RARe
RARe
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Michael O'DONOHUE
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
www
Nicolas DEPRETRE
Nœud français d’IBISBA-EU, IBISBA-FR est une infrastructure de recherche distribuée pour le développement des biotechnologies au service de la bioéconomie circulaire. Identifiée en tant qu'Infrastructure Nationale en Biologie Santé (INBS), elle est présente sur la Feuille de Route du Ministère de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche depuis 2016. Elle propose des modules de services et apporte son expertise scientifique et technologique à IBISBA-EU. Elle encourage l’adoption par les plateformes de recherche françaises de normes et pratiques requises pour la production de services dans le cadre d’IBISBA-EU. Réparties dans six localisations, les activités des plateformes d’IBISBA-FR portent sur les biotechnologies industrielles et environnementales, depuis la conception assistée par ordinateur de voies de synthèses construites par ingénierie métabolique pour la production de molécules d’intérêt via l’exploitation des données de –omics (géno-, transcripto-, métabol-, flux-), la découverte et l’amélioration des enzymes et des souches microbiennes adéquates, le développement et le scale-up de bioprocédés.
Labellisée ESFRI 2018, IBISBA-EU est une infrastructure de recherche translationnelle qui entend accélérer le développement des biotechnologies industrielle et environnementale en Europe en tant que pivot de la bio-économie circulaire. Fédérant les infrastructures de recherche de pointe de 10 pays européens et associant les dernières technologies numériques, IBISBA-EU propose aux communautés académique et industrielle un accès unique à des services R&D&I intégrés et innovants en biotechnologie, prenant le virage de l’ère de la « BioIndustry 4.0 ». Les 31 Janvier et 1er Février 2024, l'infrastructure IBISBA France, avec le soutien d'INRAE était fière et heureuse d'organiser le Mini-Summit Inspiring Biotech Solutions de l'infrastructure IBISBA-EU. Cet événement a été l'occasion d'annoncer la candidature de la France pour accueillir le siège légal d'IBISBA-ERIC (en 2026).
www
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Patrick WINCKER
Denis MILAN
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Marie-Thérèse BIHOREAU
Aude PERDEREAU
France Génomique est l'infrastructure nationale de génomique et transcriptomique qui rassemble 11 plateformes de séquençage dont les 2 plateformes nationales d'Evry.
Sont associées à France Génomique, 9 plateformes associées de séquençage, et 13 plateformes associées de bioinformatique, par ailleurs participants de l'IFB, Institut Français de Bioinformatique.
www
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Philippe HANTRAYE
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Emilie HANGEN
NeurATRIS est une infrastructure de recherche destinée à accélérer la transformation des découvertes issues de la recherche fondamentale en innovations médicales pour le traitement des maladies du système nerveux. Se fondant sur sept centres de recherche principaux situés dans la région parisienne et à Nantes, NeurATRIS représente l’une des plus grandes concentrations de chercheurs, ingénieurs et cliniciens en neurosciences en Europe (environ 2 000). NeurATRIS est une infrastructure distribuée qui regroupe MIRCen du CEA, l’Institut du Cerveau, les groupes hospitaliers Henri Mondor, Bicêtre et Robert Debré, l’UMR PANTHER de l’INRAE et I-Stem, autour de compétences, expertises et plateaux techniques de haut niveau et spécialisés en neurologie, biothérapies et troubles du développement neurologique.
Dans ces domaines NeurATRIS se positionne ainsi comme la plus grande infrastructure européenne conduisantdes projets de R&D et fournissant des services aux universitaires, cliniciens et industriels. L ’ensemble destravaux menés grâce à NeurATRIS concerne les maladies de Parkinson, Huntington, Alzheimer, sclérose enplaques, maladies neurodéveloppementales. L’objectif de ces recherches est d’accélérer la compréhensiondes mécanismes physiopathologiques, biologiques et développementaux, de faciliter la réalisationd’essais précliniques/ cliniques de validation de nouvelles thérapies et de développer des approchesinnovantes de diagnostic et de soin pour ces pathologies.
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
www
Pascal VILLA
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Kiet TRAN
Mikael LE CLECH
La mission de ChemBioFrance est de fournir aux chercheurs du secteur académique ou privé, une offre intégrée de services pour la découverte et l'utilisation de petites molécules pour "comprendre et soigner le vivant" (sondes biologiques et candidats médicaments).
www
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Bertrand MULLER
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Tania ROUGIER
Phenome-Emphasis développe des équipements pour des milliers de plante, ainsi que des méthodes pour analyser la variabilité génétique des réponses des plantes au changement climatique (sécheresse, CO2, élevé, hautes températures, maladies émergentes). Le projet a:
- Construit ou amélioré des installations en neuf sites français en serre, en champs fortement équipés et dans des réseau de champs à équipement plus simple.
- Développé de nouveaux capteurs, des robots pour l'acquisition des données, des chaines de traitement et des systèmes d'information capable de gérer des millions de données.
- Disséminé les techniques et les méthodes vers la communauté française de phénotypage (compagnies semencières, instituts techniques, recherche publique).
- Favorisé l'émergence de PME fournisseuses de technologies.
Phenome-Emphasis continue ces activités, mais a aussi identifié de nouveaux défis.
- Faciliter la transition agro-écologique avec des équipements et des méthodes pour analyser les interactions entre les plantes et d'autres organismes (micro-organismes, insectes, autres plantes).
- Déployer un système d'information et des outils pour que les données collectée soient ouvertes et disponibles, avec toutes les informations nécessaires.
- Pleinement insérer ses activités dans un contexte européen.
www
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Fabrice LAURENT
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Edouard GUITTON
Emerg’in est une Infrastructure Nationale de Recherche pour la lutte contre les maladies infectieuses animales émergentes ou zoonotiques par l'exploration in vivo. Elle est sur la feuille de route nationale depuis 2018 et a pour mission de :
- Doter la France d'un instrument de coordination nationale pour accroître les connaissances d’amont et proposer des solutions de diagnostic et de contrôle des maladies infectieuses animales émergentes, vectorisées ou non, capables de mettre en péril des secteurs entiers d’élevage (danger économique, souveraineté alimentaire, sûreté et sécurité alimentaire) ou de porter globalement atteinte à la santé publique (maladies zoonotiques émergentes, malveillances).
- Constituer une Force de Réaction Rapide face aux émergences infectieuses (santé publique vétérinaire et santé des animaux, faune sauvage comprise), qui doit être comprise dans le sens anglo‐saxon de «preparedness » prôné par l’OIE ‐ Organisation mondiale de la Santé animale - et à l’échelle européenne.
- Proposer des ressources et des savoir-faire issus de Six plates-formes reconnues d’infectiologie d’INRAE (Nouzilly et Jouy-en-Josas), de l’ANSES (Ploufragan-Plouzané et Malzéville), du CIRAD (Montpellier/Guadeloupe) et du CNRS (Strasbourg), dotées de laboratoires et d'animaleries en confinement adaptés aux recherches en infectiologie.
- Développer des partenariats public‐privé dans le secteur du diagnostic et du médicament vétérinaire ainsi que dans le secteur des innovations en « Bio-contrôle » des agents infectieux et de leurs vecteurs (le cas échéant) et pour les produits animaux.
Les plateformes (PFIE, IERP , INSECTA) sont labellisées par le GIS IBISA.
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
www
Guy PERRIERE
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Juliette DUMONT
L ’institut Français de Bioinformatique (IFB) fédère 21 plateformes membres, 7 plateformes contributrices, 8 équipes associées, et l’UAR coordinatrice IFB-core. Les missions de l’IFB incluent le déploiement d’une infrastructure numérique distribuée, le développement et le déploiement d‘outils logiciels et de bases de connaissances biologiques, l’accompagnement des biologistes pour l’analyse de leurs données, la promotion des bonnes pratiques pour le développement logiciel et pour la gestion des données, la formation. Les services et formations de l’IFB s’adressent à toutes les communautés des sciences du vivant. En particulier, les projets actuels sont structurés autour des communautés microbiologie, agronomie, biodiversité et bioinformatique pour la santé.
Dans le cadre de l’écosystème Recherche Data Gouv, l’IFB a été désigné Centre de Référence Thématique pour les données de biologie-santé. Son rôle de CRT inclut la définition et la diffusion de standards pour les métadonnées et de bonnes pratiques pour la gestion des données, et l’identification des entrepôts de référence de biologie-santé.
L ’IFB participe aux activités du réseau des Infrastructures Nationales de Biologie Santé (INBS) au sein de groupes de travail sur la structuration des infrastructures nationales, les modèles économiques, les interactions avec l’industrie, et la gestion des données biologiques.
L ’IFB est le nœud français de l’infrastructure européenne de bioinformatique ELIXIR. Cette appartenance permet de mutualiser les expertises et réalisations des 23 noeuds nationaux, et offre un levier à la France pour participer aux projets européens de grande envergure.
www
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Christian JORGENSEN
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Séverine KREMER
ECELLFrance (ECF) est l'infrastructure de recherche française pour les thérapies cellulaires visant à régénérer les tissus endommagés dans de nombreuses maladies liées à l'âge ou dans des maladies inflammatoires chroniques actuellement sans traitement curatif viable. ECF fédère 7 sites et 11 plateformes technologiques et rassemble des experts nationaux de premier plan, reconnus au niveau européen dans les domaines suivants : maladies ostéoarticulaires, auto-immunes, accident vasculaire cérébral (maladies neuro-vasculaires), affections cutanées, infarctus du myocarde.
ECF est une infrastructure à guichet unique qui coordonne entièrement toutes les activités allant de la bioproduction de thérapies cellulaires, y compris les Médicaments de Thérapie Innovante (MTI), au pipeline de développement, y compris la validation du projet, les études précliniques, le soutien réglementaire, les tests de sécurité et d'activité, les essais cliniques et l'immunomonitoring. Cette expertise a un impact majeur sur la communauté scientifique et donne à ECF une visibilité nationale et internationale. De ce fait, ECF est impliquée dans de nombreux réseaux nationaux et internationaux et dans des projets majeurs (essais cliniques européens et nationaux, PIIEC, PEPR...).
The Drug Cell
www
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Edouard BERTRAND
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Marine BERAUD
France-BioImaging (FBI) is the national infrastructure for biological imaging. We provide our ~5,000 users immediate access to cutting-edge and innovative microscopy technologies, powerful labeling and computing methods, and appropriate training. As such, FBI plays an essential role in enabling competitive research in many fields, from fundamental questions in cell and developmental biology to preclinical research, and it impacts a variety of domains such as agronomy, marine biology and human health. The study of human diseases is particularly important for FBI, with many of our users working on cancer research, host-pathogen interactions, immunity, neurodegenerative and developmental disorders, genetic diseases, aging...
FBI is composed of 10 geographical nodes and one transversal node dedicated to data management and image processing (IPDM). FBI covers a significant part of the national territory, and each node combines a set of advanced technologies with excellence in specific scientific fields, ensuring complementarity and synergy between the nodes.
FBI comprises 30 IBiSA-labeled imaging facilities and ~80 R&D teams, which bring together the multidisciplinary expertise of biologists, chemists, physicists, mathematicians and computer scientists.
This strategy of mixing facilities and R&D teams enables the infrastructure to generate innovations in imaging, and then transfer these innovations to facilities so that they become easily accessible to the largest possible number of researchers. FBI’s strategy is reflected in our motto "Innovation-Training-Access": (i) Innovation, to invent and disseminate new imaging technologies, from probe development and instrumentation to image analysis; (ii) Training, to enable facility staff and users to master traditional and newly developed imaging technologies; (iii) Access, to provide instrumentation, tools and expertise on methods and models to as many users as possible. FBI is the French node of the European Research Infrastructure Euro-BioImaging.
www
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Alex McDOUGALL
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Kamilia LATAMNA
Le Centre National de Ressources Biologiques Marines, EMBRC-FRANCE, offre à la communauté scientifique et aux entreprises un ensemble complet de services pour l'accès et l'étude de la biodiversité marine et des écosystèmes côtiers, méditerranéen et atlantique sur place ou à distance.
EMBRC accompagne notamment vos projets en proposant son expertise scientifique sur les modèles marins émergents.
Les services d'EMBRC-France vont de l'expédition d'organismes marins à l'accueil scientifique dans les 3 stations marines de Banyuls, Roscoff et Villefranche. Sur place vous pourrez bénéficier de plateformes technologiques de haut niveau (bioinformatique, imagerie, cristallographie, etc.) de laboratoires d’accueil équipés et de structures d’hébergement et de restauration, de moyens variés d'accès à la mer (navires, plongée).
www
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Darren HART
Julie MENETREY
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Marie-Christine POTERSZMAN
The French Infrastructure for Integrated Structural Biology (FRISBI) provides an infrastructure for integrative structural biology approaches, from the molecular to the cellular level, integrating multi-resolution data from X-ray crystallography, small angle X-ray scattering, NMR, Cryo-EM and functional data including development for protein expression and crystallization.
FRISBI is open to structural and molecular and cell biologists from both academia and industry from France and Europe. A simple, transparent reviewed process will provide access based on its feasibility and resource availability. Applications for access can be submitted at any time. Users will be required to contribute towards the costs of access.
www
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Vincent DIEBOLT
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Céline GENTILHOMME
F-CRIN, pour French Clinical Research Infrastructure Network, est une infrastructure nationale créée en 2012 pour soutenir et valoriser l'excellence de la recherche clinique française. Elle a pour objectif principal de renforcer la collaboration entre les différents acteurs de la recherche clinique en France, ainsi que d'assurer un relais national avec ECRIN, le réseau européen de recherche clinique. F-CRIN se positionne aujourd’hui comme une plateforme essentielle pour structurer et soutenir les réseaux nationaux de recherche clinique, d'expertise et d'investigation dans des domaines médicaux spécifiques. L'infrastructure rassemble à l'heure actuelle 21 composantes, dont 17 réseaux thématiques de recherche clinique, 2 réseaux d’expertise méthodologique, une plateforme multiservices et une unité de coordination nationale. Elle couvre plus de 19 domaines médicaux, permettant ainsi le développement d'un large éventail de collaborations et d'initiatives au service d’une recherche clinique française de pointe.
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Yann HERAULT
www
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Hamid MEZIANE
Infrastructure Nationale pour la création, l’élevage, le phénotypage, la distribution et l’archivage d’organismes modèles
CELPHEDIA (Creation, Breeding, Phenotyping, Distribution and Archiving of model organisms) is a national operational research infrastructure distributed over the French territory. Its mission is to support academic and industrial scientific community to accelerate discoveries in biology and improve biomedical research.
To this end, CELPHEDIA operates in 3 main activities with respect of ethical principles and animal welfare:
- Standardized service offers, in the areas of creation, functional exploration, archiving and distribution of animal models, necessary for fundamental research and preclinical approaches: rodents with the mouse as the leader, non-human primates and non-mammals including aquatic vertebrates
- Research and development activity for new technological offers
- Training courses adapted to users' needs either for the use of animals in research with respect to institutional regulations or to develop specific technological skills.
With 13 centres distributed throughout France, CELPHEDIA offers an outstanding range of expertise, skills and services, unique in Europe and covering 3 major families of animal models:
- non mammalians → TEFOR Paris Saclay (Saclay), Fly Facility (Clermont-Ferrand), TACGene (Paris)
- rodents → Anexplo (Toulouse), AniRA (Lyon), Chronobiotron (Strasbourg), PHENOMIN-CIPHE (Marseille), PHENOMIN-ICS (Strasbourg), PHENOMIN-TAAM (Orléans), TRIP (Nantes)
- non-human primates → MPRC (Marseille), SdP (Rousset-s-Arc), SILABE (Strasbourg)
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Myriam FERRO
www
ProFI est l'infrastructure nationale en biologie et santé dédiée à la R&D et au service en protéomique. Cette infrastructure a démarré en 2012 et a été financée par le Programme d'investissements d'avenir sur la période 2012-2024). Les six nœuds composant ProFI sont les plateformes IBISA suivantes : Grenoble Proteomics (Grenoble) ; MS4OMICS (Lille) ; Plateforme Protéomique Strasbourg Grand Est (PSGE ; Strasbourg) ; Pôle Protéomique de Montpellier (PPM ; Montpellier) ; ProGénomix (Bagnols/Cèze) ; Protéomique Toulouse (ProtéoToul ; Toulouse). Le CNRS est le coordinateur institutionnel de ProFI et ses partenaires sont le CEA, l’Inserm, les universités Grenoble Alpes (UGA), de Lille, de Montpellier, Paul Sabatier (Toulouse, UPS), de Strasbourg (Unistra) et les CHU de Lille et Montpellier. Les objectifs de l’INBS ProFI réunissent les activités de R&D, de service, de formation et d’actions envers la communauté. L'activité R&D concerne le développement de méthodes de caractérisation fonctionnelle et structurale des protéines et des complexes protéiques.
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Michèle TIXIER-BOICHARD
www
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Patricia HUAN
RARe est l’infrastructure de référence pour sécuriser, documenter et distribuer les ressources de la biosphère du système Terre et notamment les ressources génétiques, génomiques, et biologiques assemblées et caractérisées par la recherche agronomique, ainsi que les données qui leur sont associées. L ’objectif est d’améliorer le fonctionnement des Centres de Ressources biologiques et d’augmenter la visibilité et la valorisation scientifique des collections qu’ils gèrent.
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Grégoire REY
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
www
Guillemette PARDOUX
France Cohortes développe et mutualise des services et une infrastructure informatique sécurisée certifiée "hébergeur de données de santé ", pour accompagner les équipes de recherche porteuses d’une cohorte de santé publique dans la consolidation et le traitement de leurs données (du recueil à leur réutilisation), et ce, dans le respect de la confidentialité des données des participants.
Les cohortes françaises fournissent régulièrement des données essentielles à la recherche et aux études en santé humaine, sur de longues périodes. France Cohortes met en place un centre de ressources et de services auprès des chercheurs, pour valoriser et pérenniser les projets et l’exploitation scientifique des données produites par les cohortes de santé publique, favorisant ainsi l’émergence de connaissances utiles à la prévention des maladies et à l’amélioration des soins, chez tout ou partie de la population.
D’ici 2024, France Cohortes intègrera plusieurs cohortes affiliées au périmètre initial des tutelles de l’infrastructure. Au-delà, les services seront ouverts aux nouvelles cohortes sur des critères d’éligibilité scientifiques et institutionnels.
www
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Vincent LE BON
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Régine TREBOSSEN
L ’Infrastructure Nationale en Biologie Santé France Life Imaging, FLI, rassemble les plateformes académiques de recherche en imagerie médicale en un réseau coordonné. Elle a été créée en 2012 pour doter les plateformes d’équipements d’imagerie de pointe pour la recherche et maintenir au meilleur niveau les expertises en imagerie des chercheurs des laboratoires adossés.
La coordination des plateformes d’imagerie médicale par FLI permet aujourd’hui aux chercheurs en biologie santé, qu’ils soient dans une structure académique ou industrielle, d’accéder à des technologies d’imagerie médicale de pointe multi modales en Imagerie par Résonance Magnétique (IRM), d’imagerie radio-isotopique (notamment la Tomographie par Emission de Positons, TEP), de tomodensitométrie (scanner), d’échographie et d’imagerie multimodale TEP-IRM, TEP-Ultrasons-Scanner, opto-acoustique. Au total, FLI intègre plus de 120 équipements d’imagerie médicale de pointe pour la recherche dans plus de 40 plateformes, regroupées en 9 hubs régionaux dont plus de la moitié est coordonnée par des hospitalo-universitaires (Isabelle Berry, Vincent Dousset, Philippe Douek, Daniel Fagret, Jacques Felblinger, Jean-Christophe Ferré), le reste par des physiciens et des physiciennes de l’imagerie.
Depuis 2012, FLI a accompagné le développement de nouveaux systèmes d’imagerie, comme le scanner à comptage photonique (Single Photon Counting Computed Tomography scanner, SPCCT), les nouveaux capteurs pour la MagnétoEencéphaloGraphie (MEG) ou les antennes radiofréquences basées sur de nouveaux matériaux pour l’IRM. L’infrastructure organise aussi le partage de savoir-faire et de compétences en imagerie pour maintenir au meilleur niveau l’expertise des laboratoires adossés aux plateformes d’imagerie. Ainsi, elle soutient financièrement un réseau d’entraide en IRM 7T clinique. Enfin, FLI a accompagné le développement d'une infrastructure sécurisée d'analyse et de gestion des données générées par les différentes plateformes d'imagerie in vivo.
FLI est portée par le CEA conjointement avec les universités Paris-Saclay, Grenoble Alpes, Aix-Marseille Université, Claude Bernard Lyon I, Paris Cité, Paul Sabatier-Toulouse III, les universités de Bordeaux, de Montpellier, de Nancy, de Nantes, de Rennes et de Strasbourg ainsi que les principaux organismes de recherche, INSERM, CNRS et INRIA. Elle est inscrite depuis 2016 sur la feuille de route nationale des Infrastructures établie par le Ministère de la Recherche et de l’Enseignement Supérieur. Sa coordination au niveau national est hébergée sur le campus du CEA Paris-Saclay. FLI propose aux tutelles une feuille de route pour l’imagerie médicale pour la recherche incluant l’équipement stratégique au niveau national.
www
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Michel SAMSON
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Christelle HEYS
Jade LOHE
La nouvelle infrastructure de recherche France Exposome a pour vocation de structurer et dynamiser la communauté scientifique travaillant dans le champ environnement-santé sur la thématique de l’exposome chimique humain, via des approches (impliquant principalement la spectrométrie de masse) ciblées et non ciblées de caractérisation de marqueurs d’exposition, de modélisation toxicocinétique et de toxicologie prédictive.
France Exposome offre un support à la recherche dans le champ de la santé environnementale, contribuant à mieux comprendre les associations existantes entre des expositions à des facteurs d’origine chimique et des évènements de santé en lien avec des maladies chroniques, via la mise à disposition d’outils et de méthodes innovantes à la communauté.
France Exposome offre une expertise et un ensemble de services scientifiques, méthodologiques et techniques pour des équipes de recherche en expologie, en épidémiologie et dans le champ de la santé publique, mais également pour des structures privées. Les agences nationales (Santé publique France, Anses) et d'autres instituts (INCa) pourront également s’appuyer sur France Exposome pour développer leurs programmes de biosurveillance et de prévention.
Les équipements technologiques et le savoir-faire sont localisés à l'Irset-Leres à Rennes, au Laberca (UMR 1329) à Nantes, à l'Ineris à Verneuil-en-Halatte, à Toxalim (UMR 1331) à Toulouse et à l'unité T3S à Paris. Ces partenaires apportent une expertise complémentaire en matière de toxicologie, d’interprétation des données et de modélisation. Inscrite sur la feuille de route 2021 du Ministère de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche, l’infrastructure France Exposome est portée par l’Inserm et ses partenaires, l’EHESP , Ineris, INRAE, Oniris, Université Paris Cité et l’Université de Rennes.
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
www
Fabien JOURDAN
Floriant BELLVERT
François FENAILLE
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Lindsay PEYRIGA
Infrastructure française distribuée pour la métabolomique et la fluxomique dédiée à l’innovation, à la formation et au transfert de technologie. Outils et méthodes essentielles pour le phénotypage métabolique et la caractérisation fonctionnelle du métabolisme des systèmes biologiques dans de nombreux domaines de recherche (santé, plantes, biotechnologies).
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RARe
RARe
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Michael O'DONOHUE
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
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Nicolas DEPRETRE
Nœud français d’IBISBA-EU, IBISBA-FR est une infrastructure de recherche distribuée pour le développement des biotechnologies au service de la bioéconomie circulaire. Identifiée en tant qu'Infrastructure Nationale en Biologie Santé (INBS), elle est présente sur la Feuille de Route du Ministère de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche depuis 2016. Elle propose des modules de services et apporte son expertise scientifique et technologique à IBISBA-EU. Elle encourage l’adoption par les plateformes de recherche françaises de normes et pratiques requises pour la production de services dans le cadre d’IBISBA-EU. Réparties dans six localisations, les activités des plateformes d’IBISBA-FR portent sur les biotechnologies industrielles et environnementales, depuis la conception assistée par ordinateur de voies de synthèses construites par ingénierie métabolique pour la production de molécules d’intérêt via l’exploitation des données de –omics (géno-, transcripto-, métabol-, flux-), la découverte et l’amélioration des enzymes et des souches microbiennes adéquates, le développement et le scale-up de bioprocédés.
Labellisée ESFRI 2018, IBISBA-EU est une infrastructure de recherche translationnelle qui entend accélérer le développement des biotechnologies industrielle et environnementale en Europe en tant que pivot de la bio-économie circulaire. Fédérant les infrastructures de recherche de pointe de 10 pays européens et associant les dernières technologies numériques, IBISBA-EU propose aux communautés académique et industrielle un accès unique à des services R&D&I intégrés et innovants en biotechnologie, prenant le virage de l’ère de la « BioIndustry 4.0 ». Les 31 Janvier et 1er Février 2024, l'infrastructure IBISBA France, avec le soutien d'INRAE était fière et heureuse d'organiser le Mini-Summit Inspiring Biotech Solutions de l'infrastructure IBISBA-EU. Cet événement a été l'occasion d'annoncer la candidature de la France pour accueillir le siège légal d'IBISBA-ERIC (en 2026).
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Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Patrick WINCKER
Denis MILAN
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Marie-Thérèse BIHOREAU
Aude PERDEREAU
France Génomique est l'infrastructure nationale de génomique et transcriptomique qui rassemble 11 plateformes de séquençage dont les 2 plateformes nationales d'Evry.
Sont associées à France Génomique, 9 plateformes associées de séquençage, et 13 plateformes associées de bioinformatique, par ailleurs participants de l'IFB, Institut Français de Bioinformatique.
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Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Philippe HANTRAYE
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Emilie HANGEN
NeurATRIS est une infrastructure de recherche destinée à accélérer la transformation des découvertes issues de la recherche fondamentale en innovations médicales pour le traitement des maladies du système nerveux. Se fondant sur sept centres de recherche principaux situés dans la région parisienne et à Nantes, NeurATRIS représente l’une des plus grandes concentrations de chercheurs, ingénieurs et cliniciens en neurosciences en Europe (environ 2 000). NeurATRIS est une infrastructure distribuée qui regroupe MIRCen du CEA, l’Institut du Cerveau, les groupes hospitaliers Henri Mondor, Bicêtre et Robert Debré, l’UMR PANTHER de l’INRAE et I-Stem, autour de compétences, expertises et plateaux techniques de haut niveau et spécialisés en neurologie, biothérapies et troubles du développement neurologique.
Dans ces domaines NeurATRIS se positionne ainsi comme la plus grande infrastructure européenne conduisantdes projets de R&D et fournissant des services aux universitaires, cliniciens et industriels. L ’ensemble destravaux menés grâce à NeurATRIS concerne les maladies de Parkinson, Huntington, Alzheimer, sclérose enplaques, maladies neurodéveloppementales. L’objectif de ces recherches est d’accélérer la compréhensiondes mécanismes physiopathologiques, biologiques et développementaux, de faciliter la réalisationd’essais précliniques/ cliniques de validation de nouvelles thérapies et de développer des approchesinnovantes de diagnostic et de soin pour ces pathologies.
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
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Pascal VILLA
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Kiet TRAN
Mikael LE CLECH
La mission de ChemBioFrance est de fournir aux chercheurs du secteur académique ou privé, une offre intégrée de services pour la découverte et l'utilisation de petites molécules pour "comprendre et soigner le vivant" (sondes biologiques et candidats médicaments).
www
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Bertrand MULLER
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Tania ROUGIER
Phenome-Emphasis développe des équipements pour des milliers de plante, ainsi que des méthodes pour analyser la variabilité génétique des réponses des plantes au changement climatique (sécheresse, CO2, élevé, hautes températures, maladies émergentes). Le projet a:
Phenome-Emphasis continue ces activités, mais a aussi identifié de nouveaux défis.
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Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Fabrice LAURENT
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Edouard GUITTON
Emerg’in est une Infrastructure Nationale de Recherche pour la lutte contre les maladies infectieuses animales émergentes ou zoonotiques par l'exploration in vivo. Elle est sur la feuille de route nationale depuis 2018 et a pour mission de :
- Développer des partenariats public‐privé dans le secteur du diagnostic et du médicament vétérinaire ainsi que dans le secteur des innovations en « Bio-contrôle » des agents infectieux et de leurs vecteurs (le cas échéant) et pour les produits animaux.
Les plateformes (PFIE, IERP , INSECTA) sont labellisées par le GIS IBISA.Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
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Guy PERRIERE
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Juliette DUMONT
L ’institut Français de Bioinformatique (IFB) fédère 21 plateformes membres, 7 plateformes contributrices, 8 équipes associées, et l’UAR coordinatrice IFB-core. Les missions de l’IFB incluent le déploiement d’une infrastructure numérique distribuée, le développement et le déploiement d‘outils logiciels et de bases de connaissances biologiques, l’accompagnement des biologistes pour l’analyse de leurs données, la promotion des bonnes pratiques pour le développement logiciel et pour la gestion des données, la formation. Les services et formations de l’IFB s’adressent à toutes les communautés des sciences du vivant. En particulier, les projets actuels sont structurés autour des communautés microbiologie, agronomie, biodiversité et bioinformatique pour la santé.
Dans le cadre de l’écosystème Recherche Data Gouv, l’IFB a été désigné Centre de Référence Thématique pour les données de biologie-santé. Son rôle de CRT inclut la définition et la diffusion de standards pour les métadonnées et de bonnes pratiques pour la gestion des données, et l’identification des entrepôts de référence de biologie-santé.
L ’IFB participe aux activités du réseau des Infrastructures Nationales de Biologie Santé (INBS) au sein de groupes de travail sur la structuration des infrastructures nationales, les modèles économiques, les interactions avec l’industrie, et la gestion des données biologiques.
L ’IFB est le nœud français de l’infrastructure européenne de bioinformatique ELIXIR. Cette appartenance permet de mutualiser les expertises et réalisations des 23 noeuds nationaux, et offre un levier à la France pour participer aux projets européens de grande envergure.
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Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Christian JORGENSEN
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Séverine KREMER
ECELLFrance (ECF) est l'infrastructure de recherche française pour les thérapies cellulaires visant à régénérer les tissus endommagés dans de nombreuses maladies liées à l'âge ou dans des maladies inflammatoires chroniques actuellement sans traitement curatif viable. ECF fédère 7 sites et 11 plateformes technologiques et rassemble des experts nationaux de premier plan, reconnus au niveau européen dans les domaines suivants : maladies ostéoarticulaires, auto-immunes, accident vasculaire cérébral (maladies neuro-vasculaires), affections cutanées, infarctus du myocarde.
ECF est une infrastructure à guichet unique qui coordonne entièrement toutes les activités allant de la bioproduction de thérapies cellulaires, y compris les Médicaments de Thérapie Innovante (MTI), au pipeline de développement, y compris la validation du projet, les études précliniques, le soutien réglementaire, les tests de sécurité et d'activité, les essais cliniques et l'immunomonitoring. Cette expertise a un impact majeur sur la communauté scientifique et donne à ECF une visibilité nationale et internationale. De ce fait, ECF est impliquée dans de nombreux réseaux nationaux et internationaux et dans des projets majeurs (essais cliniques européens et nationaux, PIIEC, PEPR...).
The Drug Cell
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Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Edouard BERTRAND
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Marine BERAUD
France-BioImaging (FBI) is the national infrastructure for biological imaging. We provide our ~5,000 users immediate access to cutting-edge and innovative microscopy technologies, powerful labeling and computing methods, and appropriate training. As such, FBI plays an essential role in enabling competitive research in many fields, from fundamental questions in cell and developmental biology to preclinical research, and it impacts a variety of domains such as agronomy, marine biology and human health. The study of human diseases is particularly important for FBI, with many of our users working on cancer research, host-pathogen interactions, immunity, neurodegenerative and developmental disorders, genetic diseases, aging...
FBI is composed of 10 geographical nodes and one transversal node dedicated to data management and image processing (IPDM). FBI covers a significant part of the national territory, and each node combines a set of advanced technologies with excellence in specific scientific fields, ensuring complementarity and synergy between the nodes.
FBI comprises 30 IBiSA-labeled imaging facilities and ~80 R&D teams, which bring together the multidisciplinary expertise of biologists, chemists, physicists, mathematicians and computer scientists.
This strategy of mixing facilities and R&D teams enables the infrastructure to generate innovations in imaging, and then transfer these innovations to facilities so that they become easily accessible to the largest possible number of researchers. FBI’s strategy is reflected in our motto "Innovation-Training-Access": (i) Innovation, to invent and disseminate new imaging technologies, from probe development and instrumentation to image analysis; (ii) Training, to enable facility staff and users to master traditional and newly developed imaging technologies; (iii) Access, to provide instrumentation, tools and expertise on methods and models to as many users as possible. FBI is the French node of the European Research Infrastructure Euro-BioImaging.
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Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Alex McDOUGALL
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Kamilia LATAMNA
Le Centre National de Ressources Biologiques Marines, EMBRC-FRANCE, offre à la communauté scientifique et aux entreprises un ensemble complet de services pour l'accès et l'étude de la biodiversité marine et des écosystèmes côtiers, méditerranéen et atlantique sur place ou à distance.
EMBRC accompagne notamment vos projets en proposant son expertise scientifique sur les modèles marins émergents.
Les services d'EMBRC-France vont de l'expédition d'organismes marins à l'accueil scientifique dans les 3 stations marines de Banyuls, Roscoff et Villefranche. Sur place vous pourrez bénéficier de plateformes technologiques de haut niveau (bioinformatique, imagerie, cristallographie, etc.) de laboratoires d’accueil équipés et de structures d’hébergement et de restauration, de moyens variés d'accès à la mer (navires, plongée).
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Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Darren HART
Julie MENETREY
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Marie-Christine POTERSZMAN
The French Infrastructure for Integrated Structural Biology (FRISBI) provides an infrastructure for integrative structural biology approaches, from the molecular to the cellular level, integrating multi-resolution data from X-ray crystallography, small angle X-ray scattering, NMR, Cryo-EM and functional data including development for protein expression and crystallization.
FRISBI is open to structural and molecular and cell biologists from both academia and industry from France and Europe. A simple, transparent reviewed process will provide access based on its feasibility and resource availability. Applications for access can be submitted at any time. Users will be required to contribute towards the costs of access.
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Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Vincent DIEBOLT
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Céline GENTILHOMME
F-CRIN, pour French Clinical Research Infrastructure Network, est une infrastructure nationale créée en 2012 pour soutenir et valoriser l'excellence de la recherche clinique française. Elle a pour objectif principal de renforcer la collaboration entre les différents acteurs de la recherche clinique en France, ainsi que d'assurer un relais national avec ECRIN, le réseau européen de recherche clinique. F-CRIN se positionne aujourd’hui comme une plateforme essentielle pour structurer et soutenir les réseaux nationaux de recherche clinique, d'expertise et d'investigation dans des domaines médicaux spécifiques. L'infrastructure rassemble à l'heure actuelle 21 composantes, dont 17 réseaux thématiques de recherche clinique, 2 réseaux d’expertise méthodologique, une plateforme multiservices et une unité de coordination nationale. Elle couvre plus de 19 domaines médicaux, permettant ainsi le développement d'un large éventail de collaborations et d'initiatives au service d’une recherche clinique française de pointe.
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Yann HERAULT
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Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Hamid MEZIANE
Infrastructure Nationale pour la création, l’élevage, le phénotypage, la distribution et l’archivage d’organismes modèles
CELPHEDIA (Creation, Breeding, Phenotyping, Distribution and Archiving of model organisms) is a national operational research infrastructure distributed over the French territory. Its mission is to support academic and industrial scientific community to accelerate discoveries in biology and improve biomedical research.
To this end, CELPHEDIA operates in 3 main activities with respect of ethical principles and animal welfare:
With 13 centres distributed throughout France, CELPHEDIA offers an outstanding range of expertise, skills and services, unique in Europe and covering 3 major families of animal models:
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Myriam FERRO
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ProFI est l'infrastructure nationale en biologie et santé dédiée à la R&D et au service en protéomique. Cette infrastructure a démarré en 2012 et a été financée par le Programme d'investissements d'avenir sur la période 2012-2024). Les six nœuds composant ProFI sont les plateformes IBISA suivantes : Grenoble Proteomics (Grenoble) ; MS4OMICS (Lille) ; Plateforme Protéomique Strasbourg Grand Est (PSGE ; Strasbourg) ; Pôle Protéomique de Montpellier (PPM ; Montpellier) ; ProGénomix (Bagnols/Cèze) ; Protéomique Toulouse (ProtéoToul ; Toulouse). Le CNRS est le coordinateur institutionnel de ProFI et ses partenaires sont le CEA, l’Inserm, les universités Grenoble Alpes (UGA), de Lille, de Montpellier, Paul Sabatier (Toulouse, UPS), de Strasbourg (Unistra) et les CHU de Lille et Montpellier. Les objectifs de l’INBS ProFI réunissent les activités de R&D, de service, de formation et d’actions envers la communauté. L'activité R&D concerne le développement de méthodes de caractérisation fonctionnelle et structurale des protéines et des complexes protéiques.
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Michèle TIXIER-BOICHARD
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Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Patricia HUAN
RARe est l’infrastructure de référence pour sécuriser, documenter et distribuer les ressources de la biosphère du système Terre et notamment les ressources génétiques, génomiques, et biologiques assemblées et caractérisées par la recherche agronomique, ainsi que les données qui leur sont associées. L ’objectif est d’améliorer le fonctionnement des Centres de Ressources biologiques et d’augmenter la visibilité et la valorisation scientifique des collections qu’ils gèrent.
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Grégoire REY
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
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Guillemette PARDOUX
France Cohortes développe et mutualise des services et une infrastructure informatique sécurisée certifiée "hébergeur de données de santé ", pour accompagner les équipes de recherche porteuses d’une cohorte de santé publique dans la consolidation et le traitement de leurs données (du recueil à leur réutilisation), et ce, dans le respect de la confidentialité des données des participants.
Les cohortes françaises fournissent régulièrement des données essentielles à la recherche et aux études en santé humaine, sur de longues périodes. France Cohortes met en place un centre de ressources et de services auprès des chercheurs, pour valoriser et pérenniser les projets et l’exploitation scientifique des données produites par les cohortes de santé publique, favorisant ainsi l’émergence de connaissances utiles à la prévention des maladies et à l’amélioration des soins, chez tout ou partie de la population.
D’ici 2024, France Cohortes intègrera plusieurs cohortes affiliées au périmètre initial des tutelles de l’infrastructure. Au-delà, les services seront ouverts aux nouvelles cohortes sur des critères d’éligibilité scientifiques et institutionnels.
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Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Vincent LE BON
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Régine TREBOSSEN
L ’Infrastructure Nationale en Biologie Santé France Life Imaging, FLI, rassemble les plateformes académiques de recherche en imagerie médicale en un réseau coordonné. Elle a été créée en 2012 pour doter les plateformes d’équipements d’imagerie de pointe pour la recherche et maintenir au meilleur niveau les expertises en imagerie des chercheurs des laboratoires adossés.
La coordination des plateformes d’imagerie médicale par FLI permet aujourd’hui aux chercheurs en biologie santé, qu’ils soient dans une structure académique ou industrielle, d’accéder à des technologies d’imagerie médicale de pointe multi modales en Imagerie par Résonance Magnétique (IRM), d’imagerie radio-isotopique (notamment la Tomographie par Emission de Positons, TEP), de tomodensitométrie (scanner), d’échographie et d’imagerie multimodale TEP-IRM, TEP-Ultrasons-Scanner, opto-acoustique. Au total, FLI intègre plus de 120 équipements d’imagerie médicale de pointe pour la recherche dans plus de 40 plateformes, regroupées en 9 hubs régionaux dont plus de la moitié est coordonnée par des hospitalo-universitaires (Isabelle Berry, Vincent Dousset, Philippe Douek, Daniel Fagret, Jacques Felblinger, Jean-Christophe Ferré), le reste par des physiciens et des physiciennes de l’imagerie.
Depuis 2012, FLI a accompagné le développement de nouveaux systèmes d’imagerie, comme le scanner à comptage photonique (Single Photon Counting Computed Tomography scanner, SPCCT), les nouveaux capteurs pour la MagnétoEencéphaloGraphie (MEG) ou les antennes radiofréquences basées sur de nouveaux matériaux pour l’IRM. L’infrastructure organise aussi le partage de savoir-faire et de compétences en imagerie pour maintenir au meilleur niveau l’expertise des laboratoires adossés aux plateformes d’imagerie. Ainsi, elle soutient financièrement un réseau d’entraide en IRM 7T clinique. Enfin, FLI a accompagné le développement d'une infrastructure sécurisée d'analyse et de gestion des données générées par les différentes plateformes d'imagerie in vivo.
FLI est portée par le CEA conjointement avec les universités Paris-Saclay, Grenoble Alpes, Aix-Marseille Université, Claude Bernard Lyon I, Paris Cité, Paul Sabatier-Toulouse III, les universités de Bordeaux, de Montpellier, de Nancy, de Nantes, de Rennes et de Strasbourg ainsi que les principaux organismes de recherche, INSERM, CNRS et INRIA. Elle est inscrite depuis 2016 sur la feuille de route nationale des Infrastructures établie par le Ministère de la Recherche et de l’Enseignement Supérieur. Sa coordination au niveau national est hébergée sur le campus du CEA Paris-Saclay. FLI propose aux tutelles une feuille de route pour l’imagerie médicale pour la recherche incluant l’équipement stratégique au niveau national.
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Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
Michel SAMSON
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Christelle HEYS
Jade LOHE
La nouvelle infrastructure de recherche France Exposome a pour vocation de structurer et dynamiser la communauté scientifique travaillant dans le champ environnement-santé sur la thématique de l’exposome chimique humain, via des approches (impliquant principalement la spectrométrie de masse) ciblées et non ciblées de caractérisation de marqueurs d’exposition, de modélisation toxicocinétique et de toxicologie prédictive.
France Exposome offre un support à la recherche dans le champ de la santé environnementale, contribuant à mieux comprendre les associations existantes entre des expositions à des facteurs d’origine chimique et des évènements de santé en lien avec des maladies chroniques, via la mise à disposition d’outils et de méthodes innovantes à la communauté.
France Exposome offre une expertise et un ensemble de services scientifiques, méthodologiques et techniques pour des équipes de recherche en expologie, en épidémiologie et dans le champ de la santé publique, mais également pour des structures privées. Les agences nationales (Santé publique France, Anses) et d'autres instituts (INCa) pourront également s’appuyer sur France Exposome pour développer leurs programmes de biosurveillance et de prévention.
Les équipements technologiques et le savoir-faire sont localisés à l'Irset-Leres à Rennes, au Laberca (UMR 1329) à Nantes, à l'Ineris à Verneuil-en-Halatte, à Toxalim (UMR 1331) à Toulouse et à l'unité T3S à Paris. Ces partenaires apportent une expertise complémentaire en matière de toxicologie, d’interprétation des données et de modélisation. Inscrite sur la feuille de route 2021 du Ministère de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche, l’infrastructure France Exposome est portée par l’Inserm et ses partenaires, l’EHESP , Ineris, INRAE, Oniris, Université Paris Cité et l’Université de Rennes.
Directeur de l’infrastructure ou représentant(s)
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Fabien JOURDAN
Floriant BELLVERT
François FENAILLE
Référent-e-s / Chargé-e-s de communication
Lindsay PEYRIGA
Infrastructure française distribuée pour la métabolomique et la fluxomique dédiée à l’innovation, à la formation et au transfert de technologie. Outils et méthodes essentielles pour le phénotypage métabolique et la caractérisation fonctionnelle du métabolisme des systèmes biologiques dans de nombreux domaines de recherche (santé, plantes, biotechnologies).