Structure de l'ADN et codage de l'information- 2nde

Activité 2 - A LA DECOUVERTE DU SUPPORT DE L'INFORMATION GENETIQUE

Répondre aux différentes questions sur une feuille. Un compte-rendu par binôme sera évalué.

Cliché 54 : 1ère image de l'ADN obtenue par cristallographie par rayons X, par Rosalind Franklin

Rosalind Franklin 1920-1958

Partie 1 : Structure et composition de l'ADN

Partie 2 : Structure de l'ADN et information génétique

Mme Grégoire Lycée Marcellin Berthelot, Questembert

Partie 1 - Structure et composition de l'ADN

L'objectif de cette partie est de découvrir la structure de la molécule d'ADN. Répondre aux 7 questions dans l'ordre, en utilisant le logiciel Libmol et les aides techniques.

LIBMOL

Question 3

Question 1

Question 2

Question 4

Question 5

Question 6

Question 7 Bilan

!! Mot de passe !! Indiquer les 4 initiales des nucléotides de l'ADN.

Respecter l'ordre alphabétique.

Partie 2- Structure de l'ADN et information génétique

L'objectif de cette partie est de comprendre comment la structure de l'ADN lui permet de porter une information. Vous répondrez aux questions, dans l'ordre, en comparant 2 gènes grâce au logiciel Anagène. Utiliser les aides techniques

ANAgene

Question 1

Question 2

Question 3

Info

Malgré la puissance des microscopes modernes, les images des molécules obtenues ne sont pas assez détaillées. Par contre, on parvient, en combinant les résultats des analyses chimiques, cristallographiques et de résonance magnétique nucléaire à fournir suffisamment d’informations à de puissants ordinateurs pour qu’ils puissent calculer un modèle moléculaire en 3D que l’on peut ensuite manipuler grâce aux fonctions d’un logiciel de visualisation comme Libmol.

comment utiliser libmol ?

Libmol est un site en ligne qui permet de visualiser les molécules en 3D

Site web Libmol

Fiche technique Libmol

Vidéo tutoriel Libmol

comment utiliser anagene ?

Anagène est un logiciel qui permet d'analyser des séquences d'ADN, d'ARN ou de protéines et de les comparer.

Lancer le logiciel ANAGENE à partir du menu Démarrer du PC

Fiche technique Anagène

Vidéo tutoriel Anagène

- Sélectionner les 2 séquences à comparer en appuyant sur le carré gris placé devant la séquence, puis cliquer sur l'icône Comparaison.

- Dans la fenêtre qui apparaît, choisir le type de comparaison : Comparaison simple et appuyer sur OK.

exemple de résultat. (Ici, le nucléotide 103 est différent dans les deux séquences.)

1- En haut à droite de la fenêtre, cliquer sur Mesures. 2- Activer la mesure de distances. 3- Cliquer sur 2 atomes pour mesurer la distance qui les sépare.

Cliquer sur le menu "Séquence"

1- Dans le menu "Fichiers" Chercher dans la librairie de molécule : ADN 14 paires de bases

2- Dans le menu "Commandes"

Identifier les atomes contenus dans l'ADN grâce à leurs couleurs

IMPORTANT : dans le logiciel Anagène, une seule chaîne de la molécule d'ADN est representée.

Chaque chaîne d'ADN est composée d'une répétition d'unité, appelée nucléotide.

1- Modifier la représentation en choisissant Boules et bâtonnets.

2- Colorer par résidus.

3- Lire les informations données par le logiciel pour identifier ces résidus (nucléotides)

Dans le menu "Commandes"

1- Sélectionner la représentation en rubans 2- Colorer par chaînes