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Informe Bioinformático 1

Montse Navarro

Created on January 23, 2023

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INFORME BIOINFORMÁTICO

Avellanada Alcantara Sebastian 00460129Díaz Badillo Fernando 00426073 Navarro Carvajal Montserrat 00449486 Noemi Kammerlohr Zoe 00462122

Imagen real del Gen APC humano

Base de datos NCIB

Identificación del exón de interacción de los primers

Índice

referencias

identificación de la secuencia de amplificación

1. Imagen real del gen APC humano (NCBI), con la delimitación de exones e intrones (indicando cada uno)

Fig. 1. Gen APC humano. Las líneas horizontales indican los intrones, mientras que las líneas horizontales indican los exones. Las flechas grises indican la dirección de 5´(NM) a 3´(NP) (NCBI, 2023).

Fig. 2 Gen APC humano. Las líneas verdes verticales muestran los Exones (1-16) (NCBI, 2023)

2. Identificación del exón donde interaccionan los primers de APC que ustedes usarán en la PCR:

APCFwd: 5' AGTAGAAGTGGTCAGCCTCAAAA 3' APCRev: 5' GAACTTCGCTCACAGGATCTTC 3'

Fig. 3. Exón donde interaccionan los primers (Fwd y Rev) de APC. Línea azul: APCFwd. Línea Roja: APCRev. Ambos primers se encuentran interaccionando dentro del Exon numero 16 (NCBI, 2023).

3. Identificación de la secuencia que estos oligonucleótidos amplificarán.

Fig. 4. Secuencia que los oligonucleótidos APCFwd y APCRev amplificarán. Se muestra la secuencia completa del Gen APC Humano, resaltando en corchetes la localización de los primers dentro de un exón, siendo el azul APCFwd, el rojo APCRev y en medio de ambos toda la secuencia que se amplificará (NCBI, 2023).

4. Explique cuál es la relevancia de la base de datos NCBI y por qué es importante para los investigadores clínicos.

  • National Center of Biotechnology Information ("NCBI") es una base de datos que forma parte de la Biblioteca Nacional de Medicina de Estados Unidos, rama del Instituto Nacional de Salud (NIH). La relevancia de esta base de datos recae en ser una importante herramienta y fuente de información de biología molecular.
  • La base de datos NCBI es importante para los investigadores clínicos, ya que alberga información sobre secuencias genómicas que permiten determinar la región exacta de un gen que se desea analizar. Además, contiene artículos científicos en PubMed referentes a biología celular y molecular, genética, bioquímica, microbiología, entre otras, que le podrán proporcionar a los investigadores información adicional. Cabe recalcar que es una plataforma gratuita (NCBI, 2023).

REFERENCIAS ELECTRÓNICAS

  • NCBI. 2023. [Internet]. National Center for Biotechnology Information. U.S. National Library of Medicine. Accesado el 21 de enero de 2023, de: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/home/about/
  • APC. 2015. [internet]. Cidegen. Accesado el 21 de enero de 2023, de: https://cidegen.com/apc/

GRACIAS