Introducción a la Bioinformática

Introducción a la bioinformática

Temas de clase : Presentación Discusión de matriz de sesiones Sistemas de Evaluación Introducción a la Bioinformática

Autor: Joivier Vichi Lozada

Fecha

O2022

Presentación Prof.

Presentación Est.

Matriz de Sesiones

Objetivos

Índice

¿Qué es la Bioinformática

Desglose de Calf.

Joivier Vichi Lozada

Lic. Microbiología / Doctorado en Biología Molecular y celular.

¿Quién eres . . . ?

Me gusta . . . Que no me gusta . . .

• ¿ Por qué decidiste ser ingeniero en biotecnología ?
• ¿Qué te gusta . . . ?
• ¿ Qué no te gusta . . . ?
• ¿Qué esperas alcanzar al estudiar en la UPEMOR ?
• ¿Qué expectativas tienes del curso ?

Presentación

objetivos: Que el alumno sea capaz de Identificar secuencias de DNA y proteínas de importancia biotecnológica, a través del uso de herramientas bioinformáticas de análisis de secuencias biológicas y bases de datos biológicas depositadas en internet, para generar construcciones de importancia biotecnológica, la mejora de procesos y productos mediante la investigación aplicada y para el desarrollo de procesos biotecnológicos innovadores.

Habilidades: Al final de la asignatura, el alumno contará con actitudes procedimentales : - Recuperar secuencias peptídicas y nucleotídicas de interés biotecnológico, a partir de bases de datos como NCBI y Ensembl. - Diseñar oligonucleótidos para PCR punto final y tiempo real,así como evaluar su calidad utilizando herramientas in silico. - Anotar secuencias nucleotídicas, incorporando en ellas características como regiones codificantes, y no codificantes. - Anotar secuencias peptídicas, señalando características como dominios, motivos, modificaciones postraduccionales, péptido señal, regiones transmembranales, etc. - Obtener las características fisicoquímicas de una proteína (pI, peso molecular, número de aminoácidos que la integran, perfil de hidropatía) mediAnte análisis in silico. - Generar secuencias peptídicas y nucleotídicas en formato FASTA, que pueda abrir y manipular en programas bioinformáticos. - Realizar e interpretar análisis de restricción in silico de secuencias nucleotídicas de interés así como construcciones de plasmídos. - Realizar alineamientos pareados y múltiples de proteínas y ácidos nucleicos e interpretar los resultados.Generar e interpretar árboles filogenéticos, a partir de secuencias proteicas y nucleotídicas. - Análisis de datos de secuenciación masiva de DNA y RNA.Determinación procesos biológicos enriquecidos y de regiones reuladoras de genes.

Matriz de Sesiones

1. 15 Semanas de clase
2. 7 Horas presenciales a la semana
3. Evaluación diagnóstico, formativa, sumativa

Evidencias:

• Conocimiento
• Desempeño
• Producto

Bases de datos

Análisis Bioinformáticos

Genómica y regulación

Estado de la cuestión

Ponderación de la calificación

Evidencias de conocimiento (Exámenes, Presentaciones, y Exposiciones): 25 % Evidencia de productos (Proyecto) : 30 % Evidencia de Desempeño (Actividades académicas):

• Ejercicio en Plataforma : 20 %
• Tareas: 15 %
• Portafolio de evidencias : 10 %

_______________________ Total 100%

¿Qué es la Bionformática ?

La bioinformática es la aplicación de la tecnología de la información/ computación al campo de la biología molecular. Es el término dado a los enfoques matemáticos y de computación utilizados para recoger la comprensión de los procesos biológicos. El uso, creación y avance en el desarrollo de bases de datos, algoritmos, técnicas computacionales y estadísticas para el análisis de datos biológicos. (competencia) Resolver problemas formales y prácticos derivados de la gestión y el análisis de datos biológicos.(proyectos)

¿Qué es la Bioinformática? ¿Por qué crees que es parte de tu formación ?

Actividad de clase : Localizar el artículo que se muestro en la imagen (¿Comó ?) Indicar si pertenece al JCR Factor de Impacto de la revista Tema que aborda el artículo Categoría del artículo Herramientas bioinformática que discute