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Coccinelles arlequin
stephanevaraire
Created on September 12, 2019
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Transcript
La diversité des individus au sein d'une espece L'exemple des coccinelles arlequins
Réalisé à partir du travail de Stéphane Varaire. Merci
INTRO
Tout le monde connait la coccinelle à 7 points Coccinella septempunctata, une grande habituée de nos jardins...
Mais connaissez-vous les coccinelles arlequins ?Il s'agit de coccinelles présentant des motifs variés sur leur élytres (la carapace protégeant leurs ailes). Il s'agit d'un bon exemple de diversité des êtres vivants...
Les objectifs ce travail sont de :- Savoir s'il s'agit de variations intraspécifiques (au sein d'une même espèce) ou spécifiques (plusieurs espèces différentes). - Savoir si les coccinelles arlequins sont de la même espèce que Coccinella septempunctata. - Connaitre l'origine précise de cette variabilité.
Direction le labo
Des infos sur la coccinelle? ... c'est par ici !
Il y a tâche et tâche....
La notion d'espèce
Rappels de génétique
Séquencer l'ADN
Localiser et inactiver des gènes
Faire des croisements
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Afin d'identifier la région du génome associée aux variations de coloration des élytres, nous avons séquencé plusieurs génomes de coccinelles et les avons comparé entre eux.
Lancer l'analyse génétique pour connaitre la région responsable du motif des élytres
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Afin d'identifier la région du génome associée aux variations de coloration des élytres, nous avons séquencé plusieurs génomes de coccinelles et les avons comparé entre eux.
Nous avons identifié une région bien précise du chromosome 4 de la coccinelle arlequin, dont les variations de séquences sont corrélées avec les variations de coloration. Cette région s’étend sur trois gènes : le gène aor, le gène pnr et le gène itr Pour pouvoir savoir lequel de ces trois gènes est impliqué, on peut inactiver chaque gène l'un après l'autre et d’observer les effets de cette inactivation sur les caractéristiques de la coccinelle.
Inactiver le gène aor
Inactiver le gène pnr
Inactiver le gène itr
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Expérience d'inactivation du gène pnr
Red-nspots
Black-nspots
Black-4spots
Black-2spots
Gène pnr actif(expérience témoin)
Gène pnr inactif
Refaire une expérience d'inactivation
Red-nspots
Black-nspots
Black-4spots
Black-2spots
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Expérience d'inactivation du gène aor
Red-nspots
Black-nspots
Black-4spots
Black-2spots
Gène aor actif(expérience témoin)
Gène aor inactif
Refaire une expérience d'inactivation
Red-nspots
Black-nspots
Black-4spots
Black-2spots
Retour au labo
Expérience d'inactivation du gène itr
Black-nspots
Red-nspots
Black-4spots
Black-2spots
Gène itr actif(expérience témoin)
Gène itr inactif
Refaire une expérience d'inactivation
Red-nspots
Black-nspots
Black-4spots
Black-2spots
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Attention aux yeux des coccinelles
Les 2 tâches blanches derrière la tête ne sont pas des yeux (mais juste des taches)
l'oeil est ici
refermer le placard
Pour tout connaître sur les secrets sur notre diversité phénotypique......... RDV sur GenieGen2!
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Oups désolé !
je crois qu'on dérange...
Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Entrez le chiffre correspondant au chromosome concerné par le séquencage.
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Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
___
Recommencer le sequençage
Recommencer le sequençage
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Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
x__
Recommencer le sequençage
Recommencer le sequençage
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Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
xx_
Recommencer le sequençage
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Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
___
Recommencer le sequençage
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Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
x__
Recommencer le sequençage
Recommencer le sequençage
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Bienvenue dans votre séquenceur ADN
Maintenant, indiquez le nom du gène (trois lettres) que vous voulez séquencer
xx_
Recommencer le sequençage
Recommencer le sequençage
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Si vous avez testé les 3 gènes, il est temps de retourner au labo et de découvrir ce que contient l'enveloppe laissée à votre disposition...
La séquence d'ADN demandée a bien été séquencée.Il existe 4 versions (allèles) de ce gène pnr ("pannier") : hsp : allèle trouvé chez Black-4spots hA : allèle trouvé chez Black-nspots hC : allèle trouvé chez Black-2spots h : allèle trouvé chez Red-nspots
Recommencer le sequençage
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Bienvenue dans votre séquenceur ADN
ERREUR : ce n'est pas le bon gène !
Recommencer le sequençage
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Ce chromosome contient plein de gènes, mais aucun ne participe à la mise ne place du motif des élytres.
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Sélectionnez les coccinelles que vous voulez croiser...
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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Sélectionnez une deuxième coccinelle...
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
Retour au labo
Refaire un croisement
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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Refaire un croisement
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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Refaire un croisement
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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Refaire un croisement
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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Refaire un croisement
Pas de croisement possible
Sélectionnez une deuxième coccinelle...
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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Refaire un croisement
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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Refaire un croisement
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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Refaire un croisement
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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Refaire un croisement
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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Refaire un croisement
Pas de croisement possible
Sélectionnez une deuxième coccinelle...
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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Pas de croisement possible
Sélectionnez une deuxième coccinelle...
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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Pas de croisement possible
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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Pas de croisement possible
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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Pas de croisement possible
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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Pas de croisement possible
Sélectionnez une deuxième coccinelle...
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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Pas de croisement possible
ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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ArlequinBlack-nspots
ArlequinBlack-2spots
ArlequinBlack-4spots
ArlequinRed-nspots
Coccinella septempunctata
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ArlequinRed-nspots
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