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Activité n°2 Origine de la biodiversité

elodieburghoffer

Created on April 8, 2021

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Transcript

Tout le monde connait la coccinelle Coccinella septempunctata, une grande habituée de nos jardins...

Mais connaissez-vous les coccinelles arlequins ? Il s'agit de coccinelles présentant des motifs variés sur leurs élytres (la carapace protégeant leurs ailes).Il s'agit d'un bon exemple de diversité des êtres vivants...

Le but de ce travail est d'expliquer l’origine de la diversité des phénotypes des individus appartenant à la même espèce : - en étudiant l'origine génétique de ses variations. - en déterminant si les coccinelles arlequins sont de la même espèce que Coccinella septempunctata.

Prêt

Bibliothèque

La notion d'espèce

Réaliser les différentes étapes dans l'ordre.

Notions de génétique

Séquencer l'ADN

Faire des croisements

Localiser et inactiver des gènes

Retour à l'introduction

Avec des méthodes statistiques, il est possible de connaitre la région approximative d'un chromosome responsable d'un certain caractère (ici les motifs des élytres de la coccinelle).

Connaitre la région responsable du motif des élytres.

Les phénotypes correspondent à la couleur et au nombre de points sur les élytres. Les noms des phénotypes sont exprimés en anglais.

Retour au labo

Avec des méthodes statistiques, il est possible de connaitre la région approximative d'un chromosome responsable d'un certain caractère (ici les motifs des élytres de la coccinelle).

Connaitre la région responsable du motif des élytres.

Nous avons identifié une région bien précise du chromosome 4 de la coccinelle arlequin, dont les variations de séquences sont corrélées avec les variations de coloration. Cette région s’étend sur trois gènes : le gène aor, le gène pnr et le gène itr.Pour pouvoir trancher entre ces trois gènes, il y a possibilité d’inactiver chaque gène et d’observer les effets sur les caractéristiques de la coccinelle.

Inactiver le gène aor

Inactiver le gène pnr

Inactiver le gène itr

Retour au labo

Expérience d'inactivation du gène aor

Red-nspots

Black-nspots

Black-4spots

Black-2spots

Gène aor actif(expérience témoin)

Gène aor inactif

Refaire une expérience d'inactivation.

Red-nspots

Black-nspots

Black-4spots

Black-2spots

Retour au labo

Expérience d'inactivation du gène pnr

Red-nspots

Black-nspots

Black-4spots

Black-2spots

Gène pnr actif(expérience témoin)

Gène pnr inactif

Refaire une expérience d'inactivation.

Red-nspots

Black-nspots

Black-4spots

Black-2spots

Retour au labo

Expérience d'inactivation du gène itr

Black-nspots

Red-nspots

Black-4spots

Black-2spots

Gène itr actif(expérience témoin)

Gène itr inactif

Refaire une expérience d'inactivation.

Red-nspots

Black-nspots

Black-4spots

Black-2spots

Retour au labo

Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Entrez le chiffre correspondant au chromosome concerné par le séquencage.

Retour au labo

Bienvenue dans votre séquenceur ADN

ERREUR : Veuillez recommencer ! Entrez le chiffre correspondant au chromosome concerné par le séquencage.

Retour au labo

Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

___

Retour au labo

Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

x__

Retour au labo

Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

x__

Retour au labo

Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

xx_

Retour au labo

Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

x__

Retour au labo

Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

xx_

Retour au labo

Définition d'un allèle

La séquence d'ADN demandée a bien été séquencée. Il existe 4 versions (allèles) de ce gène pnr ("pannier") : hsp : allèle trouvé chez Black-4spots hA : allèle trouvé chez Black-nspots hC : allèle trouvé chez Black-2spots h : allèle trouvé chez Red-nspots

Origine des allèles

Cliquer ICI pour accèder au comparateur de séquences (geniegen2). Suivre les instruction de la deuxième étape de votre activité.

Retour au labo

Bienvenue dans votre séquenceur ADN

ERREUR : ce n'est pas le bon gène

Retour au labo

Sélectionnez les coccinelles que vous voulez croiser...

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Retour au labo

Sélectionnez une deuxième coccinelle...

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

coccinelle pouvant se reproduire et avoir une descendance fertile

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

coccinelle pouvant se reproduire et avoir une descendance fertile

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

coccinelle pouvant se reproduire et avoir une descendance fertile

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

Pas de croisement possible

Sélectionnez une deuxième coccinelle...

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

coccinelle pouvant se reproduire et avoir une descendance fertile

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

coccinelle pouvant se reproduire et avoir une descendance fertile

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

coccinelle pouvant se reproduire et avoir une descendance fertile

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

Pas de croisement possible

Sélectionnez une deuxième coccinelle...

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

coccinelle pouvant se reproduire et avoir une descendance fertile

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

coccinelle pouvant se reproduire et avoir une descendance fertile

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

coccinelle pouvant se reproduire et avoir une descendance fertile

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

Pas de croisement possible

Sélectionnez une deuxième coccinelle...

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

Pas de croisement possible

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

Pas de croisement possible

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

Pas de croisement possible

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

Pas de croisement possible

Sélectionnez une deuxième coccinelle...

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

Pas de croisement possible

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

coccinelle pouvant se reproduire et avoir une descendance fertile

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

coccinelle pouvant se reproduire et avoir une descendance fertile

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Autre croisement

Retour au labo

coccinelle pouvant se reproduire et avoir une descendance fertile