Coccinelles & biodiversité 2nd

Origine de la diversité des individus d’une espèce

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Tout le monde connait la coccinelle Coccinella septempunctata, une grande habituée de nos jardins...

Mais connaissez-vous les coccinelles arlequins ? Il s'agit de coccinelles présentant des motifs variés sur leurs élytres (la carapace protégeant leurs ailes). Il s'agit d'un bon exemple de diversité des êtres vivants...

Le but de cette activité est de : -Savoir s'il s'agit de variations intraspécifiques (au sein d'une même espèce) ou spécifiques (plusieurs espèces différentes). -Savoir si les coccinelles arlequins sont de la même espèce que Coccinella septempunctata. -Connaitre l'origine précise de cette variabilité.

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Définition d'espèce

Notions de génétique

séquencer l'ADN

Faire des croisements

Localiser et inactiver les gènes

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Avec des méthodes statistiques, il est possible de connaitre la région approximative d'un chromosome responsable d'un certain caractère (ici les motifs des élytres de la coccinelle).

Connaître la région responsable du motif des élytres

Avec des méthodes statistiques, il est possible de connaitre la région approximative d'un chromosome responsable d'un certain caractère (ici les motifs des élytres de la coccinelle).

Connaitre la région responsable du motif des élytres

Nous avons identifié une région bien précise du chromosome 4 de la coccinelle arlequin, dont les variations de séquences sont corrélées avec les variations de coloration. Cette région s’étend sur trois gènes : le gène aor, le gène pnr et le gène itr Pour pouvoir trancher entre ces trois gènes, il y a possibilité d’inactiver chaque gène et d’observer les effets sur les caractéristiques de la coccinelle.

Inactiver le gène pnr

Inactiver le gène itr

Inactiver le gène aor

Expérience d'inactivation du gène aor

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Gène aor actif (expérience témoin)

Refaire une expérience d'inactivation

Expérience d'inactivation du gène pnr

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Refaire une expérience d'inactivation

Expérience d'inactivation du gène itr

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Sélectionnez les coccinelles que vous voulez croiser...

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Sélectionnez une deuxième coccinelle...

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Sélectionnez les coccinelles que vous voulez croiser...

Autre croisement

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Sélectionnez les coccinelles que vous voulez croiser...

Autre croisement

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Autre croisement

pas de croisement possible

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Autre croisement

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Sélectionnez une deuxième coccinelle...

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Autre croisement

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Autre croisement

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Autre croisement

pas de croisement possible

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Autre croisement

pas de croisement possible

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Autre croisement

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Sélectionnez une deuxième coccinelle...

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Autre croisement

pas de croisement possible

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Autre croisement

pas de croisement possible

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Autre croisement

pas de croisement possible

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Autre croisement

pas de croisement possible

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Sélectionnez une deuxième coccinelle...

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Autre croisement

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Autre croisement

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Autre croisement

pas de croisement possible

Bienvenue dans votre séquenceur ADN

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Entrez le chiffre correspondant au chromosome concerné par le séquencage.

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

ERREUR : ce n'est pas le bon chromosome !

Bienvenue dans votre séquenceur ADN

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Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

_ _ _

Bienvenue dans votre séquenceur ADN

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Recommencer le séquencage

ERREUR : ce n'est pas le bon gène !

Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Retour au labo

Recommencer le séquencage

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

p _ _

Bienvenue dans votre séquenceur ADN

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Recommencer le séquencage

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

p n _

Bienvenue dans votre séquenceur ADN

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Le gène pannier code une molécule impliquée dans la chaîne de production de pigment noir par ces cellules et donc la formation des fameux points noirs (chez les coccinelles « rouges ») ou du fond noir (chez les coccinelles « noires »).

La séquence d'ADN demandée a bien été séquencée !!Il existe 4 versions (allèles) de ce gène pnr ("pannier"): hsp : allèle trouvé chez Black-4spots hA : allèle trouvé chez Black-nspots hC : allèle trouvé chez Black-2spots h : allèle trouvé chez Red-nspots Pour visualiser ces séquences, lancez le logiciel Geniegen en ligne en cliquant sur le séquenceur ADN Déplacez le curseur et identifier les différences dans les séquences d’ADN en notant leur position.

Recommencer le séquencage