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ADVENTURE TRADUCTION

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De l'ARN à la protéine Décoder le code génétique

AdVENTURE traduction

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INTRODUCTION

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Vous avez reçu un message de F. Jacob et J. Monod : « Nous avons caché un trésor. Pour le trouver vous devrez percer le mystère du code génétique. »

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Vous avez reçu un message de F. Jacob et J. Monod : « Nous avons caché un trésor. Pour le trouver vous devrez percer le mystère du code génétique. »

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CHOOSE YOUR DESTINY

Mission 1

Pour continuer, tapez la valeur de X ?

Pour continuer, tapez la valeur de X ?

Pour continuer, tapez la valeur de X ?

Pour continuer, tapez la valeur de X ?

CHOOSE YOUR DESTINY

Mission 2

Mission 2

Le message contenu dans la molécule d’ARN sert d’intermédiaire entre l’ADN et les protéines. Alors que l’ARN est constitué d’un enchaînement ordonné de nucléotides parmi 4 possibles (A, C, G, U), une protéine est constituée d’un enchainement ordonné d’acides aminés parmi 20 possibles. On peut alors formuler l’hypothèse suivante : « Il existe une correspondance, ou code, entre la séquence en nucléotide de l’ARN et la séquence en acides aminés de la protéine, tel que : un acide aminé est codé/désigné par X ribonucléotide (avec X= nombre entier) » Pour accéder à l'indice suivant vous devez trouver la plus petite valeur de X nucléotides qui permet de coder l’ensemble des 20 acides aminés. ATTENTION : BIEN GARDER L'ENSEMBLE DES CHIFFRES POUR LA FIN !

START

Aide à la résolution :1. Combien de bases compte l’ARNm de la chaîne beta de l'hemogloBine ? 2. Combien d’acides aminés compte le polypeptide beta ? 3. Déterminer la relation mathématique existant entre l’ARNm et le polypeptide. 4. Proposer alors une hypothèse sur la correspondance existante entre les bases de l’ARNm et les acides aminés du polypeptide(nombre =X).

Numéro X

Pour continuer, tapez la valeur de X ?

Pour continuer, tapez la valeur de X ?

Pour continuer, tapez la valeur de X ?

Mission 3

Mission n°3 :Une séquence de 3 nucléotides appelée codon code pour un acide aminé. Il existe donc 64 codons différents qui constituent le code génétique. Les correspondances codon - acide aminé ont été découvertes par NireNberg et Matthaei en 1961. Utiliser les documents pour compléter le code génétique qui vous est fourni.

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Quelques résultats des expériences de Niremberg et Matthaei :

Donner le code génétique rempli à votre professeur pour obtenir le code

Coup de pouce : - Comparer le début les séquences d’ARN et protéine des 3 molécules affichées à l’écran- Comparer la fin de la séquence d’ARN et de la protéine de la chaîne alpha de l’hémoglobine en vous aidant de l’échelle de repérage des acides aminés.

Il existe des codons particuliers permettant à la machinerie cellulaire d’identifier le début et la fin du message génétique sur chaque molécule d’ARN. On peut les mettre en évidence en analysant des séquences d’ARN et les séquences de protéines correspondantes à l’aide du logiciel Anagène.Ouvrir le logiciel Anagène : Menu démarrer → Anagène Afin d’afficher les molécules aller dans « Banque de séquences » puis sélectionner les molécules d’ARNm suivantes :• Chaîne alpha de l’hémoglobine : alphacod.arn• Chaîne bêta de l’hémoglobine : bêtacod.arnAfin d’afficher les séquences en acides aminés correspondantes, sélectionner les 2 molécules d’ARN puis cliquer sur Traiter → convertir → séquences → séquences peptidiques → traduction simple Afin de pouvoir comparer ARN et protéine, il faut changer l’échelle de repérage des nucléotides en échelle d’acides aminés

ERROR

Mission 4

Mission 4 : formuler une hypothèse sur le deroulement du mecanisme de la traductionet Traduire la sequence d'ARN

La traduction démarre par la reconnaissance d'un codon d'initiation et se terminant par un codon stop. C'est au codon stop que la synthèse de la séquence d'acides aminés s'arrêtent.

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La première lettre du premier et dernier acide aminé de la séquence vous serviront de code.

Séquence ARN : AUGGCGAGCGAACAGGAAAACUGCGAACCGCGCACCGAAAUUCAGCAA

Tapez la lettre du premier acide aminé et celle du dernier acide aminé de la séquence que vous avez traduite.

A Z E R T Y U I O PQ S D F G H J K L MW X C V B N

A Z E R T Y U I O PQ S D F G H J K L MW X C V B N

A Z E R T Y U I O PQ S D F G H J K L MW X C V B N

ERROR

A Z E R T U I O PQ S D F G H J K L MW X C V B N

Mission 5

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Mission n°5 : Le code génétique est dit : - non chevauchant, c'est à dire qu'un nucléotide n’appartient qu’à un seul codon - univoque, c’est-à-dire, qu’un codon désigne toujours le même acide aminé Utilisez les indices précédents et le document présent dans cette page afin de savoir si le code génétique est également redondant (=qui se répète) et/ou universel.

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Mission n°5 : Le code génétique est dit : - non chevauchant, c'est à dire qu'un nucléotide n’appartient qu’à un seul codon - univoque, c’est-à-dire, qu’un codon désigne toujours le même acide aminé Utilisez les indices précédents et le document présent dans cette page afin de savoir si le code génétique est également redondant (=qui se répète) et/ou universel.

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Cliquez sur la bonne réponse :Le code génétique est :

Redondant

Universel

Redondant et Universel

Quel acide aminé est codé par les codons par CGU, CGC, CGA, CGG ?

L'arginine et la phénylalanine

La phénylalanine, l'arginine et la glutamine

L'arginine

Vous voyez le code est redondant : 4 codons codent 1 acide aminé

Mission n°5 :Enigme finale : BRGCAGUCO CUUEAGU CCAREMAUCEREAGC, GUUOUUCA EUACEUCG AUGAGGAUANACCENGCANACA DE GUCRAGAAUUUCU GGCENEUAUAUCUGCAUCENUCC. TGCUUUCER CUGE UGCODE GAUGUUEUGC LEAGC NOAUGBRES UAUROUGUUES CUGORUGC DEUGC MIUCGUCGIONS.

Demandez la version papier à votre professeur

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Créer et écrire sa propre séquence sur Anagène :

Créer et écrire sa propre séquence sur Anagène :

Exploiter les documents 1a et 1b pour formuler une hypothèse expliquant comment cet organite pourrait être impliqué dans la synthèse protéique. Appeler le professeur quand vous avez trouvé