2DE TP TD IG Activité 1 : structure de l'ADN

Thème Organisation du monde vivant

TP : Information génétique commune aux cellules Activité 1 : la molécule d’ADN

COMMENCER

Utiliser LibMol

Etape 1 : Accès au logiciel et à la molécule d'ADN

LIRE L’ENSEMBLE DES RENSEIGNEMENTS DE LA FICHE TECHNIQUE POUR APPRENDRE A UTILISER LES FENETRES.

Lien

• Pour avoir accès au logiciel :
• Lancer le navigateur Internet Firefox.
• Cliquer sur le lien https://libmol.org/
• Pour visualiser la molécule d’ADN entière :
• Charger une molécule locale : sur la partie gauche de la fenêtre,
• Cliquer sur l’icône déposer un fichier
• Chercher la molécule dans le répertoire /Echanges/Tous/ SVT/TP IG Act1/.
• Choisir le fichier ADN.PDB .
• Pour faire tourner la molécule :
• Cliquer à côté de la molécule et traîner la souris

Lien

Info

Charger un fichier de molécule

ADN.PDB

Etape 2 : Afficher les chaînes

• Choisir :

• Commandes ;
• Colorer ;
• Changer Atomes en Chaînes
• Faire une copie d’écran de chaque étape.

Info

Charger la couleur de la molécule

ADN.PDB

Etape 3 : Afficher un monomère et un dimère

• Pour afficher un seul monomère :
• Charger une molécule locale : sur la partie gauche de la fenêtre,
• Cliquer sur l’icône déposer un fichier.
• Chercher la molécule dans le répertoire /Echanges/Tous/ SVT/ TP IG Act1/ .
• Choisir le fichier ADENINEH.PDB ; I ; GUANINEH.PDB ;
• Faire une copie d’écran

Etape 3 : Afficher un monomère et un dimère

• Pour afficher un dimère :
• Charger une molécule locale : sur la partie gauche de la fenêtre,
• Cliquer sur l’icône déposer un fichier.
• Chercher la molécule dans le répertoire /Echanges/Tous/ SVT/ TP IG Act1/ .
• Choisir le fichier ADN.PDB ;
• Choisir : séquence ; Aucun ; cliquer sur « C » et « G » sur la dernière ligne.
• Choisir : séquence ; Aucun ; cliquer sur « A » et « T » sur la 3ème ligne.
• Faire une copie d’écran

Charger la couleur de la molécule

ADN.PDB

Paire de base A / T

Adénine

Thymine

Paire de base C /G

Cytosine

Guanine

Etape 4 : Afficher les liaisons Hydrogène

• Pour afficher les liaisons H :
• Charger une molécule locale : sur la partie gauche de la fenêtre,
• Cliquer sur l’icône déposer un fichier
• Chercher la molécule dans le répertoire /Echanges/Tous/ SVT/TP IG Act1/.
• Choisir le fichier ADN.PDB .
• Choisir : interactions à afficher ;
• Cocher liaisons hydrogènes
• Faire une copie d’écran

Etape 5 : obtenir des renseignements sur les molécules et établir leur ordre de grandeur

• Pour chacune des 5 molécules, mesurer :
• La taille (longueur et largeur) de chaque monomère.
• Le diamètre de la molécule d’ADN
• Faire une copie d’écran pour chaque molécule

+ info

Paire de base A / T

Adénine

Thymine

Les composants de l'ADN

• Code de couleur des atomes :
• C (Carbone)= gris
• H (Hydrogène), pas représentés car trop mnombreux = blancs
• O (Oxygène) = rouge
• N (Azote) = bleu
• P (Phosphore) = orange

La double hélice

Double hélice d'ADN

En connaissant la strusture, on peut déduire le brin opposé

Double hélice d'ADN

En connaissant la structure, on peut déduire le brin opposé : A en face de T et C en face de G

L'ADN dans le cinéma

GATACA

Roman et film

• GATACA, le roman
• GATTACA, le film

+ info