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La Spé SVT en images et en vidéos

Bekaert

Created on October 26, 2023

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Transcript

Programme de Première Spé
Géologie
Biologie
A 31 ans, Henrietta Lacks, une américaine, meurt d'un cancer foudroyant de l'utérus:
Source: https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Henrietta_Lacks_statue,_Bristol,_RHS.jpg
Pourtant, 72 ans après sa mort, ses cellules cancéreuses sont toujours en vie et toujours entrain de se diviser !
Comment expliquer ce paradoxe ? D'où les cancers viennent - ils?
Des leçons pour comprendre:

Conservation Et variation du génotype

Mitose méiose

Caractéristiques Origines

Cancers

Biologie

Immunité innée Immunité acquise

Enzymes Synthèse des protéines

Expression du génotype

Immunité

Divisions synthèse des protéines et enzymes sommaire:
Résumé
En images
Evaluation
En savoir +
En vidéos
L'essentiel, ..., en quelques mots!
La mitose se compose de 4 phases: la prophase, la métaphase, l'anaphase et la télophase

Info

Lors de la mitose, la quantité de chromosomes et de chromatides est conservée

Info

La méiose se compose de 2 divisions: la divsion réductionnelle et la division équationnelle

Info

L'ADN est répliqué, selon le mode semi conservatif, lors de la phase S

Info

La réduction du nombre de chromosomes survient lors de l'anaphase 1, pendant la méiose.

Info

Info

La fréquence des mutations spontannées est de 10-9
Des enzymes réduisent la fréquence des mutations et les agents mutagènes les augmentent.

Info

Source: https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Les_4_phases_principales_de_la_mitose. Auteur: National Center for Biotechnology Information, Public domain, via Wikimedia Commons

Etapes de la mitose

Quantité d'ADN (pg)

temps (jours)

Source: www.jpb-imagine.com

Evolution de la quantité d'ADN lors d'un cycle cellulaire

Source: http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article912

Etapes de la méiose

Source: http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article1915

Evolution de la quantité d'ADN lors de la méiose

Source: http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article787

Mécanisme de réplication de l'ADN

Zone à réparer, entourée

Source: https://www.rcsb.org/structure/6UKI Fichier: 6UKI.pdb

Source: https://www.rcsb.org/structure/1vas Fichier: 1VAS.pdb

Enzyme (verte) réparant l'ADN (bleu)
Enzyme (bleue) contrôlant l'ADN (jaune)
Des mécanismes de détection et de réparation des mésappariements de l'ADN

Sources: https://go.drugbank.com/drugs/DB14761 (à gauche) et https://www.rcsb.org/ligand/ADP (à droite)

Source: https://www.rcsb.org/structure/1d86 Fichier: 1d86.pdb

Agent mutagène à gauche et nucléotide naturel à droite
Agent mutagène (en vert) déformant l'ADN
Vidéo présentant les étapes de la mitose
Vidéo présentant les étapes de la méiose
Vidéo qui présente la réplication de l'ADN
Avez - vous retenu l'essentiel?
En savoir +:
Pour avoir des schémas: http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt
Pour avoir des molécules en 3D: https://www.rcsb.org
Pour voir une chanson: https://www.youtube.com/watch?v=iCL6d0OwKt8
Pour voir ou avoir des photos supplémentaires: contacter olivier.bekaert@ac-Bordeaux.fr
Et si vous deveniez technicien en amélioration génétique: https://www.orientation-pour-tous.fr/metier/technicienne-amelioration-genetique,15053.html

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Synthèse des protéines et enzymes sommaire:
Résumé
En images
Evaluation
En savoir +
En vidéos
L'essentiel, ..., en quelques mots!

Info

Le code génétique fait correspondre un triplet de nucléotides à un acide aminé
L'ADN est dans le noyau et les protéines sont synthètisées dans le cytoplasme

Info

Info

L'ARN est l'intermédiaire entre l'ADN et les protéines
La synthèse des protéines comporte 2 étapes: la transcription et la traduction

Info

Info

Les enzymes accélèrent les réactions biochimiques

Info

Le site de reconnaissance et le site catalytique des enzymes expliquent leurs spécificités

Source: http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article864

Le code génétique, un système de correspondance entre ADN et protéines
Particularités du code génétique
un code universel (ou presque)
un code redondant
des codons non sens qui ne codent pour aucun acide aminé
des acides aminés voisins codés par des codons qui se ressemblent

Source: https://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article901

L'ADN situé dans le noyau MAIS une synthèse des protéines dans le cytoplasme

Source: https://www.pedagogie.ac-nantes.fr/sciences-de-la-vie-et-de-la-terre/enseignement/ressources-pedagogiques/visualisation-et-etude-de-la-molecule-d-arn-114033.kjsp?RH=PEDA

L'ARN, intermédiaire entre ADN et protéines
L'uracile, à la place de la thymine
Le sucre, du ribose
Une seule chaîne

Sources: https://www.pedagogie.ac-nantes.fr/sciences-de-la-vie-et-de-la-terre/enseignement/ressources-pedagogiques/visualisation-et-etude-de-la-molecule-d-arn-114033.kjsp?RH=PEDA et https://libmol.org/?libmol=111 (uracile)

Différences entre ARN et ADN

Source: http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article2628

Transcription de l'ADN en ARNm

Source: http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article2653

Traduction de l'ARNm en protéines
Les enzymes, des accélératrices de réactions chimiques
Enzymes et énergie d'activation
Etapes de la réaction enzymatique
Evolution de la vitesse de la réaction en fonction de la concentration

Source: http://librairiedemolecules.education.fr/molecule.php?idmol=274.

Structure de l'enzyme et site de reconnaissance

Source: http://acces.ens-lyon.fr/biotic/rastop/html/3D-DB.htm

Varièté A de l'enzyme
Varièté B de l'enzyme
Des différences de forme expliquent des différences d'activité
Vidéo présenant la transcription
Vidéo présentant la traduction
Vidéo présentant le fonctionnement des enzymes
Avez - vous retenu l'essentiel?
En savoir +:
Comparaison ADN / ARN:https://www.pedagogie.ac-nice.fr/svt/productions/molecules/adnarnmol/
Les virus à ARN: https://www.techno-science.net/glossaire-definition/Virus-a-ARN.html
Maturation des ARN = épissage: https://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89pissage
Pour en savoir + sur les enzymes: https://view.genial.ly/624d35f4f516550018859bf4/presentation-les-enzymes-en-images-et-en-videos
En chanson: https://www.youtube.com/watch?v=NdMVRL4oaUo
Origine des cancers sommaire:
Résumé
En images
Evaluation
En savoir +
En vidéos
L'essentiel, ..., en quelques mots!
Les cellules cancéreuses se multiplient de manière anarchique

Info

Elles accumulent des mutations et leur phénotype se modifie

Info

Certains gènes, les oncogènes , provquent le développement de cancers

Info

Les gènes et allèles de prédisposition augmentent les risques d'apparition de ces maladies

Info

Info

Les facteurs du milieu augmentent les risques d'apparition de ces maladies

Info

Des méthodes préventives réduisent les risques

Info

Des traitements permettent de guérir ces maladies
Tissu sain
Tissu cancéreux
Comparaison de tissu sain et de tissu cancereux

Source: https://causam.fr/easyblog/sciences/immortelle-henrietta-lacks

Caryotypes de cellule saine et de cellule de cancer de l'utérus
OB

Arbre généalogique d’une personne atteinte d’un cancer

Source: http://acces.ens-lyon.fr/acces/thematiques/evolution/logiciels/anagene/sequences

Délétion de 2 nucléotides dans un gène de réparation de l’ADN, chez un patient atteint d’un cancer

Source: http://acces.ens-lyon.fr/acces/thematiques/evolution/logiciels/anagene/sequences

Arbre généalogique d'une porteuse de BRCA1+

Source: http://cancertherapyadvisory.com

Des allèles comme BRCA1 qui multiplient les risques de cancer

Source: https://www.canceraustralia.gov.au/cancer-types/melanoma/statistics

Une vague irrésistible de cancers de la peau, en Australie

Début de la vaccination

Source: https://www.canceraustralia.gov.au/cancer-types/cervical-cancer/statistics

Effets d’une vaccination systématique contre les papillomavirus (HP16 et HP18) sur le taux d’incidence du cancer du col de l’utérus

ADN

Actinomycine D, qui introduit des mutations supplémentaires

Source: https://www.rcsb.org/structure/173d

Chimiothérapie

OB

Anticorps dirigé contre un récepteur impliqué dans les cancers

Récepteur favorisant les cancers

Source: https://www.rcsb.org/structure/7E9B

Anticorps dirigé contre un récepteur impliqué dans la survie et le développement des tumeurs

Vidéo présentant les étapes de la cancérisation
Avez - vous retenu l'essentiel?
En savoir +:
Pour voir un témoignage de patiente: https://www.youtube.com/watch?v=OJRSjM3aWnE
Pour avoir des molécules en 3D: https://www.rcsb.org
Pour avoir plus d'information sur les nouveaux traitements: https://www.youtube.com/watch?v=_JGOFruqf6g
Pour voir un diaporama détaillé sur le cancer: https://view.genial.ly/6457ce84608891001a3b642e/presentation-les-cancers
Immunité sommaire:
Résumé
En images
Evaluation
En savoir +
En vidéos
L'essentiel, ..., en quelques mots!
L'immunité innée est la 1° ligne de défense. Elle n'est pas spécifique et n'entraine pas de mise en mémoire des antigènes

Info

Info

Elle se compose de la réaction inflammatoire et de la phagocytose
L'immunité adaptative est la 2° ligne de défense.Elle est spécifique et entraine une mise en mémoire des éléments étrangers

Info

Info

Elle fait appel aux anticorps et à la destruction par contact.

Info

La vaccination est préventive et fait appel à la mémoire immunitaire
Une fréquence élevée de vaccination entraine une immunité de groupe et prévient les épidémies.

Info

Info

L'immunothérapie guérit efficacement de nombreuses maladies
Source: etapinflam.doc/ http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt
Etapes de l'inflammation
Source: https://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article3101
Etapes de la phagocytose
OB
Source: Capture d'écran d'expériences avec Logger Pro

Un moyen de défense non spécifique

Source: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/fastaformat/

Des molécules voisines dans tous les groupes

Source: immun_elimin/ http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt
Mécanisme d'action des anticorps

Partie variable, Fixatrice des antigènes

Partie fixe, fixatrice des macrophages

Source: 1IGT_ok.pdb/https://www.rcsb.org/structure/1igt

Structure d’un anticorps

Test qui montre la spécificité des anticorps

Source: https://www.rcsb.org/structure/3nsj.pdb

Source: https://www.rcsb.org/structure/6sb5.pdb

Pore formé par l'assemblage de perforines
Perforine
Perforine et pore formé par l'assemblage de perforines
Source: http://acces.ens-lyon.fr/biotic/immuno Capture d'écran du logiciel Anagène 2
Des anticorps différents qui fixent des antigènes différents
Source: memory_1_2.doc.doc / http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt
Mise en évidence d'une mémoire immunitaire
infection vaccination
anticorps maternels, anticorps monoclonaux

Table

You can write a description here

Oui
Non
Oui
Non
Faible, quelques semaines
forte, quelques années
Prévention
Traitement
Cliquez sur les cases pour faire apparaître leur contenu en bleu ce qui est naturel et en rouge ce qui artificiel !
Tableau de comparaison des immunités passive et active
Vidéo qui montre une cellule en phagocytant une autre
Une vidéo qui résume les étapes de l'inflammation
Vidéo qui présente la réponse cytotoxique
Vidéo du test d'Ouchterlony
Un taux de vaccination important permet d'arrêter une épidémie !
Avez - vous retenu l'essentiel?
En savoir +:
Pour avoir des schémas: http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt
Pour voir un anticorps en 3D: https://www.rcsb.org/structure/1igt
Et si vous deveniez médecin spécialiste: https://www.fedsante.fr/candidats/sanitaire/oncologie

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Pour voir une chanson: https://www.youtube.com/watch?v=qds-rzWc4sY
Pour en savoir plus sur les nouveaux vaccins à ARN: https://vimeo.com/618385339
Des leçons pour comprendre:

Structure du globe

Strutures superficielles Profondes

Reliefs Roches

Divergence

Géologie

Reliefs Roches

Horizontaux Verticaux

Convergence

Mouvements

Structure du globe sommaire:
Résumé
En images
Evaluation
En savoir +
En vidéos
D'où viennent ces volcans explosifs?
L'essentiel, ..., en quelques mots!

Info

Une distribution, bimodale , des altitudes
2 types de de croûtes de densité et de composition , différentes

Info

Info

Un globe terrestre, hétérogène
2 mécanismes pour évacuer la chaleur interne du globe

Info

Source: tectoglob3D: https://www.pedagogie.ac-nice.fr/svt/productions/tectoglob3d/
Des altitudes très différentes pour les continents et les océans
Source: https://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article2666
Une distribution bimodale des altitudes
Océans
Continents
Roches
Basalte
Granite
2.9
2.6
Densités
Comparaison des continents et des océans
Source: https://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article1693
Mise en évidence d'une zone d'ombre sur une carte
Dispositif expérimental
Explication de la zone d'ombre: une Terre hétérogène
Croûte
Lithosphère
Manteau supérieur
Moho
Asthénosphère
Asthénosphère
Source: https://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article2691
Evolution de la vitesse des ondes et structure superficielle du globe
Croûte
Manteau
Discontinuité de Gutemberg
Noyau externe
Discontinuité de Lehman
Noyau interne
Source: http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article3687
Evolution de la vitesse des ondes avec la profondeur
Source: http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article3687
Schéma qui présente la structure du globe terrestre
Courant froid descendant
Source: https://www.pedagogie.ac-nice.fr/svt/productions/tomographie2/
Des anomalies de vitesse qui traduisent l'existence de courants de convection
Source: https://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article911
Mécanisme d'évacuation de la chaleur par convection
Source: http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article2947
Convection dans le manteau
Vidéo qui explique la zone d'ombre
Vidéo qui présente la structure du globe terrestre
Vidéo qui présente une expérience de convection dans un liquide
Avez - vous retenu l'essentiel?
En savoir +:
Voir une vidéo sur la géothermie: https://www.youtube.com/watch?v=wbWgp538cjo
Voir une animation sur la conduction: https://www.youtube.com/watch?v=qW59Y9lJso8
Une application pour visualiser les ondes sismiques: http://svt.ac-besancon.fr/visualiser-des-ondes-sismiques-et-mesurer-leurs-vitesses-dans-differents-materiaux/

Link

Pour en savoir + : utilisation de séismes artificiels pour rechercher du gaz naturel ou du pétrole: https://coursgeologie.com/sismique-reflection-et-refraction-154/
Et si vous deveniez géophysicien: https://www.onisep.fr/ressources/Univers-Metier/Metiers/geophysicien-geophysicienne

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Mouvement des plaques sommaire:
Résumé
En images
Evaluation
En savoir +
En vidéos
L'essentiel, ..., en quelques mots!
Une lithosphère découpée en plaques mobiles

Info

Des mouvements repérables grâce à des méthodes géodésiques

Info

Des mouvements repérables grâce à des méthodes géologiques

Info

Des frontières de divergence et des frontières de covergence

Info

Comment expliquer de tels mouvements?
Source: https://www.pedagogie.ac-nice.fr/svt/productions/tectoglob3d/
Les séismes et les volcans délimitent des plaques en mouvement
Source: https://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article107
Une Terre, divisée en plaques lithosphériques
Déplacement en longitude
Déplacement en latitude
Source: https://sideshow.jpl.nasa.gov/post/series.html
Détermination des vitesses instantanées en latitude et en longitude de la plaque européenne (balise REYK)
2 cm/AN
Source: https://www.pedagogie.ac-nice.fr/svt/productions/tectoglob3d/
Détermination de la vitesse moyenne d'expansion du plancher océanique, dans l'Atlantique
Source: https://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article3612
Utilisation des points chauds pour déterminer l'orientation et la vitesse moyenne des plaques
Source: https://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article767
Des mouvements de divergence et de convergence
Vidéo qui explique comment calculer la vitesse instantanée d'une plaque
Vidéo qui explique comment calculer la vitesse moyenne d'une plaque
Vidéo qui présente le mouvement des plaques depuis -240 millions d'années jusque dans 250 millions d'années
Avez - vous retenu l'essentiel?
En savoir +:
Pour avoir des données GPS: https://sideshow.jpl.nasa.gov/post/series.html
Et si vous deveniez géologue: https://www.onisep.fr/ressources/Univers-Metier/Metiers/geologue

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Une application pour voir le mouvement des plaques: http://geosciences3d.univ-lyon1.fr/resources.php
Pour voir une chanson: https://www.youtube.com/watch?v=hhxjAAnwNKM
Evolution du modèle de la tectonique des plaques: https://planet-terre.ens-lyon.fr/ressource/tectonique-plaques-1970-2011.xml
Divergence sommaire:
Résumé
En images
Evaluation
En savoir +
En vidéos
L'essentiel, ..., en quelques mots!

Info

Caractéristiques des dorsales
3 types de roches magmatiques fréquentes dans les zones de divergence

Info

Info

Dorsales lentes et dorsales rapides ont des activités magmatiques différentes
Une décompression à l'origine des magmas

Info

Info

Une circulation d'eau et des échanges au niveau de la lithosphère
Un refroidissement et un épaississement de la lithosphère avec le temps

Info

Volcan
Failles normales
Moho
Source: https://www.pedagogie.ac-nice.fr/svt/productions/tectoglob3d/
Bloc diagramme 3D à travers la zone de divergence du Golfe d'Aden
Les zones de divergence sont le siège d'un magmatisme intense: Pourquoi?
Basalte vu au microscope (X40)
Basaltes, en surface
Coussin de basalte, à l'affleurement
Source: https://phototheque.enseigne.ac-lyon.fr/photossql/photos.php?RollID=images&FrameID=gabbro1
Gabbro vu au microscope (X40)
Gabbro, vu à l'oeil nu
Gabbro, en profondeur
Péridotite vue au microscope (X40)
Enclave de péridotite, vue l'oeil nu
Péridotite, sous le gabbro ou le basalte
Source: https://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article165
Schéma bilan d'une dorsale (rapide)
Source: https://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article166
Particularités des dorsales lentes, par rapport aux dorsales rapides
Source: https://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article187
Des courants de convection ascendants, à l'origine des magmas des zones de divergence
Quelles sont les conséquences de la circulation d'eau au niveau des dorsales?
Fe + Mn+ Ca
Eau + Na
Source: https://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article2614
Echanges de matières et de chaleur entre l'eau de mer et la lithosphère océanique
X40
directions d'entrée de l'eau de mer
Transformation des minéraux de la lithosphère au contact de l'eau de mer
Source: https://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article1370
Evolution de la densité de la lithosphère avec la distance à l'axe de la dorsale
Vidéo qui montre l'écoulement de la lave dans les océans
Vidéo qui montre l'éruption d'eau chaude au niveau d'un geyser (Islande)
3 modes de formation des magmas
Vidéo qui résume la formation de la lithosphère océanique
Avez - vous retenu l'essentiel?
En savoir +:
Pour voir une source hydrothermale ("fumeur noir") au sein des océans: https://www.youtube.com/watch?v=KtFFmDGIsa4
Pour voir un océan se former au coeur d'un désert: https://www.youtube.com/watch?v=Ouzs3GL0BAc
Un océan au coeur des Alpes: https://actugeologique.fr/2019/02/le-massif-du-chenaillet/
Une application pour analyser des images (de géologie et +....): Mesurim 2

Tooltip

Des photos de géologie libre de droit : https://phototheque.enseigne.ac-lyon.fr/photossql/photos.php
Convergence sommaire:
Résumé
En images
Evaluation
En savoir +
En vidéos
L'essentiel, ..., en quelques mots!

Info

La subduction: le plongement de lithosphère, rigide, dans l'asthénosphère, plus souple

Info

3 types de roches magmatiques fréquentes dans les zones de convergence

Info

L'eau des plaques plogeantes, à l'origine des magmas
Un épaississement de la lithsophère continentale, lors de la collision

Info

Info

Des structures tectoniques, témoins d'un raccourcissement
Les zones de subduction des océans: des zones volcaniques
Source: https://www.pedagogie.ac-nice.fr/svt/productions/tectoglob3d/
Des données GPS, qui confirment le rapprochement des plaques
Fosse océanique
Volcans
Source: https://www.pedagogie.ac-nice.fr/svt/productions/tectoglob3d/
Les zones de subduction, des zones volcaniques et sismiques, très actives
Lithosphère, rigide
Source: https://www.pedagogie.ac-nice.fr/svt/productions/tectoglob3d/
Une lithosphère, rigide, s'enfonçant dans de l'asthénosphère, moins rigide
X 40
amphibole
Feldspath Na
Andésite, vue au microscope polarisant
Des coulées, courtes, de lave visqueuse
L'andésite et ses coulées
X40
Feldspath
Quartz
Biotite
Rhyolite ou dacite, vue au microscope polarisant
Dôme de rhyolite
Rhyolite et son dôme de lave très visqueuse
X40
Quartz
Feldspath Na
Biotite
Granodiorite, vue au microscope polarisant
Amphibole
Biotite
Source: https://libmol.org/minusc
Des minéraux riches en OH (= "eau"), dans les roches magmatiques de subduction
Conditions de formation des magmas des zones de subduction
Source: https://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article186/ MODIFIE
Diagramme PT dans les zones de subduction
X40
Pyroxène relique
Glaucophane
Minéral primaire de la plaque plongeant perdant son eau
Source: https://svtlyceedevienne.com/1ere-specialite/theme-1-b-le-domaine-continental-et-sa-dynamique/chapitre-1-la-caracterisation-du-domaine-continental-lithosphere-continentale-reliefs-et-epaisseur-crustale
Schéma bilan des zones de subduction
Mont Viso (Alpes italiennes)
D'où viennent les chaînes de montagnes?
Moho
Moho
Moho
Source: http://didac.free.fr/bac_s_archive_2013-20/ts16noumea/2.htm
Profil sismique à travers les Alpes
Source: https://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article1686
Epaississement et raccourcissement crustal dans les chaînes de montagnes de collision
Faille inverse, dans les Alpes
Pli, dans les Alpes
Trias (-245MA à -200 MA)
Contact anormal
Crétacé sup. (-100 MA à -65 MA)
Nappe de charriage
Des éruptions volcaniques explosives
Vidéo qui présente les déformations associées à la collision
Vidéo qui résume le cours sur la convergence
Avez - vous retenu l'essentiel?
En savoir +:
Voir une éruption historique célèbre: https://www.youtube.com/watch?v=M3f5w3NPC7M
Une application pour visualiser les minéraux en 3D, Minusc: https://libmol.org/minusc/

Link

Voir des structures particulières, les prismes d'accrétion: https://planet-terre.ens-lyon.fr/ressource/prisme-alpes.xml
Voir des minéraux témoins d'une collision: à la page suivante
Et si vous deveniez volcanologue: https://www.onisep.fr/ressources/univers-metier/metiers/volcanologue

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Disthène
Sillimanite
Minéraux métamorphiques vus au microscope