micro-organisme et santé

Rayan est malade, son médecin lui prescrit des antibiotiques pour combattre une infection bactérienne diagnostiquée. Mais ces antibiotiques provoquent chez lui des troubles intestinaux. Mission 1 : Déterminer l'origine de des troubles gastriques de Rayan.

Un individu sain contient quasiment autant de cellules bactériennes que de cellules humaines dans son organisme !!! La proportion de bactéries par rapport aux cellules humaines chez des individus en bonne santé de l'âge de Rayan est en effet égale à 1,31 en moyenne.

Déterminer s' il y a une perte au niveau du microbiote de Rayan en calculant sa proportion de bactéries par rapport aux cellules humaines.

Réaliser les calculs qui suivent ...

L'apparition de diarrhée, d'une inflammation, de douleurs intestinales peuvent être dû à une altération du microbiote intestinal. En effet, la quantité et la composition du microbiote peuvent être perturbées (réduction et/ou perte de diversité du microbiote) par certains facteurs. On parle alors de DYSBIOSE . On cherche à savoir si c'est le cas pour Rayan.

Qu'est-ce que le microbiote intestinal ?

START

Calculer la quantité totale de bactéries constituant le microbiote de Rayan

E+ signifie 10 puissance, exemple 3.8E+13 = 3.8 x 1013

Info

Calculer maintenant le nombre de cellules humaines constituant le corps de Rayan

Calculer le rapport entre le nombre de bactéries présentes dans le corps de Rayan et le nombre total de cellules humaines que son corps contient.

Rappel : la proportion de bactéries par rapport aux cellules humaines chez des individus en bonne santé de l'âge de Rayan est en effet égale à 1,31 en moyenne.

Conclure

Déterminer à présent si la diversité bactérienne du microbiote de Rayan a été réduite.

Le graphique ci-contre, représente la diversité des espèces de bactéries d'un groupe majoritaire du microbiote intestinal, les Bacteroïdes, chez quatre personnes saines (A à D) et actuellement chez Rayan.Chaque rectangle coloré correspond à une espèce bactérienne du groupe. La hauteur du rectangle correspond à son abondance.

Analyser le document et conclure

Qu'est ce qu'une espèce ?

Faites une conclusion de votre étude : le microbiote de Rayan est-il perturbé ? Avez-vous déterminé l'origine des troubles gastriques de Rayan ?

Info

Info

Mission 2: Identifier le facteur ayant perturbé le microbiote de Rayan On rappelle que ces perturbations gastriques sont survenues suite à la prise d'un traitement antibiotique. Un traitement antibiotique a pour but de détruire les bactéries causant une pathologie. Regarder si l'antibiotique utilisé par Rayan détruit aussi les bactéries de son microbiote et donc le perturbe.

START

Observons les effets de l'antibiotique polymyxine pris par Rayan sur les bactéries non pathogènes de son microbiote intestinal en réalisant un antibiogramme.

Antibiogramme des bactéries du microbiote de RayanA : polymyxine B : eau distillée (témoin) C : Amoxicilline D : trétacycline E : Céfotaxine F : Pénicilline

Info

Analyser les résultats de l'antibiogramme afin de déterminer quel est l'effet des antibiotiques prescrits à Rayan. (j'observe ... j'en déduis ...)

Le médecin de Rayan lui a conseillé, pour éviter les troubles intestinaux associés au traitement antibiotique, de consommer des yaourts, du lait fermenté.

Les bienfaits du kéfir La fermentation du lait s’est répandue dans les populations de façon concomitante à l’agriculture, environ 8000 ans avant notre ère, pour conserver ce lait, devenu plus abondant avec l’élevage. Le lait fermenté était alors un produit à haute valeur nutritionnelle puisqu’il est riche en protéines, en calcium, en vitamines et en autres micronutriments. (…) La diversité des produits fermentés à travers le monde est incroyable : on en compte plus de 3500 ! Dans les pays occidentaux ce sont les yaourts, les fromages, le pain, la choucroute, … Dans d’autres régions du monde, c’est par exemple le kéfir, un lait fermenté originaire du Caucase. Deux études menées aux Etats-Unis et aux Pays-Bas ont mis en évidence des associations positives entre la richesse du microbiote et la consommation régulière de produits fermentés. Ces études intéressent beaucoup la communauté scientifique car elles suggèrent que la consommation régulière de produits fermentés pourrait stimuler la diversité microbienne. (D’après « Dossier spécial, Pour la science avril-juin 2017)

Mission 3 : Observer un frottis de yaourt au microscope optique pour en déterminer la composition.

A l'aide de la fiche d'identification des principaux microorganismes, légender et titrer la photographie obtenue.

fiche d'identification

D'après vos observations, expliquer cette recommandation du médecin.

Une autre solution pour aider Rayan à rétablir son microbiote

La transplantation fécale

Fin de l'activité, tu l'as réussi si :

1. Tu sais définir le "microbiote humain"2. Tu as compris où on pouvait le trouver dans notre corps 3. Tu as compris les différents rôles assurés par le microbiote3. Tu as identifié le rôle des antibiotiques et leurs effets sur le microbiote4. Tu as compris pourquoi les antibiotiques pouvaient être responsables de troubles digestifs5. Tu as compris pourquoi certains aliments peuvent aider notre microbiote à remplir ses fonctions lorsqu'on doit suivre un traitement antibiotique

Home