - Unité Génétique Développement et Ecophysiologie des Céréales (GDEC), Clermont-Ferrand - Cheffe de projet de l'Infrastructure de Recherche PHENOME-EMPHASIS France David Rousseau, Université d'Angers - Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), Angers - Chef d'équipe Imagerie pour l'Horticulture et le Phénotypage (ImHorPhen) Marie Weiss, INRAE - Unité environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystemes, Avignon - Ingénieure, animatrice du Groupe de développement méthodologique 4P
Vendredi 7 Février - début de journée
8h - Traitement des données : second atelier parmi les 3:
Gérer les données sur Phis en autonomie
Utiliser des outils libres et développer des modules
TRaiter les données sur 4P en autonomie
Isabelle AlicAnne Tireau
David Rousseau, Jordan B. Samatan
Marie WeissRaul Lopez Lozano Florentin L'Homme - Sylvain Jay
12h00 - Repas
13h30 - Stockage des données - Renaud Colin
Isabelle Alic, Anne Tireau, INRAE- Unité Mathématiques, Informatique et STatistique pour l'Environnement et l'Agronomie (MISTEA), Montpellier - Ingénieure en Systèmes d'Information et de gestion de connaissances Jordan Bernigaud-Samatan, INRAE - Unité Expérimentale d'AgroEcologie et Phenotypage des Cultures (APC), Auzeville - Ingénieur en Analyse de données de phenotypage David Rousseau, Université d'Angers - Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), Angers - Chef d'équipe Imagerie pour l'Horticulture et le Phénotypage (ImHorPhen) Marie Weiss, INRAE - Unité Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystemes, LPA CAPTE, Avignon - Ingénieure, animatrice du Groupe de développement méthodologique 4P Florentin L'homme, INRAE - Unité Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystemes, LPA CAPTE, Avignon - Ingénieur développement 4P Raul Lopez-Lazaro, Sylvain Jay, INRAE - Unité Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystemes, LPA CAPTE, Avignon- Ingénieur développement 4P - Chargé de recherche / Ingénieur développement de méthodes
Jeudi 6 Février - après midi
13h30 - Introduction générale au traitement et la gestion de données : quel type de données, quelles méthodes, pour quels traits? David Rousseau, Marie Weiss, Jordan Bernigaud-Samatan, Romain Chapuis 14h30 - 18h30 Traitement des données : premier atelier parmi les 3:
Gérer les données sur Phis en autonomie
Utiliser des outils libres et développer des modules
TRaiter les données sur 4P en autonomie
Isabelle AlicAnne Tireau
Marie WeissRaul Lopez Lozano Florentin L'Homme - Sylvain Jay
David Rousseau, Jordan B. Samatan
19h30 Repas en commun
Jeudi 6 Février - matin
8 h - 12h Outils d'acquisition (second atelier)
Drone
Perche
Piquet connecté
Rémy Marandel (INRAE)Philippe Burger (INRAE)
Mathieu Roy (INRAE)Gaetan Daubige (Arvalis)
Boris Adam (INRAE)Nathan Drogue (INRAE)
12h Repas
5 février matin
9h30 - Accueil 10h00 - Introduction - Comité d'organisation 10h15 - Le déploiement du phenotypage vegetal à haut débit (PHD) à INRAE - Jacques Le Gouis 10h45 - Contexte du PHD - Sessions Posters (par groupe) 12h15 - Repas
Comité d'organisation
- Infrastructure et projets - Anne Delaunay, Tania Rougier
- Méthodes et concepts - Gilles Tison, David Rousseau
- Outils de traitement et traits disponibles - Marie Weiss, Florentin L'Homme et Philippe Burger
mercredi 5 Février - après midi
13h30 - Introduction générale aux outils d'acquisition à haut débit Boris Adam, Romain Chapuis et Philippe Burger14h30 - 18h30 Outils d'acquisition (premier atelier parmi les 3)
Drone
Perche
Piquet connecté
Rémy Marandel (INRAE)Philippe Burger (INRAE)
Mathieu Roy (INRAE)Gaetan Daubige (Arvalis)
Boris Adam (INRAE)Nathan Drogue (INRAE)
19h30 - Repas pris en commun
Boris Adam, INRAE -Unité Expérimentale PHenotypage Au Champ des Céréales (PHACC), Clermont-Ferrand - Directeur de la plateforme de phenotypage au champ sous contraintes climatiques Pheno3C Philippe Burger, INRAE - Unité/ Laboratoire d’Écophysiologie des Plantes Sous Stress Environnementaux (LEPSE), Montpellier - Ingénieur en méthode de phénotypage système d’information Nathan Drogue, INRAE -Unité Expérimentale PHenotypage Au Champ des Céréales (PHACC), Clermont-Ferrand -Ingénieur en traitement des données sur la plateforme de phenotypage au champ sous contraintes climatiques Pheno3C Remy Marandel et Mathieu Roy, INRAE - Unité Expérimentale d'AgroEcologie et Phenotypage des Cultures (APC), Auzeville - Opérateurs en Phenotypage Haut Débit Gaetan Daubige, Arvalis - Pole CIGALE, Outils et méthodes de mesure par capteurs, Avignon
Boris Adam, INRAE -Unité Expérimentale PHenotypage Au Champ des Céréales (PHACC), Clermont-Ferrand - Directeur de la plateforme de phenotypage au champ sous contraintes climatiques Pheno3C Philippe Burger, INRAE - Unité Laboratoire d’Écophysiologie des Plantes Sous Stress Environnementaux (LEPSE), Montpellier - Ingénieur en méthodes de phénotypage système d’information Romain Chapuis, INRAE - Unité Expérimentale Diascope, Observation de la Diversité et capacité d'adaptation, Maugio - Responsable de la plateforme de phenotypage au champ Diaphen (Céréales et Arboriculture) Rémy Marandel et Mathieu Roy, INRAE - Unité Expérimentale d'AgroEcologie et Phenotypage des Cultures (APC), Auzeville - Opérateurs en Phenotypage Haut Débit Getan Daubige, Arvalis - Pole CIGALE, Outils et méthodes de mesure par capteurs, Avignon Nathan Drogue, INRAE -Unité Expérimentale PHenotypage Au Champ des Céréales (PHACC), Clermont-Ferrand -Ingénieur en traitement des données sur la plateforme de phenotypage au champ sous contraintes climatiques Pheno3C
Philippe Burger, INRAE - Unité/ Laboratoire d’Écophysiologie des Plantes Sous Stress Environnementaux (LEPSE), Montpellier - Ingénieur en méthode de phénotypage système d’information Anne Delaunay, INRAE - Adjointe au Chef de département Biologie et Amélioration des Plantes (BAP) en charge des Unités Expérimentales Jacques Le Gouis, INRAE - Unité Génétique Diversité Ecophysiologie des Céréales, Clermont-Fd - Co-coordinateur de l'Infrastructure de Recherche PHENOME-EMPHASIS France David Rousseau, Université d'Angers - Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), Angers - Chef d'équipe Imagerie pour l'Horticulture et le Phénotypage (ImHorPhen) Tania Rougier, INRAE - Unité Génétique Diversité Ecophysiologie des Céréales, Clermont-Fd - Cheffe de projet de l'Infrastructure de Recherche PHENOME-EMPHASIS France Gilles Tison, INRAE
- Directeur de l'Unité Expérimentale d'AgroEcologie et Phenotypage des Cultures (APC), Auzeville - Directeur de l'Unité, Animateur du comité d'organisation de l'Ecole Technique PHD Marie Weiss et Florentin L'Homme, INRAE
- Unité Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystemes, Avignon - Ingénieurs, développement 4P.
Programme Ecole Technique PHD 25
Tania
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7 fev.
5 fev.
6 fev.
Traitement de données - 2
Outils d'acquisition - 2
Introduction
8h00 - Second atelier (3h30)PHIS / 4P / développer des modules
9h30 - Accueil et Introduction 10h15 - Le déploiement du PHD à l'INRAE 10h45 - Le contexte du PHD
Ecole Technique de Phenotypage HD2025
8h00 - Second atelier (4h)Perche / Drone / Piquet connecté
Stockage de données
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6 fev.
5 fev.
7 fev.
Programme
du 5 au 7 février 2025 Domaine du Lazaret 223 rue du Pasteur Benoit 34200 Sète
Traitement de données -1
Outils d'acquisition - 1
Conclusion
13h30 - Introduction sur le traitement et la gestion de données14h30 - Premier atelier (3h30) PHIS / 4P / développer des modules
14h00 - Comment collecter les besoins et prioriser les développements 14h45 - Perspective : PHD en 2030 15h15 - Conclusion - 15h30 - Fin
13h30 - Introduction sur les outils14h30 - Premier atelier (4h) Perche / Drone / Piquet connecté
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Vendredi 7 février - après midi
14h - Le processus de collecte des besoins et priorisation : Echange avec la salle - Marie Weiss, David Rousseau et Bertrand Muller 14h45 - Pespectives : Quel phenotypage végétal haut-débit en 2030? - Bertrand Muller 15h15 - Conclusion - Anne Delaunay, Olivier Pailly 15h30 - Fin
Isabelle Alic, Renaud Colin et Anne Tireau, INRAE- Unité Mathématiques, Informatique et STatistique pour l'Environnement et l'Agronomie (MISTEA), Montpellier - Ingénieurs en Systèmes d'Information et de gestion de connaissances Jordan Bernigaud-Samatan, INRAE - Unité Expérimentale d'AgroEcologie et Phenotypage des Cultures (APC), Auzeville - Ingénieur en Analyse de données de phenotypage David Rousseau, Université d'Angers- Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), Angers - Chef d'équipe Imagerie pour l'Horticulture et le Phénotypage (ImHorPhen) Marie Weiss, INRAE - Unité Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystemes, LPA CAPTE, Avignon - Ingénieure, animatrice du Groupe de développement méthodologique 4P Florentin L'homme, INRAE - Unité Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystemes, LPA CAPTE, Avignon - Ingénieur développement 4P Raul Lopez-Lazaro, Sylvain Jay, INRAE - Unité Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystemes, LPA CAPTE, Avignon- Ingénieur développement 4P - Chargé de recherche / Ingénieur développement de méthodes
Anne Delaunay, INRAE- Adjointe au Chef de département Biologie et Amélioration des Plantes (BAP) en charge des Unités Expérimentales, Versailles-Saclay Bertrand Muller, INRAE- Unité Laboratoire d’Écophysiologie des Plantes Sous Stress Environnementaux (LEPSE), Montpellier - Coordinateur de l'infrastructure de Recherche PHENOME-EMPAHSIS France Olivier Pailly, INRAE - Unité Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes Méditerranéennes et Tropicales (AGAP), San Juliano - En charge des Unité Exépérimentales pour le département AgroEcoSystèmes (AES) Tania Rougier, INRAE - Unité Génétique Développement et Ecophysiologie des Céréales (GDEC), Clermont-Ferrand - Cheffe de projet de l'Infrastructure de Recherche PHENOME-EMPHASIS France David Rousseau, Université d'Angers - Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), Angers - Chef d'équipe Imagerie pour l'Horticulture et le Phénotypage (ImHorPhen) Marie Weiss, INRAE - Unité environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystemes, Avignon - Ingénieure, animatrice du Groupe de développement méthodologique 4P
Vendredi 7 Février - début de journée
8h - Traitement des données : second atelier parmi les 3:
Gérer les données sur Phis en autonomie
Utiliser des outils libres et développer des modules
TRaiter les données sur 4P en autonomie
Isabelle AlicAnne Tireau
David Rousseau, Jordan B. Samatan
Marie WeissRaul Lopez Lozano Florentin L'Homme - Sylvain Jay
12h00 - Repas
13h30 - Stockage des données - Renaud Colin
Isabelle Alic, Anne Tireau, INRAE- Unité Mathématiques, Informatique et STatistique pour l'Environnement et l'Agronomie (MISTEA), Montpellier - Ingénieure en Systèmes d'Information et de gestion de connaissances Jordan Bernigaud-Samatan, INRAE - Unité Expérimentale d'AgroEcologie et Phenotypage des Cultures (APC), Auzeville - Ingénieur en Analyse de données de phenotypage David Rousseau, Université d'Angers - Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), Angers - Chef d'équipe Imagerie pour l'Horticulture et le Phénotypage (ImHorPhen) Marie Weiss, INRAE - Unité Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystemes, LPA CAPTE, Avignon - Ingénieure, animatrice du Groupe de développement méthodologique 4P Florentin L'homme, INRAE - Unité Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystemes, LPA CAPTE, Avignon - Ingénieur développement 4P Raul Lopez-Lazaro, Sylvain Jay, INRAE - Unité Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystemes, LPA CAPTE, Avignon- Ingénieur développement 4P - Chargé de recherche / Ingénieur développement de méthodes
Jeudi 6 Février - après midi
13h30 - Introduction générale au traitement et la gestion de données : quel type de données, quelles méthodes, pour quels traits? David Rousseau, Marie Weiss, Jordan Bernigaud-Samatan, Romain Chapuis 14h30 - 18h30 Traitement des données : premier atelier parmi les 3:
Gérer les données sur Phis en autonomie
Utiliser des outils libres et développer des modules
TRaiter les données sur 4P en autonomie
Isabelle AlicAnne Tireau
Marie WeissRaul Lopez Lozano Florentin L'Homme - Sylvain Jay
David Rousseau, Jordan B. Samatan
19h30 Repas en commun
Jeudi 6 Février - matin
8 h - 12h Outils d'acquisition (second atelier)
Drone
Perche
Piquet connecté
Rémy Marandel (INRAE)Philippe Burger (INRAE)
Mathieu Roy (INRAE)Gaetan Daubige (Arvalis)
Boris Adam (INRAE)Nathan Drogue (INRAE)
12h Repas
5 février matin
9h30 - Accueil 10h00 - Introduction - Comité d'organisation 10h15 - Le déploiement du phenotypage vegetal à haut débit (PHD) à INRAE - Jacques Le Gouis 10h45 - Contexte du PHD - Sessions Posters (par groupe) 12h15 - Repas
Comité d'organisation
mercredi 5 Février - après midi
13h30 - Introduction générale aux outils d'acquisition à haut débit Boris Adam, Romain Chapuis et Philippe Burger14h30 - 18h30 Outils d'acquisition (premier atelier parmi les 3)
Drone
Perche
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Rémy Marandel (INRAE)Philippe Burger (INRAE)
Mathieu Roy (INRAE)Gaetan Daubige (Arvalis)
Boris Adam (INRAE)Nathan Drogue (INRAE)
19h30 - Repas pris en commun
Boris Adam, INRAE -Unité Expérimentale PHenotypage Au Champ des Céréales (PHACC), Clermont-Ferrand - Directeur de la plateforme de phenotypage au champ sous contraintes climatiques Pheno3C Philippe Burger, INRAE - Unité/ Laboratoire d’Écophysiologie des Plantes Sous Stress Environnementaux (LEPSE), Montpellier - Ingénieur en méthode de phénotypage système d’information Nathan Drogue, INRAE -Unité Expérimentale PHenotypage Au Champ des Céréales (PHACC), Clermont-Ferrand -Ingénieur en traitement des données sur la plateforme de phenotypage au champ sous contraintes climatiques Pheno3C Remy Marandel et Mathieu Roy, INRAE - Unité Expérimentale d'AgroEcologie et Phenotypage des Cultures (APC), Auzeville - Opérateurs en Phenotypage Haut Débit Gaetan Daubige, Arvalis - Pole CIGALE, Outils et méthodes de mesure par capteurs, Avignon
Boris Adam, INRAE -Unité Expérimentale PHenotypage Au Champ des Céréales (PHACC), Clermont-Ferrand - Directeur de la plateforme de phenotypage au champ sous contraintes climatiques Pheno3C Philippe Burger, INRAE - Unité Laboratoire d’Écophysiologie des Plantes Sous Stress Environnementaux (LEPSE), Montpellier - Ingénieur en méthodes de phénotypage système d’information Romain Chapuis, INRAE - Unité Expérimentale Diascope, Observation de la Diversité et capacité d'adaptation, Maugio - Responsable de la plateforme de phenotypage au champ Diaphen (Céréales et Arboriculture) Rémy Marandel et Mathieu Roy, INRAE - Unité Expérimentale d'AgroEcologie et Phenotypage des Cultures (APC), Auzeville - Opérateurs en Phenotypage Haut Débit Getan Daubige, Arvalis - Pole CIGALE, Outils et méthodes de mesure par capteurs, Avignon Nathan Drogue, INRAE -Unité Expérimentale PHenotypage Au Champ des Céréales (PHACC), Clermont-Ferrand -Ingénieur en traitement des données sur la plateforme de phenotypage au champ sous contraintes climatiques Pheno3C
Philippe Burger, INRAE - Unité/ Laboratoire d’Écophysiologie des Plantes Sous Stress Environnementaux (LEPSE), Montpellier - Ingénieur en méthode de phénotypage système d’information Anne Delaunay, INRAE - Adjointe au Chef de département Biologie et Amélioration des Plantes (BAP) en charge des Unités Expérimentales Jacques Le Gouis, INRAE - Unité Génétique Diversité Ecophysiologie des Céréales, Clermont-Fd - Co-coordinateur de l'Infrastructure de Recherche PHENOME-EMPHASIS France David Rousseau, Université d'Angers - Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), Angers - Chef d'équipe Imagerie pour l'Horticulture et le Phénotypage (ImHorPhen) Tania Rougier, INRAE - Unité Génétique Diversité Ecophysiologie des Céréales, Clermont-Fd - Cheffe de projet de l'Infrastructure de Recherche PHENOME-EMPHASIS France Gilles Tison, INRAE - Directeur de l'Unité Expérimentale d'AgroEcologie et Phenotypage des Cultures (APC), Auzeville - Directeur de l'Unité, Animateur du comité d'organisation de l'Ecole Technique PHD Marie Weiss et Florentin L'Homme, INRAE - Unité Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystemes, Avignon - Ingénieurs, développement 4P.