práctica 8: HUELLA GÉNICA
Elaborado por: Márquez SalinaS aLEJANDRO
Características del DNA
Características del DNA
- Formado por desoxirribonucleótidos que contienen las bases nitrogenadas:
- Adenina
- Timidina
- Guanina
- Citosina
- El grupo fosfato (carga negativa) unido a:
- Carbono 5' de una desoxirribosa
- Carbono 3' de otra desoxirribosa (nucleótido contiguo)
Contiene la información genética de un organismo 3 bases --> Codón --> Aminoácido
Dogma central de la biología molecular
Dogma central de la biología molecular
RNA
Proteína
DNA
Dogma central de la biología molecular
Proceso:
Enzima:
RNA
Proteína
DNA
Dogma central de la biología molecular
Proceso: Replicación
Enzima: DNA polimerasa
RNA
Proteína
DNA
Dogma central de la biología molecular
Proceso:
Enzima:
RNA
Proteína
DNA
Dogma central de la biología molecular
Proceso: Transcripción
Enzima: RNA polimerasa
RNA
Proteína
DNA
Dogma central de la biología molecular
Proceso:
Organelo:
RNA
Proteína
DNA
Dogma central de la biología molecular
Proceso: Traducción
Organelo: Ribosomas
RNA
Proteína
DNA
Dogma central de la biología molecular
RNA
Proteína
DNA
Proceso:
Enzima:
Dogma central de la biología molecular
RNA
Proteína
DNA
Proceso: Transcripción inversa
Enzima: Retrotranscriptasa
Dogma central de la biología molecular
Replicación
DNA polimerasa
Transcripción
RNA polimerasa
Traducción
Ribosomas
RNA
Proteína
DNA
Transcripción inversa
Retrotranscriptasa
Actividad 1
Con base en la siguiente secuencia de DNA molde:
5' atgccatttg tggacccctc agcgtcgcac atatacacgc catatctcca accatgccgc ccaaaaccgg attttcagtt tttgaccttc aaggttcctt cacggcgagc gagagagaga 3'
Escriba la candena de DNA complementaria
Escriba la candena de RNA correspondiente
Escriba la candena de RNA obtenida de la cadena de DNA complementaria
Escriba la candena polipeptídica resultante
Escriba la candena polipeptídica resultante de la cadena de DNA complementaria
Electroforesis
Técnica que usa un campo eléctrico para la separación de moléculas con base en el tamaño
Se pueden utilizar geles de:
- Agarosa (polisacárido de agarosa)
- Poliacrilamida (polímero de acrilamida-bisacrilamida)
Se produce un patrón de bandas
Cátodo
RECUERDA
Ánodo
"Cátodo atrae cationes""Ánodo atrae aniones"
Ver vídeo: https://www.youtube.com/watch?v=NL1usCc0n38
Actividad 2
En la siguiente figura se presenta un fragmento de DNA que ha sido cortado por una endonucleasa en 6 segmentos:
- A - 550pb
- B - 4500pb
- C - 450pb
- D - 2000pb
- E - 120pb
- F - 1800pb
Utiliza como referencia el marcador de peso molecular lambda-HindIII (10 puntos)
Reacción en cadena de la polimerasa
Técnica que permite sintetizar muchas copias aún con una cantidad pequeña de DNA
Taq DNA Polimerasa termoestableNO se desnaturaliza con los ciclos repetidos de calentamiento, obtenida de Thermus aquaticus (bacteria termófila)
- PCR
- RT-PCR: PCR con transcriptasa reversa
- qPCR: PCR cuantitativa
Huella génica
Secuencias cortas (~4pb) que se repiten muchas veces en un cromosoma específico
Repeticiones cortas en tándem (STR)
El DNA alrededor de la STR es único para cada locus e idéntico en todos los humanos
Las STR tienen un número de repeticiones (tamaño) distinto para cada persona
http://www.stewartsociety.org/images/bannockburn-tandem-repeats.jpg.
Huella génica
- Las STR se pueden amplificar mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR).
- Cebadores: secuencias complementarias a las que rodean a las STR, se marcan con colores para poder distinguirlas.
- Los productos de la PCR se separan con electroforesis en gel de poliacrilamida.
STR de distinto tamaño para cada persona.Los pesos moleculares permiten determinar a quién pertenece el material genético.
Aplicaciones:
- Ciencia forense: identificar restos humanos.
- Legal: sospechosos de algún crimen, pruebas de paternidad.
- Médicina: Compatibilidad en donación de órganos.
- Filogenética: evolución poblacional.
Actividad 3
EC
S1
S2
S3
S4
S5
M: Marcador de peso molecular
EC: Escena del crimen
S1: Sospechoso 1
S2: Sospechoso 2
S3: Sospechoso 3
S4: Sospechoso 4
S5: Sospechoso 5
Indique quién es el culpable y explique el por qué.
Actividad 4
A tres pacientes con rinorrea, odinofagia, tos y fiebre de dos días de evolución se les realiza muestras de epitelio nasofaríngeo para realizar PCR y establecer diagnóstico.Los diagnósticos diferenciales son: infección por influenza, infección por SARS-CoV2 e infección bacterina
Proteína RdRP (RNA polimerasa): SARS-CoV2
Proteína HA hemaglutinina: Influenza
Proteína N (400pb) y Spike (300pb): SARS-CoV2
Referencias
Leberman M. Peet A. Marks: Bioquímica Médica Básica. 5a Ed. Wolters Kluwer; 2018. McKee T, McKee BJ. Bioquímica. 5a Ed. España: McGraw Hill Interamericana editores; 2014.
Nelson D, Cox M. Lehninger: Principios de Bioquímica. 6a Ed. España: Omega; 2013.
Práctica 8 - Huella génica
Alejandro Márquez Sa
Created on May 14, 2021
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práctica 8: HUELLA GÉNICA
Elaborado por: Márquez SalinaS aLEJANDRO
Características del DNA
Características del DNA
- Formado por desoxirribonucleótidos que contienen las bases nitrogenadas:
- Adenina
- Timidina
- Guanina
- Citosina
- El grupo fosfato (carga negativa) unido a:
- Carbono 5' de una desoxirribosa
- Carbono 3' de otra desoxirribosa (nucleótido contiguo)
Contiene la información genética de un organismo 3 bases --> Codón --> AminoácidoDogma central de la biología molecular
Dogma central de la biología molecular
RNA
Proteína
DNA
Dogma central de la biología molecular
Proceso:
Enzima:
RNA
Proteína
DNA
Dogma central de la biología molecular
Proceso: Replicación
Enzima: DNA polimerasa
RNA
Proteína
DNA
Dogma central de la biología molecular
Proceso:
Enzima:
RNA
Proteína
DNA
Dogma central de la biología molecular
Proceso: Transcripción
Enzima: RNA polimerasa
RNA
Proteína
DNA
Dogma central de la biología molecular
Proceso:
Organelo:
RNA
Proteína
DNA
Dogma central de la biología molecular
Proceso: Traducción
Organelo: Ribosomas
RNA
Proteína
DNA
Dogma central de la biología molecular
RNA
Proteína
DNA
Proceso:
Enzima:
Dogma central de la biología molecular
RNA
Proteína
DNA
Proceso: Transcripción inversa
Enzima: Retrotranscriptasa
Dogma central de la biología molecular
Replicación
DNA polimerasa
Transcripción
RNA polimerasa
Traducción
Ribosomas
RNA
Proteína
DNA
Transcripción inversa
Retrotranscriptasa
Actividad 1
Con base en la siguiente secuencia de DNA molde:
5' atgccatttg tggacccctc agcgtcgcac atatacacgc catatctcca accatgccgc ccaaaaccgg attttcagtt tttgaccttc aaggttcctt cacggcgagc gagagagaga 3'
Escriba la candena de DNA complementaria
Escriba la candena de RNA correspondiente
Escriba la candena de RNA obtenida de la cadena de DNA complementaria
Escriba la candena polipeptídica resultante
Escriba la candena polipeptídica resultante de la cadena de DNA complementaria
Electroforesis
Técnica que usa un campo eléctrico para la separación de moléculas con base en el tamaño
Se pueden utilizar geles de:
- Agarosa (polisacárido de agarosa)
- Poliacrilamida (polímero de acrilamida-bisacrilamida)
Se produce un patrón de bandasCátodo
RECUERDA
Ánodo
"Cátodo atrae cationes""Ánodo atrae aniones"
Ver vídeo: https://www.youtube.com/watch?v=NL1usCc0n38
Actividad 2
En la siguiente figura se presenta un fragmento de DNA que ha sido cortado por una endonucleasa en 6 segmentos:
- A - 550pb
- B - 4500pb
- C - 450pb
- D - 2000pb
- E - 120pb
- F - 1800pb
Utiliza como referencia el marcador de peso molecular lambda-HindIII (10 puntos)Reacción en cadena de la polimerasa
Técnica que permite sintetizar muchas copias aún con una cantidad pequeña de DNA
Taq DNA Polimerasa termoestableNO se desnaturaliza con los ciclos repetidos de calentamiento, obtenida de Thermus aquaticus (bacteria termófila)
Huella génica
Secuencias cortas (~4pb) que se repiten muchas veces en un cromosoma específico
Repeticiones cortas en tándem (STR)
El DNA alrededor de la STR es único para cada locus e idéntico en todos los humanos
Las STR tienen un número de repeticiones (tamaño) distinto para cada persona
http://www.stewartsociety.org/images/bannockburn-tandem-repeats.jpg.
Huella génica
STR de distinto tamaño para cada persona.Los pesos moleculares permiten determinar a quién pertenece el material genético.
Aplicaciones:
Actividad 3
EC
S1
S2
S3
S4
S5
M: Marcador de peso molecular
EC: Escena del crimen
S1: Sospechoso 1
S2: Sospechoso 2
S3: Sospechoso 3
S4: Sospechoso 4
S5: Sospechoso 5
Indique quién es el culpable y explique el por qué.
Actividad 4
A tres pacientes con rinorrea, odinofagia, tos y fiebre de dos días de evolución se les realiza muestras de epitelio nasofaríngeo para realizar PCR y establecer diagnóstico.Los diagnósticos diferenciales son: infección por influenza, infección por SARS-CoV2 e infección bacterina
Proteína RdRP (RNA polimerasa): SARS-CoV2
Proteína HA hemaglutinina: Influenza
Proteína N (400pb) y Spike (300pb): SARS-CoV2
Referencias
Leberman M. Peet A. Marks: Bioquímica Médica Básica. 5a Ed. Wolters Kluwer; 2018. McKee T, McKee BJ. Bioquímica. 5a Ed. España: McGraw Hill Interamericana editores; 2014. Nelson D, Cox M. Lehninger: Principios de Bioquímica. 6a Ed. España: Omega; 2013.