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MICROBIOTE HUMAIN ET SANTE

laurent.centene

Created on March 18, 2021

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Transcript

Le microbiote, une diversité de micro-organismes

Exercices

Notice

illustrations by macrovector / Freepik

Te poses-tu les mêmes questions qu'Alba?

Mission 1 : Découvrir la diversité et l'origine du microbiote

Mission 2 : Identifier les rôles du microbiote intestinal

Compte rendu de mission

illustrations by macrovector / Freepik

MISSION 1 Découvrir la diversité et l'origine du microbiote.

Découvrir la diversité du microbiote

Découvrir l'origine et l'évolution du microbiote

CONSIGNES

illustrations by macrovector / Freepik

Définition

Le microbiote humain représente l'ensemble des microorganismes qui vivent sur et dans le corps humain. Il est composé de bactéries, virus, champignons non pathogènes (levures), parasites, archées qui vivent dans un environnement spécifique. Dans l'organisme, il existe différentes associations microbiennes caractérisant chaque partie du corps : ​

  • - le microbiote cutané (peau) qui se nourrit de sébum et de cellules mortes. Il comporterait environ un million de bactéries par centimètres carrés de peau ;
  • - le microbiote bucco-dantaire (dans la bouche) ;
  • - le microbiote pulmonaire (dans les voies respiratoires) ;
  • - le microbiote vaginal (au niveau du vagin) ;
  • - le microbiote intestinal (dans le tube digestif).

DEFINITION

Découvrir la diversité du microbiote

Découvrir la diversité du microbiote

Découvrir la diversité du microbiote

Découvrir la diversité du microbiote

Découvrir l'origine du microbiote

Afin de déterminer l'origine du microbiote initial, des analyses ont été réalisées sur les microorganismes de la bouche, la peau et le nasopharynx de nouveau-nés. Puis, on a réalisé un séquençage de l'ADN après extraction. Les groupes bactériens déduits de l'analyse ont ensuite été comparés à ceux du microbiote maternel. Cette étude a été effectuée pour différentes conditions de naissance : - par voie basse - par césarienne Il est ainsi possible d'avoir une idée de l'origine des microorganismes d'un nouveau-né lors de ces premières minutes de vie extra-utérine.

Découvrir l'origine du microbiote

Abondance de différents groupes bactériens constituant différents microbiotes de la mère et du nouveau-né.

ET POUR FINIR!

Découvrir l'évolution du microbiote

Visionnez la vidéo ci-contre et trouvez des informations sur l'évolution du microbiote après la naissance ! Profitez-en pour compléter vos notes sur le sujet.

Indicareurs de réussite

MISSION 2 Identifier les rôles du microbiote intestinal

Les rôles du microbiote

Les perturbations du microbiote

Des perspectives médicales

CONSIGNES

illustrations by macrovector / Freepik

Les rôles du microbiote

LISEZ LA CONSIGNE ET CLIQUEZ SUR L'IMAGE POUR LANCER LA VIDEO Le microbiote : ses rôles

Le microbiote : ses rôles.

Les perturbations du microbiote

Souvenez-vous..., après une prise d'antibiotiques prolongée, Alba n'est toujours pas en grande forme. Et même si les symptômes initiaux ont disparu. Elle en a d'autres, des problèmes intestinaux...

Documents

Les perturbations du microbiote

Des chercheurs ont étudié la diversité du microbiote (quantité d'individus) en fonction de la prise répétée et prolongée d'antibiotiques. Alba a pris des antibiotiques pendant trois semaines.

Document 1 : Impact "écologique" des antibiotiques sur le microbiote

Les perturbations du microbiote

Document 2 : Conséquences possibles de la prise d'antibiotiquesL'administration prolongée d'antibiotiques, à larges spectres ou à spectres étroits, entraîne une perturbation dans la composition du microbiote intestinal qui ne joue plus son rôle de protection.La dysbiose qui en résulte a des conséquences sur le métabolisme des acides biliaires, sur la fermentation des glucides qui est réduite et sur la composition des bactéries qui peut entraîner l'émergence et la prolifération de certaines bactéries pathogènes telles que Clostridium difficile ou Klebsiella oxytoca.

Les perturbations du microbiote

Document 3 : Clostridium difficile Clostridium difficile est une bactérie naturellement présente dans le micobiote intestinal ; elle représente environ 3% des espèces bactériennes du microbiote intestinal d'un individu sain, mais peut atteindre 15 à 20% après un traitement antibiotique.Elle est impliquée dans 15 à 25 % des diarrhées post-antibiotiques.Elle peut exister sous deux formes, dont une est pathogène.En temps normal,les microorganismes du microbiote intestinal empêchent la germination des spores inoffensives de Clostridium difficile.Sous sa forme végétative, Clostridium difficile produit des toxines qui peuvent endommager les intestins et entraîner une diarrhée.

Résultats

Les perturbations du microbiote

Des chercheurs ont collecté des selles de personnes n’ayant eu aucun traitement antibiotique depuis 3 mois, et d’autres personnes atteintes de diarrhées dues à Clostridium difficile après avoir reçu un traitement antibiotique. Ils ont comparé la diversité de leur microbiote intestinal.

Effet de la prise d’antibiotiques sur le microbiote intestinal d’humains.

SUITE

Les perturbations du microbiote

Pour savoir si une altération du microbiote intestinal peut provoquer la multiplication de la bactérie Clostridium difficile, des chercheurs ont contaminé des souris par ce pathogène. Après 24 jours, ils ont traité les souris avec la prise unique d’un antibiotique oral. Ils ont suivi leur état de santé et mesuré la composition de leur microbiote.

L’effet d’un antibiotique sur l’état de santé et le microbiote de souris.

PASSE A LA SUITE

Des perspectives d'application médicales du microbiote

RAPPORT D'ENQUËTE Perspectives : l'apport des transferts de microbiote * Pour Alba, la situation n'est de loin pas aussi inquiétante, OUF ! * Après quelques jours et une alimentation appropriée, ses diarrhées sont passées ! * Mais dans certains cas, le patient peut présenter un microbiote très altéré avec une présence mortelle de Clostridium difficile. * Dans ce cas, différents traitements médicamenteux sont possibles, dont pour les cas compliqués, une greffe fécale.

Des perspectives d'application médicales du microbiote

EXPERIENCE Le receveur est un patient malade avec une présence mortelle de Clostridium difficile qui reçoit une greffe fécale provenant d'un individu sain.

RESULTATS * Le receveur présente un microbiote diversifié * La quantité de Clostridium difficile n'est plus mortelle .

Des perspectives d'application médicales du microbiote

Pourquoi le microbiote pourrait changer l'avenir de la médecine?

L'apport des transferts de microbiote LISEZ LA CONSIGNES et Visionnez la vidéo ci-contre POUR COMPRENDRE ET identifier l'apport des transferts de microbiote pour la santé humaine.

Indicareurs de réussite

BONUS

Doc 1. Protocole expérimental d’étude du rôle du microbiote dans la nutrition.

Des souris axéniques reçoivent le microbiote d’individus soit obèses (Ob), soit minces (Mi). Les souris sont ensuite élevées en groupes, soit homogènes soit mixtes (on parle alors de coélevage). Les souris se nourrissent des excréments présents dans la cage, ce qui permet des transferts de microbiote.

SUITE

BONUS

SUITE

Quelles sont vos conclusions?

Le microbiote a-t-il une influence sur la nutrition?

Si oui, laquelle??

Quelles ont vos preuves?

Un petit texte pour résumer tout ça!!!

Bon, si vous êtes arrivés jusqu'ici c'est que vous avez terminé votre deuxième mission ! Bravo ...mais...