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Coccinelles arlequin

stephanevaraire

Created on September 12, 2019

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Transcript

La diversité des individus au sein d'une espece L'exemple des coccinelles arlequins

Réalisé à partir du travail de Stéphane Varaire. Merci

INTRO

Tout le monde connait la coccinelle à 7 points Coccinella septempunctata, une grande habituée de nos jardins...

Mais connaissez-vous les coccinelles arlequins ?Il s'agit de coccinelles présentant des motifs variés sur leur élytres (la carapace protégeant leurs ailes). Il s'agit d'un bon exemple de diversité des êtres vivants...

Les objectifs ce travail sont de :- Savoir s'il s'agit de variations intraspécifiques (au sein d'une même espèce) ou spécifiques (plusieurs espèces différentes). - Savoir si les coccinelles arlequins sont de la même espèce que Coccinella septempunctata. - Connaitre l'origine précise de cette variabilité.

Direction le labo

Des infos sur la coccinelle? ... c'est par ici !

Il y a tâche et tâche....

La notion d'espèce

Rappels de génétique

Séquencer l'ADN

Localiser et inactiver des gènes

Faire des croisements

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Afin d'identifier la région du génome associée aux variations de coloration des élytres, nous avons séquencé plusieurs génomes de coccinelles et les avons comparé entre eux.

Lancer l'analyse génétique pour connaitre la région responsable du motif des élytres

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Afin d'identifier la région du génome associée aux variations de coloration des élytres, nous avons séquencé plusieurs génomes de coccinelles et les avons comparé entre eux.

Nous avons identifié une région bien précise du chromosome 4 de la coccinelle arlequin, dont les variations de séquences sont corrélées avec les variations de coloration. Cette région s’étend sur trois gènes : le gène aor, le gène pnr et le gène itr Pour pouvoir savoir lequel de ces trois gènes est impliqué, on peut inactiver chaque gène l'un après l'autre et d’observer les effets de cette inactivation sur les caractéristiques de la coccinelle.

Inactiver le gène aor

Inactiver le gène pnr

Inactiver le gène itr

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Expérience d'inactivation du gène pnr

Red-nspots

Black-nspots

Black-4spots

Black-2spots

Gène pnr actif(expérience témoin)

Gène pnr inactif

Refaire une expérience d'inactivation

Red-nspots

Black-nspots

Black-4spots

Black-2spots

Retour au labo

Expérience d'inactivation du gène aor

Red-nspots

Black-nspots

Black-4spots

Black-2spots

Gène aor actif(expérience témoin)

Gène aor inactif

Refaire une expérience d'inactivation

Red-nspots

Black-nspots

Black-4spots

Black-2spots

Retour au labo

Expérience d'inactivation du gène itr

Black-nspots

Red-nspots

Black-4spots

Black-2spots

Gène itr actif(expérience témoin)

Gène itr inactif

Refaire une expérience d'inactivation

Red-nspots

Black-nspots

Black-4spots

Black-2spots

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Attention aux yeux des coccinelles

Les 2 tâches blanches derrière la tête ne sont pas des yeux (mais juste des taches)

l'oeil est ici

refermer le placard

Pour tout connaître sur les secrets sur notre diversité phénotypique......... RDV sur GenieGen2!

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Oups désolé !

je crois qu'on dérange...

Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Entrez le chiffre correspondant au chromosome concerné par le séquencage.

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

___

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

x__

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

xx_

Recommencer le sequençage

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

___

Recommencer le sequençage

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

x__

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer

xx_

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Si vous avez testé les 3 gènes, il est temps de retourner au labo et de découvrir ce que contient l'enveloppe laissée à votre disposition...

La séquence d'ADN demandée a bien été séquencée.Il existe 4 versions (allèles) de ce gène pnr ("pannier") : hsp : allèle trouvé chez Black-4spots hA : allèle trouvé chez Black-nspots hC : allèle trouvé chez Black-2spots h : allèle trouvé chez Red-nspots

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

ERREUR : ce n'est pas le bon gène !

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Bienvenue dans votre séquenceur ADN

Ce chromosome contient plein de gènes, mais aucun ne participe à la mise ne place du motif des élytres.

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Sélectionnez les coccinelles que vous voulez croiser...

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Retour au labo

Sélectionnez une deuxième coccinelle...

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

Retour au labo

Refaire un croisement

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

Pas de croisement possible

Sélectionnez une deuxième coccinelle...

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Refaire un croisement

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Pas de croisement possible

Sélectionnez une deuxième coccinelle...

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

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Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-4spots

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Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

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Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Pas de croisement possible

Sélectionnez une deuxième coccinelle...

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

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Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Pas de croisement possible

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Pas de croisement possible

ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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Sélectionnez une deuxième coccinelle...

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ArlequinBlack-2spots

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Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-2spots

ArlequinBlack-4spots

ArlequinRed-nspots

Coccinella septempunctata

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ArlequinBlack-nspots

ArlequinBlack-2spots

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