Allèle 2nde

Tout le monde connait la coccinelle Coccinella septempunctata,une grande habituée de nos jardins...

Mais connaissez-vous les coccinelles arlequins ? Il s'agit de coccinelles présentant des motifs variés sur leurs élytres (la carapace protégeant leurs ailes).

Consigne : À partir de vos explorations sur le Genially, expliquez sous forme d’un texte argumenté : - Si les coccinelles arlequins sont de la même espèce que Coccinella septempunctata. - L’origine de la variabilité entre les différentes coccinelles

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Bienvenue au laboratoire !

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C'est à partir d'ici que vous trouverez l'ensemble des informations pour rédiger votre texte argumenté d'expert. Prenez des notes tout au long de votre enquête. N'hésitez pas à re-lire les objectifs de la séance

Je dois me documenter

SORTIE : fin de l'enquête

3. Séquencer l'ADN

2. Localiser et inactiver les gènes

1. Croiser les coccinelles

Avec des méthodes statistiques, il est possible de connaitre la région approximative d'un chromosome responsable d'un certain caractère (ici les motifs des élytres de la coccinelle).

Connaitre la région responsable du motif des élytres

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Avec des méthodes statistiques, il est possible de connaitre la région approximative d'un chromosome responsable d'un certain caractère (ici les motifs des élytres de la coccinelle).

Connaitre la région responsable du motif des élytres

Nous avons identifié une région bien précise du chromosome 4 de la coccinelle arlequin, dont les variations de séquences nucléotidiques sont corrélées avec les variations de coloration des élytres. Cette région s’étend sur trois gènes : le gène aor, le gène pnr et le gène itr. Pour pouvoir trancher entre ces trois gènes, il y a possibilité d’inactiver chaque gène et d’observer les effets sur les caractéristiques de la coccinelle.

Inactiver le gène aor

Inactiver le gène pnr

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Inactiver le gène itr

Expérience d'inactivation du gène pnr

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Expérience d'inactivation du gène aor

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Expérience d'inactivation du gène aor

Refaire une expérience d'inactivation

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Expérience d'inactivation du gène aor

Cliquez sur le chromosome concerné par le séquençage

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Expérience d'inactivation du gène aor

Choisissez le gène d'intéret que vous voulez séquençer

Gène itr

Gène aor

Gène pnr

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Expérience d'inactivation du gène aor

Erreur : ce n'est pas le bon gène ! Pourquoi voulez vous séquencez celui-ci ??

Recommencez le séquençage

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Expérience d'inactivation du gène aor

La séquence d'ADN demandée a bien été séquencée. Il existe 4 versions (allèles) de ce gène pnr ("pannier"): - hsp : allèle trouvé chez Black-4spots - hA : allèle trouvé chez Black-nspots - hC : allèle trouvé chez Black-2spots - h : allèle trouvé chez Red-nspots

Ce sont les 4 allèles différents retrouvés dans l'ADN des coccinelles arlequins

Je continue l'enquête sur les séquences alléliques

Rappels de cours

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Expérience d'inactivation du gène aor

Consigne : Comparer les séquences alléliques du gène pannier sur le logiciel GENIEGEN2 en vous servant des fonctionnalités du logiciel pour faire un tableau de comparaison.

AVANT DE CLIQUER SUR LE LIEN LIRE ATTENTIVEMENT Lorsque 2 allèles présentent des taux de similitudes très élevés, les individus porteurs des allèles sont toujours capables de se reproduire entre eux car leur ADN est suffisamment proche. Les différences entre deux allèles sont dûes à des mutations

Ce lien vous permet d'accéder directement au site GENIEGEN2

Je ne me souviens plus comment on utilise le logiciel...

Pour retrouver les séquences du gène pannier faites : "Charger des séquences" puis : > commun > SVT > Crédeville > chapitre 4 > Pannier.edi

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Consigne : Comparer les séquences alléliques du gène pannier sur l'image tirée du logiciel GENIEGEN2

Expérience d'inactivation du gène aor

LIRE ATTENTIVEMENT Lorsque 2 allèles présentent des taux de similitudes très élevés, les individus porteurs des allèles sont toujours capables de se reproduire entre eux car leur ADN est suffisamment proche. Les différences entre deux allèles sont dûes à des mutations

Je ne me souviens plus comment utiliser le logiciel...

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Tableau de comparaison des différents allèles

Expérience d'inactivation du gène aor

Comparaison de seulement 2 allèles

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Quitter le zoom

Expérience d'inactivation du gène aor

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Autre croisement

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Autre croisement

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Pas de croisement possible

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Autre croisement

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Pas de croisement possible

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Pour sortir du laboratoire, il faut d'abord répondre à quelques questions !

j'ai besoin de revoir certaines choses

je suis prêt(e)

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j'ai le code !

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EN MAJUSCULE

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Question 4: Que diriez-vous pour décrire le résultat de la comparaison allélique réalisée? - Ces allèles sont tous identiques, cette comparaison n'a rien apportée à l'enquête................O - Ces allèles présentent des séquences complétement différentes les unes des autres ................A - Ces allèles présentent de fortes similitudes de séquences, les différences correspondent à des mutations ................I

Rappels sur le logiciel GENIEGEN2

Représente la séquence nucléotidique d'1 seul brin de l'allèle hC du gène pnr, à l'horizontal et non à la verticale. Seules les bases azotées sont montrées.

Noms des allèles

Noms des individus porteurs de l'allèle

Rappelez vous ! il est important d'aligner les séquences avant de les comparer !

Dans Affichage : vous trouverez comment faire un tableau de comparaison

Question 1: Est ce que coccinella septempunctata appartient à la même espèce que les coccinelles arlequins? OUI .........A NON.........M

Question 2: À quoi correspondent les différents phénotypes de coccinelles arlequins observés ? - À une variabilité interspécifique................OP - À une variabilité intraspécifique.............UT

Consigne :

À partir de vos explorations sur le Genially, expliquez sous forme d’un texte argumenté : - Si les coccinelles arlequins sont de la même espèce que Coccinella septempunctata. - L’origine de la variabilité entre les différentes coccinelles

Question 2: À quoi correspondent les différents phénotypes de coccinelles arlequins observés ? - À une variabilité interspécifique................OP - À une variabilité intraspécifique.............UT

Question 3: Quelle est l'origine de la diversité phénotypique observée? - l'existence d'allèles différents pour le gène responsable de la coloration des élytres................AT - l'existence de gènes différents responsables de la coloration des élytres............OP

Rappels sur le logiciel GENIEGEN2

Représente la séquence nucléotidique d'1 seul brin de l'allèle hC du gène pnr, à l'horizontal et non à la verticale. Seules les bases azotées sont montrées.

Noms des allèles

Noms des individus porteurs de l'allèle

Rappelez vous ! il est important d'aligner les séquences avant de les comparer !

Dans Affichage : vous trouverez comment faire un tableau de comparaison

Question 1: Est ce que j'appartiens à la même espèce que les coccinelles arlequins? OUI .........A NON.........M

Gène : portion d'ADN, dont l'ordre des nucléotides détermine l'information. L'expression d'un gène (c'est à dire l'utilisation de ce gène par la cellule) conduit le plus souvent à la fabrication d'une protéine. Allèle : version d'un gène, ce qui signifie que la séquence de nucléotides est quasiment identiques entre les différents allèles d'un même gène. Exemple: Nous sommes tous porteur du gène déterminant le groupe sanguin. Certains individus possèdent deux fois l'allèle O et sont donc de groupe sanguin O. Certains individus possèdent une fois l'allèle A et une fois l'allèle B et sont donc de groupe AB

Question 5: Quelle est l'origine de cette diversité allélique? - Dès le départ il existe différentes versions d'un même gène et cela ne change pas au cours du temps........................TE - Des mutations aléatoires apparaissent au cours des générations et modifient ainsi les séquences d'ADN donnant parfois de nouveaux allèles.............ON