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Cannabis - Grupo Márcio
Lucas Ribeiro
Created on March 10, 2021
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Transcript
Cannabis sativa
e a utilização de marcadores moleculares para identificação e rastreabilidade de espécimes
Lucas de Oliveira Pereira Ribeiro
início
Background
Trabalho Mestrado
Produto Final
Projeto Atual
Histórico do Lab
Perspectiva Futura
Genoma Cannabis
genoma referência
Esboço (2011)High-quality (2019)
Estrutura cromossomal
9 pares autossômicos 1 par sexual (X e Y)
Marcadores
Indel, RAPD, SNPs e STRs
Preferência Forense
IdentificaçãoRastreabilidade Individualização
Microssatélites
SNPs
cannabis
Literatura - "Estado da Arte"
Fett et al.
Houston et al.
STRs e SNPs
2018
2015 e 2017
34 STRs(29 nucleares, 1 mitocondrial e 4 cloroplastidial) Centenas de SNPs
Aplicou o Painel 2015 em 72 amostras brasileiras
Dois painéis multiplex de 13 loci STR
Histórico Lab
13-loci STR multiplex system for Brazilian seized samples of marijuana: individualization and origin differentiation
Fett et al. 2018
Histórico Lab
Paraguai
Identificar
Diferenciar de acordo com a origem
Polígono da Maconha
Exterior
Background
Trabalho Mestrado
Produto Final
Projeto Atual
Histórico do Lab
Perspectiva Futura
Trabalho Mestrado
Evaluation of two 13-loci STR multiplex system regarding identification and origin discrimination of Brazilian Cannabis sativa samples
Ribeiro et al. 2020
Trabalho Mestrado
AUmento amostral
Total de 94 amostras
Comparação dos painéis
Painel 2015 Painel 2017
Marcadores
↓ Baixa Heterozigozidade
Doutorado - Projeto atual
desenvolver uma ferramenta molecular que possibilite a identificação e a rastreabilidade de amostras de Cannabis sativa traficadas em território brasileiro
Disponibilizar nos bancos de dados sequências de DNA de C. sativa cultivadas e traficadas no território brasileiro
Construir um sistema multiplex único para análise de C. sativa eficaz e efetivo para uso na rotina forense brasileira
Criação e manutenção de um Biobanco genético para Cannabis sativa. Descrevendo e atualizando as frequência alélicas populacionais.
Avaliar centenas de milhares de marcadores moleculares e, através de análises de bioinformática, verificar os mais informativos para identificação e rastreabilidade de C. sativa
Descrever as frequências alélicas dos marcadores moleculares encontrados nas plantas traficadas no Brasil, por população
Doutorado - Projeto atual
Ampliação amostral e representatividade
Seleção dos marcadores
Amostras representativas do território brasileiro
Painéis multiplex 2015 e 2017
Avaliação e Frequência dos marcadores selecionados
Análise in silico
STRSNPs (microhaps)
Análise amostral e "produto final"
Genomas completos (SRAs)
Genoma referência
Seleção dos marcadores
Não
Whole Genome Seq.(Repositórios de SRA)
Controle Qualidade
Trimmagem
Sim
Seleção dos marcadores
Genoma de Referência
Pareamento
Seleção dos marcadores
Poli G
Kmer
Poli G
SRR10578262
SRR10578267
SRR10578257
Retorno às instituições
Relatório técnico
Genética canábica
Inteligência Policial
Background
Trabalho Mestrado
Produto Final
Projeto Atual
Histórico do Lab
Perspectiva Futura
Produto Final
Painel multiplex completo
Produto Final
PoPs para cálculos forenses
Frequência alélica por população
Uma ferramenta molecular capaz de identificar espécimes de Cannabis sativa e diferenciá-las de acordo com a origem geográfica.
Treinamento
PoPs para os experimentos
Perspectiva Futura
Biobanco Brasileiro de Cannabis - BBC
Obrigado
Lucas de Oliveira Pereira Ribeiro
oprlucas@gmail.com(51)99893.7615
início
Single Nucleotide Polymorphism
Short Tandem Repeats
Sequências curtas (2 a 6 nucleotídeos) que se repetem em tandem
Substitução de um único nucleotídeo (transição ou transversão)
Uma a cada 33kb Uma a cada 6kb
0,67 - 6,1 a cada 1kb 1,07 a cada 1kb
Alto Polimorfismo, alta heterozigosidade, alta reprodutibilidade
Baixa mutação e Alta prevalência
Microhaplótipos *
Padrão-ouro, CODIS
SWGDAM
Evaluation of a 13-loci STR multiplex system for Cannabis sativa genetic identification(Houston et al. - 2015)
ISFG
19
marcadores STR ao total
B05H06 D02 C11 501 CS1 305
92594910 5159 9043 1528 3735
H09B01 E07 ANUCS 301 ANUCS 302 308
Developmental and internal validation of a novel 13 loci STR multiplex method for Cannabis sativa DNA profiling(Houston et al. - 2017)
Painel 2015
H09B01 E07 ANUCS 301
D02 C11 501 CS1
ANUCS 302 308 B05 H06
305
Painel 2017
9259 4910 5159 9043
D02 C11 501 CS1
1528 3735B05 H06
305
Amostras atuais
Polígono da Maconha
24 (2015)
12 (2017)
16 (2018)
Sementes apreendidas SP
31 (2014-15)
Paraguai
5 (2015)
5 (2017)
Amostragem
1 (2018)
Santa Catarina
22 (2019)
22 (2020)
Amostragem
Matriz biológica
> Folhas
> Inflorescência
> "Prensado"
Volume
Extração: 20mg
armazenamento
[~ 10 ng/μL]
stock: 1g
DNAeasy Mericon Kit
Painel 2017
9259 4910 5159 9043
D02 C11 501 CS1
1528 3735B05 H06
305
192 Milhões
67% dos jovens atendidos pelo CRATOD
usuários de maconha
3ª droga mais consumida