Rappels/Lexique
Activités
Plan et doc
Présentation
Suppléments
Rappels/Lexique sur La biodiversité et son évolution
Activités pour réviser le lexique
Lexique
Rappels
Activités
Rappels/Lexique
activités
Plan et doc
Suppléments
Présentation
La biodiversité et son évolution
Il existe sur Terre un grand nombre d’espèces dont seule une faible proportion est effectivement connue. Aujourd’hui, certaines de ces espèces sont menacées d’extinction.
Évaluer la biodiversité à différentes échelles spatiales et temporelles représente donc un enjeu majeur pour comprendre sa dynamique et les conséquences des actions humaines.
Comment inventorier et estimer la biodiversité et comment évolue-t-elle?
Rappels/Lexique
Activités
Plan et doc
Suppléments
Présentation
La biodiversité et son évolution
Accès au plan du chapitre et aux documents
cours en vidéo
cours
Rappels/Lexique
Présentation
Suppléments
Activités
Plan et doc
Activités pour s'entrainer
Exercice supplementaire sur Hardy Weinberg
Exercice supplémentaire CMR/ IC
Rappels/Lexique
Présentation
Suppléments
Activités
Plan et doc
Activités ludiques proposées par les élèves
Activités pour s'entrainer
Propositions d'élèves
Exercice supplementaire sur Hardy Weinberg
Exercice d'application 1
Exercice d'application 2
Exercice supplémentaire
Rappels/Lexique
Présentation
Activités
Plan et doc
Suppléments
Estimer la biodiversité
Evolution de la biodiversité
Activité 1: échantillonnage et identification des espèces
Réponses
Activité 3: Evolution de la biodiversité au sein des populations
Activité 2: Calculer une estimation de la biodiversité à partir d'échantillons
Activité 4: L'impact des activités humaines
Comment estimer et caractériser la biodiversité?
1ère partieEchantillonnage et identification les espèces
2ème partie Comparer la biodiversité de trois stations étudiées
Partie 1 : échantillonnage et identification des espèces
Consignes
Partie 2A l´aide des documents à votre disposition, comparez la richesse spécifique et l'abondance des trois stations étudiées. Concluez en comparant la biodiversité de ces stations.
La carte ci-dessus présente l'abondance relative des différents taxons dans trois des lieux étudiés.
Calculer une estimation de la biodiversité à partir d'échantillons
1- La méthode CMR: Capture Marquage Recapture
2- Utiliser un intervalle de confiance
Exercice d'application
Principe
Consigne : Exercice 1
Consigne de l'exercice 2
FOCUS MATHS
Logiciel à utiliser
Fichier EXCEL à remplir
Calculer une moyenne avec EXCEL
Réaliser un graphique avec Excel
Réponses
Réponses
Réponses
Calculer une estimation de la biodiversité à partir d'échantillons
La méthode CMR: Capture Marquage Recapture
Utiliser un intervalle de confiance
Principe
Consigne : Exercice 1
Consigne de l'exercice 2
FOCUS MATHS
Logiciel à utiliser
Fichier EXCEL à remplir
Calculer une moyenne avec EXCEL
Réponses
Réponses
Réponses
Evolution de la biodiversité au sein des populations
Evolution de la biodiversité d'une population
Composition génétique d'une population de lézards
Réponses
Réponses
Evolution de la biodiversité au sein des populations
Evolution de la biodiversité d'une population
Composition génétique d'une population de lézards
Réponses
Réponses
FOCUS MATHS
Exercice d'application
Etudier la composition génétique des
populations et son évolution avec le
modèle de Hardy-Weinberg
Rappel sur la distinction gène et allèle
Document phénotype/génotype/allèle
1- Régarder la vidéo explicative sur les calculs de fréquences et prendre des notes
2- Réaliser les exercices d'application ( au moins 2)
3- Regarder la vidéo sur l'équilibre de Hardy Weinberg et prendre des notes
4- Réaliser les exercices d'application
5- Regarder la vidéo "déterminer si l'équilibre de HW est respecté"
6- Réaliser les exercices d'application
L'impact des activités humaines
Dérive génétique?
Consigne
Logiciel: Dérive génétique
En classe
TE: exercices à effectuer suivant vos résultats
L'impact des activités humaines
TD: exercices à effectuer suivant vos résultats
Effets des activités humaines sur la biodiversité
La fragmentation des habitats
Des mesures de préservation
Pour aller plus loin sur la fragmentation des habitats
auto-évaluation
L'impact des activités humaines
Effets des activités humaines sur la biodiversité
La fragmentation des habitats
Des mesures de préservation
Pour aller plus loin sur la fragmentation des habitats
Effectif d’une population de papillons (CMR) On cherche à évaluer l’effectif d’une population de papillons Azuré du Serpolet dans un milieu. Pour cela 346 papillons sont capturés, marqués puis relâchés. Pour le marquage, les papillons sont saisis au niveau du thorax afin de ne pas endommager leurs ailes. Le marquage est effectué à l’aide d’un feutre inodore et permanent. Quelques jours plus tard, on capture 380 papillons l’un après l’autre que l’on relâche immédiatement. On observe que 208 papillons sont marqués. 1) Estimer la taille de la population de papillons Azuré du Serpolet (= abondance) dans le milieu étudié. 2) Estimer la proportion d’individus de cette population possédant un marquage par un intervalle de confiance au niveau de confiance de 95 %. = donner un encadrement de la fréquence des papillons marqués 3) Donner un encadrement de la population de papillon Azuré du Serpolet
Pour donner un encadrement de la population N, il y a une étape supplémentaire qui est : N = n1/f (les fréquences de l’encadrement) avec n1 = individu capturé et marqué la première fois
La dérive génétique est une variation aléatoire des fréquences alléliques au cours des générations. Ce phénomène peut entraîner la disparition de certains allèles. Elle est plus importante dans les petites populations.
La dérive génétique est une problématique importante en biologie de la conservation. En effet, la diversité génétique est bénéfique sur le long terme pour permettre aux populations de préserver des caractères potentiellement avantageux permettant une meilleure adaptation à des environnements changeants (urbanisation, changement climatique, maladies, etc.).
Modéliser la dérive génétique dans une petite population à l'aide d'un logiciel Matériel nécessaire : Logiciel dérive génétique
. Protocole : Réaliser 10 fois la simulation pour un effectif initial de 1 000 individus. Réaliser 10 fois la simulation pour un effectif initial de 100 individus. Comparer l'évolution des fréquences alléliques dans les deux cas.
Répondre aux questions suivantes en utilisant les éléments disponibles (documents, vidéos, infographie sur le plancton) 1) Expliquer l'intérêt des différents outils d'échantillonnage (3 attendus) et d'analyse (2 attendus) utilisés sur Tara 2) Indiquer les 3 avantages qui existent lorsque l'on travaille à partir des échantillons de séquences ADN.
correction 1) La taille de la population par méthode CMR : 346 X 380 /208 = 632 papillons 2) Fobs= 208 / 380 = 0.547 K= 1.96 car intervalle de confiance est de 95% Epsilon = 1.96 X √ ((0.547 X (1-0.547))/380) = 0.05 IC = [0.497, 0.597] 3) N = [346 /0.597 ; 346/0.497] = [579,6 ; 696,2] = [580, 696]
Mme Golema - La biodiversité et son évolution
Mme Nochelski
Created on July 7, 2021
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La biodiversité et son évolution
Il existe sur Terre un grand nombre d’espèces dont seule une faible proportion est effectivement connue. Aujourd’hui, certaines de ces espèces sont menacées d’extinction. Évaluer la biodiversité à différentes échelles spatiales et temporelles représente donc un enjeu majeur pour comprendre sa dynamique et les conséquences des actions humaines.
Comment inventorier et estimer la biodiversité et comment évolue-t-elle?
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Estimer la biodiversité
Evolution de la biodiversité
Activité 1: échantillonnage et identification des espèces
Réponses
Activité 3: Evolution de la biodiversité au sein des populations
Activité 2: Calculer une estimation de la biodiversité à partir d'échantillons
Activité 4: L'impact des activités humaines
Comment estimer et caractériser la biodiversité?
1ère partieEchantillonnage et identification les espèces
2ème partie Comparer la biodiversité de trois stations étudiées
Partie 1 : échantillonnage et identification des espèces
Consignes
Partie 2A l´aide des documents à votre disposition, comparez la richesse spécifique et l'abondance des trois stations étudiées. Concluez en comparant la biodiversité de ces stations.
La carte ci-dessus présente l'abondance relative des différents taxons dans trois des lieux étudiés.
Calculer une estimation de la biodiversité à partir d'échantillons
1- La méthode CMR: Capture Marquage Recapture
2- Utiliser un intervalle de confiance
Exercice d'application
Principe
Consigne : Exercice 1
Consigne de l'exercice 2
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Logiciel à utiliser
Fichier EXCEL à remplir
Calculer une moyenne avec EXCEL
Réaliser un graphique avec Excel
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Calculer une estimation de la biodiversité à partir d'échantillons
La méthode CMR: Capture Marquage Recapture
Utiliser un intervalle de confiance
Principe
Consigne : Exercice 1
Consigne de l'exercice 2
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Evolution de la biodiversité au sein des populations
Evolution de la biodiversité d'une population
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Evolution de la biodiversité d'une population
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Exercice d'application
Etudier la composition génétique des populations et son évolution avec le modèle de Hardy-Weinberg
Rappel sur la distinction gène et allèle
Document phénotype/génotype/allèle
1- Régarder la vidéo explicative sur les calculs de fréquences et prendre des notes
2- Réaliser les exercices d'application ( au moins 2)
3- Regarder la vidéo sur l'équilibre de Hardy Weinberg et prendre des notes
4- Réaliser les exercices d'application
5- Regarder la vidéo "déterminer si l'équilibre de HW est respecté"
6- Réaliser les exercices d'application
L'impact des activités humaines
Dérive génétique?
Consigne
Logiciel: Dérive génétique
En classe
TE: exercices à effectuer suivant vos résultats
L'impact des activités humaines
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Effets des activités humaines sur la biodiversité
La fragmentation des habitats
Des mesures de préservation
Pour aller plus loin sur la fragmentation des habitats
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L'impact des activités humaines
Effets des activités humaines sur la biodiversité
La fragmentation des habitats
Des mesures de préservation
Pour aller plus loin sur la fragmentation des habitats
Effectif d’une population de papillons (CMR) On cherche à évaluer l’effectif d’une population de papillons Azuré du Serpolet dans un milieu. Pour cela 346 papillons sont capturés, marqués puis relâchés. Pour le marquage, les papillons sont saisis au niveau du thorax afin de ne pas endommager leurs ailes. Le marquage est effectué à l’aide d’un feutre inodore et permanent. Quelques jours plus tard, on capture 380 papillons l’un après l’autre que l’on relâche immédiatement. On observe que 208 papillons sont marqués. 1) Estimer la taille de la population de papillons Azuré du Serpolet (= abondance) dans le milieu étudié. 2) Estimer la proportion d’individus de cette population possédant un marquage par un intervalle de confiance au niveau de confiance de 95 %. = donner un encadrement de la fréquence des papillons marqués 3) Donner un encadrement de la population de papillon Azuré du Serpolet Pour donner un encadrement de la population N, il y a une étape supplémentaire qui est : N = n1/f (les fréquences de l’encadrement) avec n1 = individu capturé et marqué la première fois
La dérive génétique est une variation aléatoire des fréquences alléliques au cours des générations. Ce phénomène peut entraîner la disparition de certains allèles. Elle est plus importante dans les petites populations. La dérive génétique est une problématique importante en biologie de la conservation. En effet, la diversité génétique est bénéfique sur le long terme pour permettre aux populations de préserver des caractères potentiellement avantageux permettant une meilleure adaptation à des environnements changeants (urbanisation, changement climatique, maladies, etc.).
Modéliser la dérive génétique dans une petite population à l'aide d'un logiciel Matériel nécessaire : Logiciel dérive génétique . Protocole : Réaliser 10 fois la simulation pour un effectif initial de 1 000 individus. Réaliser 10 fois la simulation pour un effectif initial de 100 individus. Comparer l'évolution des fréquences alléliques dans les deux cas.
Répondre aux questions suivantes en utilisant les éléments disponibles (documents, vidéos, infographie sur le plancton) 1) Expliquer l'intérêt des différents outils d'échantillonnage (3 attendus) et d'analyse (2 attendus) utilisés sur Tara 2) Indiquer les 3 avantages qui existent lorsque l'on travaille à partir des échantillons de séquences ADN.
correction 1) La taille de la population par méthode CMR : 346 X 380 /208 = 632 papillons 2) Fobs= 208 / 380 = 0.547 K= 1.96 car intervalle de confiance est de 95% Epsilon = 1.96 X √ ((0.547 X (1-0.547))/380) = 0.05 IC = [0.497, 0.597] 3) N = [346 /0.597 ; 346/0.497] = [579,6 ; 696,2] = [580, 696]