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Coccinelles arlequin
stephanevaraire
Created on September 12, 2019
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Transcript
Réalisé à partir du travail de Stéphane Varaire. Merci
INTRO
La diversité des individus au sein d'une espece L'exemple des coccinelles arlequins
Direction le labo
Les objectifs ce travail sont de :- Savoir s'il s'agit de variations intraspécifiques (au sein d'une même espèce) ou spécifiques (plusieurs espèces différentes). - Savoir si les coccinelles arlequins sont de la même espèce que Coccinella septempunctata. - Connaitre l'origine précise de cette variabilité.
Mais connaissez-vous les coccinelles arlequins ?Il s'agit de coccinelles présentant des motifs variés sur leur élytres (la carapace protégeant leurs ailes). Il s'agit d'un bon exemple de diversité des êtres vivants...
Tout le monde connait la coccinelle à 7 points Coccinella septempunctata, une grande habituée de nos jardins...
Il y a tâche et tâche....
Des infos sur la coccinelle? ... c'est par ici !
Rappels de génétique
Retour à l'intro
Séquencer l'ADN
Localiser et inactiver des gènes
Faire des croisements
La notion d'espèce
Lancer l'analyse génétique pour connaitre la région responsable du motif des élytres
Retour au labo
Afin d'identifier la région du génome associée aux variations de coloration des élytres, nous avons séquencé plusieurs génomes de coccinelles et les avons comparé entre eux.
Afin d'identifier la région du génome associée aux variations de coloration des élytres, nous avons séquencé plusieurs génomes de coccinelles et les avons comparé entre eux.
Inactiver le gène itr
Inactiver le gène pnr
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Inactiver le gène aor
Nous avons identifié une région bien précise du chromosome 4 de la coccinelle arlequin, dont les variations de séquences sont corrélées avec les variations de coloration. Cette région s’étend sur trois gènes : le gène aor, le gène pnr et le gène itr Pour pouvoir savoir lequel de ces trois gènes est impliqué, on peut inactiver chaque gène l'un après l'autre et d’observer les effets de cette inactivation sur les caractéristiques de la coccinelle.
Refaire une expérience d'inactivation
Expérience d'inactivation du gène pnr
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Gène pnr inactif
Gène pnr actif(expérience témoin)
Black-2spots
Black-nspots
Red-nspots
Black-4spots
Black-2spots
Black-nspots
Red-nspots
Black-4spots
Refaire une expérience d'inactivation
Expérience d'inactivation du gène aor
Gène aor inactif
Retour au labo
Gène aor actif(expérience témoin)
Black-2spots
Black-nspots
Red-nspots
Black-4spots
Black-2spots
Black-nspots
Red-nspots
Black-4spots
Refaire une expérience d'inactivation
Expérience d'inactivation du gène itr
Retour au labo
Gène itr inactif
Gène itr actif(expérience témoin)
Black-2spots
Black-nspots
Red-nspots
Black-4spots
Black-2spots
Black-nspots
Red-nspots
Black-4spots
refermer le placard
l'oeil est ici
Les 2 tâches blanches derrière la tête ne sont pas des yeux (mais juste des taches)
Attention aux yeux des coccinelles
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Lien vers GenieGen2
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Pour tout connaître sur les secrets sur notre diversité phénotypique......... RDV sur GenieGen2!
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je crois qu'on dérange...
Oups désolé !
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Entrez le chiffre correspondant au chromosome concerné par le séquencage.
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Recommencer le sequençage
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___
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Recommencer le sequençage
Recommencer le sequençage
Retour au labo
x__
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Recommencer le sequençage
Recommencer le sequençage
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xx_
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Recommencer le sequençage
Recommencer le sequençage
Retour au labo
___
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Recommencer le sequençage
Recommencer le sequençage
Retour au labo
x__
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Recommencer le sequençage
Recommencer le sequençage
Retour au labo
xx_
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Si vous avez testé les 3 gènes, il est temps de retourner au labo et de découvrir ce que contient l'enveloppe laissée à votre disposition...
Recommencer le sequençage
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La séquence d'ADN demandée a bien été séquencée.Il existe 4 versions (allèles) de ce gène pnr ("pannier") : hsp : allèle trouvé chez Black-4spots hA : allèle trouvé chez Black-nspots hC : allèle trouvé chez Black-2spots h : allèle trouvé chez Red-nspots
Recommencer le sequençage
Recommencer le sequençage
Retour au labo
ERREUR : ce n'est pas le bon gène !
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Recommencer le sequençage
Recommencer le sequençage
Ce chromosome contient plein de gènes, mais aucun ne participe à la mise ne place du motif des élytres.
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Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
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Sélectionnez les coccinelles que vous voulez croiser...
Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Refaire un croisement
Retour au labo
Sélectionnez une deuxième coccinelle...
Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Refaire un croisement
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Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Refaire un croisement
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Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Refaire un croisement
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Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Pas de croisement possible
Refaire un croisement
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Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Refaire un croisement
Retour au labo
Sélectionnez une deuxième coccinelle...
Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Refaire un croisement
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Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Refaire un croisement
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Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Refaire un croisement
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Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Pas de croisement possible
Refaire un croisement
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Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Refaire un croisement
Retour au labo
Sélectionnez une deuxième coccinelle...
Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
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Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
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Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
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Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Pas de croisement possible
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Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
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Sélectionnez une deuxième coccinelle...
Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Pas de croisement possible
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Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Pas de croisement possible
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Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Pas de croisement possible
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Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Pas de croisement possible
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Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
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Sélectionnez une deuxième coccinelle...
Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Pas de croisement possible
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Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
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Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
Refaire un croisement
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Coccinella septempunctata
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-nspots
ArlequinRed-nspots
ArlequinBlack-4spots
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