échelles de la biodiversité

Les différentes échelles de la biodiversité: - 1 ère échelle - 2 ème échelle - 3 ème échelle

1 ère échelle de la biodiversité:

L’ensemble des êtres vivants qui peuplent un milieu ainsi que les conditions physico-chimiques de ce milieu (température, luminosité, humidité, ...) interagissent. L'ensemble porte un nom mais lequel ? Aidez- vous de la diapositive suivante !

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2 ème échelle de la biodiversité:

Pour étudier la biodiversité d'un écosystème il faut d'abord la décrire. C'est un travail de terrain réalisé par les scientifiques. La richesse spécifique (c'est à dire le nombre d'espèces différentes dans un endroit) est l'une des mesures les plus courantes de la biodiversité. Cliquez sur l'écosystème "Haie d'orties" pour rescencer les espèces présentes!

Quelques méthodes pour faire un iventaire de la biodiversité.

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Direction le labo

A l'aide de votre filet à papillons vous avez attrapé deux espèces différentes, vous avez en votre possession des clés de détermination pour les identifier.

Sur une feuille d'ortie, vous observez 5 cocinelles qui présentent des motifs différents, combien d'espèces différentes de cocinelles peut-on identifier dans notre écosystème ? Au laboratoire vous trouverez des renseignements sur la notion d'espèce !

Direction le labo

La notion d'espèce

Des infos sur la coccinelle?

Rappels de génétique

Etape 3: Séquencer l'ADN

Etape 2 : Localiser et inactiver des gènes

Etape1: Faire des croisements

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Ecosystème "Haie d'orties"

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3 ème échellede la biodiversité:

Grace aux croisements test on a pu montrer qu'il y a deux espèces de cocinnelles dans notre écosystème. La première espèce est la coccinelle à 7 points Coccinella septempunctata, une grande habituée de nos jardins... La deuxième espèce est la coccinelle arlequin. Il s'agit de coccinelles présentant des motifs variés sur leurs élytres (la carapace protégeant leurs ailes). D'ou provient la variabilité des motifs entre les différents individus chez les cocinelles arlequins ?

QUEL EST LE gène à l'origine deS motifs sur les ELYTRES ?

Nous avons identifié une région bien précise du chromosome 4 de la coccinelle arlequin, dont les variations de séquences sont corrélées avec les variations de coloration. Cette région s’étend sur trois gènes : le gène aor, le gène pnr et le gène itrPour pouvoir savoir lequel de ces trois gènes est impliqué, on peut inactiver chaque gène l'un après l'autre et observer les effets de cette inactivation sur les caractéristiques de la coccinelle.

Inactiver le gène aor

Inactiver le gène pnr

Inactiver le gène itr

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Expérience d'inactivation du gène pnr

Red-nspots

Black-nspots

Black-4spots

Black-2spots

Gène pnr actif(expérience témoin)

Gène pnr inactif

Refaire une expérience d'inactivation

Red-nspots

Black-nspots

Black-4spots

Black-2spots

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Expérience d'inactivation du gène aor

Red-nspots

Black-nspots

Black-4spots

Black-2spots

Gène aor actif(expérience témoin)

Gène aor inactif

Refaire une expérience d'inactivation

Red-nspots

Black-nspots

Black-4spots

Black-2spots

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Expérience d'inactivation du gène itr

Red-nspots

Black-nspots

Black-4spots

Black-2spots

Gène itr actif(expérience témoin)

Gène itr inactif

Refaire une expérience d'inactivation

Red-nspots

Black-nspots

Black-4spots

Black-2spots

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Les résultats du séquençage sont arrivés !!! Pour connaître les secrets sur la diversité phénotypique des concinelles arlequins: RDV sur GenieGen2!

Lien vers GenieGen2

Protocole

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Entrez le chiffre correspondant au chromosome concerné par le séquencage.

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

___

Recommencer le sequençage

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

x__

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

xx_

Recommencer le sequençage

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

___

Recommencer le sequençage

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

x__

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

xx_

Recommencer le sequençage

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La séquence d'ADN demandée a bien été séquencée.Il existe 4 versions (allèles) de ce gène pnr ("pannier") : hsp : allèle trouvé chez Black-4spots hA : allèle trouvé chez Black-nspots hC : allèle trouvé chez Black-2spots h : allèle trouvé chez Red-nspots

Il est temps de retourner au labo et de découvrir ce que contient l'enveloppe laissée à votre disposition...

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

ERREUR : ce n'est pas le bon gène !

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Ce chromosome contient plein de gènes, mais aucun ne participe à la mise ne place du motif des élytres.

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Sélectionnez une deuxième coccinelle...

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

Sélectionnez les coccinelles que vous voulez croiser...

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

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ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Ecosystème "Haie d'orties"

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

Pas de croisement possible

Sélectionnez une deuxième coccinelle...

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

Pas de croisement possible

Sélectionnez une deuxième coccinelle...

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

Pas de croisement possible

Sélectionnez une deuxième coccinelle...

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

Pas de croisement possible

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Pas de croisement possible

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Pas de croisement possible

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

Pas de croisement possible

Sélectionnez une deuxième coccinelle...

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Pas de croisement possible

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

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ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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