An introduction to systematic searching in PubMed
Introducción a la búsqueda sistemática en PubMed
Santiago Piedra MD.Contenido: Douglas Grindlay
. Diseño y producción: Natasha Rogers.
Asesoramiento técnico: Julian Tenney.
Introducción
-Este curso está destinado a cualquiera que desee aprender a buscar sistemáticamente en PubMed.
-El curso fue producido por el Centro de Dermatología Basada en Evidencias (CEBD), por lo que utiliza ejemplos de dermatología, pero los principios se pueden aplicar a cualquier especialidad.
Para continuar, por favor llenar la siguiente encuesta: Conflicto de interés: Ninguno.
Introducción
-Cualquiera puede ingresar uno o dos términos en PubMed para encontrar algunos documentos relevantes, pero ¿puede estar seguro de que no le falta algo importante que pueda ser útil para tratar a sus pacientes?
Si no hace una pregunta específica, identifica todos los posibles términos de búsqueda relevantes y elabora una estrategia de búsqueda sistemática, no puede estar seguro.
Introducción
Este curso le muestra cómo puede construir una estrategia de búsqueda integral y sistemática en PubMed para responder una pregunta clínica.
Los métodos que aprenderá son particularmente adecuados para llevar a cabo un tema evaluado críticamente (CAT), que es un breve resumen de la evidencia disponible para responder a una pregunta clínica específica.
Este taller tardará aproximadamente 1 hora en completarse.
Objetivos de Aprendizaje
Al final de este curso introductorio, usted podrá:
-Formular una pregunta clínica desde un escenario clínico de la vida real.
Identificar conceptos de búsqueda.
-Comprender la diferencia entre los términos de texto libre y los Encabezados de Temas Médicos (términos MeSH).
-Comprender cómo PubMed hace un mapeo automático de términos.
-Compilar y ejecutar una búsqueda sistemática en PubMed que combine conceptos de búsqueda usando términos booleanos (OR, AND).
Búsqueda en bases de datos y revisiones sistemáticas
Búsqueda en bases de datos y revisiones sistemáticas
PubMed es un recurso gratuito de literatura biomédica en línea basado en la base de datos de MEDLINE. Si bien este curso se centra en la búsqueda en PubMed, los principios que aprenderá aquí se pueden aplicar a otras bases de datos científicas.
PubMed incluye la mayoría de las revistas médicas importantes, pero hay algunas revistas que solo se incluyen en otras bases de datos, por ejemplo, en Embase.
En las revisiones sistemáticas, es normal buscar en una variedad de bases de datos, dependiendo del tema, y luego combinar los resultados, para tratar de encontrar toda la evidencia relevante.
Acerca de PubMed
PubMed es de uso gratuito y no es necesario iniciar sesión (aunque puede configurar una cuenta de PubMed gratuita para guardar búsquedas y crear alertas).Una característica clave de PubMed es el mapeo automatizado de los términos de búsqueda a términos alternativos para ayudar a los buscadores no expertos a encontrar el número máximo de citas relevantes de forma rápida y fácil.
Pero…
Este mapeo automatizado de PubMed puede generar términos no relevantes y dificultar las búsquedas sistemáticas.Para construir una búsqueda sistemática puede necesitar usar comandos de búsqueda de PubMed específicos y tomar el control de cómo PubMed ejecuta una búsqueda.
¿Cuáles son los conceptos de búsqueda?
ElPrimer paso
Para ello, se construye una pregunta clínica en un formato definido.Los conceptos de búsqueda de la pregunta clínica se utilizan luego para identificar los términos de búsqueda que se usarán en su estrategia de búsqueda.
El primer paso para compilar una estrategia de búsqueda de base de datos es identificar sus conceptos de búsqueda.
Preguntas clínicas
Se han desarrollado varios formatos para formular preguntas clínicas y especificar los conceptos de búsqueda involucrados.
Preguntas clínicas
Hay dos tipos principales de preguntas clínicas que probablemente desee responder:Preguntas sobre intervenciones / tratamientos
Preguntas sobre factores de riesgo o causas
PICO y PEO son los formatos más ampliamente utilizados para preguntas clínicas. PICO se usa para preguntas de intervención y PEO se usa para preguntas de factores de riesgo.
Preguntas de Intervención
Para preguntas clínicas sobre intervenciones puede usar un formato de pregunta PICO:
P: Paciente/Población
I: Intervención
C: Comparación
O: Outcome (Resultado)
Preguntas de Intervención: Ejemplo.
Por ejemplo: En pacientes con eccema atópico, ¿hay menos riesgo de adelgazamiento de la piel con pimecrolimus tópico que con corticosteroides tópicos?
Por ejemplo: ¿Una dieta baja en azúcar mejora los síntomas del acné vulgar?
Hay que tener en cuenta que el comparador C en las preguntas PICO puede no ser una intervención, como con un control con placebo en un ensayo controlado aleatorio (ECA). En este caso, el comparador podría estar implicado en lugar de estar especificado en la pregunta clínica.
La comparación C también puede ser una práctica normal (que de nuevo podría no especificarse en la pregunta clínica), o un tratamiento establecido contra el cual se debe comparar una nueva intervención I.
PubMed incluye la mayoría de las revistas médicas importantes, pero hay algunas revistas que solo se incluyen en otras bases de datos, por ejemplo, en Embase.
En las revisiones sistemáticas, es normal buscar en una variedad de bases de datos, dependiendo del tema, y luego combinar los resultados, para tratar de encontrar toda la evidencia relevante.
Preguntas clínicas: Ejercicios.
Haga click en cada símbolo para ingresar a los ejercicios: Ejercicio 1: Ejercicio 2:
Preguntas sobre factores de riesgo
Para preguntas clínicas sobre factores de riesgo y causas, puede usar un formato de pregunta PEO: P: Población de pacientes
E: Exposición
O: Outcome (Resultado)
Preguntas sobre Factores de riesgo: Ejemplo.
Por ejemplo: ¿El tabaquismo aumenta la gravedad de la psoriasis?
¿Tener eczema atópico reduce el riesgo de tumores cerebrales como el glioma y el meningioma?
Hay que tener en cuenta que el concepto de búsqueda de pacientes / población (P) a menudo se define por la enfermedad que tienen las personas. En algunas preguntas PEO, la exposición (E) es la enfermedad que define al paciente/población (P), como en el segundo ejemplo anterior.
Preguntas sobre factores de riesgo: Ejercicios.
Haga click en cada símbolo para ingresar a los ejercicios: Ejercicio 1: Ejercicio 2:
Definición del Paciente/población (P)
Como habrá visto que tanto en las preguntas PICO como PEO, el concepto de búsqueda de pacientes / población (P) a menudo se define por la enfermedad que padecen las personas.
Según su pregunta, también puede especificar otras características del paciente / población, como:
Su grupo de edad (por ejemplo, recién nacidos, adultos, ancianos)
La gravedad de su enfermedad
Dónde viven (por ejemplo, zonas rurales, países tropicales, hogares de atención) Condiciones específicas que pueden tener (por ejemplo, embarazo o inmunodeficiencia)
Por ejemplo: ¿Son seguros los corticosteroides tópicos durante el embarazo? (P es mujeres embarazadas, E es corticosteroides tópicos, O es la seguridad / efectos adversos)
Echemos un vistazo a un escenario clínico...
La Sra. Dowling ha estado tomando la terapia biológica adalimumab para su psoriasis, pero su piel no se ha aclarado por completo y ha experimentado algunos efectos secundarios. La Sra. Dowling ha leído en un artículo en el Daily Mail que infliximab puede proporcionar una cura completa de psoriasis? Ella le pregunta si infliximab es más eficaz que adalimumab, y también se pregunta sobre sus posibles efectos secundarios…
¿Qué tipo de pregunta clínica es esta, PICO o PEO?
Respuesta: pregunta PICO
Ya que se trata de los efectos de una intervención en comparación con otra.
¿Cuáles son los conceptos de búsqueda para construir una pregunta clínica para construir una pregunta clínica para este escenario?
La Sra. Dowling ha estado tomando el adalimumab biológico para su psoriasis, pero no ha tenido un aclaramiento completo de su piel y ha experimentado algunos efectos secundarios. La Sra. Dowling ha leído en un artículo en el Daily Mail que infliximab puede proporcionar una cura completa de psoriasis.? Ella le pregunta si infliximab es más eficaz que adalimumab, y también se pregunta sobre sus posibles efectos secundarios.
Usando el formato PICO, ¿qué conceptos de búsqueda utilizaría para responder a esta pregunta clínica?
Paciente / Población: Paciente (mujer adulta) con psoriasis en placa crónicaIntervención: Infliximab
Comparador: Adalimumab
Resultados: Gravedad de la enfermedad (por ejemplo, PASI) y efectos secundarios
El uso de resultados (O) a partir de preguntas clínicas en la búsqueda
Para las preguntas PICO, el resultado O no se incluye generalmente en la estrategia de búsqueda, por las siguientes razones:A menudo es difícil definir todos los términos posibles para un resultado.
Los resultados pueden no mencionarse en el título o resumen (que es lo que se busca en PubMed).
Uso de Resultados (O)
El número de conceptos de búsqueda que se combinarán debe mantenerse al mínimo, para reducir la posibilidad de omitir algo relevante.
Sin embargo, para las preguntas PEO, debe incluir el resultado O en la búsqueda. Esto se debe a que el resultado O es clave para definir lo que está buscando, por ejemplo, una enfermedad causada por un factor de riesgo, o una comorbilidad asociada con una enfermedad en particular.
Identificar términos de búsqueda para cada concepto de búsqueda
Después de haber identificado los conceptos de búsqueda para su pregunta clínica, ahora tiene que pensar en todos los términos alternativos posibles para cada concepto.
"Puede haber varios sinónimos y otros términos que sean relevantes para una condición o intervención particular."
Para evitar perderse cualquier artículo relevante, debe incluir todos estos términos alternativos en su estrategia de búsqueda. Esto es lo mismo para todas las bases de datos, no solo para PubMed.
Pensar en todas las alternativas
Es importante tomarse un tiempo para pensar en todos los términos alternativos.Las posibilidades a considerar incluyen:
Sinónimos, por ejemplo: atopic eczema, atopic dermatitis; cutaneous mastocytosis, urticaria pigmentosa; dermoscopy, dermatoscopy
Plurales, por ejemplo: comedone, comedones; probiotic, probiotics; louse, lice; naevus, naevi; exanthem, exanthems, exanthemata
Términos en inglés y en latín. rash, exanthem; itch, pruritus
Pensar en todas las alternativas...
Deletreos alternativos (especialmente en los Estados Unidos): anaesthetic, anesthetic; naevus, nevus; seborrhoeic, seborrheic.
Términos divididos y conjuntos. Por ej. sun burn, sunburn; non-melanoma, nonmelanoma.
Nombres genéricos y comerciales. P. Ej. isotretinoin, Roaccutane, Accutane.
Abreviaturas. P. Ej. basal cell carcinoma, BCC; psoralen and ultraviolet A, psoralen and UVA, PUVA
Posesivos. P. ej. Kaposi’s sarcoma, Kaposi sarcoma
Un par de ejemplos en dermatología…
Ciclosporin, ciclosporine, cyclosporin, cyclosporine (más plurales se pueden usar) Bowen’s disease, Bowen disease, Bowens disease, squamous cell carcinoma in situ, SCC in situ, intraepidermal squamous cell carcinoma, intraepidermal SCC, intraepidermal carcinoma (más variaciones que utilizan "intra-epidermal").
Ejemplos en dermatología
Wart
warts, verruca, verrucas, verrucae
Blistering
blister, blisters, bulla, bullae, bullous
Sinónimos y otros términos relevantes para usar en algunos conceptos dermatológicos para incluirlos en una estrategia de búsqueda en PubMed.
Ejemplos en dermatología
Anaesthesia
anesthesia, anesthesiology, anaesthetics, anesthetics
Anaesthesia, anesthesia, anesthesiology, anaesthetics, anesthetics
Pompholyx
dyshidrotic eczema, vesicular hand eczema
Sinónimos y otros términos relevantes para usar en algunos conceptos dermatológicos para incluirlos en una estrategia de búsqueda en PubMed.
Ejemplos en dermatología
Athlete's foot
Athletes foot, tinea pedis
Keratosis
keratoses, keratotic, keratoma, keratomas
Sinónimos y otros términos relevantes para usar en algunos conceptos dermatológicos para incluirlos en una estrategia de búsqueda en PubMed.
Términos de búsqueda basados en pregunta PICO
¿Puede pensar en posibles sinónimos y términos alternativos a usar para cada concepto de búsqueda en la pregunta PICO?
En pacientes con psoriasis crónica en placa, ¿es el infliximab más efectivo y tiene menos efectos secundarios que el adalimumab?
Recuerde que antes dijimos que normalmente no necesita usar el resultado O en las preguntas PICO, por lo que solo necesita pensar en sinónimos y términos alternativos para P, I y C.
Paciente/Población
psoriasischronic plaque psoriasis plaque-type psoriasis plaque type psoriasis chronic plaque-type psoriasis severe plaque psoriasis relapsing plaque psoriasis
Intervención
infliximabRemicade
Comparador
adalimumabHumira
Tipos de término de búsqueda
Ahora vamos a ver los tipos de términos de búsqueda que puede utilizar para buscar en PubMed.En PubMed (y muchas otras bases de datos) hay dos tipos de términos de búsqueda:
• Términos de texto libre
• Títulos de los temas
Tipos de Términos de búsqueda
Los títulos de los temas en PubMed (y MEDLINE) se denominan términos MeSH, para los títulos de temas médicos. En general, debe utilizar tanto los términos de texto libre como los títulos de los temas para que su búsqueda sea lo más completa posible.
Términos de búsqueda de texto libre
Los términos de búsqueda de texto libre encuentran la palabra exacta en el registro de la base de datos, independientemente del tema del artículo o del significado de la palabra.
Por lo tanto, para un término que tiene varios significados, encontrará todos los registros que contienen ese término, independientemente de lo que se quiere decir. Los ejemplos incluyen las palabras “radius”, “nail”, “palm” y “lichen”.
Tipos de Términos de búsqueda
En PubMed (y en la mayoría de las otras bases de datos) no está buscando el texto completo de los artículos. En su lugar, está buscando un registro de base de datos con ciertos campos, incluidos el título, el resumen y los detalles de las citas del artículo (año, autores, revista, volumen, número, números de página).
En PubMed, el valor predeterminado para una búsqueda de texto libre (si se ingresa un término en PubMed sin ningún comando de búsqueda) es buscar en todos los campos del registro de PubMed, por ejemplo, "acne“[All Fields] “Todos los campos”.
Títulos de los temas
Un títulos del tema es un término fijo para un tema o concepto de búsqueda.Como solo hay un término, esto evita el problema de los sinónimos y las variaciones ortográficas.
Los títulos del tema son agregados por, y específicos a, la base de datos. Se agregan a los registros basándose en un análisis del contenido del artículo.
Recuerde: encabezados de materia = ¿de qué trata este artículo?
Términos MESH
Como ya se ha visto, los títulos de los temas utilizados en PubMed (y MEDLINE) se denominan términos MeSH. Los términos MeSH se derivan de un tesauro compilado por los productores de la base de datos. Como PubMed y MEDLINE se producen en los EE. UU., MeSH usa los términos y la ortografía en inglés de los EE. UU. Los términos MeSH se organizan en una jerarquía, con una estructura de árbol.
Ejemplo:
Por ejemplo, las posiciones de los términos para diferentes tipos de acné dentro de la jerarquía de MeSH se muestran en la imagen adjunta. Puede ver cómo están bajo el término genérico MeSH Erupciones Acneiformes, que a su vez se encuentra en Enfermedades de la Piel, que a su vez se encuentra en Enfermedades de la Piel y el Tejido Conectivo. También puede ver que en la jerarquía de MeSH, Acne Conglobata es un término de menos jerarquía que Acne Vulgaris.
Términos MESH
Los términos MeSH se agregan a los registros de PubMed cuando se indexan.
Los registros más recientes (en proceso) en PubMed aún no tienen términos MeSH agregados, por lo que solo se pueden encontrar por términos de búsqueda de texto libre.
Como se recomendó anteriormente, debe usar términos de texto libre y términos MeSH, ya que esto maximizará la sensibilidad de su búsqueda.
Términos MESH
Debe usar un comando de búsqueda específico para decirle a PubMed que busque un término MeSH, como en estos ejemplos:
"acne vulgaris"[MeSH Terms] "surgical procedures, operative"[MeSH Terms]
Tenga en cuenta que las comillas pueden ser excluidas de los términos MeSH y no necesitan comenzar con mayúsculas. También el comando [MeSH Terms] se puede abreviar como [mh].
Por lo tanto, el acne vulgar[mh] es equivalente a "acne vulgar"[MeSH Terms]
Explotando los términos MESH
Como valor predeterminado en PubMed, si ingresa un término MeSH en PubMed, PubMed también buscará los términos MeSH que están debajo de ese término en la jerarquía MeSH, un proceso llamado explosión.Como ejemplo, si busca el término MeSH “Skin Diseases, Bacterial” usando el término "Skin Diseases, Bacterial"[MeSH Terms] en PubMed, así como los artículos con el término MeSH “Skin Diseases, Bacterial”, Pubmed encuentra artículos con términos MeSH debajo en la jerarquía, como “Erysipelas”, “Fasciitis, Necrotizing” and “Yaws”
¿Cómo identificar los términos MeSH?
¿Cómo identificar los términos MeSH?
Debe averiguar qué término(s) MeSH usar para cada concepto de búsqueda en el que esté interesado (¡puede haber varios, uno o ninguno!)
Entonces, ¿cómo descubres qué términos de MeSH usar?
Para comprender esto, es útil saber cómo PubMed utiliza los procesos automatizados para ayudarlo con su búsqueda...
Procesos de búsqueda automatizados de PubMed
Procesos de búsqueda automatizados de PubMed
¡PubMed está diseñado para ayudarte!Cuenta con procesos automatizados incorporados diseñados para ayudar a los buscadores inexpertos a encontrar la evidencia relevante.
Cuando ingresa un término de búsqueda en PubMed sin incluir comandos de búsqueda específicos, la base de datos lleva a cabo la asignación automática a los Términos de MeSH. También puede asignar su búsqueda a términos alternativos de texto libre, dependiendo de lo que se haya programado en el software de la base de datos.
Sin embargo, la forma en que se asigna un término de búsqueda en PubMed puede crear problemas si intenta realizar una búsqueda sistemática, como veremos más adelante.
Nueva interfaz de PubMed
Ejemplo: Búsqueda de “surgery” (cirugía)
PubMed en realidad busca un rango de títulos de temas y combinaciones de términos de texto libre relacionados con la cirugía. Esto está diseñado para maximizar el número de resultados relevantes para esta búsqueda rápida y simple.
Este proceso está ocurriendo en segundo plano para la mayoría de las búsquedas en PubMed, pero la mayoría de los usuarios no saben que está sucediendo.
Cómo identificar los términos MeSH
Hay dos formas principales de identificar los términos MeSH para su estrategia de búsqueda.Ingrese los términos probables en el cuadro de búsqueda de PubMed y copie los términos MeSH asignados del cuadro de Detalles de búsqueda en su estrategia de búsqueda.
Por ejemplo: Para buscar resultados de acné: "acne vulgaris"[MeSH Terms]
Utilice el navegador MeSH en línea: https://meshb.nlm.nih.gov
Deberá copiar y pegar cada término relevante que encuentre en el navegador MeSH en su estrategia de búsqueda, y luego agregar el comando [MeSH terms]. También puede agregar comillas rectas invertidas "" para que coincidan con la forma en que aparecen los términos MeSH en el cuadro de Detalles de búsqueda (pero estos son opcionales, como se señaló anteriormente).
MeSH Browser
Usando el buscador MESH
Busque en Google el "navegador MeSH".
En el navegador de MeSH:
Encuentre el término MeSH para cáncer de piel y vea dónde se encuentra en la jerarquía de MeSH.
Encuentre el término MeSH para el carcinoma de células basales y vea dónde se encuentra en la jerarquía MeSH.
¿Es lo que esperaba?
Respuestas
El término MeSH para el cáncer de piel es Skin Neoplasms “Neoplasias de la piel”.Al hacer clic en la pestaña "MeSH Tree Structures", se muestra que en la jerarquía de MeSH, Skin Neoplasms se encuentra en Neoplasms by Site y también en Skin Diseases.
El término MeSH para BCC (tiene que ingresar a “basal cell carcinoma” para encontrarlo) es Carcinoma, Basal Cell.
Al hacer clic en la pestaña "MeSH Tree Structures", se muestra que en la jerarquía de MeSH, Carcinoma, Basal Cell se incluye en Carcinoma y también en Neoplasms, Basal Cell. En otras palabras, el carcinoma de células basales no está incluido en la jerarquía MeSH bajo el término MeSH utilizado para los cánceres de piel (neoplasias de la piel).
Esto significa que si estuviera buscando el tema de cánceres de piel en general, tendría que incluir el término MeSH Carcinoma, Basal Cell así como Skin Neoplasms. Esto también se aplica al término MeSH, Carcinoma, Squamous Cell.
En el buscador MESH:
Encuentre el término MeSH para lunares (traducción al inglés: "moles"
)
En el buscador MESH
RESPUESTA
Moles (topos) es en realidad el término MeSH para animales pequeños, ciegos, peludos.
Nevus, pigmented (Nevus pigmentado) es el término MeSH apropiado para un lunar de la piel (también conocido como naevus, nevus or melanocytic naevus).
Respuestas
Si simplemente ingresa moles en PubMed, la base de datos no "sabe" lo que le interesa y traducirá su búsqueda de la siguiente manera:
"nevus, pigmented"[MeSH Terms] OR ("nevus"[All Fields] AND "pigmented"[All Fields]) OR "pigmented nevus"[All Fields] OR "moles"[All Fields] OR "nevus"[MeSH Terms] OR "nevus"[All Fields] OR "moles"[All Fields] OR "moles"[MeSH Terms]
En otras palabras, está buscando los términos MeSH tanto para el animal como para la lesión de la piel. También tenga en cuenta que PubMed no incluye el término ortográfico inglés como un término de texto libre, solo la ortografía de EE. UU. (como "nevus"[All Fields]).
Este ejemplo demuestra por qué para una búsqueda sistemática es generalmente mejor ingresar los términos MeSH y los términos de texto libre usted mismo en lugar de confiar en el mapeo automático de PubMed.
Construyendo su estrategia de búsqueda PubMed
Ahora que hemos explicado sobre los términos de texto libre y los términos MeSH, y cómo PubMed trabaja con ellos, volvamos a la pregunta PICO de ejemplo:
En pacientes con psoriasis en placa crónica, ¿es el infliximab más efectivo y tiene menos efectos secundarios que el adalimumab?
Anteriormente se indicó que los términos posibles para el paciente/población P incluirían:
psoriasis chronic plaque psoriasis plaque-type psoriasis plaque type psoriasis chronic plaque-type psoriasis severe plaque psoriasis relapsing plaque psoriasis
Cadenas de búsqueda
Verá que algunos de estos términos constan de más de una palabra. Las combinaciones de palabras utilizadas como un término de búsqueda se llaman cadenas.Al buscar en PubMed, debe colocar las cadenas entre comillas rectas "" para buscar esas palabras juntas en ese orden.
Por ejemplo: "chronic plaque psoriasis“
De lo contrario, PubMed combinará las palabras con AND y puede hacer un mapeo no deseado. Intente ingresar la psoriasis en placa crónica en PubMed sin las comillas y busque en el cuadro de Detalles de búsqueda para ver cómo PubMed interpreta esta búsqueda
¡Incluye términos para la placa amiloide y la placa dental!
Cadenas de búsqueda: hágalo simple
Cuando use cadenas, trate de mantenerlas lo más cortas posible. Trate de usar palabras sueltas o pares de palabras que sean comunes a sus posibles términos de búsqueda. De lo contrario, deberá incluir todas las permutaciones posibles y podría olvidar algo relevante.
En este ejemplo, podemos evitar las cadenas y usar la palabra psoriasis como el término de texto libre:
psoriasis
chronic plaque psoriasis
plaque-type psoriasis
plaque type psoriasis
chronic plaque-type psoriasis
severe plaque psoriasis
relapsing plaque psoriasis
Nuestros términos de búsqueda finales
Patient/Population P
psoriasis "psoriasis"[MeSH Terms] Intervention I
infliximab Remicade "infliximab"[MeSH Terms]
Comparator C
adalimumab Humira "adalimumab"[MeSH Terms]
Después de consultar los términos MeSH relevantes como se describió anteriormente, ahora puede armar una lista final de términos para P, I y C que usará en su estrategia de búsqueda. Para cada concepto de búsqueda, tendrá términos alternativos de texto libre y términos MeSH relevantes (si existen).
Este ejemplo es una búsqueda relativamente sencilla de hacer. Los únicos sinónimos para I y C son los nombres genéricos y comerciales de los medicamentos en cuestión (tenga en cuenta que no importa si los nombres comerciales están en mayúsculas o no al buscar en PubMed)
Combinar términos dentro de un concepto de búsqueda
Los términos alternativos dentro de cada concepto de búsqueda (P, I, C) se combinan con OR, siendo OR lo que se conoce como un término u operador booleano.
Recuerde que son términos alternativos para el mismo concepto, por lo que es lógico combinarlos con OR.
Nótese bien: Escriba OR en mayúsculas para asegurarse de que PubMed interpreta el comando correctamente.
Operadores booleanos
Por lo tanto, los términos dentro de cada uno de los tres conceptos de búsqueda se combinan de la siguiente manera:
Patient/Population P psoriasis OR "psoriasis"[MeSH Terms]
Intervention I infliximab OR remicade OR "infliximab"[MeSH Terms]
Comparator C adalimumab OR humira OR "adalimumab"[MeSH Terms]
Combinar términos dentro de un concepto de búsqueda
Los conceptos de búsqueda (P, I, C) se combinan con AND. También AND se llama término u operador booleano.
Recuerde que está buscando artículos sobre el grupo de pacientes, la intervención y el comparador, por lo que es lógico combinarlos con AND
Nótese bien: Escriba AND en mayúsculas para asegurarse de que PubMed interpreta el comando correctamente.
Operadores booleanos
Nótese bien: Coloque paréntesis () alrededor de cada uno de los conceptos de búsqueda, para garantizar que AND & OR se implementen en el orden correcto. ¡Los paréntesis alrededor de los conceptos de búsqueda son esenciales para que la búsqueda funcione correctamente!
Así, sus conceptos de búsqueda combinados son los siguientes:
Patient/Population P (psoriasis OR "psoriasis"[MeSH Terms]) AND
Intervention I (infliximab OR remicade OR "infliximab"[MeSH Terms]) AND
Comparator C (adalimumab OR humira OR "adalimumab"[MeSH Terms])
Estrategia de búsqueda final
Estrategia de búsqueda final
Al eliminar los saltos de línea que se muestran arriba para mayor claridad, su estrategia de búsqueda final será:
(psoriasis OR "psoriasis"[MeSH Terms]) AND (infliximab OR remicade OR "infliximab"[MeSH Terms]) AND (adalimumab OR humira OR "adalimumab"[MeSH Terms])
Si reúne su búsqueda en su computadora en un editor de texto como el Bloc de notas, es muy sencillo copiar y pegar su estrategia de búsqueda en el cuadro de búsqueda de PubMed y ejecutar su búsqueda.
También puede compilar la búsqueda en un procesador de textos como Word, pero luego debe usar la forma correcta (recta) de comillas "" que usa PubMed y no las comillas “” que Word usa por defecto.
Para ayudarlo a asegurarse de que los paréntesis se usen correctamente y los términos booleanos se apliquen en el orden correcto, puede comenzar con un conjunto de paréntesis en blanco combinado con AND, y luego agregar los términos para cada concepto de búsqueda:
( OR OR ) AND ( OR OR ) AND ( OR OR )
Generador de búsqueda PubMed
Como una forma alternativa de compilar su búsqueda, puede usar el Generador de búsqueda en la Búsqueda avanzada en PubMed para crear un término de la estrategia de búsqueda por término.
Sin embargo, sin la práctica puede ser difícil combinar los diferentes conceptos de búsqueda de una estrategia de búsqueda PICO o PEO en el Generador de búsqueda, y la búsqueda que genere tendrá paréntesis adicionales e innecesarios que pueden dificultar su comprensión y verificación.
Le sugerimos que es más fácil compilar su estrategia de búsqueda de la manera que hemos demostrado antes de ejecutar su búsqueda en PubMed.
An introduction to systematic searching in PubMed
Conclusiones
Puede ver cómo combinar sus conceptos de búsqueda con AND ha enfocado su búsqueda. Como resultado, ha reducido la cantidad de resultados que obtendría si solo buscara conceptos de búsqueda individuales.Al mismo tiempo, al utilizar términos alternativos de texto libre y MeSH para cada concepto de búsqueda, ha maximizado la sensibilidad de su búsqueda.
Consejos finales:
El mapeo automatizado de términos de texto libre puede no ser un problema, a menos que PubMed se asigne a un término no relevante y aumente el número de resultados no relevantes.Una forma de evitar el mapeo automatizado de términos de texto libre es ingresarlos en PubMed entre comillas.
p.ej. “mole"
Otra forma de evitar el mapeo automatizado de términos de texto libre es usando el comando de texto Word [tw] por ejemplo: mole[tw]
El comando [tw] también es útil si está buscando una enfermedad o un procedimiento que lleva el nombre de una persona, para evitar que PubMed encuentre artículos de autores con ese apellido.
Por ejemplo:
-Bowen[tw] si estás buscando la enfermedad de Bowen.
-Merkel[tw] si está buscando un carcinoma de células de Merkel.
Tareas
Compare los resultados que obtiene en PubMed cuando busca el término mole o el término "mole" (entre comillas). Desplácese hacia abajo en la página de resultados hasta el cuadro "Detalles de la búsqueda" para ver qué está buscando realmente PubMed en cada caso.
Compare los resultados que obtiene en PubMed cuando busca el término bowen o el término bowen[tw].
Un escenario para probarse usted mismo...
Ahora debería ser un buscador efectivo en PubMed.
Para probar sus nuevas habilidades encontradas, ahora puede intentar construir y ejecutar una búsqueda en PubMed por usted mismo.
Su grupo local de atención primaria ha pedido consejo sobre si el ácido salicílico es tan eficaz como la crioterapia para el tratamiento de las verrugas virales cutáneas.
Usted decide realizar una búsqueda de la literatura para responder esta pregunta.
Decida los términos de búsqueda para cada concepto de búsqueda de su pregunta PICO y luego construya una estrategia de búsqueda en PubMed.
Realice su búsqueda en PubMed y vea qué estudios encuentra que responden a su pregunta.
Gracias¡Ha completado el curso!
¡Felicidades!
Agradecimientos:Contenido: Douglas Grindlay
Diseño y producción: Natasha Rogers.
Asesoramiento técnico: Julian Tenney.
Traducción: Santiago Piedra.
Haga click en el símbolo para obtener su certificado:
Santiago Piedra MD.
Búsqueda sistemática PubMed 3.0
Santiago Piedra
Created on August 10, 2020
Curso sobre búsqueda sistemática en PubMed. Traducido por: Santiago Piedra MD.
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An introduction to systematic searching in PubMed
Introducción a la búsqueda sistemática en PubMed
Santiago Piedra MD.Contenido: Douglas Grindlay . Diseño y producción: Natasha Rogers. Asesoramiento técnico: Julian Tenney.
Introducción
-Este curso está destinado a cualquiera que desee aprender a buscar sistemáticamente en PubMed. -El curso fue producido por el Centro de Dermatología Basada en Evidencias (CEBD), por lo que utiliza ejemplos de dermatología, pero los principios se pueden aplicar a cualquier especialidad. Para continuar, por favor llenar la siguiente encuesta: Conflicto de interés: Ninguno.
Introducción
-Cualquiera puede ingresar uno o dos términos en PubMed para encontrar algunos documentos relevantes, pero ¿puede estar seguro de que no le falta algo importante que pueda ser útil para tratar a sus pacientes? Si no hace una pregunta específica, identifica todos los posibles términos de búsqueda relevantes y elabora una estrategia de búsqueda sistemática, no puede estar seguro.
Introducción
Este curso le muestra cómo puede construir una estrategia de búsqueda integral y sistemática en PubMed para responder una pregunta clínica. Los métodos que aprenderá son particularmente adecuados para llevar a cabo un tema evaluado críticamente (CAT), que es un breve resumen de la evidencia disponible para responder a una pregunta clínica específica. Este taller tardará aproximadamente 1 hora en completarse.
Objetivos de Aprendizaje
Al final de este curso introductorio, usted podrá: -Formular una pregunta clínica desde un escenario clínico de la vida real. Identificar conceptos de búsqueda. -Comprender la diferencia entre los términos de texto libre y los Encabezados de Temas Médicos (términos MeSH). -Comprender cómo PubMed hace un mapeo automático de términos. -Compilar y ejecutar una búsqueda sistemática en PubMed que combine conceptos de búsqueda usando términos booleanos (OR, AND).
Búsqueda en bases de datos y revisiones sistemáticas
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PubMed es un recurso gratuito de literatura biomédica en línea basado en la base de datos de MEDLINE. Si bien este curso se centra en la búsqueda en PubMed, los principios que aprenderá aquí se pueden aplicar a otras bases de datos científicas.
PubMed incluye la mayoría de las revistas médicas importantes, pero hay algunas revistas que solo se incluyen en otras bases de datos, por ejemplo, en Embase. En las revisiones sistemáticas, es normal buscar en una variedad de bases de datos, dependiendo del tema, y luego combinar los resultados, para tratar de encontrar toda la evidencia relevante.
Acerca de PubMed
PubMed es de uso gratuito y no es necesario iniciar sesión (aunque puede configurar una cuenta de PubMed gratuita para guardar búsquedas y crear alertas).Una característica clave de PubMed es el mapeo automatizado de los términos de búsqueda a términos alternativos para ayudar a los buscadores no expertos a encontrar el número máximo de citas relevantes de forma rápida y fácil.
Pero…
Este mapeo automatizado de PubMed puede generar términos no relevantes y dificultar las búsquedas sistemáticas.Para construir una búsqueda sistemática puede necesitar usar comandos de búsqueda de PubMed específicos y tomar el control de cómo PubMed ejecuta una búsqueda.
¿Cuáles son los conceptos de búsqueda?
ElPrimer paso
Para ello, se construye una pregunta clínica en un formato definido.Los conceptos de búsqueda de la pregunta clínica se utilizan luego para identificar los términos de búsqueda que se usarán en su estrategia de búsqueda.
El primer paso para compilar una estrategia de búsqueda de base de datos es identificar sus conceptos de búsqueda.
Preguntas clínicas
Se han desarrollado varios formatos para formular preguntas clínicas y especificar los conceptos de búsqueda involucrados.
Preguntas clínicas
Hay dos tipos principales de preguntas clínicas que probablemente desee responder:Preguntas sobre intervenciones / tratamientos Preguntas sobre factores de riesgo o causas PICO y PEO son los formatos más ampliamente utilizados para preguntas clínicas. PICO se usa para preguntas de intervención y PEO se usa para preguntas de factores de riesgo.
Preguntas de Intervención
Para preguntas clínicas sobre intervenciones puede usar un formato de pregunta PICO: P: Paciente/Población I: Intervención C: Comparación O: Outcome (Resultado)
Preguntas de Intervención: Ejemplo.
Por ejemplo: En pacientes con eccema atópico, ¿hay menos riesgo de adelgazamiento de la piel con pimecrolimus tópico que con corticosteroides tópicos? Por ejemplo: ¿Una dieta baja en azúcar mejora los síntomas del acné vulgar? Hay que tener en cuenta que el comparador C en las preguntas PICO puede no ser una intervención, como con un control con placebo en un ensayo controlado aleatorio (ECA). En este caso, el comparador podría estar implicado en lugar de estar especificado en la pregunta clínica. La comparación C también puede ser una práctica normal (que de nuevo podría no especificarse en la pregunta clínica), o un tratamiento establecido contra el cual se debe comparar una nueva intervención I.
PubMed incluye la mayoría de las revistas médicas importantes, pero hay algunas revistas que solo se incluyen en otras bases de datos, por ejemplo, en Embase. En las revisiones sistemáticas, es normal buscar en una variedad de bases de datos, dependiendo del tema, y luego combinar los resultados, para tratar de encontrar toda la evidencia relevante.
Preguntas clínicas: Ejercicios.
Haga click en cada símbolo para ingresar a los ejercicios: Ejercicio 1: Ejercicio 2:
Preguntas sobre factores de riesgo
Para preguntas clínicas sobre factores de riesgo y causas, puede usar un formato de pregunta PEO: P: Población de pacientes E: Exposición O: Outcome (Resultado)
Preguntas sobre Factores de riesgo: Ejemplo.
Por ejemplo: ¿El tabaquismo aumenta la gravedad de la psoriasis? ¿Tener eczema atópico reduce el riesgo de tumores cerebrales como el glioma y el meningioma? Hay que tener en cuenta que el concepto de búsqueda de pacientes / población (P) a menudo se define por la enfermedad que tienen las personas. En algunas preguntas PEO, la exposición (E) es la enfermedad que define al paciente/población (P), como en el segundo ejemplo anterior.
Preguntas sobre factores de riesgo: Ejercicios.
Haga click en cada símbolo para ingresar a los ejercicios: Ejercicio 1: Ejercicio 2:
Definición del Paciente/población (P)
Como habrá visto que tanto en las preguntas PICO como PEO, el concepto de búsqueda de pacientes / población (P) a menudo se define por la enfermedad que padecen las personas. Según su pregunta, también puede especificar otras características del paciente / población, como: Su grupo de edad (por ejemplo, recién nacidos, adultos, ancianos) La gravedad de su enfermedad Dónde viven (por ejemplo, zonas rurales, países tropicales, hogares de atención) Condiciones específicas que pueden tener (por ejemplo, embarazo o inmunodeficiencia) Por ejemplo: ¿Son seguros los corticosteroides tópicos durante el embarazo? (P es mujeres embarazadas, E es corticosteroides tópicos, O es la seguridad / efectos adversos)
Echemos un vistazo a un escenario clínico...
La Sra. Dowling ha estado tomando la terapia biológica adalimumab para su psoriasis, pero su piel no se ha aclarado por completo y ha experimentado algunos efectos secundarios. La Sra. Dowling ha leído en un artículo en el Daily Mail que infliximab puede proporcionar una cura completa de psoriasis? Ella le pregunta si infliximab es más eficaz que adalimumab, y también se pregunta sobre sus posibles efectos secundarios…
¿Qué tipo de pregunta clínica es esta, PICO o PEO?
Respuesta: pregunta PICO
Ya que se trata de los efectos de una intervención en comparación con otra.
¿Cuáles son los conceptos de búsqueda para construir una pregunta clínica para construir una pregunta clínica para este escenario?
La Sra. Dowling ha estado tomando el adalimumab biológico para su psoriasis, pero no ha tenido un aclaramiento completo de su piel y ha experimentado algunos efectos secundarios. La Sra. Dowling ha leído en un artículo en el Daily Mail que infliximab puede proporcionar una cura completa de psoriasis.? Ella le pregunta si infliximab es más eficaz que adalimumab, y también se pregunta sobre sus posibles efectos secundarios.
Usando el formato PICO, ¿qué conceptos de búsqueda utilizaría para responder a esta pregunta clínica?
Paciente / Población: Paciente (mujer adulta) con psoriasis en placa crónicaIntervención: Infliximab Comparador: Adalimumab Resultados: Gravedad de la enfermedad (por ejemplo, PASI) y efectos secundarios
El uso de resultados (O) a partir de preguntas clínicas en la búsqueda
Para las preguntas PICO, el resultado O no se incluye generalmente en la estrategia de búsqueda, por las siguientes razones:A menudo es difícil definir todos los términos posibles para un resultado. Los resultados pueden no mencionarse en el título o resumen (que es lo que se busca en PubMed).
Uso de Resultados (O)
El número de conceptos de búsqueda que se combinarán debe mantenerse al mínimo, para reducir la posibilidad de omitir algo relevante. Sin embargo, para las preguntas PEO, debe incluir el resultado O en la búsqueda. Esto se debe a que el resultado O es clave para definir lo que está buscando, por ejemplo, una enfermedad causada por un factor de riesgo, o una comorbilidad asociada con una enfermedad en particular.
Identificar términos de búsqueda para cada concepto de búsqueda
Después de haber identificado los conceptos de búsqueda para su pregunta clínica, ahora tiene que pensar en todos los términos alternativos posibles para cada concepto. "Puede haber varios sinónimos y otros términos que sean relevantes para una condición o intervención particular." Para evitar perderse cualquier artículo relevante, debe incluir todos estos términos alternativos en su estrategia de búsqueda. Esto es lo mismo para todas las bases de datos, no solo para PubMed.
Pensar en todas las alternativas
Es importante tomarse un tiempo para pensar en todos los términos alternativos.Las posibilidades a considerar incluyen: Sinónimos, por ejemplo: atopic eczema, atopic dermatitis; cutaneous mastocytosis, urticaria pigmentosa; dermoscopy, dermatoscopy Plurales, por ejemplo: comedone, comedones; probiotic, probiotics; louse, lice; naevus, naevi; exanthem, exanthems, exanthemata Términos en inglés y en latín. rash, exanthem; itch, pruritus
Pensar en todas las alternativas...
Deletreos alternativos (especialmente en los Estados Unidos): anaesthetic, anesthetic; naevus, nevus; seborrhoeic, seborrheic. Términos divididos y conjuntos. Por ej. sun burn, sunburn; non-melanoma, nonmelanoma. Nombres genéricos y comerciales. P. Ej. isotretinoin, Roaccutane, Accutane. Abreviaturas. P. Ej. basal cell carcinoma, BCC; psoralen and ultraviolet A, psoralen and UVA, PUVA Posesivos. P. ej. Kaposi’s sarcoma, Kaposi sarcoma
Un par de ejemplos en dermatología…
Ciclosporin, ciclosporine, cyclosporin, cyclosporine (más plurales se pueden usar) Bowen’s disease, Bowen disease, Bowens disease, squamous cell carcinoma in situ, SCC in situ, intraepidermal squamous cell carcinoma, intraepidermal SCC, intraepidermal carcinoma (más variaciones que utilizan "intra-epidermal").
Ejemplos en dermatología
Wart warts, verruca, verrucas, verrucae
Blistering blister, blisters, bulla, bullae, bullous
Sinónimos y otros términos relevantes para usar en algunos conceptos dermatológicos para incluirlos en una estrategia de búsqueda en PubMed.
Ejemplos en dermatología
Anaesthesia anesthesia, anesthesiology, anaesthetics, anesthetics Anaesthesia, anesthesia, anesthesiology, anaesthetics, anesthetics
Pompholyx dyshidrotic eczema, vesicular hand eczema
Sinónimos y otros términos relevantes para usar en algunos conceptos dermatológicos para incluirlos en una estrategia de búsqueda en PubMed.
Ejemplos en dermatología
Athlete's foot Athletes foot, tinea pedis
Keratosis keratoses, keratotic, keratoma, keratomas
Sinónimos y otros términos relevantes para usar en algunos conceptos dermatológicos para incluirlos en una estrategia de búsqueda en PubMed.
Términos de búsqueda basados en pregunta PICO
¿Puede pensar en posibles sinónimos y términos alternativos a usar para cada concepto de búsqueda en la pregunta PICO? En pacientes con psoriasis crónica en placa, ¿es el infliximab más efectivo y tiene menos efectos secundarios que el adalimumab? Recuerde que antes dijimos que normalmente no necesita usar el resultado O en las preguntas PICO, por lo que solo necesita pensar en sinónimos y términos alternativos para P, I y C.
Paciente/Población
psoriasischronic plaque psoriasis plaque-type psoriasis plaque type psoriasis chronic plaque-type psoriasis severe plaque psoriasis relapsing plaque psoriasis
Intervención
infliximabRemicade
Comparador
adalimumabHumira
Tipos de término de búsqueda
Ahora vamos a ver los tipos de términos de búsqueda que puede utilizar para buscar en PubMed.En PubMed (y muchas otras bases de datos) hay dos tipos de términos de búsqueda: • Términos de texto libre • Títulos de los temas
Tipos de Términos de búsqueda
Los títulos de los temas en PubMed (y MEDLINE) se denominan términos MeSH, para los títulos de temas médicos. En general, debe utilizar tanto los términos de texto libre como los títulos de los temas para que su búsqueda sea lo más completa posible.
Términos de búsqueda de texto libre
Los términos de búsqueda de texto libre encuentran la palabra exacta en el registro de la base de datos, independientemente del tema del artículo o del significado de la palabra. Por lo tanto, para un término que tiene varios significados, encontrará todos los registros que contienen ese término, independientemente de lo que se quiere decir. Los ejemplos incluyen las palabras “radius”, “nail”, “palm” y “lichen”.
Tipos de Términos de búsqueda
En PubMed (y en la mayoría de las otras bases de datos) no está buscando el texto completo de los artículos. En su lugar, está buscando un registro de base de datos con ciertos campos, incluidos el título, el resumen y los detalles de las citas del artículo (año, autores, revista, volumen, número, números de página). En PubMed, el valor predeterminado para una búsqueda de texto libre (si se ingresa un término en PubMed sin ningún comando de búsqueda) es buscar en todos los campos del registro de PubMed, por ejemplo, "acne“[All Fields] “Todos los campos”.
Títulos de los temas
Un títulos del tema es un término fijo para un tema o concepto de búsqueda.Como solo hay un término, esto evita el problema de los sinónimos y las variaciones ortográficas. Los títulos del tema son agregados por, y específicos a, la base de datos. Se agregan a los registros basándose en un análisis del contenido del artículo. Recuerde: encabezados de materia = ¿de qué trata este artículo?
Términos MESH
Como ya se ha visto, los títulos de los temas utilizados en PubMed (y MEDLINE) se denominan términos MeSH. Los términos MeSH se derivan de un tesauro compilado por los productores de la base de datos. Como PubMed y MEDLINE se producen en los EE. UU., MeSH usa los términos y la ortografía en inglés de los EE. UU. Los términos MeSH se organizan en una jerarquía, con una estructura de árbol.
Ejemplo:
Por ejemplo, las posiciones de los términos para diferentes tipos de acné dentro de la jerarquía de MeSH se muestran en la imagen adjunta. Puede ver cómo están bajo el término genérico MeSH Erupciones Acneiformes, que a su vez se encuentra en Enfermedades de la Piel, que a su vez se encuentra en Enfermedades de la Piel y el Tejido Conectivo. También puede ver que en la jerarquía de MeSH, Acne Conglobata es un término de menos jerarquía que Acne Vulgaris.
Términos MESH
Los términos MeSH se agregan a los registros de PubMed cuando se indexan. Los registros más recientes (en proceso) en PubMed aún no tienen términos MeSH agregados, por lo que solo se pueden encontrar por términos de búsqueda de texto libre. Como se recomendó anteriormente, debe usar términos de texto libre y términos MeSH, ya que esto maximizará la sensibilidad de su búsqueda.
Términos MESH
Debe usar un comando de búsqueda específico para decirle a PubMed que busque un término MeSH, como en estos ejemplos: "acne vulgaris"[MeSH Terms] "surgical procedures, operative"[MeSH Terms] Tenga en cuenta que las comillas pueden ser excluidas de los términos MeSH y no necesitan comenzar con mayúsculas. También el comando [MeSH Terms] se puede abreviar como [mh]. Por lo tanto, el acne vulgar[mh] es equivalente a "acne vulgar"[MeSH Terms]
Explotando los términos MESH
Como valor predeterminado en PubMed, si ingresa un término MeSH en PubMed, PubMed también buscará los términos MeSH que están debajo de ese término en la jerarquía MeSH, un proceso llamado explosión.Como ejemplo, si busca el término MeSH “Skin Diseases, Bacterial” usando el término "Skin Diseases, Bacterial"[MeSH Terms] en PubMed, así como los artículos con el término MeSH “Skin Diseases, Bacterial”, Pubmed encuentra artículos con términos MeSH debajo en la jerarquía, como “Erysipelas”, “Fasciitis, Necrotizing” and “Yaws”
¿Cómo identificar los términos MeSH?
¿Cómo identificar los términos MeSH?
Debe averiguar qué término(s) MeSH usar para cada concepto de búsqueda en el que esté interesado (¡puede haber varios, uno o ninguno!) Entonces, ¿cómo descubres qué términos de MeSH usar? Para comprender esto, es útil saber cómo PubMed utiliza los procesos automatizados para ayudarlo con su búsqueda...
Procesos de búsqueda automatizados de PubMed
Procesos de búsqueda automatizados de PubMed
¡PubMed está diseñado para ayudarte!Cuenta con procesos automatizados incorporados diseñados para ayudar a los buscadores inexpertos a encontrar la evidencia relevante. Cuando ingresa un término de búsqueda en PubMed sin incluir comandos de búsqueda específicos, la base de datos lleva a cabo la asignación automática a los Términos de MeSH. También puede asignar su búsqueda a términos alternativos de texto libre, dependiendo de lo que se haya programado en el software de la base de datos. Sin embargo, la forma en que se asigna un término de búsqueda en PubMed puede crear problemas si intenta realizar una búsqueda sistemática, como veremos más adelante.
Nueva interfaz de PubMed
Ejemplo: Búsqueda de “surgery” (cirugía)
PubMed en realidad busca un rango de títulos de temas y combinaciones de términos de texto libre relacionados con la cirugía. Esto está diseñado para maximizar el número de resultados relevantes para esta búsqueda rápida y simple. Este proceso está ocurriendo en segundo plano para la mayoría de las búsquedas en PubMed, pero la mayoría de los usuarios no saben que está sucediendo.
Cómo identificar los términos MeSH
Hay dos formas principales de identificar los términos MeSH para su estrategia de búsqueda.Ingrese los términos probables en el cuadro de búsqueda de PubMed y copie los términos MeSH asignados del cuadro de Detalles de búsqueda en su estrategia de búsqueda. Por ejemplo: Para buscar resultados de acné: "acne vulgaris"[MeSH Terms] Utilice el navegador MeSH en línea: https://meshb.nlm.nih.gov Deberá copiar y pegar cada término relevante que encuentre en el navegador MeSH en su estrategia de búsqueda, y luego agregar el comando [MeSH terms]. También puede agregar comillas rectas invertidas "" para que coincidan con la forma en que aparecen los términos MeSH en el cuadro de Detalles de búsqueda (pero estos son opcionales, como se señaló anteriormente).
MeSH Browser
Usando el buscador MESH
Busque en Google el "navegador MeSH". En el navegador de MeSH: Encuentre el término MeSH para cáncer de piel y vea dónde se encuentra en la jerarquía de MeSH. Encuentre el término MeSH para el carcinoma de células basales y vea dónde se encuentra en la jerarquía MeSH. ¿Es lo que esperaba?
Respuestas
El término MeSH para el cáncer de piel es Skin Neoplasms “Neoplasias de la piel”.Al hacer clic en la pestaña "MeSH Tree Structures", se muestra que en la jerarquía de MeSH, Skin Neoplasms se encuentra en Neoplasms by Site y también en Skin Diseases. El término MeSH para BCC (tiene que ingresar a “basal cell carcinoma” para encontrarlo) es Carcinoma, Basal Cell. Al hacer clic en la pestaña "MeSH Tree Structures", se muestra que en la jerarquía de MeSH, Carcinoma, Basal Cell se incluye en Carcinoma y también en Neoplasms, Basal Cell. En otras palabras, el carcinoma de células basales no está incluido en la jerarquía MeSH bajo el término MeSH utilizado para los cánceres de piel (neoplasias de la piel). Esto significa que si estuviera buscando el tema de cánceres de piel en general, tendría que incluir el término MeSH Carcinoma, Basal Cell así como Skin Neoplasms. Esto también se aplica al término MeSH, Carcinoma, Squamous Cell.
En el buscador MESH:
Encuentre el término MeSH para lunares (traducción al inglés: "moles" )
En el buscador MESH
RESPUESTA Moles (topos) es en realidad el término MeSH para animales pequeños, ciegos, peludos. Nevus, pigmented (Nevus pigmentado) es el término MeSH apropiado para un lunar de la piel (también conocido como naevus, nevus or melanocytic naevus).
Respuestas
Si simplemente ingresa moles en PubMed, la base de datos no "sabe" lo que le interesa y traducirá su búsqueda de la siguiente manera: "nevus, pigmented"[MeSH Terms] OR ("nevus"[All Fields] AND "pigmented"[All Fields]) OR "pigmented nevus"[All Fields] OR "moles"[All Fields] OR "nevus"[MeSH Terms] OR "nevus"[All Fields] OR "moles"[All Fields] OR "moles"[MeSH Terms] En otras palabras, está buscando los términos MeSH tanto para el animal como para la lesión de la piel. También tenga en cuenta que PubMed no incluye el término ortográfico inglés como un término de texto libre, solo la ortografía de EE. UU. (como "nevus"[All Fields]). Este ejemplo demuestra por qué para una búsqueda sistemática es generalmente mejor ingresar los términos MeSH y los términos de texto libre usted mismo en lugar de confiar en el mapeo automático de PubMed.
Construyendo su estrategia de búsqueda PubMed
Ahora que hemos explicado sobre los términos de texto libre y los términos MeSH, y cómo PubMed trabaja con ellos, volvamos a la pregunta PICO de ejemplo: En pacientes con psoriasis en placa crónica, ¿es el infliximab más efectivo y tiene menos efectos secundarios que el adalimumab? Anteriormente se indicó que los términos posibles para el paciente/población P incluirían: psoriasis chronic plaque psoriasis plaque-type psoriasis plaque type psoriasis chronic plaque-type psoriasis severe plaque psoriasis relapsing plaque psoriasis
Cadenas de búsqueda
Verá que algunos de estos términos constan de más de una palabra. Las combinaciones de palabras utilizadas como un término de búsqueda se llaman cadenas.Al buscar en PubMed, debe colocar las cadenas entre comillas rectas "" para buscar esas palabras juntas en ese orden. Por ejemplo: "chronic plaque psoriasis“ De lo contrario, PubMed combinará las palabras con AND y puede hacer un mapeo no deseado. Intente ingresar la psoriasis en placa crónica en PubMed sin las comillas y busque en el cuadro de Detalles de búsqueda para ver cómo PubMed interpreta esta búsqueda ¡Incluye términos para la placa amiloide y la placa dental!
Cadenas de búsqueda: hágalo simple
Cuando use cadenas, trate de mantenerlas lo más cortas posible. Trate de usar palabras sueltas o pares de palabras que sean comunes a sus posibles términos de búsqueda. De lo contrario, deberá incluir todas las permutaciones posibles y podría olvidar algo relevante. En este ejemplo, podemos evitar las cadenas y usar la palabra psoriasis como el término de texto libre: psoriasis chronic plaque psoriasis plaque-type psoriasis plaque type psoriasis chronic plaque-type psoriasis severe plaque psoriasis relapsing plaque psoriasis
Nuestros términos de búsqueda finales
Patient/Population P psoriasis "psoriasis"[MeSH Terms] Intervention I infliximab Remicade "infliximab"[MeSH Terms] Comparator C adalimumab Humira "adalimumab"[MeSH Terms]
Después de consultar los términos MeSH relevantes como se describió anteriormente, ahora puede armar una lista final de términos para P, I y C que usará en su estrategia de búsqueda. Para cada concepto de búsqueda, tendrá términos alternativos de texto libre y términos MeSH relevantes (si existen). Este ejemplo es una búsqueda relativamente sencilla de hacer. Los únicos sinónimos para I y C son los nombres genéricos y comerciales de los medicamentos en cuestión (tenga en cuenta que no importa si los nombres comerciales están en mayúsculas o no al buscar en PubMed)
Combinar términos dentro de un concepto de búsqueda
Los términos alternativos dentro de cada concepto de búsqueda (P, I, C) se combinan con OR, siendo OR lo que se conoce como un término u operador booleano. Recuerde que son términos alternativos para el mismo concepto, por lo que es lógico combinarlos con OR. Nótese bien: Escriba OR en mayúsculas para asegurarse de que PubMed interpreta el comando correctamente.
Operadores booleanos
Por lo tanto, los términos dentro de cada uno de los tres conceptos de búsqueda se combinan de la siguiente manera: Patient/Population P psoriasis OR "psoriasis"[MeSH Terms] Intervention I infliximab OR remicade OR "infliximab"[MeSH Terms] Comparator C adalimumab OR humira OR "adalimumab"[MeSH Terms]
Combinar términos dentro de un concepto de búsqueda
Los conceptos de búsqueda (P, I, C) se combinan con AND. También AND se llama término u operador booleano. Recuerde que está buscando artículos sobre el grupo de pacientes, la intervención y el comparador, por lo que es lógico combinarlos con AND Nótese bien: Escriba AND en mayúsculas para asegurarse de que PubMed interpreta el comando correctamente.
Operadores booleanos
Nótese bien: Coloque paréntesis () alrededor de cada uno de los conceptos de búsqueda, para garantizar que AND & OR se implementen en el orden correcto. ¡Los paréntesis alrededor de los conceptos de búsqueda son esenciales para que la búsqueda funcione correctamente! Así, sus conceptos de búsqueda combinados son los siguientes: Patient/Population P (psoriasis OR "psoriasis"[MeSH Terms]) AND Intervention I (infliximab OR remicade OR "infliximab"[MeSH Terms]) AND Comparator C (adalimumab OR humira OR "adalimumab"[MeSH Terms])
Estrategia de búsqueda final
Estrategia de búsqueda final
Al eliminar los saltos de línea que se muestran arriba para mayor claridad, su estrategia de búsqueda final será: (psoriasis OR "psoriasis"[MeSH Terms]) AND (infliximab OR remicade OR "infliximab"[MeSH Terms]) AND (adalimumab OR humira OR "adalimumab"[MeSH Terms]) Si reúne su búsqueda en su computadora en un editor de texto como el Bloc de notas, es muy sencillo copiar y pegar su estrategia de búsqueda en el cuadro de búsqueda de PubMed y ejecutar su búsqueda. También puede compilar la búsqueda en un procesador de textos como Word, pero luego debe usar la forma correcta (recta) de comillas "" que usa PubMed y no las comillas “” que Word usa por defecto. Para ayudarlo a asegurarse de que los paréntesis se usen correctamente y los términos booleanos se apliquen en el orden correcto, puede comenzar con un conjunto de paréntesis en blanco combinado con AND, y luego agregar los términos para cada concepto de búsqueda: ( OR OR ) AND ( OR OR ) AND ( OR OR )
Generador de búsqueda PubMed
Como una forma alternativa de compilar su búsqueda, puede usar el Generador de búsqueda en la Búsqueda avanzada en PubMed para crear un término de la estrategia de búsqueda por término. Sin embargo, sin la práctica puede ser difícil combinar los diferentes conceptos de búsqueda de una estrategia de búsqueda PICO o PEO en el Generador de búsqueda, y la búsqueda que genere tendrá paréntesis adicionales e innecesarios que pueden dificultar su comprensión y verificación. Le sugerimos que es más fácil compilar su estrategia de búsqueda de la manera que hemos demostrado antes de ejecutar su búsqueda en PubMed.
An introduction to systematic searching in PubMed
Conclusiones
Puede ver cómo combinar sus conceptos de búsqueda con AND ha enfocado su búsqueda. Como resultado, ha reducido la cantidad de resultados que obtendría si solo buscara conceptos de búsqueda individuales.Al mismo tiempo, al utilizar términos alternativos de texto libre y MeSH para cada concepto de búsqueda, ha maximizado la sensibilidad de su búsqueda.
Consejos finales:
El mapeo automatizado de términos de texto libre puede no ser un problema, a menos que PubMed se asigne a un término no relevante y aumente el número de resultados no relevantes.Una forma de evitar el mapeo automatizado de términos de texto libre es ingresarlos en PubMed entre comillas. p.ej. “mole" Otra forma de evitar el mapeo automatizado de términos de texto libre es usando el comando de texto Word [tw] por ejemplo: mole[tw] El comando [tw] también es útil si está buscando una enfermedad o un procedimiento que lleva el nombre de una persona, para evitar que PubMed encuentre artículos de autores con ese apellido. Por ejemplo: -Bowen[tw] si estás buscando la enfermedad de Bowen. -Merkel[tw] si está buscando un carcinoma de células de Merkel.
Tareas
Compare los resultados que obtiene en PubMed cuando busca el término mole o el término "mole" (entre comillas). Desplácese hacia abajo en la página de resultados hasta el cuadro "Detalles de la búsqueda" para ver qué está buscando realmente PubMed en cada caso. Compare los resultados que obtiene en PubMed cuando busca el término bowen o el término bowen[tw].
Un escenario para probarse usted mismo...
Ahora debería ser un buscador efectivo en PubMed. Para probar sus nuevas habilidades encontradas, ahora puede intentar construir y ejecutar una búsqueda en PubMed por usted mismo. Su grupo local de atención primaria ha pedido consejo sobre si el ácido salicílico es tan eficaz como la crioterapia para el tratamiento de las verrugas virales cutáneas. Usted decide realizar una búsqueda de la literatura para responder esta pregunta. Decida los términos de búsqueda para cada concepto de búsqueda de su pregunta PICO y luego construya una estrategia de búsqueda en PubMed. Realice su búsqueda en PubMed y vea qué estudios encuentra que responden a su pregunta.
Gracias¡Ha completado el curso! ¡Felicidades!
Agradecimientos:Contenido: Douglas Grindlay Diseño y producción: Natasha Rogers. Asesoramiento técnico: Julian Tenney. Traducción: Santiago Piedra.
Haga click en el símbolo para obtener su certificado:
Santiago Piedra MD.