Amminoacidi e proteine

BIOCHIMICA Amminoacidi Proteine

Amminoacidi: formula di Fisher

Gli aminoacidi naturali sono della serie L in quanto nella formula di Fisher il gruppo amminico si trova a sinistra. Esistono amminoacidi sintetici (es antibiotici) della serie D

Amminoacidi: STRUTTURA IONICA

9 amminoacidi apolari

9 amminoacidi apolari

6 amminoacidi polari

6 amminoacidi polari

5 amminoacidi con residuo acido o basico

Amminoacidi: PUNTO ISOELETTRICO (pI)

Il punto isoelettrico di un amminoacido è il valore di pH a cui la sua carica netta è uguale a zero, quando si trova nella forma dipolare. Ogni amminoacido ha un proprio punto isoelettrico. Negli amminoacidi con residuo ionizzabile, il punto isoelettrico dipende anche dal residuo R oltre che dai gruppi amminico e carbossilico.

Amminoacidi: PUNTO ISOELETTRICO (pI)

a pH più acido del punto isoelettrico

a pH più basico del punto isoelettrico

Amminoacidi: PUNTO ISOELETTRICO (pI)

Amminoacidi: PUNTO ISOELETTRICO (pI)

Variando il pH della soluzione in cui un amminoacido è immerso, è possibile protonare o deprotonare i residui ionizzabili.

ELETTROFORESI: tecnica in cui una miscela di amminoacidi è posta al centro di una striscia di carta trattata con un tampone di determinato pH e le cui estremità sono collegate a due elettrodi.

Amminoacidi: GLUTAMMATO e pI

pKa = 2,1

a pH = 1 che succede?

pKa = 9,7

pKa = 4,3

Amminoacidi: GLUTAMMATO e pI

pKa = 2,1

a pH = 3 che succede?

pKa = 9,7

pKa = 4,3

Amminoacidi: GLUTAMMATO e pI

pKa = 2,1

a pH = 6 che succede?

pKa = 9,7

pKa = 4,3

Amminoacidi: GLUTAMMATO e pI

pKa = 2,1

a pH = 11 che succede?

pKa = 9,7

pKa = 4,3

Amminoacidi: ELETTROFORESI

Proteine: PEPTIDI E PROTEINE

Proteina opolipeptide

Peptide

massa molecolare < 20 000 u

massa molecolare > 20 000 u

Proteine: LEGAME PEPTIDICO

Proteine: STRUTTURA PRIMARIA

E' data dalla sequenza degli amminoacidi di una proteina E' determinata dalla sequenza delle triplette (codoni) di uno specifico gene del DNA. Ogni mutazione nel DNA può avere effetti sull'intera funzionalità della proteina. 1958 Frederick Sanger Primo Premio Nobel per aver identificato la struttura primaria di 51 amminoacidi dell'insulina umana

Proteine: STRUTTURA PRIMARIA

Proteine: STRUT. SECONDARIA

Proteine: STRUT. SECONDARIA

Proteine: STRUTTURA TERZIARIA

Generalmente la struttura secondaria di una proteina si riavvolge su se stessa generando una struttura più compatta e GLOBULARE detta struttura terziaria. Stabilizzata da 4 tipi diversi di interazioni fra gruppi R della catena polipeptidica:

Proteine: STRUTTURA QUATERNARIA

Solo alcune proteine. Due o più subulità si associano tra loro mediante forze di natura elettrostatica. es. Emoglobina