Tarea 1. P3S1 GyP 2024

Tarea 1 P.3 S1 RNA

Laboratorio de Genómica y ProteómicaDocente: Dra. Abril Saint Martin Castellanos Universidad Anáhuac México Campus Norte Licenciatura en Médico Cirujano

Equipo 2: - Edna Solangely Nava Castro 00443101 - Angel Alexis Hernández Tirado 00453335 - Jesús Miguel Dávalos Dávalos 00459068

Summary

Tipos de RNA que conforman el RNA total que se extrae de tejidos o células

Cuadro comparativo

¿Qué es la espectrofotometría? y ¿por qué se usa para determinar concentración de RNA?

¿Por qué el RNA absorbe a una longitud de onda de 260nm?

¿Qué información da sobre la pureza del RNA el cociente 260/230?

¿Qué información da sobre la pureza del RNA el cociente 260/280?

REFERENCIAS

1.tipos de RNA que conforman el RNA total que se extrae de tejidos o células. Esquematiza los tipos de RNA.

a. Describe todos los tipos de RNA en un extracto total → adiciona esquemas de los mismos

RNAm

• Cada codón especifica un aminoácido particular, aunque un aminoácido puede ser codificado por muchos codones diferentes. Aunque hay 64 posibles, solo 20 de ellos representan aminoácidos.

• Como parte del procesamiento post-transcripcional en eucariotas, el extremo 5' del RNAm está coronado con un nucleótido trifosfato de guanosina, que ayuda en el reconocimiento de RNAm durante la traducción o síntesis de proteínas. Del mismo modo, el extremo 3' de un RNAm tiene una cola poli-A o múltiples residuos de adenilato añadido a la misma, lo que evita la degradación enzimática del RNAm. Tanto el extremo 5' y 3' de un RNAm imparte estabilidad al RNAm.

Es el mensajero entre el ADN y la producción de proteínas. Esta es la plantilla genética del ADN que le permite codificar proteínas. El RNAm constituye sólo el 5% del RNA total de una célula. El RNAm es el más heterogéneo de los tres tipos de RNA en términos de secuencia y tamaño de bases. Lleva un código genético adicional copiado de durante la transcripción, el ADN se compone de tres nucleótidos llamados codones.

1. tipos de RNA que conforman el RNA total que se extrae de tejidos o células. Esquematiza los tipos de RNA.

RNAt

Es el más pequeño de los tres tipos de RNA y tiene entre 75 y 95 nucleótidos. Los RNAt son un componente esencial de la traducción, cuya función principal es la transferencia de aminoácidos durante la síntesis de proteínas. Por eso se les llama RNA de transferencia. Cada uno de los 20 aminoácidos tiene un RNAt específico que actúa sobre ellos y los transfiere a la cadena polipeptídica en crecimiento. Los RNA también actúan como adaptadores para traducir la secuencia genética del ARNm en proteínas. Por eso también se les llama moléculas adaptadoras.

• Los RNAt tienen una estructura de trébol o T que se estabiliza mediante fuertes enlaces de hidrógeno entre los nucleótidos. Además de las 4 habituales, suelen contener también algunas bases inusuales que se forman por metilación de las bases habituales. La metilguanina y la metilcitosina son dos ejemplos de bases metiladas.

¿qué información da sobre la pureza del RNA el cociente 260/230?

¿qué información da sobre la pureza del RNA el cociente 260/280?

REFERENCIAS

1.Tipos de RNA que conforman el RNA total que se extrae de tejidos o células. Esquematiza los tipos de RNA.

RNAr

Se encuentran en los ribosomas y constituyen el 80% del RNA total presente en la célula. Los ribosomas están formados por una subunidad grande llamada 50S y una subunidad pequeña llamada 30S, cada una formada por sus propias moléculas de RNAr específicas. Los diversos RNAr presentes en los ribosomas incluyen RNAr pequeños y RNAr grandes, que pertenecen a las subunidades pequeña y grande del ribosoma, respectivamente.

Los RNAr se combinan con proteínas y enzimas en el citoplasma para formar ribosomas, que actúan como sitio de síntesis de proteínas. Estas estructuras complejas se mueven a lo largo de la molécula de RNAm durante la traducción y facilitan el ensamblaje de aminoácidos para formar una cadena polipeptídica. Interactúan con RNAt y otras moléculas que son fundamentales para la síntesis de proteínas. Tiene 1800-5000 nucleótidos.

Justification

CUADRO COMPARATIVO

3. ¿Qué es la espectrofotometría? y ¿por qué se usa para determinar concentración de RNA?

La espectrofotometría es un método de análisis óptico para la investigación biológica. El instrumento antes a esto se le llama espectrofotómetro, un instrumento con la función de comparar la radiacióntransferido a través de una solución que contiene una cantidad desconocida de soluto a una cantidad conocida de la misma sustancia. Cabe señalar que todas las sustancias son capaces de absorber energía radiante sin hacerloimportar sus propiedades.

Una vez que leemos sobre esto, sabemos que la base de la espectrofotometría es que cada solución contiene las moléculas suspendidas transmiten un haz de luz en proporción inversa al número de moléculas suspendidas. Contiene, en este caso los nucleótidos de RNA presentan un máximo de absorción a 260 nm (UV); Por lo tanto, los espectrofotómetros son el dispositivo más utilizado para determinar la concentración de ácidos nucleicos en Solución. Cuanta más luz absorbe la muestra (absorción), mayor es la concentración de ácidos nucleicos.

Objectives

4. Investigue: ¿por qué el RNA absorbe a una longitud de onda de 260nm?

Como revisamos anteriormente el análisis por espectrofotometría está fundamentando en la absorbancia, comprendiendo ésta como la cantidad de luz que se absorbe en una solución que contiene moléculas cuando un haz de luz UV incide sobre dicha solución de tal forma que podemos determinar que a mayor absorbancia, mayor la concentración de moléculas de la muestra. La absorbancia puede ser cuantificada en un rango que oscila entre 0.001 y 1.000 en unidades conocidas como densidad óptica “OD” (alguna literatura también refiere tal unidad como sinónimo de absorbancia) es así que el máximo punto de absorbancia encontrado para ácidos nucleicos es a una longitud de onda igual a 260 nm donde OD posee un valor de 1. La relación establecida entre la absorbancia y la concentración de moléculas en una solución puede ser obtenida a través de la ley de Beer-Lambert A=cϵL, donde: “A” es la absorbancia, “c” es la concentración, “ϵ” es la absorbancia molar siendo directamente dependiente de la longitud de onda y “L” la longitud de la trayectoria. En esta ley encontramos que la absorbancia molar o coeficiente de extinción molar “ϵ” es directamente proporcional a la absorbancia, encontrando en máximo punto de absorción de luz para moléculas de ácidos nucleicos a una longitud de onda de 260 nm

Hypotheses

5. ¿Qué información da sobre la pureza del RNA el cociente 260/230?

Contaminación con fenol y sales: índice 260/230. La absorción de radiación UV a 230 nm indica que la muestra está contaminada con iones de fenolato o tiocianato, péptidos, compuestos aromáticos u otras sustancias. Para muestras de ARN puro, se espera que la proporción 260/230 esté entre 2,0 y 2,2. Las muestras con una proporción más baja indican la presencia de impurezas que se absorben a 230 nm.

Theoretical framework

6. ¿Qué información da sobre la pureza del RNA el cociente 260/280?

Medición de contaminación por proteínas: índice 260/280. El índice de absorción 260/280 nm se utiliza para evaluar la pureza de los ácidos nucleicos (ARN) en relación con la contaminación por proteínas, ya que estas últimas absorben luz a una longitud de onda de 280 nm. En el caso del ARN, una proporción óptima es de 2.0. La presencia de proteínas disminuye esta relación. Por lo tanto, si el índice 260/280 es inferior a 2.0, indica una alta cantidad de proteína en la muestra y puede requerir un nuevo proceso de extracción.

Bibliography

Referencias

Cheriyedath, S. M. (2021, 25 mayo). Types of RNA: mRNA, rRNA and tRNA. News-Medical.net. https://www.news-medical.net/life-sciences/-Types-of-RNA-mRNA-rRNA-and-tRNA.aspx ● Enríquez M, & Partida J (2016). Ácidos nucleicos. Montes A, & Rodríguez A, & Borunda J(Eds.), Biología Molecular. Fundamentos y aplicaciones en las ciencias de la salud, 2e. McGraw Hill. https://accessmedicina.mhmedical.com/content.aspx?bookid=1803&sectionid=124154993 ● Weil, P. A. (2018). Nucleic acid structure & function. V. W. Rodwell, D. A. Bender, K. M. Botham, P. J. Kennelly & P. A. Weil (Eds.), Harper’s illustrated biochemistry, 31e. New York, NY: McGraw-Hill Education. accessmedicine.mhmedical.com/content.aspx?aid=1160190679

Appendix