TP expression des gènes

TP - Etude de l'expression des gènes dans 3 tissus humains

OBJECTIFS: - comprendre le fonctionnement des gènes - montrer que les gènes ne s'expriment que dans certains tissus

Index

1. Découverte des tissus

2. Etude des gènes et de leur séquence de nucléotides

Découverte des tissus

Je choisis le tissu que je vais étudier

LE SANG

LA PEAU

LA RETINE

Consigne: Remplir les 3 premières lignes du tableau

Le sang

Le sang est constitué de cellules en suspension dans un liquide : le plasma. L'ensemble est contenu dans les vaisseaux sanguins. Le volume de sang chez un adulte est d'environ 5L.

Les globules rouges sont des cellules dépourvues de noyau, qu'elles perdent au cours de leur vie. Elle possède de l'hémoglobine, une protéine qui permet de transporter le O2 et le CO2

Les globules blancs sont des cellules de plus grande taille, qui sont impliquées dans le système immunitaire (défense de l'organisme).

Frottis sanguin observé au microscope optique (x100)

Suite

On va étudier le globule rouge

La peau

La peau est le tissu protecteur de notre organisme. Il est composé de 3 tissus remplissant des rôles différents.

Kératinocytes

Mélanocytes

Suite

On va étudier le mélanocyte

La rétine

La rétine est le tissu photosensible de notre oeil, il capte la lumière qui traverse les milieux transparents de l'oeil et produit des messages nerveux envoyés au cerveau

2,3

Suite

On va étudier les cellules photoréceptrices

Etude des gènes exprimés

Nous allons étudier à l'aide du logiciel Anagène2 les 3 gènes utilisés par les cellules étudiés

Consigne: Remplir les 5 lignes suivantes du tableau

ETAPE 2: ouvrir les séquences des gènes

ETAPE 1: ouvrir anagène 2

Ouvrir les 3 séquences des gènes

ETAPE 3: continuez en ouvrant la protéine étudiée

La β-globine (hémoglobile)

La tyrosinase

La rhodopsine

La ß globine

La ß globine entre dans la composition de l'hémoglobine, elle est codée par un gène situé sur le chromosome 11

Le gène HBB code pour la beta-globine

A faire

• Dans Anagène 2, sélectionnez le gène de la bêta-globine
• Relevez le nombre de nucléotide du gène
• Recopiez la séquence

• Lancez ensuite une comparaison des séquences des 3 gènes. Sont-ils identiques?

La ß globine

• Ouvrir le lien ci-contre
• Dans "search", tapez "HBB" (pour hémglobine)
• Choisir "hemoglobin subunit beta"

• Cliquer sur "Tissue Atlas"
• Notez les organes où se gènes s'exprime le plus: cela se traduit par la production de la protéine
• Compléter le tableau

Suite

La tyrosinase

La tyrosinase est une enzyme, une protéine qui permet de produire la mélanine qui pigmente les cellules de l'épiderme . Elle est codée par un gène situé sur le chromosome 11

La tyrosinase en 3D

A faire

• Dans Anagène 2, sélectionnez le gène de la tyrosinase
• Relevez le nombre de nucléotide du gène
• Recopiez la séquence

• Lancez ensuite une comparaison des séquences des 3 gènes. Sont-ils identiques?

La tyrosinase

• Ouvrir le lien ci-contre
• Dans "search", tapez "Tyr" (pour tyrosinase)
• Choisir "tyrosinase"

• Cliquer sur "Tissue Atlas"
• Notez les organes où se gènes s'exprime le plus: cela se traduit par la production de la protéine
• Compléter le tableau

Suite

La rhodopsine

La Rhodopsine est une protéine, un pigment qui capte la lumière dans les bâtonnets, cellules photoréceptrice de la rétine, elle est codée par un gène situé sur le chromosome 3.

A faire

• Dans Anagène 2, sélectionnez le gène de la rhodopsine
• Relevez le nombre de nucléotide du gène
• Recopiez la séquence

• Lancez ensuite une comparaison des séquences des 3 gènes. Sont-ils identiques?

La rhodopsine

• Ouvrir le lien ci-contre
• Dans "search", tapez "Rho" (pour hémglobine)
• Choisir "rhodopsin"

• Cliquer sur "Tissue Atlas"
• Notez les organes où se gènes s'exprime le plus: cela se traduit par la production de la protéine
• Compléter le tableau

Suite

Bilan

Completer votre tableau en reprenant les informations de vos camarades. Puis essayer de répondre aux problèmes posés au début du TP