Structure ADN

TP3 La structure de la molécule d’ADN

Les molécules d’ADN constituent les chromosomes. Chaque chromosome est une molécule d’ADN (ou deux molécules si le chromosome est à deux chromatides). Ceux-ci sont parfois visibles au microscope (voir photo ci-contre prise au microscope électronique à balayage) mais dans ce cas la molécule est très enroulée sur elle-même et sur des protéines de support. On ne voit donc pas la structure propre de la molécule d’ADN et on ne comprend pas avec cette photo comment elle peut être porteuse d’un message

On cherche à comprendre quelle est l’organisation de la molécule d’ADN.

En 1951, Rosalind Franklin (photo ci-contre) utilise une méthode indirecte, la diffraction au rayon X pour élucider sa structure. Aujourd’hui, on peut visualiser cette structure à l’aide de logiciels de modélisation moléculaire en 3D tels que le logiciel Libmol. Quelle que soit l’espèce, la structure de l’ADN est identique. Ces modèles ne sont que des resprésentations des résultats obtenus par rayons X.

Capacités et attitudes

Consignes : 1) Aller sur l’application en ligne « Libmol » 2) Rechercher dans la librairie de molécule « ADN 14 paires de bases » Vous pouvez faire pivoter la molécule en cliquant dessus.

Savoir utiliser l’application LIBMOL

Question 1 : Les boules qui s'affichent représentent :

Bonne réponse

Mauvaise réponse

Des molécules

Des atomes

Des électrons

Des cellules

La nature des atomes est indiquée par la couleur de ceux-ci et est indiquée en bas à gauche de la fenêtre avec la molécules

Question 2 : Quels sont les atomes composant la molécule d’ADN?

Mesure de la taille en largeur de la molécule:

Cliquer sur « Mesure » (en haut à gauche)Cliquer sur « Activer la mesure de distance »Puis cliquer sur l’atome à l’une des extrémités de votre mesure puis sur l’atome à l’autre extrémité. Question 3 : Quelle est la taille de la molécule d’ADN?

Aller dans « Commandes »Afficher la molécule en Rubans.

Aide : Une hélice

Question 4 : L’organisation de la molécule d’ADN ressemble :

à une double hélice (avec 2 chaînes)

Bonne réponse

Mauvaise réponse

à une hélice simple

à 3 brins entrelacés.

à 4 brins entrelacés.

Une hydrolyse partielle de la molécule d’ADN (ADN partiellement coupé en présence d’eau) permet d’obtenir quatre constituants à structures analogues : les nucléotides nommés Adénine (A),Thymine (T), Guanine (G), Cytosine (C). On a observé le % de ces quatre constituants chez différentes espèces qui sont représentés dans le tableau ci-dessous :

Question 5 D’après le tableau à double entrée ci-contre chez une espèce, quelle qu'elle soit (plusieurs bonnes réponses) :

Il y a autant de chaque type de nucléotide

Il y a autant de nucléotides C que de nucléotides A

Il y a autant de nucléotides A que de nucléotides T

Il y a autant de nucléotides G que de nucléotides C

Bonne réponse

Mauvaise réponse

Colorer chaque nucléotide en une couleur différente :

Question 6 La coloration des nucléotides en différentes couleurs (plusieurs bonnes réponses) :

Montre que le nucléotide A s’associe toujours avec le nucléotide G (est toujours en face de)

Cliquer sur « Commande »Puis « Colorer par »Puis « Résidus »Le nom des nucléotides et la couleur associée est indiquée en bas à gauche.

Montre que le nucléotide T s’associe toujours avec le nucléotide A

Montre que le nucléotide C s’associe toujours avec le nucléotide G

Explique les valeurs du tableau précédent

N’explique pas les valeurs du tableau précédent

Bonne réponse

Mauvaise réponse

Bilan : A partir de vos observations, réaliser un schéma simplifié de la molécule d’ADN

Capacités et attitudes

Communiquer par un schéma

Bilan : A partir de vos observations, réaliser un schéma simplifié de la molécule d’ADN

Lister les éléments importants découverts dans ce TP à faire figurer sur votre schéma (ne pas hésiter à relire les réponses aux questions)

Capacités et attitudes

Communiquer par un schéma

Bilan : A partir de vos observations, réaliser un schéma simplifié de la molécule d’ADN

Lister les éléments importants découverts dans ce TP à faire figurer sur votre schéma (ne pas hésiter à relire les réponses aux questions)

Le schéma est une représentation simplifiée de la molécule d’ADN : choisir des symboles, couleurs ou autre pour symboliser les différents éléments importants. Les atomes n’ont pas à être tous représentés et la molécule peut-être schématisée à plat (et non torsadée

Capacités et attitudes

Communiquer par un schéma

Bilan : A partir de vos observations, réaliser un schéma simplifié de la molécule d’ADN

Lister les éléments importants découverts dans ce TP à faire figurer sur votre schéma (ne pas hésiter à relire les réponses aux questions)

Le schéma est une représentation simplifiée de la molécule d’ADN : choisir des symboles, couleurs ou autre pour symboliser les différents éléments importants. Les atomes n’ont pas à être tous représentés et la molécule peut-être schématisée à plat (et non torsadée

Soigner son schéma : faire des traits au stylo avec des couleurs, fins, nets et continus, sans rature

Capacités et attitudes

Communiquer par un schéma

Bilan : A partir de vos observations, réaliser un schéma simplifié de la molécule d’ADN

Lister les éléments importants découverts dans ce TP à faire figurer sur votre schéma (ne pas hésiter à relire les réponses aux questions)

Le schéma est une représentation simplifiée de la molécule d’ADN : choisir des symboles, couleurs ou autre pour symboliser les différents éléments importants. Les atomes n’ont pas à être tous représentés et la molécule peut-être schématisée à plat (et non torsadée

Soigner son schéma : faire des traits au stylo avec des couleurs, fins, nets et continus, sans rature

Capacités et attitudes

Communiquer par un schéma

Le schéma possède un titre et des légendes (tous les symboles utilisés doivent être identifiables par une légende)

Consigne :A partir des documents des deux pages suivantes, lister toutes les informations apprises concernant les gènes.

Capacités et attitudes

Recenser, extraire, organiser des informations

Capacités et attitudes

Recenser, extraire, organiser des informations