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21_22 TP7amylase Diapos

Laurent JIMENEZ

Created on November 17, 2021

21_22 TP7amylase Diapos

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Transcript

TP n°7 : Propriétés d’une enzyme : l’amylase salivaire

21_22 TP7proprétés amylase

photocopie

On cherche à montrer les conditions d’action de l’amylase salivaire, enzyme produite par les cellules des glandes salivaires. L’amylase est une protéine qui catalyse les réactions d’hydrolyse de l’amidon, au cours de la digestion.

A partir des activités proposées, caractérisez les conditions d’action de l’amylase salivaire

21_22 TP7proprétés amylase

21_22 TP7proprétés amylase

21_22 TP7proprétés amylase

Résultats

21_22 TP7proprétés amylase

Activité2 : Modélisation de la relation amylase-amidon Consigne : Après avoir visualisé le modèle proposé, présenter et traiter les données brutes pour qu'elles apportent les informations relatives à la partie de l’enzyme impliquée dans l’interaction avec son substrat Matériel à disposition :

  • Logiciel Rastop et sa fiche technique
  • Fichier 1MFV.pdb (sur le réseau) : structure spatiale (*) de l’amylase salivaire humaine liée à un analogue structural (**) non hydrolysable de l’amidon,
(*) déterminée par cristallographie aux rayons X. (**) composé ayant une structure chimique similaire.

21_22 TP7proprétés amylase

Protocole :

  • Afficher le complexe enzyme-substrat en bleu puis, dans le menu ruban, choisir squelette carboné puis, afficher seul.
  • Grâce à l’éditeur de commandes, désigner certains éléments du complexe enzyme substrat selon le tableau ci-dessous. Choisir une représentation en sphères et colorer différemment les éléments sélectionnés :
  • Afficher le fond en blanc, en vue d’imprimer.

21_22 TP7proprétés amylase

Eléments à sélectionner

Désignation des éléments

Substrat

501- 506

Acides aminés formant le site actif : partie de l’enzyme en interaction avec le substrat

58, 59, 62, 63, 151, 197, 233, 299, 300, 305

Acides aminés catalytiques : intervenant dans la réaction d’hydrolyse

ASP197

21_22 TP7proprétés amylase

Résultat

Squelette carboné de l’amylase

Analogue structural de l’amidon

Acides aminés formant le site catalytique enzymatique

Acides aminés formant le site actif enzymatique

19_20TP7proprétés amylase